MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pseudomonas protegens Pf-5 chromosome

Total Repeats: 4758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004129	ACCAC	2	10	1536	1545	40 %	0 %	0 %	60 %	70733514
2	NC_004129	ATGGA	2	10	6664	6673	40 %	20 %	40 %	0 %	70733518
3	NC_004129	GTGCT	2	10	7194	7203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_004129	GCGAC	2	10	8195	8204	20 %	0 %	40 %	40 %	70733521
5	NC_004129	CTGCC	2	10	9307	9316	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_004129	CCTGT	2	10	9678	9687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_004129	TGCCC	2	10	10565	10574	0 %	20 %	20 %	60 %	70733522
8	NC_004129	GCCGG	2	10	11227	11236	0 %	0 %	60 %	40 %	70733523
9	NC_004129	AGCCG	2	10	11456	11465	20 %	0 %	40 %	40 %	70733523
10	NC_004129	TGGCG	2	10	16562	16571	0 %	20 %	60 %	20 %	70733526
11	NC_004129	CCCAG	2	10	17339	17348	20 %	0 %	20 %	60 %	70733527
12	NC_004129	GCCTT	2	10	21164	21173	0 %	40 %	20 %	40 %	70733532
13	NC_004129	GTGCG	2	10	22543	22552	0 %	20 %	60 %	20 %	70733533
14	NC_004129	GAAAA	2	10	23948	23957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004129	TGGCC	2	10	26439	26448	0 %	20 %	40 %	40 %	346642646
16	NC_004129	GGGTG	2	10	28851	28860	0 %	20 %	80 %	0 %	70733540
17	NC_004129	GGCCA	2	10	32184	32193	20 %	0 %	40 %	40 %	70733542
18	NC_004129	TGAGG	2	10	34648	34657	20 %	20 %	60 %	0 %	70733544
19	NC_004129	GTCCA	2	10	36008	36017	20 %	20 %	20 %	40 %	70733546
20	NC_004129	GCGCC	2	10	39210	39219	0 %	0 %	40 %	60 %	70733550
21	NC_004129	TGAGC	2	10	43277	43286	20 %	20 %	40 %	20 %	70733556
22	NC_004129	TGTGG	2	10	45001	45010	0 %	40 %	60 %	0 %	70733560
23	NC_004129	TCATT	2	10	49789	49798	20 %	60 %	0 %	20 %	346642648
24	NC_004129	CGATC	2	10	51171	51180	20 %	20 %	20 %	40 %	70733566
25	NC_004129	GCAGC	2	10	53152	53161	20 %	0 %	40 %	40 %	70733568
26	NC_004129	CACCG	2	10	54093	54102	20 %	0 %	20 %	60 %	70733568
27	NC_004129	GCGGG	2	10	55673	55682	0 %	0 %	80 %	20 %	70733570
28	NC_004129	TGCCC	2	10	58027	58036	0 %	20 %	20 %	60 %	70733572
29	NC_004129	ACCAC	2	10	60636	60645	40 %	0 %	0 %	60 %	70733573
30	NC_004129	AACGC	2	10	60837	60846	40 %	0 %	20 %	40 %	70733573
31	NC_004129	TGGAG	2	10	62533	62542	20 %	20 %	60 %	0 %	70733574
32	NC_004129	CCCGA	2	10	63717	63726	20 %	0 %	20 %	60 %	70733576
33	NC_004129	GCCTG	2	10	66541	66550	0 %	20 %	40 %	40 %	70733580
34	NC_004129	GCTGG	2	10	67309	67318	0 %	20 %	60 %	20 %	70733581
35	NC_004129	CACTG	2	10	67833	67842	20 %	20 %	20 %	40 %	70733582
36	NC_004129	CTTCA	2	10	68596	68605	20 %	40 %	0 %	40 %	70733584
37	NC_004129	GTGCC	2	10	71250	71259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_004129	CGACC	2	10	72273	72282	20 %	0 %	20 %	60 %	70733586
39	NC_004129	GGGCC	2	10	72576	72585	0 %	0 %	60 %	40 %	70733586
40	NC_004129	CAGCG	2	10	72697	72706	20 %	0 %	40 %	40 %	70733586
41	NC_004129	GCTGC	2	10	73980	73989	0 %	20 %	40 %	40 %	70733587
42	NC_004129	CGGCC	2	10	74341	74350	0 %	0 %	40 %	60 %	70733588
43	NC_004129	GGCGG	2	10	76106	76115	0 %	0 %	80 %	20 %	70733590
44	NC_004129	TCGGC	2	10	76442	76451	0 %	20 %	40 %	40 %	70733591
45	NC_004129	TGGCG	2	10	76518	76527	0 %	20 %	60 %	20 %	70733591
46	NC_004129	TCCAG	2	10	77914	77923	20 %	20 %	20 %	40 %	70733592
47	NC_004129	TGCCT	2	10	81943	81952	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_004129	CAGCA	2	10	84974	84983	40 %	0 %	20 %	40 %	70733598
49	NC_004129	GCGCG	2	10	85048	85057	0 %	0 %	60 %	40 %	70733598
50	NC_004129	ACGCC	2	10	88393	88402	20 %	0 %	20 %	60 %	70733600
51	NC_004129	CGGCC	2	10	89196	89205	0 %	0 %	40 %	60 %	70733601
52	NC_004129	TGCCC	2	10	90268	90277	0 %	20 %	20 %	60 %	70733602
53	NC_004129	GCGCC	2	10	90464	90473	0 %	0 %	40 %	60 %	70733602
54	NC_004129	CCCAG	2	10	91147	91156	20 %	0 %	20 %	60 %	70733602
55	NC_004129	CGGGC	2	10	92347	92356	0 %	0 %	60 %	40 %	70733603
56	NC_004129	CGGCG	2	10	92543	92552	0 %	0 %	60 %	40 %	70733603
57	NC_004129	CACCT	2	10	92961	92970	20 %	20 %	0 %	60 %	70733603
58	NC_004129	AATTT	2	10	93710	93719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004129	CGCCA	2	10	94730	94739	20 %	0 %	20 %	60 %	346642653
60	NC_004129	GGCCT	2	10	96696	96705	0 %	20 %	40 %	40 %	70733607
61	NC_004129	TGGCT	2	10	97091	97100	0 %	40 %	40 %	20 %	70733608
62	NC_004129	GACCC	2	10	97577	97586	20 %	0 %	20 %	60 %	70733608
63	NC_004129	TGCCC	2	10	98398	98407	0 %	20 %	20 %	60 %	70733609
64	NC_004129	GCTGG	2	10	100553	100562	0 %	20 %	60 %	20 %	70733611
65	NC_004129	CATTC	2	10	104258	104267	20 %	40 %	0 %	40 %	70733614
66	NC_004129	GATCA	2	10	105011	105020	40 %	20 %	20 %	20 %	70733615
67	NC_004129	CGCCC	2	10	113948	113957	0 %	0 %	20 %	80 %	70733624
68	NC_004129	GGCCA	2	10	116218	116227	20 %	0 %	40 %	40 %	70733625
69	NC_004129	TCGTG	2	10	123876	123885	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004129	ACCGA	2	10	125589	125598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_004129	AGTCG	2	10	125965	125974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_004129	ATCCC	2	10	127930	127939	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_004129	ATCCC	2	10	128159	128168	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_004129	GTTTT	2	10	128282	128291	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004129	GCTAC	2	10	128912	128921	20 %	20 %	20 %	40 %	70733631
76	NC_004129	GGCCA	2	10	132513	132522	20 %	0 %	40 %	40 %	70733633
77	NC_004129	CTGAT	2	10	132526	132535	20 %	40 %	20 %	20 %	70733633
78	NC_004129	CCAGC	2	10	132894	132903	20 %	0 %	20 %	60 %	70733633
79	NC_004129	GCCAG	2	10	133079	133088	20 %	0 %	40 %	40 %	70733633
80	NC_004129	ATGAA	2	10	134063	134072	60 %	20 %	20 %	0 %	70733635
81	NC_004129	GGCCA	2	10	134368	134377	20 %	0 %	40 %	40 %	70733635
82	NC_004129	GGCCA	2	10	136650	136659	20 %	0 %	40 %	40 %	70733636
83	NC_004129	GCCGG	2	10	136896	136905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_004129	GCATT	2	10	137061	137070	20 %	40 %	20 %	20 %	70733637
85	NC_004129	TGCGG	2	10	138247	138256	0 %	20 %	60 %	20 %	70733638
86	NC_004129	GGTCG	2	10	140343	140352	0 %	20 %	60 %	20 %	70733640
87	NC_004129	CGTGG	2	10	143335	143344	0 %	20 %	60 %	20 %	70733640
88	NC_004129	CTGGG	2	10	153965	153974	0 %	20 %	60 %	20 %	70733640
89	NC_004129	GGTCG	2	10	154662	154671	0 %	20 %	60 %	20 %	70733640
90	NC_004129	GCCGC	2	10	154720	154729	0 %	0 %	40 %	60 %	70733640
91	NC_004129	GGCCG	2	10	154947	154956	0 %	0 %	60 %	40 %	70733640
92	NC_004129	GCCCT	2	10	155461	155470	0 %	20 %	20 %	60 %	70733641
93	NC_004129	GCGTG	2	10	155961	155970	0 %	20 %	60 %	20 %	70733641
94	NC_004129	GCCTG	2	10	156467	156476	0 %	20 %	40 %	40 %	70733641
95	NC_004129	CGGGC	2	10	157017	157026	0 %	0 %	60 %	40 %	70733642
96	NC_004129	ATCGT	2	10	162863	162872	20 %	40 %	20 %	20 %	70733646
97	NC_004129	GTGGC	2	10	163328	163337	0 %	20 %	60 %	20 %	70733646
98	NC_004129	GGCGC	3	15	164625	164639	0 %	0 %	60 %	40 %	70733648
99	NC_004129	TGCCT	2	10	166242	166251	0 %	40 %	20 %	40 %	70733649
100	NC_004129	CTGTC	2	10	166760	166769	0 %	40 %	20 %	40 %	70733649
101	NC_004129	TGAAC	2	10	167625	167634	40 %	20 %	20 %	20 %	70733650
102	NC_004129	GGGCT	2	10	170239	170248	0 %	20 %	60 %	20 %	346642656
103	NC_004129	GCAGC	2	10	170681	170690	20 %	0 %	40 %	40 %	70733653
104	NC_004129	GCGCT	2	10	171759	171768	0 %	20 %	40 %	40 %	70733654
105	NC_004129	AGCGC	2	10	171846	171855	20 %	0 %	40 %	40 %	70733654
106	NC_004129	CAGCG	2	10	173228	173237	20 %	0 %	40 %	40 %	70733654
107	NC_004129	GCCAG	2	10	174391	174400	20 %	0 %	40 %	40 %	70733655
108	NC_004129	GCGTT	2	10	175274	175283	0 %	40 %	40 %	20 %	70733656
109	NC_004129	GGCCA	2	10	175537	175546	20 %	0 %	40 %	40 %	70733656
110	NC_004129	TGACC	2	10	177344	177353	20 %	20 %	20 %	40 %	70733657
111	NC_004129	CCTGG	2	10	178124	178133	0 %	20 %	40 %	40 %	70733657
112	NC_004129	TTCGC	2	10	178215	178224	0 %	40 %	20 %	40 %	70733657
113	NC_004129	GCAGC	2	10	178935	178944	20 %	0 %	40 %	40 %	70733658
114	NC_004129	GCGCG	2	10	179196	179205	0 %	0 %	60 %	40 %	70733658
115	NC_004129	TGCCG	2	10	182143	182152	0 %	20 %	40 %	40 %	70733662
116	NC_004129	GTCTG	2	10	182987	182996	0 %	40 %	40 %	20 %	70733663
117	NC_004129	GGCGC	2	10	184817	184826	0 %	0 %	60 %	40 %	70733665
118	NC_004129	GCGTG	2	10	186554	186563	0 %	20 %	60 %	20 %	346642658
119	NC_004129	AAGCC	2	10	187429	187438	40 %	0 %	20 %	40 %	346642658
120	NC_004129	GGGCG	2	10	188095	188104	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
121	NC_004129	ACGGC	2	10	189414	189423	20 %	0 %	40 %	40 %	70733668
122	NC_004129	ACGGC	2	10	191387	191396	20 %	0 %	40 %	40 %	70733669
123	NC_004129	GCCGA	2	10	192253	192262	20 %	0 %	40 %	40 %	70733669
124	NC_004129	TGTGC	2	10	195030	195039	0 %	40 %	40 %	20 %	70733672
125	NC_004129	TGACC	2	10	197254	197263	20 %	20 %	20 %	40 %	70733673
126	NC_004129	CGTGA	2	10	200465	200474	20 %	20 %	40 %	20 %	70733673
127	NC_004129	TACGG	2	10	203120	203129	20 %	20 %	40 %	20 %	70733673
128	NC_004129	AGTTG	2	10	207091	207100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004129	AAAAT	2	10	207244	207253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004129	CGCGG	2	10	208965	208974	0 %	0 %	60 %	40 %	70733675
131	NC_004129	GCAAG	2	10	209185	209194	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_004129	CAGCT	2	10	211838	211847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004129	GCGAG	2	10	212353	212362	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004129	GGGCC	2	10	212720	212729	0 %	0 %	60 %	40 %	70733680
135	NC_004129	TGGCG	2	10	213292	213301	0 %	20 %	60 %	20 %	70733681
136	NC_004129	AGTGC	2	10	215578	215587	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_004129	GCGCC	2	10	215860	215869	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_004129	CGGCG	2	10	216738	216747	0 %	0 %	60 %	40 %	70733687
139	NC_004129	GTACC	2	10	219348	219357	20 %	20 %	20 %	40 %	70733691
140	NC_004129	CCGGC	2	10	219729	219738	0 %	0 %	40 %	60 %	70733691
141	NC_004129	GGCCT	2	10	220460	220469	0 %	20 %	40 %	40 %	70733691
142	NC_004129	CCCCG	2	10	220795	220804	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
143	NC_004129	AGCGC	2	10	222987	222996	20 %	0 %	40 %	40 %	70733693
144	NC_004129	GCCCA	2	10	225280	225289	20 %	0 %	20 %	60 %	346642660
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146	NC_004129	GCGCC	2	10	227287	227296	0 %	0 %	40 %	60 %	70733696
147	NC_004129	CGGTG	2	10	228421	228430	0 %	20 %	60 %	20 %	70733697
148	NC_004129	GACCC	2	10	228788	228797	20 %	0 %	20 %	60 %	70733698
149	NC_004129	TCCGT	2	10	229825	229834	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_004129	GCTTG	2	10	234387	234396	0 %	40 %	40 %	20 %	70733704
152	NC_004129	GCCCG	2	10	234449	234458	0 %	0 %	40 %	60 %	70733704
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159	NC_004129	CGCTG	2	10	243271	243280	0 %	20 %	40 %	40 %	70733713
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161	NC_004129	CCAGG	2	10	244154	244163	20 %	0 %	40 %	40 %	70733713
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167	NC_004129	GTGGC	2	10	252658	252667	0 %	20 %	60 %	20 %	70733719
168	NC_004129	CGTTC	2	10	253324	253333	0 %	40 %	20 %	40 %	70733719
169	NC_004129	CTGGA	2	10	253986	253995	20 %	20 %	40 %	20 %	70733720
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171	NC_004129	CATGC	2	10	256369	256378	20 %	20 %	20 %	40 %	346642662
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174	NC_004129	CCAGG	2	10	257554	257563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_004129	AACCC	2	10	258071	258080	40 %	0 %	0 %	60 %	346642663
176	NC_004129	TGAGT	2	10	258497	258506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
177	NC_004129	GCGCC	2	10	260825	260834	0 %	0 %	40 %	60 %	70733729
178	NC_004129	GCCGG	2	10	261874	261883	0 %	0 %	60 %	40 %	70733730
179	NC_004129	CGGCG	2	10	263533	263542	0 %	0 %	60 %	40 %	70733732
180	NC_004129	TCGGC	2	10	265866	265875	0 %	20 %	40 %	40 %	70733735
181	NC_004129	CCTGA	2	10	266443	266452	20 %	20 %	20 %	40 %	70733735
182	NC_004129	GGTGA	2	10	269383	269392	20 %	20 %	60 %	0 %	346642664
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184	NC_004129	GAACA	2	10	269950	269959	60 %	0 %	20 %	20 %	346642664
185	NC_004129	GCGCC	2	10	270184	270193	0 %	0 %	40 %	60 %	70733740
186	NC_004129	GCAGT	2	10	270523	270532	20 %	20 %	40 %	20 %	70733740
187	NC_004129	CCGGC	2	10	272075	272084	0 %	0 %	40 %	60 %	70733741
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192	NC_004129	AGGCC	2	10	287948	287957	20 %	0 %	40 %	40 %	70733754
193	NC_004129	TTTTG	2	10	288189	288198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_004129	CACCG	2	10	292856	292865	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
197	NC_004129	CGTGG	2	10	296562	296571	0 %	20 %	60 %	20 %	346642666
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199	NC_004129	CTGGA	2	10	297183	297192	20 %	20 %	40 %	20 %	346642666
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210	NC_004129	TCCTG	2	10	317009	317018	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
211	NC_004129	GCGCG	2	10	321080	321089	0 %	0 %	60 %	40 %	346642667
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224	NC_004129	GCGTT	2	10	345038	345047	0 %	40 %	40 %	20 %	70733802
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241	NC_004129	AAAAT	2	10	363832	363841	80 %	20 %	0 %	0 %	70733819
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261	NC_004129	TGAGT	2	10	387364	387373	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_004129	CCACC	2	10	389260	389269	20 %	0 %	0 %	80 %	70733842
263	NC_004129	TGTGC	2	10	390687	390696	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_004129	GTGCC	2	10	399407	399416	0 %	20 %	40 %	40 %	346642674
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