MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome I

Total Repeats: 289

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004310	CATGC	2	10	26938	26947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_004310	CATGC	2	10	28353	28362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_004310	CGAAA	2	10	28551	28560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_004310	CGGAG	2	10	31529	31538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_004310	CCGTG	2	10	40683	40692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_004310	TAAAG	2	10	50828	50837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004310	TGAAA	2	10	51945	51954	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004310	CGGAG	2	10	72796	72805	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_004310	AAATA	2	10	78927	78936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004310	AAGGC	2	10	83562	83571	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004310	TCTGG	2	10	83707	83716	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004310	TCGAT	2	10	89269	89278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004310	TTCCA	2	10	95544	95553	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_004310	CGGTT	2	10	95916	95925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004310	GAACC	2	10	95968	95977	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_004310	GCACC	2	10	106852	106861	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_004310	TTTGT	2	10	107345	107354	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004310	GCCGC	2	10	114561	114570	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_004310	ATGGA	2	10	122893	122902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004310	CCGCC	2	10	145082	145091	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_004310	GCACG	2	10	146992	147001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_004310	CGAAC	2	10	147288	147297	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_004310	GCTTC	2	10	147336	147345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_004310	CGAAG	2	10	147473	147482	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_004310	CAATG	2	10	148713	148722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_004310	CGCGC	2	10	148727	148736	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_004310	ACAGC	2	10	162494	162503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_004310	CGGAG	2	10	165829	165838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004310	ACAAA	2	10	165896	165905	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004310	CTGCC	2	10	170460	170469	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_004310	TGAAA	2	10	171832	171841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004310	CGTGT	2	10	172729	172738	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004310	TTTTA	2	10	174536	174545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004310	AAAGC	2	10	196436	196445	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004310	TTTCG	2	10	217075	217084	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_004310	CTTGG	2	10	228103	228112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004310	GGCAG	2	10	233481	233490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004310	GCAAC	2	10	269136	269145	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_004310	GGGGC	2	10	269673	269682	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004310	ATTCT	2	10	288949	288958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_004310	TGGCT	2	10	305595	305604	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004310	AAAAG	2	10	311568	311577	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004310	GTTTC	2	10	321489	321498	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_004310	CAGCT	2	10	327099	327108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_004310	TCTTT	2	10	330920	330929	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_004310	CGTGG	2	10	347349	347358	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_004310	CCAAG	2	10	349430	349439	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_004310	GCGCA	2	10	350365	350374	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_004310	GCCTG	2	10	386287	386296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_004310	ACGCG	2	10	386301	386310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_004310	CCGGC	2	10	386321	386330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_004310	CGAAA	2	10	404000	404009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004310	CCGGG	2	10	405094	405103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_004310	ACAAA	2	10	405305	405314	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004310	AGCGA	2	10	408394	408403	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004310	GAAAA	2	10	413329	413338	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004310	CAGGC	2	10	418364	418373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_004310	CGTCA	2	10	418522	418531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_004310	TACGA	3	15	418879	418893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004310	AGGCT	2	10	422070	422079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_004310	GGGTT	2	10	427876	427885	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004310	AATGT	2	10	427953	427962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004310	AAAAG	2	10	432527	432536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004310	ACCGC	2	10	433657	433666	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_004310	GTTTT	2	10	433678	433687	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004310	AACGC	2	10	451519	451528	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_004310	CGGCA	2	10	468611	468620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_004310	AGGGC	2	10	475941	475950	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_004310	TGCCG	2	10	476002	476011	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_004310	CGGAA	2	10	484498	484507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004310	TTTTA	2	10	485211	485220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004310	AAATT	2	10	487178	487187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004310	ATGAA	2	10	487199	487208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004310	ACAGG	2	10	494352	494361	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004310	GATGC	2	10	515480	515489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_004310	ACGAG	2	10	516198	516207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004310	CCGCA	2	10	516383	516392	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_004310	TGCCA	2	10	522015	522024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_004310	TGCAT	2	10	527626	527635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004310	AGTTT	2	10	546744	546753	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004310	ATAGT	2	10	546871	546880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004310	TTTGC	2	10	560992	561001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004310	AAAGA	2	10	561015	561024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004310	ACTGA	2	10	565417	565426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004310	TGGGC	2	10	569817	569826	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_004310	CGGGC	2	10	589202	589211	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_004310	CGGGC	2	10	590718	590727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_004310	AGGCG	2	10	590798	590807	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_004310	GGGCA	2	10	590919	590928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004310	TGCCA	2	10	591312	591321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_004310	TTGGA	2	10	591745	591754	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004310	TAAAA	2	10	618303	618312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004310	GAACG	2	10	625061	625070	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004310	ACCGG	2	10	626785	626794	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_004310	TTTGC	2	10	629344	629353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_004310	CCGAT	2	10	689686	689695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_004310	ACAAA	2	10	695246	695255	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004310	AAGAT	2	10	702539	702548	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004310	CAAAG	2	10	703109	703118	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004310	TCTTT	2	10	705851	705860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_004310	ACATT	2	10	717215	717224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004310	CATGC	2	10	732304	732313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_004310	ACAAA	2	10	743675	743684	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_004310	CAAGA	2	10	743703	743712	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004310	TTTGT	2	10	761303	761312	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004310	GAAAA	2	10	763058	763067	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004310	ACAAA	2	10	763190	763199	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004310	CTTGT	2	10	768470	768479	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004310	CTTGA	2	10	772783	772792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_004310	ATGCC	2	10	779141	779150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_004310	ATTGG	2	10	788127	788136	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004310	GTAAA	2	10	809028	809037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004310	TGAAG	2	10	819929	819938	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004310	AGCGA	2	10	822569	822578	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004310	GGCAG	2	10	830868	830877	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004310	GCGCG	2	10	830918	830927	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_004310	ATCAG	2	10	835885	835894	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004310	GATGA	2	10	836113	836122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004310	GAGCT	2	10	843339	843348	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004310	GGGCA	2	10	845114	845123	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_004310	GACAG	2	10	847955	847964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004310	TGCGA	2	10	892975	892984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_004310	GACAG	2	10	911826	911835	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_004310	GGTGC	2	10	918528	918537	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004310	ATGCG	2	10	922617	922626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_004310	CGGGG	2	10	922704	922713	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004310	CCAAC	2	10	923154	923163	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_004310	CATCT	2	10	927785	927794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_004310	TTGCC	2	10	929224	929233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_004310	GCAGG	2	10	937004	937013	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004310	TTCCT	2	10	943783	943792	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_004310	CGCTG	2	10	943818	943827	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004310	TGCGA	2	10	945207	945216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004310	TTGCG	2	10	980424	980433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004310	TGCAG	2	10	980444	980453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_004310	AAATA	2	10	985817	985826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004310	ATGAA	2	10	995643	995652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004310	ACAAA	2	10	997507	997516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004310	TCGGT	2	10	1009857	1009866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_004310	TTTTA	2	10	1015753	1015762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004310	CGTGG	2	10	1016420	1016429	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_004310	AGGGC	2	10	1022640	1022649	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_004310	AAAAG	2	10	1026994	1027003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004310	AAAAT	2	10	1027177	1027186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004310	ACGAA	2	10	1046912	1046921	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004310	CTCAT	2	10	1050242	1050251	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_004310	AAGAA	2	10	1050433	1050442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004310	GCGTT	2	10	1053730	1053739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_004310	GTTTT	2	10	1056068	1056077	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004310	ACGCA	2	10	1067900	1067909	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_004310	GGTCC	2	10	1102342	1102351	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_004310	AAAAG	2	10	1113929	1113938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004310	GTTTT	2	10	1122214	1122223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_004310	TTTGT	2	10	1128780	1128789	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_004310	TTTGT	2	10	1225396	1225405	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_004310	CCTCT	2	10	1229320	1229329	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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179	NC_004310	CATTT	2	10	1344866	1344875	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_004310	TGAAT	2	10	1407401	1407410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004310	CCCTT	2	10	1407651	1407660	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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189	NC_004310	ATAAA	2	10	1426327	1426336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_004310	AATGA	2	10	1439481	1439490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_004310	TCCTT	2	10	1459353	1459362	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
194	NC_004310	TTGCC	2	10	1459407	1459416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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198	NC_004310	ACCGA	2	10	1470127	1470136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
199	NC_004310	CGGTC	2	10	1485381	1485390	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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202	NC_004310	CGCAT	2	10	1498580	1498589	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_004310	CGAAG	2	10	1793426	1793435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_004310	GCGAT	2	10	1881512	1881521	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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271	NC_004310	CGCAA	2	10	1920491	1920500	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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274	NC_004310	ACAAA	2	10	1945780	1945789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_004310	GTTTG	2	10	2071583	2071592	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_004310	ACAAA	2	10	2085384	2085393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_004310	TGTGC	2	10	2089359	2089368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_004310	CCCGG	2	10	2090977	2090986	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
286	NC_004310	ACCCG	2	10	2091365	2091374	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
287	NC_004310	CGGAT	2	10	2091390	2091399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_004310	GGCTT	2	10	2101950	2101959	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_004310	GGATG	2	10	2107033	2107042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.