MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium efficiens YS-314 plasmid pCE2

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004319	ACA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577971
2	NC_004319	CAG	2	6	250	255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577971
3	NC_004319	GAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577971
4	NC_004319	GCC	2	6	478	483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577971
5	NC_004319	TCT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577971
6	NC_004319	TCC	2	6	527	532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577971
7	NC_004319	CGA	2	6	537	542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577971
8	NC_004319	TGC	2	6	582	587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577971
9	NC_004319	AAC	2	6	615	620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577971
10	NC_004319	GCA	2	6	633	638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577971
11	NC_004319	CAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577971
12	NC_004319	ACT	3	9	1067	1075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577971
13	NC_004319	AAC	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577971
14	NC_004319	CAT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577971
15	NC_004319	CTT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577971
16	NC_004319	CTT	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577971
17	NC_004319	TCA	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577971
18	NC_004319	AGC	2	6	1614	1619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577971
19	NC_004319	CTG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577971
20	NC_004319	CCG	2	6	1781	1786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577971
21	NC_004319	TGT	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577972
22	NC_004319	TAT	2	6	2688	2693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23577972
23	NC_004319	TAT	2	6	2730	2735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23577972
24	NC_004319	GCG	2	6	2796	2801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577972
25	NC_004319	GAA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
26	NC_004319	TGA	2	6	2984	2989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
27	NC_004319	GGT	2	6	2999	3004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
28	NC_004319	CTT	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577972
29	NC_004319	TGA	2	6	3080	3085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
30	NC_004319	GCA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
31	NC_004319	TGT	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577972
32	NC_004319	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
33	NC_004319	AGA	2	6	3475	3480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
34	NC_004319	CAG	2	6	3540	3545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
35	NC_004319	AGC	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
36	NC_004319	GCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
37	NC_004319	GAG	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577972
38	NC_004319	AAG	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
39	NC_004319	TGG	2	6	3682	3687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
40	NC_004319	GAT	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
41	NC_004319	TGA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
42	NC_004319	AGG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577972
43	NC_004319	CCA	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577972
44	NC_004319	GGC	2	6	3983	3988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577972
45	NC_004319	GGT	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
46	NC_004319	GTG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
47	NC_004319	CAG	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
48	NC_004319	CCT	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577972
49	NC_004319	AGC	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
50	NC_004319	TCC	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23577972
51	NC_004319	GGT	3	9	4250	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
52	NC_004319	TGG	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
53	NC_004319	CCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577972
54	NC_004319	GAT	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
55	NC_004319	TGG	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
56	NC_004319	AGA	2	6	4681	4686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
57	NC_004319	TGT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577972
58	NC_004319	TGA	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
59	NC_004319	GTG	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
60	NC_004319	TGG	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
61	NC_004319	CGA	2	6	5134	5139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
62	NC_004319	CGT	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
63	NC_004319	CTG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
64	NC_004319	GCT	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
65	NC_004319	GTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
66	NC_004319	ACT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577972
67	NC_004319	CCG	2	6	5388	5393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577972
68	NC_004319	AGA	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577972
69	NC_004319	CAG	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
70	NC_004319	CTG	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
71	NC_004319	GAT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577972
72	NC_004319	CGT	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
73	NC_004319	TGG	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577972
74	NC_004319	TAC	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577972
75	NC_004319	AGC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577972
76	NC_004319	TCG	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577972
77	NC_004319	CGC	2	6	5950	5955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577972
78	NC_004319	ATT	2	6	7260	7265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23577973
79	NC_004319	ACC	3	9	7299	7307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577973
80	NC_004319	CGC	2	6	7335	7340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577973
81	NC_004319	AGA	2	6	7406	7411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577973
82	NC_004319	ATC	2	6	7497	7502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577973
83	NC_004319	TGA	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577973
84	NC_004319	AGC	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577973
85	NC_004319	TTA	2	6	7653	7658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23577973
86	NC_004319	TCG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577973
87	NC_004319	CGC	2	6	7766	7771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577973
88	NC_004319	GAT	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577973
89	NC_004319	ACC	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577973
90	NC_004319	GAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577974
91	NC_004319	ACC	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577974
92	NC_004319	GAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577974
93	NC_004319	GAT	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577974
94	NC_004319	ATC	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577974
95	NC_004319	ACG	2	6	8436	8441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577975
96	NC_004319	ACC	2	6	8466	8471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577975
97	NC_004319	CGG	2	6	8480	8485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577975
98	NC_004319	ACC	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577975
99	NC_004319	CAA	2	6	8678	8683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23577975
100	NC_004319	TGG	2	6	8701	8706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577975
101	NC_004319	GCA	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577975
102	NC_004319	GGT	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577975
103	NC_004319	TCT	2	6	9059	9064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577975
104	NC_004319	CAG	2	6	9114	9119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577975
105	NC_004319	TCA	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577975
106	NC_004319	GGA	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577975
107	NC_004319	TGA	2	6	9296	9301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577975
108	NC_004319	TGC	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577975
109	NC_004319	ATC	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577975
110	NC_004319	AGG	2	6	9412	9417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577975
111	NC_004319	GCC	2	6	9446	9451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23577975
112	NC_004319	ACG	2	6	9498	9503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577975
113	NC_004319	CCA	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577975
114	NC_004319	GAA	2	6	9593	9598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577975
115	NC_004319	CTT	2	6	9719	9724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577975
116	NC_004319	TGA	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577975
117	NC_004319	TAG	2	6	9806	9811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577975
118	NC_004319	CTG	2	6	9823	9828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577975
119	NC_004319	GAA	2	6	9851	9856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23577975
120	NC_004319	CAC	2	6	10431	10436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577976
121	NC_004319	TCA	2	6	10499	10504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577976
122	NC_004319	GCG	2	6	10538	10543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23577976
123	NC_004319	CTT	2	6	10662	10667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577976
124	NC_004319	CCA	2	6	10751	10756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23577976
125	NC_004319	GGA	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577976
126	NC_004319	TGG	2	6	10772	10777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577976
127	NC_004319	AGG	2	6	10929	10934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577976
128	NC_004319	GTG	2	6	10939	10944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577976
129	NC_004319	GTT	2	6	10995	11000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23577976
130	NC_004319	TTC	2	6	11047	11052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23577976
131	NC_004319	CAG	2	6	11251	11256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23577976
132	NC_004319	GGA	2	6	11340	11345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577976
133	NC_004319	TGA	2	6	11352	11357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577976
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136	NC_004319	GTC	2	6	11458	11463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577976
137	NC_004319	ATG	2	6	11525	11530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577976
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140	NC_004319	CAT	2	6	11601	11606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577976
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145	NC_004319	TGC	2	6	12030	12035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577977
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152	NC_004319	ATG	2	6	12680	12685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577977
153	NC_004319	TAC	2	6	12808	12813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23577977
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155	NC_004319	TAG	2	6	13307	13312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23577978
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158	NC_004319	GGA	2	6	13982	13987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23577979
159	NC_004319	TGG	2	6	14078	14083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23577979
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161	NC_004319	CTG	2	6	14130	14135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577979
162	NC_004319	GCT	2	6	14145	14150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23577979
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.