MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE3

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004320	GA	3	6	364	369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004320	TG	4	8	752	759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004320	CA	4	8	770	777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004320	TC	3	6	861	866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004320	GC	3	6	1191	1196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004320	GA	3	6	1777	1782	50 %	0 %	50 %	0 %	23577987
7	NC_004320	CG	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	23577989
8	NC_004320	GC	4	8	3175	3182	0 %	0 %	50 %	50 %	23577989
9	NC_004320	TC	4	8	3413	3420	0 %	50 %	0 %	50 %	23577989
10	NC_004320	AG	3	6	3527	3532	50 %	0 %	50 %	0 %	23577989
11	NC_004320	GC	3	6	3824	3829	0 %	0 %	50 %	50 %	23577990
12	NC_004320	TC	3	6	4204	4209	0 %	50 %	0 %	50 %	23577990
13	NC_004320	TG	3	6	5709	5714	0 %	50 %	50 %	0 %	23577992
14	NC_004320	GA	3	6	5847	5852	50 %	0 %	50 %	0 %	23577992
15	NC_004320	CT	3	6	7959	7964	0 %	50 %	0 %	50 %	23577995
16	NC_004320	TC	3	6	8511	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004320	AT	3	6	9128	9133	50 %	50 %	0 %	0 %	23577997
18	NC_004320	TC	3	6	9427	9432	0 %	50 %	0 %	50 %	23577997
19	NC_004320	TA	3	6	10251	10256	50 %	50 %	0 %	0 %	23577997
20	NC_004320	AG	3	6	10579	10584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004320	CG	3	6	11411	11416	0 %	0 %	50 %	50 %	23577998
22	NC_004320	TG	3	6	12095	12100	0 %	50 %	50 %	0 %	23577999
23	NC_004320	GT	3	6	12354	12359	0 %	50 %	50 %	0 %	23577999
24	NC_004320	CG	3	6	13083	13088	0 %	0 %	50 %	50 %	23577999
25	NC_004320	GC	3	6	13396	13401	0 %	0 %	50 %	50 %	23577999
26	NC_004320	CG	3	6	13496	13501	0 %	0 %	50 %	50 %	23577999
27	NC_004320	CG	3	6	14578	14583	0 %	0 %	50 %	50 %	23577999
28	NC_004320	TC	3	6	16455	16460	0 %	50 %	0 %	50 %	23578000
29	NC_004320	TA	3	6	17617	17622	50 %	50 %	0 %	0 %	23578001
30	NC_004320	CG	3	6	18823	18828	0 %	0 %	50 %	50 %	23578002
31	NC_004320	AC	3	6	18963	18968	50 %	0 %	0 %	50 %	23578002
32	NC_004320	AC	3	6	19929	19934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004320	TA	3	6	20271	20276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004320	CA	3	6	21428	21433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004320	GT	4	8	22359	22366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004320	CG	3	6	22664	22669	0 %	0 %	50 %	50 %	23578004
37	NC_004320	AG	3	6	24158	24163	50 %	0 %	50 %	0 %	23578006
38	NC_004320	TC	3	6	25385	25390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004320	CA	3	6	27290	27295	50 %	0 %	0 %	50 %	23578010
40	NC_004320	CA	3	6	27357	27362	50 %	0 %	0 %	50 %	23578010
41	NC_004320	GA	3	6	27366	27371	50 %	0 %	50 %	0 %	23578010
42	NC_004320	CG	3	6	29504	29509	0 %	0 %	50 %	50 %	23578011
43	NC_004320	GC	3	6	30441	30446	0 %	0 %	50 %	50 %	23578013
44	NC_004320	GT	3	6	30887	30892	0 %	50 %	50 %	0 %	23578013
45	NC_004320	CG	3	6	31932	31937	0 %	0 %	50 %	50 %	23578013
46	NC_004320	GC	3	6	34389	34394	0 %	0 %	50 %	50 %	23578015
47	NC_004320	TC	3	6	34555	34560	0 %	50 %	0 %	50 %	23578015
48	NC_004320	TA	3	6	36313	36318	50 %	50 %	0 %	0 %	23578017
49	NC_004320	GA	3	6	38007	38012	50 %	0 %	50 %	0 %	23578018
50	NC_004320	TA	3	6	38511	38516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004320	TA	3	6	38535	38540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004320	AC	3	6	40179	40184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004320	TC	3	6	40192	40197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004320	CG	3	6	42400	42405	0 %	0 %	50 %	50 %	23578021
55	NC_004320	AG	4	8	43075	43082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004320	CA	3	6	43111	43116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004320	TG	3	6	43599	43604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004320	CA	3	6	44261	44266	50 %	0 %	0 %	50 %	23578022
59	NC_004320	AG	3	6	44461	44466	50 %	0 %	50 %	0 %	23578022
60	NC_004320	TC	3	6	45168	45173	0 %	50 %	0 %	50 %	23578022
61	NC_004320	GT	3	6	46209	46214	0 %	50 %	50 %	0 %	23578024
62	NC_004320	CG	3	6	46835	46840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004320	AG	3	6	47258	47263	50 %	0 %	50 %	0 %	23578026
64	NC_004320	AG	3	6	48044	48049	50 %	0 %	50 %	0 %	23578027
65	NC_004320	TC	5	10	48192	48201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004320	AG	3	6	48433	48438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.