MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE3

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004320	AAGC	2	8	326	333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004320	TGGA	2	8	417	424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004320	GTCT	2	8	435	442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004320	TAGA	2	8	725	732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004320	CAAG	2	8	1551	1558	50 %	0 %	25 %	25 %	23577987
6	NC_004320	TACC	2	8	2253	2260	25 %	25 %	0 %	50 %	23577988
7	NC_004320	GATA	2	8	2931	2938	50 %	25 %	25 %	0 %	23577989
8	NC_004320	TACC	2	8	2978	2985	25 %	25 %	0 %	50 %	23577989
9	NC_004320	AGCT	2	8	3101	3108	25 %	25 %	25 %	25 %	23577989
10	NC_004320	CAGA	2	8	3323	3330	50 %	0 %	25 %	25 %	23577989
11	NC_004320	ACAT	2	8	3472	3479	50 %	25 %	0 %	25 %	23577989
12	NC_004320	ACCT	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	23577990
13	NC_004320	GAGG	2	8	4749	4756	25 %	0 %	75 %	0 %	23577991
14	NC_004320	TAAG	2	8	4876	4883	50 %	25 %	25 %	0 %	23577991
15	NC_004320	TTAA	2	8	5879	5886	50 %	50 %	0 %	0 %	23577992
16	NC_004320	AAAT	2	8	6246	6253	75 %	25 %	0 %	0 %	23577992
17	NC_004320	TGCG	2	8	6489	6496	0 %	25 %	50 %	25 %	23577992
18	NC_004320	CCCG	2	8	7175	7182	0 %	0 %	25 %	75 %	23577994
19	NC_004320	CGCC	2	8	7284	7291	0 %	0 %	25 %	75 %	23577994
20	NC_004320	AAAG	2	8	7584	7591	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004320	GGTA	2	8	7632	7639	25 %	25 %	50 %	0 %	23577995
22	NC_004320	GTGA	2	8	7942	7949	25 %	25 %	50 %	0 %	23577995
23	NC_004320	GGAT	2	8	8278	8285	25 %	25 %	50 %	0 %	23577996
24	NC_004320	AGAA	2	8	8623	8630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004320	CCCT	2	8	8844	8851	0 %	25 %	0 %	75 %	23577997
26	NC_004320	CACC	2	8	8930	8937	25 %	0 %	0 %	75 %	23577997
27	NC_004320	CGGG	2	8	9849	9856	0 %	0 %	75 %	25 %	23577997
28	NC_004320	GTTT	2	8	10430	10437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004320	GTGA	2	8	10596	10603	25 %	25 %	50 %	0 %	23577998
30	NC_004320	TGAC	2	8	10693	10700	25 %	25 %	25 %	25 %	23577998
31	NC_004320	GCCA	2	8	11320	11327	25 %	0 %	25 %	50 %	23577998
32	NC_004320	AACA	2	8	11915	11922	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004320	GGCA	2	8	12873	12880	25 %	0 %	50 %	25 %	23577999
34	NC_004320	GCTC	2	8	13790	13797	0 %	25 %	25 %	50 %	23577999
35	NC_004320	TGCA	2	8	13962	13969	25 %	25 %	25 %	25 %	23577999
36	NC_004320	AGGT	2	8	15288	15295	25 %	25 %	50 %	0 %	23577999
37	NC_004320	AAAC	2	8	15304	15311	75 %	0 %	0 %	25 %	23577999
38	NC_004320	GCGG	2	8	16250	16257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004320	ATTT	2	8	17882	17889	25 %	75 %	0 %	0 %	23578001
40	NC_004320	GATT	2	8	18207	18214	25 %	50 %	25 %	0 %	23578001
41	NC_004320	AGCT	2	8	18503	18510	25 %	25 %	25 %	25 %	23578001
42	NC_004320	GTTT	2	8	18597	18604	0 %	75 %	25 %	0 %	23578001
43	NC_004320	TCAC	2	8	18620	18627	25 %	25 %	0 %	50 %	23578001
44	NC_004320	TCAA	2	8	18674	18681	50 %	25 %	0 %	25 %	23578001
45	NC_004320	CTTG	2	8	19101	19108	0 %	50 %	25 %	25 %	23578002
46	NC_004320	GTGG	2	8	19583	19590	0 %	25 %	75 %	0 %	23578002
47	NC_004320	GGCA	2	8	19659	19666	25 %	0 %	50 %	25 %	23578002
48	NC_004320	CCTG	2	8	20098	20105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004320	TTTC	2	8	20148	20155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_004320	CTGG	2	8	20225	20232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004320	TAAT	2	8	20448	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004320	CCAA	2	8	22144	22151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004320	GCCA	2	8	22385	22392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004320	CTGA	2	8	22754	22761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004320	CCAT	2	8	23355	23362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004320	GCCC	2	8	23530	23537	0 %	0 %	25 %	75 %	23578005
57	NC_004320	CAGC	2	8	25022	25029	25 %	0 %	25 %	50 %	23578008
58	NC_004320	ACGG	2	8	25141	25148	25 %	0 %	50 %	25 %	23578008
59	NC_004320	CGGG	2	8	25150	25157	0 %	0 %	75 %	25 %	23578008
60	NC_004320	GTGA	2	8	25236	25243	25 %	25 %	50 %	0 %	23578008
61	NC_004320	TCGG	2	8	25768	25775	0 %	25 %	50 %	25 %	23578009
62	NC_004320	TCCC	2	8	26300	26307	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_004320	AGGG	2	8	26547	26554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004320	CCAG	2	8	26851	26858	25 %	0 %	25 %	50 %	23578010
65	NC_004320	ACCG	2	8	28370	28377	25 %	0 %	25 %	50 %	23578010
66	NC_004320	GGGT	2	8	28614	28621	0 %	25 %	75 %	0 %	23578010
67	NC_004320	GCAG	2	8	28860	28867	25 %	0 %	50 %	25 %	23578010
68	NC_004320	ACGG	2	8	30029	30036	25 %	0 %	50 %	25 %	23578012
69	NC_004320	GTTC	2	8	30255	30262	0 %	50 %	25 %	25 %	23578013
70	NC_004320	ATCC	2	8	30630	30637	25 %	25 %	0 %	50 %	23578013
71	NC_004320	GCCC	2	8	30811	30818	0 %	0 %	25 %	75 %	23578013
72	NC_004320	GCTG	2	8	31866	31873	0 %	25 %	50 %	25 %	23578013
73	NC_004320	CGGA	2	8	32067	32074	25 %	0 %	50 %	25 %	23578014
74	NC_004320	TTCT	2	8	33473	33480	0 %	75 %	0 %	25 %	23578015
75	NC_004320	GGAG	2	8	33610	33617	25 %	0 %	75 %	0 %	23578015
76	NC_004320	ATCA	2	8	33858	33865	50 %	25 %	0 %	25 %	23578015
77	NC_004320	GATG	2	8	34753	34760	25 %	25 %	50 %	0 %	23578015
78	NC_004320	CGGG	2	8	35701	35708	0 %	0 %	75 %	25 %	23578016
79	NC_004320	CCCT	2	8	35832	35839	0 %	25 %	0 %	75 %	23578016
80	NC_004320	CGCT	2	8	36595	36602	0 %	25 %	25 %	50 %	23578017
81	NC_004320	CAGC	2	8	37041	37048	25 %	0 %	25 %	50 %	23578017
82	NC_004320	AGTG	2	8	38791	38798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004320	ATTC	2	8	39443	39450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004320	GCTT	2	8	40229	40236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004320	ATTG	2	8	40660	40667	25 %	50 %	25 %	0 %	23578019
86	NC_004320	ATGG	2	8	41497	41504	25 %	25 %	50 %	0 %	23578020
87	NC_004320	GTGG	2	8	41962	41969	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004320	TGTT	2	8	43482	43489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004320	CAAG	2	8	43822	43829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004320	TCGG	2	8	44231	44238	0 %	25 %	50 %	25 %	23578022
91	NC_004320	TGCG	2	8	44480	44487	0 %	25 %	50 %	25 %	23578022
92	NC_004320	GAGC	2	8	45195	45202	25 %	0 %	50 %	25 %	23578022
93	NC_004320	TACC	2	8	46021	46028	25 %	25 %	0 %	50 %	23578024
94	NC_004320	ATTG	2	8	46070	46077	25 %	50 %	25 %	0 %	23578024
95	NC_004320	GCCA	2	8	46799	46806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004320	CGTC	2	8	47545	47552	0 %	25 %	25 %	50 %	23578026
97	NC_004320	TTTC	2	8	48058	48065	0 %	75 %	0 %	25 %	23578027
98	NC_004320	GCTT	2	8	48110	48117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_004320	TTTC	2	8	48384	48391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004320	TTTC	2	8	48631	48638	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.