MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum DJO10A plasmid pDOJH10L

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004252	CTG	2	6	1847	1852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307855
2	NC_004252	ACC	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307855
3	NC_004252	TGG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307855
4	NC_004252	TGC	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307855
5	NC_004252	ATT	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23307855
6	NC_004252	CGG	2	6	2425	2430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
7	NC_004252	TCC	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307856
8	NC_004252	GGC	2	6	2589	2594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
9	NC_004252	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307856
10	NC_004252	GCC	2	6	2722	2727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
11	NC_004252	GAG	2	6	2750	2755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307856
12	NC_004252	GCC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
13	NC_004252	TGG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307856
14	NC_004252	GTT	2	6	2981	2986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307856
15	NC_004252	TCT	2	6	3031	3036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307856
16	NC_004252	CGC	2	6	3110	3115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307856
17	NC_004252	CGA	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307856
18	NC_004252	TCC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307856
19	NC_004252	TCT	2	6	3307	3312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307856
20	NC_004252	GCA	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307856
21	NC_004252	TCG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307856
22	NC_004252	GCC	2	6	3585	3590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307857
23	NC_004252	CGA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
24	NC_004252	TGG	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307857
25	NC_004252	GAC	3	9	3831	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
26	NC_004252	ACG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307857
27	NC_004252	GCC	2	6	3872	3877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307857
28	NC_004252	ACG	2	6	4481	4486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307858
29	NC_004252	TCA	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
30	NC_004252	CAT	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
31	NC_004252	CCG	2	6	4528	4533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307858
32	NC_004252	TCG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307858
33	NC_004252	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23307858
34	NC_004252	TCG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307858
35	NC_004252	ACT	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
36	NC_004252	AAC	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307858
37	NC_004252	CCA	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307858
38	NC_004252	TGG	2	6	5036	5041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307858
39	NC_004252	CTA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307858
40	NC_004252	AGC	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307858
41	NC_004252	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307858
42	NC_004252	AAG	2	6	5150	5155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307858
43	NC_004252	GAG	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307858
44	NC_004252	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307858
45	NC_004252	GTT	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307859
46	NC_004252	TGG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307859
47	NC_004252	GCA	2	6	6006	6011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307859
48	NC_004252	GGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
49	NC_004252	GAT	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23307859
50	NC_004252	GGC	2	6	6085	6090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
51	NC_004252	CTC	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307859
52	NC_004252	CTC	2	6	6113	6118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307859
53	NC_004252	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307859
54	NC_004252	GGC	2	6	6210	6215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307859
55	NC_004252	GCT	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307860
56	NC_004252	GCC	2	6	6732	6737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307860
57	NC_004252	CGA	2	6	6763	6768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
58	NC_004252	TTG	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23307860
59	NC_004252	CTC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23307860
60	NC_004252	CCA	2	6	6910	6915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307860
61	NC_004252	TCT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23307860
62	NC_004252	CGG	2	6	6979	6984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307860
63	NC_004252	GCA	2	6	7015	7020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
64	NC_004252	GCA	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307860
65	NC_004252	CGC	2	6	7069	7074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307860
66	NC_004252	GCC	2	6	7621	7626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307861
67	NC_004252	CGA	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307861
68	NC_004252	TGG	2	6	7691	7696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23307861
69	NC_004252	ACC	2	6	7753	7758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23307861
70	NC_004252	GAC	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307861
71	NC_004252	CAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
72	NC_004252	GAA	2	6	8328	8333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307862
73	NC_004252	GAG	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
74	NC_004252	GAA	2	6	8448	8453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23307862
75	NC_004252	CAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
76	NC_004252	CTG	2	6	8503	8508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307862
77	NC_004252	ATC	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307862
78	NC_004252	AGG	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
79	NC_004252	GAG	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
80	NC_004252	CGA	2	6	8763	8768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307862
81	NC_004252	CAA	2	6	8823	8828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23307862
82	NC_004252	GAG	2	6	8851	8856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
83	NC_004252	GGA	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307862
84	NC_004252	CAT	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307862
85	NC_004252	GAG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23307863
86	NC_004252	AGC	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
87	NC_004252	GCG	2	6	9480	9485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
88	NC_004252	ATC	2	6	9496	9501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23307863
89	NC_004252	GGC	2	6	9508	9513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
90	NC_004252	ACG	2	6	9542	9547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
91	NC_004252	ACG	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
92	NC_004252	GCT	2	6	9582	9587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307863
93	NC_004252	GCC	2	6	9607	9612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23307863
94	NC_004252	CGG	2	6	9665	9670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23307863
95	NC_004252	TGC	2	6	9674	9679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23307863
96	NC_004252	AGC	2	6	9722	9727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863
97	NC_004252	GCA	3	9	9771	9779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23307863

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.