MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 1281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	GTGGC	2	10	1763	1772	0 %	20 %	60 %	20 %	23464630
2	NC_004307	CGCTC	2	10	2029	2038	0 %	20 %	20 %	60 %	23464630
3	NC_004307	CAAGA	2	10	3682	3691	60 %	0 %	20 %	20 %	23464633
4	NC_004307	GTATC	2	10	4622	4631	20 %	40 %	20 %	20 %	23464634
5	NC_004307	CCGTG	2	10	4899	4908	0 %	20 %	40 %	40 %	23464634
6	NC_004307	CTGAT	2	10	6621	6630	20 %	40 %	20 %	20 %	23464635
7	NC_004307	AGCCA	2	10	7315	7324	40 %	0 %	20 %	40 %	23464636
8	NC_004307	CGGCG	2	10	8162	8171	0 %	0 %	60 %	40 %	23464637
9	NC_004307	CGGCT	2	10	9943	9952	0 %	20 %	40 %	40 %	23464638
10	NC_004307	CCGCC	2	10	10305	10314	0 %	0 %	20 %	80 %	23464638
11	NC_004307	CAACT	2	10	12487	12496	40 %	20 %	0 %	40 %	23464639
12	NC_004307	CACCG	2	10	12886	12895	20 %	0 %	20 %	60 %	23464639
13	NC_004307	GGCAC	2	10	13491	13500	20 %	0 %	40 %	40 %	23464640
14	NC_004307	ACGCA	2	10	13940	13949	40 %	0 %	20 %	40 %	23464640
15	NC_004307	GCTCG	2	10	17948	17957	0 %	20 %	40 %	40 %	23464643
16	NC_004307	TGATC	2	10	19782	19791	20 %	40 %	20 %	20 %	23464644
17	NC_004307	GTGGC	2	10	21285	21294	0 %	20 %	60 %	20 %	23464645
18	NC_004307	GGTTG	2	10	22455	22464	0 %	40 %	60 %	0 %	23464646
19	NC_004307	GTGGC	2	10	22483	22492	0 %	20 %	60 %	20 %	23464646
20	NC_004307	GCCTG	2	10	27153	27162	0 %	20 %	40 %	40 %	23464650
21	NC_004307	AGGAG	2	10	27840	27849	40 %	0 %	60 %	0 %	23464650
22	NC_004307	CAGCT	2	10	28691	28700	20 %	20 %	20 %	40 %	23464652
23	NC_004307	GGCCG	2	10	31130	31139	0 %	0 %	60 %	40 %	23464653
24	NC_004307	TCGAC	2	10	32051	32060	20 %	20 %	20 %	40 %	23464654
25	NC_004307	CAAAT	2	10	37129	37138	60 %	20 %	0 %	20 %	23464657
26	NC_004307	AGGTG	2	10	39756	39765	20 %	20 %	60 %	0 %	23464659
27	NC_004307	TGACC	2	10	42152	42161	20 %	20 %	20 %	40 %	23464661
28	NC_004307	ACCTG	2	10	44677	44686	20 %	20 %	20 %	40 %	23464663
29	NC_004307	GCCAC	2	10	47706	47715	20 %	0 %	20 %	60 %	23464665
30	NC_004307	TGGTC	2	10	48820	48829	0 %	40 %	40 %	20 %	23464666
31	NC_004307	CACGC	2	10	53108	53117	20 %	0 %	20 %	60 %	23464671
32	NC_004307	CGGGT	2	10	54138	54147	0 %	20 %	60 %	20 %	23464671
33	NC_004307	GCACC	2	10	54965	54974	20 %	0 %	20 %	60 %	23464672
34	NC_004307	TGAAG	2	10	55684	55693	40 %	20 %	40 %	0 %	23464673
35	NC_004307	TTCGA	2	10	55769	55778	20 %	40 %	20 %	20 %	23464673
36	NC_004307	CGGCC	2	10	56200	56209	0 %	0 %	40 %	60 %	23464673
37	NC_004307	TGGTC	2	10	58153	58162	0 %	40 %	40 %	20 %	23464675
38	NC_004307	GCCGC	2	10	59539	59548	0 %	0 %	40 %	60 %	23464676
39	NC_004307	CAGAC	2	10	59698	59707	40 %	0 %	20 %	40 %	23464676
40	NC_004307	GTGGC	2	10	61269	61278	0 %	20 %	60 %	20 %	23464678
41	NC_004307	CGAAC	2	10	61488	61497	40 %	0 %	20 %	40 %	23464678
42	NC_004307	CGCGC	2	10	62566	62575	0 %	0 %	40 %	60 %	23464678
43	NC_004307	CGACC	2	10	65155	65164	20 %	0 %	20 %	60 %	23464679
44	NC_004307	ATCGA	2	10	65885	65894	40 %	20 %	20 %	20 %	23464679
45	NC_004307	GGCGC	2	10	69331	69340	0 %	0 %	60 %	40 %	23464680
46	NC_004307	GCGTG	2	10	70665	70674	0 %	20 %	60 %	20 %	23464681
47	NC_004307	ACGCG	2	10	71430	71439	20 %	0 %	40 %	40 %	23464682
48	NC_004307	GCGCA	2	10	72694	72703	20 %	0 %	40 %	40 %	23464683
49	NC_004307	CCGCC	2	10	72711	72720	0 %	0 %	20 %	80 %	23464683
50	NC_004307	TGACG	2	10	74149	74158	20 %	20 %	40 %	20 %	23464684
51	NC_004307	CGCGC	2	10	75570	75579	0 %	0 %	40 %	60 %	23464684
52	NC_004307	TGTGG	2	10	75673	75682	0 %	40 %	60 %	0 %	23464684
53	NC_004307	ATGGA	2	10	78756	78765	40 %	20 %	40 %	0 %	23464686
54	NC_004307	CGATG	2	10	79874	79883	20 %	20 %	40 %	20 %	23464688
55	NC_004307	CGTGC	2	10	82263	82272	0 %	20 %	40 %	40 %	23464691
56	NC_004307	GATCA	2	10	82862	82871	40 %	20 %	20 %	20 %	23464692
57	NC_004307	CCGCA	2	10	84636	84645	20 %	0 %	20 %	60 %	23464694
58	NC_004307	CGTGG	2	10	86020	86029	0 %	20 %	60 %	20 %	23464695
59	NC_004307	CGCTT	2	10	86281	86290	0 %	40 %	20 %	40 %	23464695
60	NC_004307	AGCCA	2	10	89427	89436	40 %	0 %	20 %	40 %	23464696
61	NC_004307	TACCG	2	10	91205	91214	20 %	20 %	20 %	40 %	23464699
62	NC_004307	GCGAT	2	10	91578	91587	20 %	20 %	40 %	20 %	23464699
63	NC_004307	TCGGC	2	10	91767	91776	0 %	20 %	40 %	40 %	23464699
64	NC_004307	TGTGG	2	10	92461	92470	0 %	40 %	60 %	0 %	23464699
65	NC_004307	AGGCG	2	10	93130	93139	20 %	0 %	60 %	20 %	23464699
66	NC_004307	GCCAT	2	10	93229	93238	20 %	20 %	20 %	40 %	23464699
67	NC_004307	AATGG	2	10	93469	93478	40 %	20 %	40 %	0 %	23464700
68	NC_004307	CGTGC	2	10	93508	93517	0 %	20 %	40 %	40 %	23464700
69	NC_004307	GTCTG	2	10	94385	94394	0 %	40 %	40 %	20 %	23464701
70	NC_004307	AGCGA	2	10	96551	96560	40 %	0 %	40 %	20 %	23464704
71	NC_004307	CCGTG	2	10	99188	99197	0 %	20 %	40 %	40 %	23464706
72	NC_004307	GAATC	2	10	104563	104572	40 %	20 %	20 %	20 %	23464712
73	NC_004307	CGAAT	2	10	104955	104964	40 %	20 %	20 %	20 %	23464712
74	NC_004307	GCCAA	2	10	106670	106679	40 %	0 %	20 %	40 %	23464714
75	NC_004307	TGGCA	2	10	107664	107673	20 %	20 %	40 %	20 %	23464715
76	NC_004307	CGGTC	2	10	108567	108576	0 %	20 %	40 %	40 %	23464717
77	NC_004307	AGCGC	2	10	111541	111550	20 %	0 %	40 %	40 %	23464718
78	NC_004307	TGGTG	2	10	113726	113735	0 %	40 %	60 %	0 %	23464720
79	NC_004307	TCCAT	2	10	117943	117952	20 %	40 %	0 %	40 %	23464723
80	NC_004307	GAGAT	2	10	121477	121486	40 %	20 %	40 %	0 %	23464726
81	NC_004307	GGTGT	2	10	121506	121515	0 %	40 %	60 %	0 %	23464726
82	NC_004307	GGCCG	2	10	126415	126424	0 %	0 %	60 %	40 %	23464730
83	NC_004307	TGACC	2	10	128569	128578	20 %	20 %	20 %	40 %	161485605
84	NC_004307	GCACC	2	10	131019	131028	20 %	0 %	20 %	60 %	23464734
85	NC_004307	CAATC	2	10	131793	131802	40 %	20 %	0 %	40 %	23464734
86	NC_004307	CGGTG	2	10	132154	132163	0 %	20 %	60 %	20 %	23464734
87	NC_004307	CCAAT	2	10	132743	132752	40 %	20 %	0 %	40 %	23464735
88	NC_004307	CGATG	2	10	134713	134722	20 %	20 %	40 %	20 %	23464737
89	NC_004307	GTGAT	2	10	137709	137718	20 %	40 %	40 %	0 %	23464740
90	NC_004307	CAGCT	2	10	138204	138213	20 %	20 %	20 %	40 %	23464740
91	NC_004307	GCCTT	2	10	143415	143424	0 %	40 %	20 %	40 %	23464743
92	NC_004307	GATGA	2	10	143904	143913	40 %	20 %	40 %	0 %	23464743
93	NC_004307	CGAGC	2	10	147247	147256	20 %	0 %	40 %	40 %	23464747
94	NC_004307	ATTTG	2	10	148713	148722	20 %	60 %	20 %	0 %	23464749
95	NC_004307	CGGTC	2	10	149387	149396	0 %	20 %	40 %	40 %	23464749
96	NC_004307	GGCCG	2	10	152995	153004	0 %	0 %	60 %	40 %	23464753
97	NC_004307	AACTT	2	10	154792	154801	40 %	40 %	0 %	20 %	23464753
98	NC_004307	CCGAA	2	10	155735	155744	40 %	0 %	20 %	40 %	23464754
99	NC_004307	CATGG	2	10	155901	155910	20 %	20 %	40 %	20 %	23464754
100	NC_004307	TCCGA	2	10	157268	157277	20 %	20 %	20 %	40 %	23464755
101	NC_004307	CGCCA	2	10	158153	158162	20 %	0 %	20 %	60 %	23464756
102	NC_004307	GCCGA	2	10	166013	166022	20 %	0 %	40 %	40 %	23465855
103	NC_004307	GCGCC	2	10	167846	167855	0 %	0 %	40 %	60 %	23465857
104	NC_004307	CCGCA	2	10	169291	169300	20 %	0 %	20 %	60 %	23465858
105	NC_004307	CCGAC	2	10	169308	169317	20 %	0 %	20 %	60 %	23465858
106	NC_004307	CGGAC	2	10	170014	170023	20 %	0 %	40 %	40 %	23465858
107	NC_004307	TGCGC	2	10	170732	170741	0 %	20 %	40 %	40 %	23465859
108	NC_004307	ATGGG	2	10	171984	171993	20 %	20 %	60 %	0 %	23465860
109	NC_004307	AATCG	2	10	173314	173323	40 %	20 %	20 %	20 %	23465862
110	NC_004307	CCAAC	2	10	173485	173494	40 %	0 %	0 %	60 %	23465862
111	NC_004307	GGATT	2	10	173852	173861	20 %	40 %	40 %	0 %	23465862
112	NC_004307	TGCGC	2	10	174778	174787	0 %	20 %	40 %	40 %	23465863
113	NC_004307	CACGT	2	10	175077	175086	20 %	20 %	20 %	40 %	23465863
114	NC_004307	GCCAG	2	10	175324	175333	20 %	0 %	40 %	40 %	23465863
115	NC_004307	CGAAC	2	10	176884	176893	40 %	0 %	20 %	40 %	23465865
116	NC_004307	GCACG	2	10	179615	179624	20 %	0 %	40 %	40 %	23465866
117	NC_004307	CTGGC	2	10	180814	180823	0 %	20 %	40 %	40 %	23465866
118	NC_004307	ACCGG	2	10	181242	181251	20 %	0 %	40 %	40 %	23465866
119	NC_004307	ATCGT	2	10	181597	181606	20 %	40 %	20 %	20 %	23465866
120	NC_004307	AGCCA	2	10	182132	182141	40 %	0 %	20 %	40 %	23465867
121	NC_004307	ACGTT	2	10	182556	182565	20 %	40 %	20 %	20 %	23465867
122	NC_004307	GCGCC	2	10	183737	183746	0 %	0 %	40 %	60 %	23465868
123	NC_004307	TGATG	2	10	189356	189365	20 %	40 %	40 %	0 %	23465874
124	NC_004307	TCAGC	2	10	190506	190515	20 %	20 %	20 %	40 %	23465875
125	NC_004307	TGCGT	2	10	191874	191883	0 %	40 %	40 %	20 %	23465875
126	NC_004307	GGCTC	2	10	193024	193033	0 %	20 %	40 %	40 %	23465877
127	NC_004307	TGAGC	2	10	194934	194943	20 %	20 %	40 %	20 %	23465878
128	NC_004307	ACGGT	2	10	196289	196298	20 %	20 %	40 %	20 %	23465879
129	NC_004307	ACATG	2	10	196925	196934	40 %	20 %	20 %	20 %	23465879
130	NC_004307	GCCGT	2	10	199140	199149	0 %	20 %	40 %	40 %	23465881
131	NC_004307	CATCG	2	10	200783	200792	20 %	20 %	20 %	40 %	23465882
132	NC_004307	GGCCA	2	10	202284	202293	20 %	0 %	40 %	40 %	23465883
133	NC_004307	TGCCG	2	10	203352	203361	0 %	20 %	40 %	40 %	23465884
134	NC_004307	CTGGA	2	10	212196	212205	20 %	20 %	40 %	20 %	23465888
135	NC_004307	CCACA	2	10	212658	212667	40 %	0 %	0 %	60 %	23465889
136	NC_004307	CCGTA	2	10	213465	213474	20 %	20 %	20 %	40 %	23465889
137	NC_004307	CGCAA	2	10	213991	214000	40 %	0 %	20 %	40 %	23465889
138	NC_004307	CCATT	2	10	214783	214792	20 %	40 %	0 %	40 %	23465889
139	NC_004307	CGGCT	2	10	214881	214890	0 %	20 %	40 %	40 %	23465889
140	NC_004307	AGTTC	2	10	216547	216556	20 %	40 %	20 %	20 %	23465890
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144	NC_004307	CATCC	2	10	219899	219908	20 %	20 %	0 %	60 %	23465891
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