MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 7045

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004337	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004337	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	56479580
3	NC_004337	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	56479580
4	NC_004337	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	56479580
5	NC_004337	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	56479580
6	NC_004337	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	24111454
7	NC_004337	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	24111454
8	NC_004337	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004337	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004337	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004337	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004337	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	24111457
13	NC_004337	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	56479582
14	NC_004337	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	56479583
15	NC_004337	CG	4	8	10127	10134	0 %	0 %	50 %	50 %	24111460
16	NC_004337	AC	3	6	10860	10865	50 %	0 %	0 %	50 %	24111461
17	NC_004337	AG	3	6	11612	11617	50 %	0 %	50 %	0 %	24111462
18	NC_004337	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004337	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	24111463
20	NC_004337	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	56479584
21	NC_004337	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004337	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004337	TG	3	6	16735	16740	0 %	50 %	50 %	0 %	24111465
24	NC_004337	GA	3	6	17359	17364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004337	TA	3	6	19476	19481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004337	GT	3	6	19683	19688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004337	TC	3	6	19689	19694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004337	GC	3	6	20002	20007	0 %	0 %	50 %	50 %	532141202
29	NC_004337	GT	3	6	20412	20417	0 %	50 %	50 %	0 %	24111470
30	NC_004337	CG	3	6	20458	20463	0 %	0 %	50 %	50 %	24111470
31	NC_004337	CG	3	6	21844	21849	0 %	0 %	50 %	50 %	24111471
32	NC_004337	GC	3	6	22517	22522	0 %	0 %	50 %	50 %	24111471
33	NC_004337	CG	3	6	22591	22596	0 %	0 %	50 %	50 %	24111471
34	NC_004337	CG	3	6	23319	23324	0 %	0 %	50 %	50 %	24111471
35	NC_004337	GC	3	6	24481	24486	0 %	0 %	50 %	50 %	24111472
36	NC_004337	AT	3	6	25803	25808	50 %	50 %	0 %	0 %	56479587
37	NC_004337	TG	3	6	26153	26158	0 %	50 %	50 %	0 %	56479587
38	NC_004337	CT	3	6	29372	29377	0 %	50 %	0 %	50 %	56479588
39	NC_004337	CG	3	6	29522	29527	0 %	0 %	50 %	50 %	56479588
40	NC_004337	GC	3	6	30335	30340	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
41	NC_004337	GC	3	6	30539	30544	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
42	NC_004337	CG	3	6	30675	30680	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
43	NC_004337	CA	3	6	30692	30697	50 %	0 %	0 %	50 %	24111479
44	NC_004337	TC	4	8	30837	30844	0 %	50 %	0 %	50 %	24111479
45	NC_004337	CG	3	6	31576	31581	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
46	NC_004337	GC	3	6	31744	31749	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
47	NC_004337	AT	3	6	33644	33649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004337	TG	3	6	33731	33736	0 %	50 %	50 %	0 %	532141204
49	NC_004337	AG	3	6	33811	33816	50 %	0 %	50 %	0 %	532141204
50	NC_004337	CG	3	6	33990	33995	0 %	0 %	50 %	50 %	532141204
51	NC_004337	CT	3	6	34464	34469	0 %	50 %	0 %	50 %	24111481
52	NC_004337	CA	3	6	34532	34537	50 %	0 %	0 %	50 %	24111481
53	NC_004337	TC	3	6	35421	35426	0 %	50 %	0 %	50 %	24111482
54	NC_004337	GC	3	6	39034	39039	0 %	0 %	50 %	50 %	24111485
55	NC_004337	CG	3	6	39306	39311	0 %	0 %	50 %	50 %	24111485
56	NC_004337	TG	3	6	39509	39514	0 %	50 %	50 %	0 %	24111485
57	NC_004337	GC	4	8	40184	40191	0 %	0 %	50 %	50 %	24111486
58	NC_004337	CG	3	6	41949	41954	0 %	0 %	50 %	50 %	344915205
59	NC_004337	GC	3	6	43051	43056	0 %	0 %	50 %	50 %	24111488
60	NC_004337	GC	3	6	43858	43863	0 %	0 %	50 %	50 %	24111489
61	NC_004337	CG	3	6	45027	45032	0 %	0 %	50 %	50 %	24111490
62	NC_004337	TG	3	6	45424	45429	0 %	50 %	50 %	0 %	24111491
63	NC_004337	TC	3	6	46467	46472	0 %	50 %	0 %	50 %	24111491
64	NC_004337	AT	3	6	46510	46515	50 %	50 %	0 %	0 %	24111491
65	NC_004337	CT	3	6	46663	46668	0 %	50 %	0 %	50 %	24111492
66	NC_004337	CT	3	6	46721	46726	0 %	50 %	0 %	50 %	24111492
67	NC_004337	GC	3	6	47042	47047	0 %	0 %	50 %	50 %	24111492
68	NC_004337	CT	3	6	47632	47637	0 %	50 %	0 %	50 %	24111493
69	NC_004337	CG	3	6	48286	48291	0 %	0 %	50 %	50 %	24111493
70	NC_004337	CG	3	6	48789	48794	0 %	0 %	50 %	50 %	24111493
71	NC_004337	CG	4	8	50129	50136	0 %	0 %	50 %	50 %	24111495
72	NC_004337	CG	4	8	50417	50424	0 %	0 %	50 %	50 %	24111495
73	NC_004337	AC	3	6	50901	50906	50 %	0 %	0 %	50 %	24111496
74	NC_004337	GC	4	8	53419	53426	0 %	0 %	50 %	50 %	24111499
75	NC_004337	AT	3	6	54437	54442	50 %	50 %	0 %	0 %	24111500
76	NC_004337	GC	4	8	54891	54898	0 %	0 %	50 %	50 %	24111500
77	NC_004337	GT	3	6	56661	56666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004337	AT	3	6	56678	56683	50 %	50 %	0 %	0 %	56479591
79	NC_004337	CG	3	6	59722	59727	0 %	0 %	50 %	50 %	24111503
80	NC_004337	AG	3	6	60602	60607	50 %	0 %	50 %	0 %	24111503
81	NC_004337	CG	3	6	60676	60681	0 %	0 %	50 %	50 %	24111503
82	NC_004337	CG	4	8	60795	60802	0 %	0 %	50 %	50 %	24111503
83	NC_004337	GC	3	6	64836	64841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_004337	TG	3	6	65450	65455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004337	CG	3	6	65764	65769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004337	CG	3	6	66503	66508	0 %	0 %	50 %	50 %	24111506
87	NC_004337	GC	3	6	67658	67663	0 %	0 %	50 %	50 %	24111506
88	NC_004337	AG	3	6	67931	67936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004337	GA	3	6	68458	68463	50 %	0 %	50 %	0 %	56479592
90	NC_004337	CG	3	6	68527	68532	0 %	0 %	50 %	50 %	56479592
91	NC_004337	CG	3	6	69830	69835	0 %	0 %	50 %	50 %	24111508
92	NC_004337	GC	3	6	70994	70999	0 %	0 %	50 %	50 %	24111510
93	NC_004337	AC	3	6	71605	71610	50 %	0 %	0 %	50 %	24111510
94	NC_004337	AG	3	6	72154	72159	50 %	0 %	50 %	0 %	24111510
95	NC_004337	GA	3	6	72167	72172	50 %	0 %	50 %	0 %	24111510
96	NC_004337	TC	3	6	73800	73805	0 %	50 %	0 %	50 %	56479595
97	NC_004337	GC	3	6	75596	75601	0 %	0 %	50 %	50 %	24111513
98	NC_004337	TC	3	6	76824	76829	0 %	50 %	0 %	50 %	24111514
99	NC_004337	GC	3	6	77172	77177	0 %	0 %	50 %	50 %	24111514
100	NC_004337	TG	3	6	77269	77274	0 %	50 %	50 %	0 %	24111514
101	NC_004337	CG	3	6	77636	77641	0 %	0 %	50 %	50 %	24111515
102	NC_004337	GC	3	6	78467	78472	0 %	0 %	50 %	50 %	24111515
103	NC_004337	GC	3	6	78570	78575	0 %	0 %	50 %	50 %	24111515
104	NC_004337	AT	3	6	78627	78632	50 %	50 %	0 %	0 %	24111515
105	NC_004337	GC	3	6	79518	79523	0 %	0 %	50 %	50 %	344915206
106	NC_004337	AT	3	6	81911	81916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004337	TC	3	6	83072	83077	0 %	50 %	0 %	50 %	344915207
108	NC_004337	TG	3	6	83230	83235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004337	CT	3	6	83238	83243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004337	GC	3	6	84541	84546	0 %	0 %	50 %	50 %	344915208
111	NC_004337	TC	3	6	85023	85028	0 %	50 %	0 %	50 %	344915208
112	NC_004337	GA	3	6	85184	85189	50 %	0 %	50 %	0 %	344915208
113	NC_004337	GC	3	6	85433	85438	0 %	0 %	50 %	50 %	56479597
114	NC_004337	CG	3	6	85664	85669	0 %	0 %	50 %	50 %	56479597
115	NC_004337	GC	3	6	86425	86430	0 %	0 %	50 %	50 %	24111523
116	NC_004337	CG	3	6	86494	86499	0 %	0 %	50 %	50 %	24111523
117	NC_004337	CA	3	6	87924	87929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_004337	AG	3	6	89635	89640	50 %	0 %	50 %	0 %	24111527
119	NC_004337	AG	3	6	91260	91265	50 %	0 %	50 %	0 %	24111529
120	NC_004337	GA	3	6	91851	91856	50 %	0 %	50 %	0 %	24111530
121	NC_004337	AT	3	6	91933	91938	50 %	50 %	0 %	0 %	24111530
122	NC_004337	CG	3	6	92782	92787	0 %	0 %	50 %	50 %	24111530
123	NC_004337	GC	3	6	92897	92902	0 %	0 %	50 %	50 %	24111530
124	NC_004337	CG	3	6	95626	95631	0 %	0 %	50 %	50 %	24111532
125	NC_004337	CG	3	6	96561	96566	0 %	0 %	50 %	50 %	24111533
126	NC_004337	GC	3	6	96825	96830	0 %	0 %	50 %	50 %	24111533
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128	NC_004337	GT	3	6	98812	98817	0 %	50 %	50 %	0 %	24111535
129	NC_004337	TG	3	6	100068	100073	0 %	50 %	50 %	0 %	24111536
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131	NC_004337	CG	3	6	100542	100547	0 %	0 %	50 %	50 %	24111536
132	NC_004337	TC	3	6	101498	101503	0 %	50 %	0 %	50 %	24111537
133	NC_004337	CG	3	6	102354	102359	0 %	0 %	50 %	50 %	24111538
134	NC_004337	CA	3	6	103281	103286	50 %	0 %	0 %	50 %	24111539
135	NC_004337	GC	3	6	103675	103680	0 %	0 %	50 %	50 %	24111539
136	NC_004337	GA	3	6	103913	103918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004337	CT	3	6	104396	104401	0 %	50 %	0 %	50 %	56479600
138	NC_004337	GC	4	8	104689	104696	0 %	0 %	50 %	50 %	56479600
139	NC_004337	TG	3	6	105920	105925	0 %	50 %	50 %	0 %	24111541
140	NC_004337	CT	3	6	106137	106142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004337	GC	3	6	106690	106695	0 %	0 %	50 %	50 %	344915209
142	NC_004337	GC	3	6	107838	107843	0 %	0 %	50 %	50 %	24111543
143	NC_004337	AC	3	6	107910	107915	50 %	0 %	0 %	50 %	24111543
144	NC_004337	GC	3	6	110981	110986	0 %	0 %	50 %	50 %	24111547
145	NC_004337	CG	3	6	111235	111240	0 %	0 %	50 %	50 %	24111548
146	NC_004337	TA	3	6	111710	111715	50 %	50 %	0 %	0 %	24111548
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