MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004319	CTGG	2	8	300	307	0 %	25 %	50 %	25 %	23577971
2	NC_004319	GATG	2	8	565	572	25 %	25 %	50 %	0 %	23577971
3	NC_004319	CTGG	2	8	1425	1432	0 %	25 %	50 %	25 %	23577971
4	NC_004319	CCCT	2	8	1445	1452	0 %	25 %	0 %	75 %	23577971
5	NC_004319	TCCC	2	8	1794	1801	0 %	25 %	0 %	75 %	23577971
6	NC_004319	GAAA	2	8	2557	2564	75 %	0 %	25 %	0 %	23577972
7	NC_004319	GGAT	2	8	2625	2632	25 %	25 %	50 %	0 %	23577972
8	NC_004319	TCAC	2	8	3173	3180	25 %	25 %	0 %	50 %	23577972
9	NC_004319	TGGA	2	8	3232	3239	25 %	25 %	50 %	0 %	23577972
10	NC_004319	TTCT	2	8	3511	3518	0 %	75 %	0 %	25 %	23577972
11	NC_004319	CTGG	2	8	4587	4594	0 %	25 %	50 %	25 %	23577972
12	NC_004319	GTGC	2	8	5526	5533	0 %	25 %	50 %	25 %	23577972
13	NC_004319	TGAT	2	8	7357	7364	25 %	50 %	25 %	0 %	23577973
14	NC_004319	GCCG	2	8	7473	7480	0 %	0 %	50 %	50 %	23577973
15	NC_004319	ACGG	2	8	7485	7492	25 %	0 %	50 %	25 %	23577973
16	NC_004319	GTGG	2	8	8810	8817	0 %	25 %	75 %	0 %	23577975
17	NC_004319	TGAT	2	8	8857	8864	25 %	50 %	25 %	0 %	23577975
18	NC_004319	GTGC	2	8	9072	9079	0 %	25 %	50 %	25 %	23577975
19	NC_004319	CATT	2	8	9733	9740	25 %	50 %	0 %	25 %	23577975
20	NC_004319	ATGA	2	8	9774	9781	50 %	25 %	25 %	0 %	23577975
21	NC_004319	CGCA	2	8	11167	11174	25 %	0 %	25 %	50 %	23577976
22	NC_004319	ATCT	2	8	12401	12408	25 %	50 %	0 %	25 %	23577977
23	NC_004319	CATA	2	8	12470	12477	50 %	25 %	0 %	25 %	23577977
24	NC_004319	GTGG	2	8	12647	12654	0 %	25 %	75 %	0 %	23577977
25	NC_004319	ACTG	2	8	13844	13851	25 %	25 %	25 %	25 %	23577979
26	NC_004319	GTGG	2	8	14611	14618	0 %	25 %	75 %	0 %	23577979
27	NC_004319	CAGC	2	8	14753	14760	25 %	0 %	25 %	50 %	23577979
28	NC_004319	TCCT	2	8	15264	15271	0 %	50 %	0 %	50 %	23577980
29	NC_004319	CATC	2	8	17085	17092	25 %	25 %	0 %	50 %	23577981
30	NC_004319	TGAT	2	8	18664	18671	25 %	50 %	25 %	0 %	23577982
31	NC_004319	TGGG	2	8	19474	19481	0 %	25 %	75 %	0 %	23577983
32	NC_004319	TTGA	2	8	19519	19526	25 %	50 %	25 %	0 %	23577983
33	NC_004319	GTGC	2	8	19735	19742	0 %	25 %	50 %	25 %	23577983
34	NC_004319	GACG	2	8	20025	20032	25 %	0 %	50 %	25 %	23577983
35	NC_004319	GCTA	2	8	20994	21001	25 %	25 %	25 %	25 %	23577984
36	NC_004319	GATC	2	8	22017	22024	25 %	25 %	25 %	25 %	23577984
37	NC_004319	TCCG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	25 %	50 %	23577984
38	NC_004319	GGAC	2	8	22487	22494	25 %	0 %	50 %	25 %	23577984
39	NC_004319	CCGG	2	8	22847	22854	0 %	0 %	50 %	50 %	23577985
40	NC_004319	CTGG	2	8	22868	22875	0 %	25 %	50 %	25 %	23577985
41	NC_004319	GCCA	2	8	22928	22935	25 %	0 %	25 %	50 %	23577985

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.