MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 4276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	CGC	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_004307	CGG	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004307	GTC	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004307	GGA	2	6	510	515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004307	GGC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004307	GGA	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004307	GGC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004307	CCG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_004307	AGC	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004307	CGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_004307	CGC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_004307	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004307	TCC	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_004307	CCT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_004307	TCT	2	6	8951	8956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004307	CGA	2	6	14852	14857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004307	CTG	2	6	14915	14920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_004307	CCA	3	9	16425	16433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_004307	CGC	2	6	17297	17302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_004307	CGA	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004307	GAC	2	6	19289	19294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004307	TGC	2	6	19340	19345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004307	TAT	2	6	20926	20931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004307	GAG	2	6	22361	22366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004307	CGG	2	6	24241	24246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004307	GAG	2	6	24272	24277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004307	AAT	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004307	AAC	2	6	24499	24504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004307	TTC	2	6	24570	24575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004307	GAG	2	6	24607	24612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004307	TCC	2	6	26131	26136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_004307	CGC	2	6	29652	29657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_004307	GAA	2	6	29669	29674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004307	GGA	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004307	GCT	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004307	AGC	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004307	AGC	2	6	31357	31362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004307	ATC	2	6	31404	31409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004307	AAG	2	6	31548	31553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004307	TCA	2	6	31597	31602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004307	CGG	2	6	31607	31612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004307	TGG	2	6	31618	31623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004307	TGA	2	6	31742	31747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004307	CGA	2	6	31805	31810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004307	GAC	3	9	32208	32216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_004307	AAC	2	6	32277	32282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004307	TCC	2	6	33277	33282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_004307	GGC	2	6	33361	33366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004307	CAA	2	6	37459	37464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004307	ATA	2	6	41660	41665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004307	TTG	2	6	41673	41678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004307	TAT	2	6	41740	41745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004307	TTA	2	6	41797	41802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004307	ATC	2	6	41913	41918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004307	GAG	3	9	41938	41946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004307	CTG	2	6	42941	42946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004307	GCT	2	6	46775	46780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004307	CAG	2	6	46796	46801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004307	TTC	2	6	46835	46840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004307	ACC	2	6	48512	48517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_004307	ATA	2	6	48653	48658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004307	CGG	2	6	48747	48752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004307	GGC	2	6	48764	48769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004307	GCG	2	6	49688	49693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004307	GGC	2	6	49694	49699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004307	GTT	2	6	49741	49746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004307	AAC	2	6	50297	50302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004307	TTG	2	6	50337	50342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004307	TTA	2	6	50399	50404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004307	CAA	2	6	50506	50511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004307	GAT	2	6	50583	50588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004307	CTT	2	6	51297	51302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004307	CAT	2	6	51318	51323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004307	GCC	2	6	52205	52210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_004307	TTC	2	6	55441	55446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004307	CAA	2	6	55665	55670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004307	GTA	2	6	56695	56700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004307	CCA	2	6	57553	57558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_004307	CGA	2	6	57648	57653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004307	TGA	2	6	57733	57738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004307	GGC	2	6	58594	58599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004307	CAC	2	6	58726	58731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_004307	CTG	2	6	63239	63244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004307	TGA	2	6	69678	69683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004307	GCC	2	6	69767	69772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_004307	AGG	2	6	69804	69809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004307	GGC	2	6	70961	70966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004307	GCT	2	6	70988	70993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004307	TGG	2	6	71029	71034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004307	AGT	2	6	72159	72164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004307	CAT	2	6	72203	72208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004307	ATT	2	6	72281	72286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004307	GGT	2	6	72424	72429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004307	ACG	2	6	72471	72476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004307	GAT	2	6	72481	72486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004307	TCG	2	6	72496	72501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004307	GTC	2	6	72648	72653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004307	GCC	2	6	73478	73483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_004307	GGC	2	6	73513	73518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004307	ATA	2	6	73554	73559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004307	CTG	2	6	75740	75745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004307	TGC	2	6	75806	75811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004307	CGG	2	6	75997	76002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004307	ATC	2	6	76003	76008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_004307	CGG	2	6	76039	76044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004307	CGC	3	9	76219	76227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_004307	GCC	2	6	76303	76308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_004307	CGC	2	6	76314	76319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_004307	CCG	2	6	76371	76376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_004307	CGA	2	6	76416	76421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_004307	CGA	2	6	76500	76505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004307	AAC	2	6	76523	76528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004307	CCG	2	6	76699	76704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_004307	AAG	2	6	76707	76712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004307	GTT	2	6	77756	77761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004307	GTT	2	6	77792	77797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004307	ATG	2	6	77829	77834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004307	ACA	2	6	77844	77849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004307	ATA	2	6	78977	78982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004307	GCG	2	6	79290	79295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004307	CGC	2	6	79310	79315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_004307	TGC	2	6	80231	80236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004307	TCT	2	6	80247	80252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004307	CGA	2	6	80253	80258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004307	ATA	2	6	82531	82536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004307	GAC	2	6	83179	83184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004307	CAG	3	9	83206	83214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_004307	TGT	2	6	83794	83799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004307	GCC	2	6	83844	83849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_004307	TTC	2	6	89579	89584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004307	TCG	2	6	89590	89595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004307	CAC	2	6	89662	89667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_004307	ATC	2	6	89668	89673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004307	GGA	2	6	89677	89682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004307	CTC	2	6	90992	90997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_004307	ATT	2	6	91052	91057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004307	GGC	2	6	91089	91094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004307	GCG	2	6	91105	91110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004307	GGT	2	6	93389	93394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004307	AAT	2	6	94077	94082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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