MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 1731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	TGAAA	2	10	248	257	60 %	20 %	20 %	0 %	22536186
2	NC_004116	AAAAG	2	10	713	722	80 %	0 %	20 %	0 %	22536186
3	NC_004116	AAAAT	2	10	1447	1456	80 %	20 %	0 %	0 %	22536186
4	NC_004116	AAACT	2	10	2030	2039	60 %	20 %	0 %	20 %	22536187
5	NC_004116	CGATT	2	10	2657	2666	20 %	40 %	20 %	20 %	22536187
6	NC_004116	ACAGA	2	10	2932	2941	60 %	0 %	20 %	20 %	22536188
7	NC_004116	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	22536188
8	NC_004116	TGGTA	2	10	4599	4608	20 %	40 %	40 %	0 %	22536191
9	NC_004116	TTTAT	2	10	5848	5857	20 %	80 %	0 %	0 %	22536192
10	NC_004116	TGGGT	2	10	10398	10407	0 %	40 %	60 %	0 %	22536196
11	NC_004116	ACTAT	2	10	12923	12932	40 %	40 %	0 %	20 %	22536199
12	NC_004116	GGATA	2	10	13152	13161	40 %	20 %	40 %	0 %	22536199
13	NC_004116	TCGTG	2	10	17480	17489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004116	GTTAA	2	10	18235	18244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004116	GGGAG	2	10	18754	18763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004116	AGGGA	2	10	20965	20974	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004116	TCGTG	2	10	23311	23320	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004116	GTTAA	2	10	24066	24075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004116	GGGAG	2	10	24585	24594	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004116	AGGGA	2	10	26796	26805	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004116	ATTTT	2	10	32776	32785	20 %	80 %	0 %	0 %	22536205
22	NC_004116	TCAAT	2	10	33204	33213	40 %	40 %	0 %	20 %	22536205
23	NC_004116	CTTTT	2	10	33823	33832	0 %	80 %	0 %	20 %	22536206
24	NC_004116	AACGG	2	10	34921	34930	40 %	0 %	40 %	20 %	22536207
25	NC_004116	TGGTG	2	10	35944	35953	0 %	40 %	60 %	0 %	22536209
26	NC_004116	CAGCT	2	10	36932	36941	20 %	20 %	20 %	40 %	22536210
27	NC_004116	AGCAG	2	10	43442	43451	40 %	0 %	40 %	20 %	22536213
28	NC_004116	GGTCA	2	10	43806	43815	20 %	20 %	40 %	20 %	22536213
29	NC_004116	TTGGG	2	10	44807	44816	0 %	40 %	60 %	0 %	22536215
30	NC_004116	CTTTT	2	10	46341	46350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_004116	AATGC	2	10	48754	48763	40 %	20 %	20 %	20 %	22536217
32	NC_004116	GAAAA	2	10	50018	50027	80 %	0 %	20 %	0 %	22536219
33	NC_004116	GTCAT	2	10	51648	51657	20 %	40 %	20 %	20 %	22536220
34	NC_004116	AATCA	2	10	53109	53118	60 %	20 %	0 %	20 %	22536222
35	NC_004116	AGTCT	2	10	53953	53962	20 %	40 %	20 %	20 %	22536223
36	NC_004116	GATGG	2	10	55591	55600	20 %	20 %	60 %	0 %	22536225
37	NC_004116	TCCTC	2	10	57719	57728	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_004116	GCAGG	2	10	59161	59170	20 %	0 %	60 %	20 %	22536228
39	NC_004116	CTCTA	2	10	59831	59840	20 %	40 %	0 %	40 %	22536229
40	NC_004116	CTGCC	2	10	60125	60134	0 %	20 %	20 %	60 %	22536230
41	NC_004116	CTTGA	2	10	60405	60414	20 %	40 %	20 %	20 %	22536230
42	NC_004116	CTCAG	2	10	60518	60527	20 %	20 %	20 %	40 %	22536230
43	NC_004116	GAATA	2	10	61159	61168	60 %	20 %	20 %	0 %	22536231
44	NC_004116	TAAAA	2	10	61723	61732	80 %	20 %	0 %	0 %	22536231
45	NC_004116	TATTT	2	10	61922	61931	20 %	80 %	0 %	0 %	22536231
46	NC_004116	TGATT	2	10	62053	62062	20 %	60 %	20 %	0 %	22536231
47	NC_004116	TATTT	2	10	62074	62083	20 %	80 %	0 %	0 %	22536231
48	NC_004116	TTTAT	2	10	62295	62304	20 %	80 %	0 %	0 %	22536231
49	NC_004116	TGATT	2	10	64499	64508	20 %	60 %	20 %	0 %	22536233
50	NC_004116	ATTTG	2	10	65059	65068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004116	TGAAA	2	10	65821	65830	60 %	20 %	20 %	0 %	22536234
52	NC_004116	TGTTT	2	10	66393	66402	0 %	80 %	20 %	0 %	22536235
53	NC_004116	TTTAC	2	10	67252	67261	20 %	60 %	0 %	20 %	22536237
54	NC_004116	TTTTA	2	10	68245	68254	20 %	80 %	0 %	0 %	22536237
55	NC_004116	CCAAC	2	10	69614	69623	40 %	0 %	0 %	60 %	22536238
56	NC_004116	GGTAT	2	10	70000	70009	20 %	40 %	40 %	0 %	22536238
57	NC_004116	AAATA	2	10	76671	76680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004116	GAAAA	2	10	79295	79304	80 %	0 %	20 %	0 %	22536247
59	NC_004116	TTTGG	2	10	79709	79718	0 %	60 %	40 %	0 %	22536248
60	NC_004116	TTCAC	2	10	80065	80074	20 %	40 %	0 %	40 %	22536249
61	NC_004116	GAAAT	2	10	81146	81155	60 %	20 %	20 %	0 %	22536251
62	NC_004116	AAGGA	2	10	82227	82236	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004116	ATTCA	2	10	83108	83117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_004116	TTCCA	2	10	86508	86517	20 %	40 %	0 %	40 %	22536263
65	NC_004116	TCCAA	2	10	86667	86676	40 %	20 %	0 %	40 %	22536263
66	NC_004116	GAATA	2	10	87238	87247	60 %	20 %	20 %	0 %	22536263
67	NC_004116	TCGTG	2	10	92288	92297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_004116	GTTAA	2	10	93043	93052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004116	GGGAG	2	10	93562	93571	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004116	AGGGA	2	10	95773	95782	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004116	TTTAA	2	10	98821	98830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004116	TAAAG	2	10	100817	100826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004116	TATAA	2	10	101359	101368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004116	ATTTG	2	10	101768	101777	20 %	60 %	20 %	0 %	22536277
75	NC_004116	GTTTG	2	10	103102	103111	0 %	60 %	40 %	0 %	22536279
76	NC_004116	ATCAA	2	10	105536	105545	60 %	20 %	0 %	20 %	22536282
77	NC_004116	TATGG	2	10	105794	105803	20 %	40 %	40 %	0 %	22536282
78	NC_004116	CAACA	2	10	106489	106498	60 %	0 %	0 %	40 %	22536282
79	NC_004116	CATTA	2	10	109493	109502	40 %	40 %	0 %	20 %	22536284
80	NC_004116	TATTG	2	10	111590	111599	20 %	60 %	20 %	0 %	22536287
81	NC_004116	CTCTG	2	10	112572	112581	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_004116	AATAG	2	10	113191	113200	60 %	20 %	20 %	0 %	22536289
83	NC_004116	TAAAC	2	10	113557	113566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004116	ATTTA	2	10	115899	115908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004116	AAAAC	2	10	116481	116490	80 %	0 %	0 %	20 %	22536292
86	NC_004116	ATTTT	2	10	117553	117562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004116	CTTTT	2	10	117597	117606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004116	AAAAT	2	10	119194	119203	80 %	20 %	0 %	0 %	22536294
89	NC_004116	CAAGT	2	10	120188	120197	40 %	20 %	20 %	20 %	22536295
90	NC_004116	ACTAT	2	10	121483	121492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004116	TGCCA	2	10	122601	122610	20 %	20 %	20 %	40 %	22536297
92	NC_004116	TGGAT	2	10	124011	124020	20 %	40 %	40 %	0 %	22536298
93	NC_004116	TATAA	2	10	124491	124500	60 %	40 %	0 %	0 %	22536298
94	NC_004116	GTGAT	2	10	125807	125816	20 %	40 %	40 %	0 %	22536300
95	NC_004116	GCTTG	2	10	127013	127022	0 %	40 %	40 %	20 %	22536301
96	NC_004116	TTTGG	2	10	128689	128698	0 %	60 %	40 %	0 %	22536303
97	NC_004116	GAAAA	2	10	130741	130750	80 %	0 %	20 %	0 %	22536306
98	NC_004116	AGTCA	2	10	131302	131311	40 %	20 %	20 %	20 %	22536306
99	NC_004116	GGGTA	2	10	132886	132895	20 %	20 %	60 %	0 %	22536308
100	NC_004116	CTAAG	2	10	132911	132920	40 %	20 %	20 %	20 %	22536308
101	NC_004116	GAAAA	2	10	134135	134144	80 %	0 %	20 %	0 %	22536310
102	NC_004116	GATTT	2	10	134839	134848	20 %	60 %	20 %	0 %	22536310
103	NC_004116	AGTTA	2	10	135144	135153	40 %	40 %	20 %	0 %	22536310
104	NC_004116	TATGA	2	10	135445	135454	40 %	40 %	20 %	0 %	22536311
105	NC_004116	AAACC	2	10	139077	139086	60 %	0 %	0 %	40 %	22536314
106	NC_004116	ATAGA	2	10	139272	139281	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004116	ATAAA	2	10	141343	141352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004116	GATTC	2	10	142174	142183	20 %	40 %	20 %	20 %	22536317
109	NC_004116	GTTAA	2	10	142925	142934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004116	TATAT	2	10	143301	143310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004116	ATTTT	2	10	143576	143585	20 %	80 %	0 %	0 %	22536320
112	NC_004116	TTGAT	2	10	145383	145392	20 %	60 %	20 %	0 %	22536321
113	NC_004116	TTTTG	2	10	145625	145634	0 %	80 %	20 %	0 %	22536321
114	NC_004116	AAGCA	2	10	145841	145850	60 %	0 %	20 %	20 %	22536321
115	NC_004116	ACTTT	2	10	148518	148527	20 %	60 %	0 %	20 %	22536323
116	NC_004116	GCTTT	2	10	150620	150629	0 %	60 %	20 %	20 %	22536325
117	NC_004116	AATAT	2	10	150894	150903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004116	ATTAC	2	10	151610	151619	40 %	40 %	0 %	20 %	22536326
119	NC_004116	AAATT	2	10	152423	152432	60 %	40 %	0 %	0 %	22536327
120	NC_004116	ATCCT	2	10	152825	152834	20 %	40 %	0 %	40 %	22536327
121	NC_004116	AGTTT	2	10	153971	153980	20 %	60 %	20 %	0 %	22536328
122	NC_004116	ATACC	2	10	155998	156007	40 %	20 %	0 %	40 %	22536330
123	NC_004116	AGGTT	2	10	157994	158003	20 %	40 %	40 %	0 %	22536332
124	NC_004116	ATTTT	2	10	158336	158345	20 %	80 %	0 %	0 %	22536332
125	NC_004116	AATAG	2	10	158855	158864	60 %	20 %	20 %	0 %	22536332
126	NC_004116	AAGAC	2	10	159361	159370	60 %	0 %	20 %	20 %	22536333
127	NC_004116	AAAAC	2	10	160440	160449	80 %	0 %	0 %	20 %	22536333
128	NC_004116	TGGGG	2	10	160471	160480	0 %	20 %	80 %	0 %	22536333
129	NC_004116	AATTA	2	10	160778	160787	60 %	40 %	0 %	0 %	22536333
130	NC_004116	ATGAT	2	10	160893	160902	40 %	40 %	20 %	0 %	22536334
131	NC_004116	CAATC	2	10	164640	164649	40 %	20 %	0 %	40 %	22536337
132	NC_004116	TCGTG	2	10	166317	166326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004116	GTTAA	2	10	167072	167081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004116	GGGAG	2	10	167591	167600	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004116	AGGGA	2	10	169802	169811	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004116	TGTTA	2	10	170336	170345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004116	ATTGT	2	10	170527	170536	20 %	60 %	20 %	0 %	22536338
138	NC_004116	ATTAG	2	10	170640	170649	40 %	40 %	20 %	0 %	22536338
139	NC_004116	TTTTA	2	10	172896	172905	20 %	80 %	0 %	0 %	22536341
140	NC_004116	ATCTA	2	10	174034	174043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004116	TTATT	2	10	174710	174719	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004116	GATTG	2	10	178330	178339	20 %	40 %	40 %	0 %	22536343
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271	NC_004116	TATCT	2	10	342852	342861	20 %	60 %	0 %	20 %	22536516
272	NC_004116	ATGAT	2	10	344152	344161	40 %	40 %	20 %	0 %	22536517
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