MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	A	6	6	3219	3224	100 %	0 %	0 %	0 %	23464632
2	NC_004307	A	6	6	4503	4508	100 %	0 %	0 %	0 %	23464634
3	NC_004307	C	6	6	15894	15899	0 %	0 %	0 %	100 %	23464641
4	NC_004307	A	6	6	21097	21102	100 %	0 %	0 %	0 %	23464645
5	NC_004307	A	6	6	32982	32987	100 %	0 %	0 %	0 %	23464655
6	NC_004307	A	6	6	34106	34111	100 %	0 %	0 %	0 %	23464656
7	NC_004307	A	6	6	39163	39168	100 %	0 %	0 %	0 %	23464659
8	NC_004307	T	6	6	40963	40968	0 %	100 %	0 %	0 %	23464660
9	NC_004307	A	6	6	46700	46705	100 %	0 %	0 %	0 %	23464664
10	NC_004307	A	6	6	83271	83276	100 %	0 %	0 %	0 %	23464693
11	NC_004307	G	6	6	98801	98806	0 %	0 %	100 %	0 %	23464705
12	NC_004307	G	6	6	122149	122154	0 %	0 %	100 %	0 %	23464726
13	NC_004307	A	6	6	123191	123196	100 %	0 %	0 %	0 %	23464728
14	NC_004307	A	6	6	143266	143271	100 %	0 %	0 %	0 %	23464743
15	NC_004307	T	6	6	150628	150633	0 %	100 %	0 %	0 %	23464751
16	NC_004307	G	6	6	151734	151739	0 %	0 %	100 %	0 %	23464752
17	NC_004307	A	6	6	152826	152831	100 %	0 %	0 %	0 %	23464753
18	NC_004307	A	6	6	153289	153294	100 %	0 %	0 %	0 %	23464753
19	NC_004307	A	6	6	172276	172281	100 %	0 %	0 %	0 %	23465860
20	NC_004307	T	6	6	185567	185572	0 %	100 %	0 %	0 %	23465870
21	NC_004307	T	6	6	207607	207612	0 %	100 %	0 %	0 %	23465886
22	NC_004307	G	6	6	224020	224025	0 %	0 %	100 %	0 %	23465895
23	NC_004307	T	6	6	224510	224515	0 %	100 %	0 %	0 %	23465895
24	NC_004307	T	6	6	246871	246876	0 %	100 %	0 %	0 %	23465910
25	NC_004307	T	6	6	335496	335501	0 %	100 %	0 %	0 %	23465981
26	NC_004307	T	6	6	337662	337667	0 %	100 %	0 %	0 %	23465983
27	NC_004307	G	7	7	357087	357093	0 %	0 %	100 %	0 %	23465993
28	NC_004307	C	6	6	358680	358685	0 %	0 %	0 %	100 %	23465995
29	NC_004307	T	6	6	365977	365982	0 %	100 %	0 %	0 %	23466000
30	NC_004307	T	6	6	367095	367100	0 %	100 %	0 %	0 %	23466002
31	NC_004307	T	6	6	367187	367192	0 %	100 %	0 %	0 %	23466002
32	NC_004307	A	6	6	395181	395186	100 %	0 %	0 %	0 %	23466025
33	NC_004307	A	7	7	397880	397886	100 %	0 %	0 %	0 %	23466026
34	NC_004307	T	6	6	411666	411671	0 %	100 %	0 %	0 %	23466039
35	NC_004307	A	6	6	444734	444739	100 %	0 %	0 %	0 %	23466056
36	NC_004307	T	6	6	463313	463318	0 %	100 %	0 %	0 %	23465272
37	NC_004307	A	6	6	482938	482943	100 %	0 %	0 %	0 %	23465284
38	NC_004307	T	6	6	501520	501525	0 %	100 %	0 %	0 %	23465300
39	NC_004307	A	6	6	506541	506546	100 %	0 %	0 %	0 %	23465303
40	NC_004307	T	6	6	549661	549666	0 %	100 %	0 %	0 %	23465344
41	NC_004307	C	6	6	552406	552411	0 %	0 %	0 %	100 %	23465348
42	NC_004307	T	6	6	558394	558399	0 %	100 %	0 %	0 %	23465355
43	NC_004307	C	6	6	578986	578991	0 %	0 %	0 %	100 %	23465373
44	NC_004307	A	6	6	589536	589541	100 %	0 %	0 %	0 %	23465384
45	NC_004307	C	6	6	590158	590163	0 %	0 %	0 %	100 %	23465384
46	NC_004307	A	6	6	590176	590181	100 %	0 %	0 %	0 %	23465384
47	NC_004307	T	6	6	592193	592198	0 %	100 %	0 %	0 %	23465388
48	NC_004307	T	6	6	592392	592397	0 %	100 %	0 %	0 %	23465388
49	NC_004307	T	6	6	592807	592812	0 %	100 %	0 %	0 %	23465389
50	NC_004307	T	7	7	592888	592894	0 %	100 %	0 %	0 %	23465389
51	NC_004307	T	6	6	593000	593005	0 %	100 %	0 %	0 %	23465389
52	NC_004307	A	7	7	608060	608066	100 %	0 %	0 %	0 %	23465405
53	NC_004307	A	6	6	608130	608135	100 %	0 %	0 %	0 %	23465405
54	NC_004307	A	6	6	624478	624483	100 %	0 %	0 %	0 %	23465418
55	NC_004307	T	7	7	626744	626750	0 %	100 %	0 %	0 %	23465419
56	NC_004307	T	6	6	664643	664648	0 %	100 %	0 %	0 %	23465451
57	NC_004307	T	6	6	666938	666943	0 %	100 %	0 %	0 %	23465453
58	NC_004307	T	6	6	668457	668462	0 %	100 %	0 %	0 %	23465455
59	NC_004307	T	6	6	708841	708846	0 %	100 %	0 %	0 %	23465488
60	NC_004307	T	7	7	708896	708902	0 %	100 %	0 %	0 %	23465488
61	NC_004307	T	6	6	716048	716053	0 %	100 %	0 %	0 %	23465492
62	NC_004307	T	6	6	719458	719463	0 %	100 %	0 %	0 %	23465495
63	NC_004307	T	6	6	728359	728364	0 %	100 %	0 %	0 %	23465502
64	NC_004307	T	6	6	731819	731824	0 %	100 %	0 %	0 %	23465504
65	NC_004307	T	6	6	746410	746415	0 %	100 %	0 %	0 %	23465515
66	NC_004307	T	6	6	802784	802789	0 %	100 %	0 %	0 %	23465554
67	NC_004307	C	6	6	804538	804543	0 %	0 %	0 %	100 %	23465556
68	NC_004307	T	6	6	808213	808218	0 %	100 %	0 %	0 %	23465559
69	NC_004307	A	6	6	821302	821307	100 %	0 %	0 %	0 %	23465570
70	NC_004307	C	6	6	829728	829733	0 %	0 %	0 %	100 %	23465577
71	NC_004307	T	6	6	843138	843143	0 %	100 %	0 %	0 %	23465589
72	NC_004307	T	6	6	843471	843476	0 %	100 %	0 %	0 %	23465589
73	NC_004307	T	6	6	848218	848223	0 %	100 %	0 %	0 %	23465592
74	NC_004307	T	6	6	850283	850288	0 %	100 %	0 %	0 %	23465593
75	NC_004307	A	6	6	851666	851671	100 %	0 %	0 %	0 %	23465594
76	NC_004307	A	6	6	860091	860096	100 %	0 %	0 %	0 %	23465600
77	NC_004307	A	6	6	860206	860211	100 %	0 %	0 %	0 %	23465600
78	NC_004307	T	6	6	862690	862695	0 %	100 %	0 %	0 %	23465603
79	NC_004307	T	6	6	862809	862814	0 %	100 %	0 %	0 %	23465603
80	NC_004307	A	6	6	866056	866061	100 %	0 %	0 %	0 %	23465605
81	NC_004307	A	6	6	912264	912269	100 %	0 %	0 %	0 %	23465649
82	NC_004307	C	6	6	940766	940771	0 %	0 %	0 %	100 %	23465674
83	NC_004307	T	6	6	978078	978083	0 %	100 %	0 %	0 %	23465701
84	NC_004307	T	7	7	1013090	1013096	0 %	100 %	0 %	0 %	23465727
85	NC_004307	A	6	6	1045483	1045488	100 %	0 %	0 %	0 %	23465754
86	NC_004307	G	6	6	1052205	1052210	0 %	0 %	100 %	0 %	23465759
87	NC_004307	T	6	6	1074207	1074212	0 %	100 %	0 %	0 %	23465767
88	NC_004307	G	6	6	1075179	1075184	0 %	0 %	100 %	0 %	23465768
89	NC_004307	A	6	6	1075356	1075361	100 %	0 %	0 %	0 %	23465768
90	NC_004307	A	6	6	1118651	1118656	100 %	0 %	0 %	0 %	23465798
91	NC_004307	A	6	6	1119379	1119384	100 %	0 %	0 %	0 %	23465799
92	NC_004307	A	6	6	1122195	1122200	100 %	0 %	0 %	0 %	23465802
93	NC_004307	T	6	6	1130468	1130473	0 %	100 %	0 %	0 %	23464832
94	NC_004307	T	6	6	1131037	1131042	0 %	100 %	0 %	0 %	23464832
95	NC_004307	A	6	6	1131224	1131229	100 %	0 %	0 %	0 %	23464832
96	NC_004307	T	6	6	1135772	1135777	0 %	100 %	0 %	0 %	23464837
97	NC_004307	A	6	6	1136174	1136179	100 %	0 %	0 %	0 %	23464837
98	NC_004307	T	7	7	1136348	1136354	0 %	100 %	0 %	0 %	23464837
99	NC_004307	A	6	6	1136519	1136524	100 %	0 %	0 %	0 %	23464837
100	NC_004307	A	6	6	1137136	1137141	100 %	0 %	0 %	0 %	23464837
101	NC_004307	T	7	7	1137405	1137411	0 %	100 %	0 %	0 %	23464838
102	NC_004307	A	6	6	1138117	1138122	100 %	0 %	0 %	0 %	23464838
103	NC_004307	T	7	7	1138696	1138702	0 %	100 %	0 %	0 %	23464838
104	NC_004307	A	6	6	1138951	1138956	100 %	0 %	0 %	0 %	23464838
105	NC_004307	T	6	6	1139113	1139118	0 %	100 %	0 %	0 %	23464839
106	NC_004307	T	6	6	1140689	1140694	0 %	100 %	0 %	0 %	23464840
107	NC_004307	A	6	6	1141030	1141035	100 %	0 %	0 %	0 %	23464840
108	NC_004307	T	6	6	1141226	1141231	0 %	100 %	0 %	0 %	23464841
109	NC_004307	A	6	6	1141317	1141322	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
110	NC_004307	A	6	6	1141504	1141509	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
111	NC_004307	A	6	6	1141841	1141846	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
112	NC_004307	A	6	6	1141892	1141897	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
113	NC_004307	A	6	6	1142007	1142012	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
114	NC_004307	A	6	6	1142232	1142237	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
115	NC_004307	A	6	6	1142253	1142258	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
116	NC_004307	A	7	7	1142411	1142417	100 %	0 %	0 %	0 %	23464841
117	NC_004307	A	6	6	1142514	1142519	100 %	0 %	0 %	0 %	23464842
118	NC_004307	T	6	6	1145261	1145266	0 %	100 %	0 %	0 %	23464844
119	NC_004307	A	6	6	1146126	1146131	100 %	0 %	0 %	0 %	23464844
120	NC_004307	T	6	6	1158691	1158696	0 %	100 %	0 %	0 %	23464853
121	NC_004307	A	6	6	1164983	1164988	100 %	0 %	0 %	0 %	23464856
122	NC_004307	A	6	6	1165061	1165066	100 %	0 %	0 %	0 %	23464856
123	NC_004307	A	6	6	1175199	1175204	100 %	0 %	0 %	0 %	23464864
124	NC_004307	T	6	6	1182767	1182772	0 %	100 %	0 %	0 %	23464866
125	NC_004307	T	6	6	1197882	1197887	0 %	100 %	0 %	0 %	23464878
126	NC_004307	A	6	6	1227571	1227576	100 %	0 %	0 %	0 %	23464903
127	NC_004307	T	6	6	1233353	1233358	0 %	100 %	0 %	0 %	23464909
128	NC_004307	T	6	6	1256807	1256812	0 %	100 %	0 %	0 %	23464929
129	NC_004307	G	7	7	1281390	1281396	0 %	0 %	100 %	0 %	23464949
130	NC_004307	T	6	6	1287035	1287040	0 %	100 %	0 %	0 %	23464955
131	NC_004307	T	6	6	1296852	1296857	0 %	100 %	0 %	0 %	23464966
132	NC_004307	C	6	6	1304594	1304599	0 %	0 %	0 %	100 %	23464975
133	NC_004307	A	6	6	1312617	1312622	100 %	0 %	0 %	0 %	23464983
134	NC_004307	T	6	6	1326588	1326593	0 %	100 %	0 %	0 %	23464993
135	NC_004307	T	6	6	1342471	1342476	0 %	100 %	0 %	0 %	23465005
136	NC_004307	C	6	6	1362038	1362043	0 %	0 %	0 %	100 %	23465019
137	NC_004307	C	6	6	1381114	1381119	0 %	0 %	0 %	100 %	23465031
138	NC_004307	A	7	7	1388837	1388843	100 %	0 %	0 %	0 %	23465037
139	NC_004307	A	7	7	1424021	1424027	100 %	0 %	0 %	0 %	23465059
140	NC_004307	T	6	6	1460259	1460264	0 %	100 %	0 %	0 %	23465086
141	NC_004307	C	7	7	1460632	1460638	0 %	0 %	0 %	100 %	23465087
142	NC_004307	T	6	6	1462823	1462828	0 %	100 %	0 %	0 %	23465090
143	NC_004307	C	6	6	1476284	1476289	0 %	0 %	0 %	100 %	23465103
144	NC_004307	A	7	7	1500480	1500486	100 %	0 %	0 %	0 %	23465120
145	NC_004307	G	6	6	1523199	1523204	0 %	0 %	100 %	0 %	23465135
146	NC_004307	G	6	6	1528856	1528861	0 %	0 %	100 %	0 %	23465139
147	NC_004307	A	6	6	1538011	1538016	100 %	0 %	0 %	0 %	23465148
148	NC_004307	T	6	6	1540147	1540152	0 %	100 %	0 %	0 %	23465149
149	NC_004307	T	6	6	1540317	1540322	0 %	100 %	0 %	0 %	23465149
150	NC_004307	C	6	6	1548992	1548997	0 %	0 %	0 %	100 %	23465158
151	NC_004307	G	6	6	1553455	1553460	0 %	0 %	100 %	0 %	23465163
152	NC_004307	A	6	6	1559596	1559601	100 %	0 %	0 %	0 %	23465168
153	NC_004307	G	6	6	1577155	1577160	0 %	0 %	100 %	0 %	23465183
154	NC_004307	T	7	7	1584806	1584812	0 %	100 %	0 %	0 %	23465188
155	NC_004307	G	6	6	1588102	1588107	0 %	0 %	100 %	0 %	23465190
156	NC_004307	A	6	6	1588169	1588174	100 %	0 %	0 %	0 %	23465190
157	NC_004307	T	6	6	1588839	1588844	0 %	100 %	0 %	0 %	23465191
158	NC_004307	T	7	7	1591127	1591133	0 %	100 %	0 %	0 %	23465194
159	NC_004307	C	6	6	1614888	1614893	0 %	0 %	0 %	100 %	23465215
160	NC_004307	T	6	6	1621178	1621183	0 %	100 %	0 %	0 %	23465220
161	NC_004307	T	6	6	1623913	1623918	0 %	100 %	0 %	0 %	23465222
162	NC_004307	T	7	7	1624062	1624068	0 %	100 %	0 %	0 %	23465222
163	NC_004307	T	6	6	1626839	1626844	0 %	100 %	0 %	0 %	23465226
164	NC_004307	G	6	6	1629840	1629845	0 %	0 %	100 %	0 %	23465230
165	NC_004307	T	6	6	1635601	1635606	0 %	100 %	0 %	0 %	23465234
166	NC_004307	G	6	6	1637769	1637774	0 %	0 %	100 %	0 %	23465235
167	NC_004307	C	6	6	1648402	1648407	0 %	0 %	0 %	100 %	23465243
168	NC_004307	G	6	6	1649062	1649067	0 %	0 %	100 %	0 %	23465243
169	NC_004307	A	6	6	1673113	1673118	100 %	0 %	0 %	0 %	23465258
170	NC_004307	G	7	7	1765031	1765037	0 %	0 %	100 %	0 %	23464778
171	NC_004307	A	6	6	1771810	1771815	100 %	0 %	0 %	0 %	23464784
172	NC_004307	G	6	6	1775031	1775036	0 %	0 %	100 %	0 %	23464787
173	NC_004307	A	6	6	1826612	1826617	100 %	0 %	0 %	0 %	23464820
174	NC_004307	A	6	6	1826772	1826777	100 %	0 %	0 %	0 %	23464820
175	NC_004307	A	6	6	1831003	1831008	100 %	0 %	0 %	0 %	23464824
176	NC_004307	G	11	11	1834821	1834831	0 %	0 %	100 %	0 %	23464827
177	NC_004307	A	6	6	1835046	1835051	100 %	0 %	0 %	0 %	23464827
178	NC_004307	A	6	6	1862228	1862233	100 %	0 %	0 %	0 %	23465817
179	NC_004307	A	6	6	1918738	1918743	100 %	0 %	0 %	0 %	23466085
180	NC_004307	A	6	6	1921511	1921516	100 %	0 %	0 %	0 %	23466088
181	NC_004307	A	7	7	1939205	1939211	100 %	0 %	0 %	0 %	23466093
182	NC_004307	A	6	6	1947157	1947162	100 %	0 %	0 %	0 %	23466096
183	NC_004307	A	6	6	1951164	1951169	100 %	0 %	0 %	0 %	23466097
184	NC_004307	T	7	7	1951215	1951221	0 %	100 %	0 %	0 %	23466097
185	NC_004307	A	6	6	1971178	1971183	100 %	0 %	0 %	0 %	23466111
186	NC_004307	G	6	6	1984860	1984865	0 %	0 %	100 %	0 %	23466122
187	NC_004307	C	6	6	1990510	1990515	0 %	0 %	0 %	100 %	23466126
188	NC_004307	A	6	6	2014830	2014835	100 %	0 %	0 %	0 %	23466160
189	NC_004307	A	6	6	2016816	2016821	100 %	0 %	0 %	0 %	23466161
190	NC_004307	A	6	6	2017876	2017881	100 %	0 %	0 %	0 %	23466161
191	NC_004307	T	6	6	2018771	2018776	0 %	100 %	0 %	0 %	23466162
192	NC_004307	A	6	6	2027582	2027587	100 %	0 %	0 %	0 %	23466168
193	NC_004307	G	6	6	2031522	2031527	0 %	0 %	100 %	0 %	23466173
194	NC_004307	T	6	6	2031924	2031929	0 %	100 %	0 %	0 %	23466173
195	NC_004307	A	7	7	2059782	2059788	100 %	0 %	0 %	0 %	23466195
196	NC_004307	G	6	6	2061913	2061918	0 %	0 %	100 %	0 %	23466196
197	NC_004307	G	6	6	2073645	2073650	0 %	0 %	100 %	0 %	23466205
198	NC_004307	G	6	6	2082760	2082765	0 %	0 %	100 %	0 %	23466214
199	NC_004307	G	6	6	2105828	2105833	0 %	0 %	100 %	0 %	23466233
200	NC_004307	T	6	6	2110953	2110958	0 %	100 %	0 %	0 %	23466237
201	NC_004307	A	6	6	2132713	2132718	100 %	0 %	0 %	0 %	23466258
202	NC_004307	C	6	6	2132981	2132986	0 %	0 %	0 %	100 %	23466258
203	NC_004307	A	6	6	2162684	2162689	100 %	0 %	0 %	0 %	23466281
204	NC_004307	T	6	6	2167544	2167549	0 %	100 %	0 %	0 %	23466285
205	NC_004307	T	6	6	2170617	2170622	0 %	100 %	0 %	0 %	23466288
206	NC_004307	A	6	6	2194288	2194293	100 %	0 %	0 %	0 %	23466306
207	NC_004307	T	6	6	2214907	2214912	0 %	100 %	0 %	0 %	23466323
208	NC_004307	A	6	6	2220173	2220178	100 %	0 %	0 %	0 %	23466327
209	NC_004307	A	6	6	2220189	2220194	100 %	0 %	0 %	0 %	23466327
210	NC_004307	A	6	6	2225086	2225091	100 %	0 %	0 %	0 %	23466329
211	NC_004307	A	6	6	2249647	2249652	100 %	0 %	0 %	0 %	23466350
212	NC_004307	A	6	6	2254190	2254195	100 %	0 %	0 %	0 %	23466355
213	NC_004307	C	6	6	2254934	2254939	0 %	0 %	0 %	100 %	23466355

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.