MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE3

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004320	TCAGA	2	10	2167	2176	40 %	20 %	20 %	20 %	23577988
2	NC_004320	GCACC	2	10	9080	9089	20 %	0 %	20 %	60 %	23577997
3	NC_004320	ATTGG	2	10	9274	9283	20 %	40 %	40 %	0 %	23577997
4	NC_004320	CAAGC	2	10	11286	11295	40 %	0 %	20 %	40 %	23577998
5	NC_004320	AGCGC	2	10	11507	11516	20 %	0 %	40 %	40 %	23577998
6	NC_004320	GCCCA	2	10	13030	13039	20 %	0 %	20 %	60 %	23577999
7	NC_004320	TGGTG	2	10	15025	15034	0 %	40 %	60 %	0 %	23577999
8	NC_004320	GCCAC	2	10	15384	15393	20 %	0 %	20 %	60 %	23577999
9	NC_004320	TGATC	2	10	19136	19145	20 %	40 %	20 %	20 %	23578002
10	NC_004320	TGTCG	2	10	19482	19491	0 %	40 %	40 %	20 %	23578002
11	NC_004320	GCGGT	2	10	20742	20751	0 %	20 %	60 %	20 %	23578003
12	NC_004320	GGGCA	2	10	21327	21336	20 %	0 %	60 %	20 %	23578003
13	NC_004320	GCCGT	2	10	24221	24230	0 %	20 %	40 %	40 %	23578006
14	NC_004320	GGCCG	2	10	25641	25650	0 %	0 %	60 %	40 %	23578009
15	NC_004320	CAGGT	2	10	27833	27842	20 %	20 %	40 %	20 %	23578010
16	NC_004320	TCCTC	2	10	29257	29266	0 %	40 %	0 %	60 %	23578011
17	NC_004320	GCCAC	2	10	29272	29281	20 %	0 %	20 %	60 %	23578011
18	NC_004320	TGCCA	2	10	29554	29563	20 %	20 %	20 %	40 %	23578012
19	NC_004320	CGGTG	2	10	31398	31407	0 %	20 %	60 %	20 %	23578013
20	NC_004320	GGTGA	2	10	32474	32483	20 %	20 %	60 %	0 %	23578014
21	NC_004320	GCCCC	2	10	32997	33006	0 %	0 %	20 %	80 %	23578014
22	NC_004320	AGGGC	2	10	36041	36050	20 %	0 %	60 %	20 %	23578016
23	NC_004320	TGATC	2	10	36613	36622	20 %	40 %	20 %	20 %	23578017
24	NC_004320	ATGGG	2	10	42691	42700	20 %	20 %	60 %	0 %	23578021
25	NC_004320	AGGCG	2	10	45238	45247	20 %	0 %	60 %	20 %	23578022

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.