MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 33320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	TTC	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464629
2	NC_004307	AAG	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464629
3	NC_004307	GGC	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464629
4	NC_004307	GAC	2	6	154	159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464629
5	NC_004307	GCA	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464629
6	NC_004307	TGT	2	6	249	254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23464629
7	NC_004307	ATC	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464630
8	NC_004307	ATG	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464630
9	NC_004307	CGT	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
10	NC_004307	AAG	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464630
11	NC_004307	CGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464630
12	NC_004307	CAC	3	9	786	794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464630
13	NC_004307	GAA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464630
14	NC_004307	TCG	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
15	NC_004307	GCC	2	6	922	927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
16	NC_004307	GCT	2	6	955	960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
17	NC_004307	CCA	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464630
18	NC_004307	CCG	2	6	974	979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
19	NC_004307	ACA	2	6	1055	1060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464630
20	NC_004307	GAC	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464630
21	NC_004307	CTG	2	6	1180	1185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
22	NC_004307	CAG	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464630
23	NC_004307	GCT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
24	NC_004307	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464630
25	NC_004307	AAC	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464630
26	NC_004307	TGC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
27	NC_004307	CGA	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464630
28	NC_004307	AAG	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464630
29	NC_004307	ACC	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464630
30	NC_004307	GCG	2	6	1640	1645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464630
31	NC_004307	TCA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464630
32	NC_004307	GCC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
33	NC_004307	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
34	NC_004307	GCT	2	6	1783	1788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
35	NC_004307	GCC	2	6	1846	1851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
36	NC_004307	TCA	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464630
37	NC_004307	CGC	2	6	1965	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
38	NC_004307	CTG	2	6	1990	1995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
39	NC_004307	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
40	NC_004307	CGC	2	6	2046	2051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
41	NC_004307	ACC	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464630
42	NC_004307	CGT	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
43	NC_004307	CAA	2	6	2094	2099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464630
44	NC_004307	CTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464630
45	NC_004307	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464630
46	NC_004307	CTG	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464631
47	NC_004307	GCC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464631
48	NC_004307	GCC	2	6	2446	2451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464631
49	NC_004307	GAT	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464631
50	NC_004307	CAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464632
51	NC_004307	AAC	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464632
52	NC_004307	TGC	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464632
53	NC_004307	CAG	3	9	2810	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464632
54	NC_004307	GCG	2	6	2827	2832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464632
55	NC_004307	CTG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464632
56	NC_004307	GGC	2	6	2990	2995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464632
57	NC_004307	TGG	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464632
58	NC_004307	TCG	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464632
59	NC_004307	CAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464632
60	NC_004307	CCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464632
61	NC_004307	ATC	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464632
62	NC_004307	TGG	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464632
63	NC_004307	TCA	3	9	3292	3300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464632
64	NC_004307	TGG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464632
65	NC_004307	AAG	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464632
66	NC_004307	AGA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464632
67	NC_004307	TTG	3	9	3437	3445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23464633
68	NC_004307	CGA	3	9	3447	3455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464633
69	NC_004307	CTG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464633
70	NC_004307	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464633
71	NC_004307	TGC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464633
72	NC_004307	GAC	2	6	3673	3678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464633
73	NC_004307	CGG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464633
74	NC_004307	ATT	2	6	3811	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23464633
75	NC_004307	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464633
76	NC_004307	GCT	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464633
77	NC_004307	GCG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464633
78	NC_004307	TCG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464633
79	NC_004307	CGA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464633
80	NC_004307	GGC	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464633
81	NC_004307	GAA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464633
82	NC_004307	AGC	2	6	4342	4347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464634
83	NC_004307	TGG	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464634
84	NC_004307	TGC	2	6	4373	4378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464634
85	NC_004307	AAC	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464634
86	NC_004307	TGC	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464634
87	NC_004307	TGG	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464634
88	NC_004307	CAA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464634
89	NC_004307	CTG	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464634
90	NC_004307	ATC	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464634
91	NC_004307	GCC	2	6	4831	4836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
92	NC_004307	GTG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464634
93	NC_004307	CGG	2	6	5001	5006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464634
94	NC_004307	ATC	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464634
95	NC_004307	CGC	2	6	5042	5047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
96	NC_004307	CCG	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
97	NC_004307	GCC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
98	NC_004307	AGG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23464634
99	NC_004307	ACC	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464634
100	NC_004307	GCC	2	6	5263	5268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
101	NC_004307	TTG	2	6	5381	5386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23464634
102	NC_004307	CTG	2	6	5392	5397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464634
103	NC_004307	TCG	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464634
104	NC_004307	CGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464634
105	NC_004307	CGC	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
106	NC_004307	CCG	2	6	5561	5566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
107	NC_004307	GGT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464634
108	NC_004307	GCG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464634
109	NC_004307	GCC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
110	NC_004307	GTG	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464634
111	NC_004307	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464634
112	NC_004307	AGA	2	6	6107	6112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464634
113	NC_004307	CTT	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464634
114	NC_004307	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464635
115	NC_004307	CAC	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464635
116	NC_004307	GTG	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23464635
117	NC_004307	CGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464635
118	NC_004307	GCC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464635
119	NC_004307	TCA	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464635
120	NC_004307	CTG	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464635
121	NC_004307	TGC	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464635
122	NC_004307	ACC	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23464636
123	NC_004307	TGC	2	6	6691	6696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464636
124	NC_004307	CGA	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464636
125	NC_004307	CGC	2	6	6779	6784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464636
126	NC_004307	ACG	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464636
127	NC_004307	TCC	2	6	6867	6872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464636
128	NC_004307	GCC	2	6	6899	6904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464636
129	NC_004307	ACG	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464636
130	NC_004307	CCG	2	6	7061	7066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464636
131	NC_004307	CCG	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464636
132	NC_004307	TTC	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464636
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134	NC_004307	GCG	2	6	7285	7290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464636
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140	NC_004307	TGA	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23464636
141	NC_004307	CGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464636
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146	NC_004307	GAC	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464636
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150	NC_004307	CAG	2	6	8239	8244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23464637
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153	NC_004307	CTT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464637
154	NC_004307	CGG	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464637
155	NC_004307	GCG	2	6	8346	8351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23464637
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163	NC_004307	CCT	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464637
164	NC_004307	CTG	2	6	9143	9148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23464638
165	NC_004307	GCC	2	6	9179	9184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23464638
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260	NC_004307	TAC	2	6	15007	15012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23464641
261	NC_004307	GAA	2	6	15047	15052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23464641
262	NC_004307	CCT	2	6	15120	15125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23464641
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264	NC_004307	TTC	2	6	15158	15163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23464641
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500	NC_004307	CAA	2	6	31953	31958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23464654

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