MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10L

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004252	GCCG	2	8	1383	1390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004252	CGGT	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004252	GCAT	2	8	1592	1599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004252	CGGG	2	8	1935	1942	0 %	0 %	75 %	25 %	23307855
5	NC_004252	CGAG	2	8	2019	2026	25 %	0 %	50 %	25 %	23307855
6	NC_004252	CAAT	2	8	2202	2209	50 %	25 %	0 %	25 %	23307855
7	NC_004252	TACA	2	8	2215	2222	50 %	25 %	0 %	25 %	23307855
8	NC_004252	CGTT	2	8	2490	2497	0 %	50 %	25 %	25 %	23307856
9	NC_004252	GCCG	2	8	3070	3077	0 %	0 %	50 %	50 %	23307856
10	NC_004252	CGTC	2	8	3177	3184	0 %	25 %	25 %	50 %	23307856
11	NC_004252	GAGG	2	8	3597	3604	25 %	0 %	75 %	0 %	23307857
12	NC_004252	CGCC	2	8	3629	3636	0 %	0 %	25 %	75 %	23307857
13	NC_004252	CGGA	2	8	3859	3866	25 %	0 %	50 %	25 %	23307857
14	NC_004252	TACA	2	8	4048	4055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004252	TGAT	2	8	4116	4123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004252	GTGG	2	8	4748	4755	0 %	25 %	75 %	0 %	23307858
17	NC_004252	GGAA	2	8	5204	5211	50 %	0 %	50 %	0 %	23307858
18	NC_004252	GCTC	2	8	5661	5668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_004252	CTGC	2	8	6618	6625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004252	CCCT	2	8	6792	6799	0 %	25 %	0 %	75 %	23307860
21	NC_004252	GGCC	2	8	6926	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	23307860
22	NC_004252	CCGT	2	8	6937	6944	0 %	25 %	25 %	50 %	23307860
23	NC_004252	CGGC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	50 %	50 %	23307860
24	NC_004252	AGGC	2	8	7510	7517	25 %	0 %	50 %	25 %	23307861
25	NC_004252	GAGG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	75 %	0 %	23307861
26	NC_004252	CGCC	2	8	7665	7672	0 %	0 %	25 %	75 %	23307861
27	NC_004252	CCAG	2	8	8645	8652	25 %	0 %	25 %	50 %	23307862
28	NC_004252	TGAT	2	8	9339	9346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.