MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	ACGC	2	8	294	301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004307	GTAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004307	TCCA	2	8	4149	4156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004307	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004307	GCGT	2	8	7898	7905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004307	AGGA	2	8	9034	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004307	TAGC	2	8	11672	11679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004307	CTGA	2	8	11724	11731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004307	TCAG	2	8	19329	19336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004307	CCGC	2	8	33325	33332	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_004307	TTCC	2	8	42999	43006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004307	CTTT	2	8	46821	46828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004307	TGCG	2	8	48455	48462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004307	CTGC	2	8	48722	48729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004307	TGTT	2	8	50485	50492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004307	CGGC	2	8	50544	50551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004307	GCAT	2	8	57590	57597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004307	AAGG	2	8	57750	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004307	GCCG	2	8	66843	66850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004307	TGGC	2	8	72412	72419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004307	CCGG	2	8	76143	76150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004307	CCGG	2	8	76175	76182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004307	CACG	2	8	76242	76249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004307	CGCC	2	8	76266	76273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_004307	ACGC	2	8	76389	76396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004307	GCGA	2	8	77684	77691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_004307	GTCG	2	8	80290	80297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004307	GCAG	2	8	80305	80312	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_004307	CCGC	2	8	98956	98963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_004307	AAAG	2	8	99050	99057	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004307	GCGT	2	8	99343	99350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004307	ATCG	2	8	99352	99359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004307	GCGG	2	8	100022	100029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004307	TTCC	2	8	100509	100516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004307	CATC	2	8	103176	103183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004307	TCAA	2	8	115030	115037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004307	CCTC	2	8	126756	126763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_004307	TTGG	2	8	129709	129716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004307	CGAG	2	8	137047	137054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004307	CATC	2	8	158030	158037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004307	GGTG	2	8	159021	159028	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004307	TCCT	2	8	159173	159180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_004307	GACC	2	8	159367	159374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004307	GAGT	2	8	159699	159706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004307	CGGG	2	8	159865	159872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_004307	GGTG	2	8	160889	160896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004307	GCCG	2	8	160985	160992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004307	TTGC	2	8	161207	161214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004307	ACCG	2	8	161333	161340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004307	GCGA	2	8	161429	161436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004307	GCCG	2	8	161526	161533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_004307	GCCG	2	8	162806	162813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004307	CACG	2	8	167481	167488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004307	TTTC	2	8	170123	170130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004307	CTCG	2	8	171091	171098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_004307	GGCC	2	8	171385	171392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004307	GGCG	2	8	171569	171576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004307	CCAA	2	8	171599	171606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004307	CGAG	2	8	176258	176265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004307	CCGG	2	8	176340	176347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004307	CCAA	2	8	182762	182769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004307	GTTA	2	8	184408	184415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004307	CATC	2	8	184459	184466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004307	ACCT	2	8	185475	185482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004307	TCGG	2	8	192146	192153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004307	TCGA	2	8	193978	193985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004307	ACCG	2	8	194004	194011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_004307	AAGA	2	8	198632	198639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004307	ACGT	2	8	205642	205649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004307	CCAT	2	8	205795	205802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_004307	GGCT	2	8	206297	206304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004307	GCCT	2	8	208090	208097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004307	TGCC	2	8	208406	208413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004307	CTAA	2	8	215905	215912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004307	TGTT	2	8	229305	229312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004307	ATGC	2	8	229386	229393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004307	ATGC	2	8	229482	229489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_004307	ATTG	2	8	235902	235909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004307	CAAT	2	8	235913	235920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004307	CGGG	2	8	238537	238544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004307	TGTA	2	8	249000	249007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004307	TGGC	2	8	250574	250581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_004307	TCTG	2	8	250583	250590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004307	TTCG	2	8	256805	256812	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004307	TGCT	2	8	264864	264871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004307	GCGT	2	8	266142	266149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004307	CGGC	2	8	266831	266838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004307	AGTA	2	8	284421	284428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004307	TGCT	2	8	292649	292656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004307	CTGA	2	8	306937	306944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004307	TCAC	2	8	311571	311578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_004307	CGAT	2	8	314106	314113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004307	TGTC	2	8	315163	315170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004307	GGCT	2	8	315185	315192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004307	ATGA	2	8	317142	317149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004307	ACTC	2	8	323620	323627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_004307	TCGG	2	8	325581	325588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004307	TGGT	2	8	325990	325997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004307	CCAT	2	8	327935	327942	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_004307	CGGT	2	8	328674	328681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004307	TAGT	2	8	332468	332475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004307	ACAT	2	8	333673	333680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004307	GGAA	2	8	341073	341080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004307	GTTT	2	8	356036	356043	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004307	GTTC	2	8	362104	362111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004307	CCGG	2	8	362743	362750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004307	CCAT	2	8	365412	365419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_004307	AGCC	2	8	377028	377035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004307	CCGG	2	8	382941	382948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004307	CCGG	2	8	383057	383064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004307	TCGC	2	8	390187	390194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_004307	TCCT	2	8	392029	392036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_004307	CGTC	2	8	394074	394081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004307	GCCG	2	8	394099	394106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_004307	CCGG	2	8	394209	394216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004307	CGGC	2	8	401936	401943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004307	ATGG	2	8	402037	402044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004307	CGAC	2	8	402084	402091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004307	CCCG	2	8	402126	402133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_004307	CACG	2	8	403008	403015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004307	CCGG	2	8	409595	409602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004307	GAGG	2	8	419789	419796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004307	CGGG	2	8	419830	419837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004307	CCCG	2	8	419849	419856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_004307	TGAA	2	8	427640	427647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004307	CCCT	2	8	432636	432643	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_004307	CGGC	2	8	439011	439018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004307	CGGC	2	8	439054	439061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004307	CACG	2	8	439103	439110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_004307	CAGA	2	8	439412	439419	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004307	AAGA	2	8	439587	439594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004307	CGTG	2	8	439954	439961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004307	TGCC	2	8	440201	440208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_004307	CGTG	2	8	443233	443240	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004307	GATG	2	8	446450	446457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004307	CCCG	2	8	446491	446498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_004307	CTGG	2	8	449172	449179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004307	GTCG	2	8	449418	449425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004307	GGCC	2	8	456142	456149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_004307	GGGC	2	8	456481	456488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004307	CTGC	2	8	456889	456896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004307	CGAA	2	8	457089	457096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004307	GGTA	2	8	457265	457272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004307	CTGA	2	8	458185	458192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_004307	CTGT	2	8	460305	460312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_004307	GTCT	2	8	467114	467121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004307	GCGG	2	8	467777	467784	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004307	TTCC	2	8	468264	468271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_004307	GCGG	2	8	468583	468590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_004307	GGGT	2	8	479808	479815	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004307	ACCC	2	8	479888	479895	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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