MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 6037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	GTCA	2	8	678	685	25 %	25 %	25 %	25 %	22536186
2	NC_004116	TGAT	2	8	745	752	25 %	50 %	25 %	0 %	22536186
3	NC_004116	TACA	2	8	823	830	50 %	25 %	0 %	25 %	22536186
4	NC_004116	ACGT	2	8	1048	1055	25 %	25 %	25 %	25 %	22536186
5	NC_004116	AATA	2	8	1632	1639	75 %	25 %	0 %	0 %	22536187
6	NC_004116	AAAT	2	8	2130	2137	75 %	25 %	0 %	0 %	22536187
7	NC_004116	ACTA	2	8	2746	2753	50 %	25 %	0 %	25 %	22536187
8	NC_004116	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	22536188
9	NC_004116	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	22536188
10	NC_004116	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	22536188
11	NC_004116	TTGA	2	8	3628	3635	25 %	50 %	25 %	0 %	22536188
12	NC_004116	TTAT	2	8	4057	4064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004116	TTGA	2	8	4447	4454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004116	TTTA	2	8	4527	4534	25 %	75 %	0 %	0 %	22536191
15	NC_004116	TCAA	2	8	4903	4910	50 %	25 %	0 %	25 %	22536191
16	NC_004116	ACTT	2	8	5341	5348	25 %	50 %	0 %	25 %	22536191
17	NC_004116	CTTA	2	8	5907	5914	25 %	50 %	0 %	25 %	22536192
18	NC_004116	TAGC	2	8	7194	7201	25 %	25 %	25 %	25 %	22536193
19	NC_004116	ACCA	2	8	7284	7291	50 %	0 %	0 %	50 %	22536193
20	NC_004116	AATC	2	8	7411	7418	50 %	25 %	0 %	25 %	22536193
21	NC_004116	TGCG	2	8	8196	8203	0 %	25 %	50 %	25 %	22536193
22	NC_004116	AACA	2	8	8352	8359	75 %	0 %	0 %	25 %	22536193
23	NC_004116	TTAG	2	8	8669	8676	25 %	50 %	25 %	0 %	22536193
24	NC_004116	TAGA	2	8	10013	10020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004116	AAGA	2	8	10237	10244	75 %	0 %	25 %	0 %	22536195
26	NC_004116	TATT	2	8	10428	10435	25 %	75 %	0 %	0 %	22536196
27	NC_004116	AATT	2	8	11063	11070	50 %	50 %	0 %	0 %	22536198
28	NC_004116	TATT	2	8	11303	11310	25 %	75 %	0 %	0 %	22536198
29	NC_004116	ACAG	2	8	11447	11454	50 %	0 %	25 %	25 %	22536198
30	NC_004116	AGTG	2	8	12525	12532	25 %	25 %	50 %	0 %	22536199
31	NC_004116	ATCC	2	8	12985	12992	25 %	25 %	0 %	50 %	22536199
32	NC_004116	ATTT	2	8	13058	13065	25 %	75 %	0 %	0 %	22536199
33	NC_004116	TATT	2	8	13196	13203	25 %	75 %	0 %	0 %	22536199
34	NC_004116	GAAG	2	8	13640	13647	50 %	0 %	50 %	0 %	22536200
35	NC_004116	TTTA	2	8	13974	13981	25 %	75 %	0 %	0 %	22536201
36	NC_004116	TTTG	2	8	14747	14754	0 %	75 %	25 %	0 %	22536201
37	NC_004116	CAAC	2	8	14867	14874	50 %	0 %	0 %	50 %	22536201
38	NC_004116	ATGG	2	8	14886	14893	25 %	25 %	50 %	0 %	22536201
39	NC_004116	AATT	2	8	15745	15752	50 %	50 %	0 %	0 %	22536201
40	NC_004116	GTTA	2	8	16078	16085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004116	ACGA	2	8	16307	16314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_004116	GTTA	2	8	16600	16607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004116	GTGA	2	8	16813	16820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004116	TAAC	2	8	16896	16903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004116	AGCG	2	8	16984	16991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_004116	TGGT	2	8	17649	17656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004116	AGCC	2	8	17866	17873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004116	GTAA	2	8	18321	18328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004116	GAAG	2	8	18403	18410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004116	GCGA	2	8	18477	18484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004116	ATTC	2	8	19343	19350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004116	CTAA	2	8	19699	19706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004116	TAGG	2	8	20354	20361	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004116	ACGA	2	8	22139	22146	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004116	GTTA	2	8	22431	22438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004116	GTGA	2	8	22644	22651	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004116	TAAC	2	8	22727	22734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004116	AGCG	2	8	22815	22822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004116	TGGT	2	8	23480	23487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004116	AGCC	2	8	23697	23704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_004116	GTAA	2	8	24152	24159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004116	GAAG	2	8	24234	24241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004116	GCGA	2	8	24308	24315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_004116	ATTC	2	8	25174	25181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_004116	CTAA	2	8	25530	25537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004116	TAGG	2	8	26185	26192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004116	TATT	2	8	28009	28016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004116	GCGT	2	8	28178	28185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004116	ACTA	2	8	29244	29251	50 %	25 %	0 %	25 %	22536202
70	NC_004116	CAAG	2	8	29426	29433	50 %	0 %	25 %	25 %	22536202
71	NC_004116	ATTA	2	8	30285	30292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004116	TTGG	2	8	30852	30859	0 %	50 %	50 %	0 %	22536203
73	NC_004116	TGAT	2	8	31045	31052	25 %	50 %	25 %	0 %	22536203
74	NC_004116	AATT	2	8	31183	31190	50 %	50 %	0 %	0 %	22536203
75	NC_004116	TGAT	2	8	31225	31232	25 %	50 %	25 %	0 %	22536203
76	NC_004116	ATTG	2	8	31259	31266	25 %	50 %	25 %	0 %	22536203
77	NC_004116	TAGA	2	8	31476	31483	50 %	25 %	25 %	0 %	22536204
78	NC_004116	AATC	2	8	31619	31626	50 %	25 %	0 %	25 %	22536204
79	NC_004116	CTTA	2	8	31700	31707	25 %	50 %	0 %	25 %	22536204
80	NC_004116	TTAA	2	8	32135	32142	50 %	50 %	0 %	0 %	22536204
81	NC_004116	TCTT	2	8	32539	32546	0 %	75 %	0 %	25 %	22536204
82	NC_004116	TCTT	2	8	32804	32811	0 %	75 %	0 %	25 %	22536205
83	NC_004116	ATTG	2	8	32969	32976	25 %	50 %	25 %	0 %	22536205
84	NC_004116	AATC	2	8	33188	33195	50 %	25 %	0 %	25 %	22536205
85	NC_004116	ACAA	2	8	33224	33231	75 %	0 %	0 %	25 %	22536205
86	NC_004116	AATT	2	8	33438	33445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004116	TTTA	2	8	33889	33896	25 %	75 %	0 %	0 %	22536206
88	NC_004116	ATTT	2	8	34020	34027	25 %	75 %	0 %	0 %	22536206
89	NC_004116	TTCA	2	8	34383	34390	25 %	50 %	0 %	25 %	22536207
90	NC_004116	GTTT	2	8	34712	34719	0 %	75 %	25 %	0 %	22536207
91	NC_004116	TAAA	2	8	35679	35686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004116	TTAT	2	8	35769	35776	25 %	75 %	0 %	0 %	22536209
93	NC_004116	TTGA	2	8	36269	36276	25 %	50 %	25 %	0 %	22536209
94	NC_004116	GGAA	2	8	36469	36476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004116	AATC	2	8	37193	37200	50 %	25 %	0 %	25 %	22536210
96	NC_004116	TGGT	2	8	37853	37860	0 %	50 %	50 %	0 %	22536210
97	NC_004116	AGGC	2	8	37898	37905	25 %	0 %	50 %	25 %	22536210
98	NC_004116	TTGG	2	8	39972	39979	0 %	50 %	50 %	0 %	22536210
99	NC_004116	TAGA	2	8	40513	40520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004116	ACTT	2	8	40798	40805	25 %	50 %	0 %	25 %	22536211
101	NC_004116	AATC	2	8	40918	40925	50 %	25 %	0 %	25 %	22536211
102	NC_004116	TGAT	2	8	41783	41790	25 %	50 %	25 %	0 %	22536211
103	NC_004116	AATT	2	8	41933	41940	50 %	50 %	0 %	0 %	22536211
104	NC_004116	TATC	2	8	41998	42005	25 %	50 %	0 %	25 %	22536211
105	NC_004116	TTAA	2	8	42016	42023	50 %	50 %	0 %	0 %	22536211
106	NC_004116	TGCT	2	8	42413	42420	0 %	50 %	25 %	25 %	22536212
107	NC_004116	GTAT	2	8	42638	42645	25 %	50 %	25 %	0 %	22536212
108	NC_004116	TAGT	2	8	43254	43261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004116	AGTT	2	8	43457	43464	25 %	50 %	25 %	0 %	22536213
110	NC_004116	GTCT	2	8	43617	43624	0 %	50 %	25 %	25 %	22536213
111	NC_004116	CCAT	2	8	43774	43781	25 %	25 %	0 %	50 %	22536213
112	NC_004116	ACCA	2	8	44078	44085	50 %	0 %	0 %	50 %	22536214
113	NC_004116	TTGA	2	8	44218	44225	25 %	50 %	25 %	0 %	22536214
114	NC_004116	TTTG	2	8	44283	44290	0 %	75 %	25 %	0 %	22536214
115	NC_004116	TTGA	2	8	45014	45021	25 %	50 %	25 %	0 %	22536215
116	NC_004116	GCTA	2	8	45748	45755	25 %	25 %	25 %	25 %	22536215
117	NC_004116	GCCA	2	8	45921	45928	25 %	0 %	25 %	50 %	22536215
118	NC_004116	AACC	2	8	46042	46049	50 %	0 %	0 %	50 %	22536215
119	NC_004116	AAAC	2	8	46228	46235	75 %	0 %	0 %	25 %	22536215
120	NC_004116	GTTA	2	8	46486	46493	25 %	50 %	25 %	0 %	22536216
121	NC_004116	GTCC	2	8	46565	46572	0 %	25 %	25 %	50 %	22536216
122	NC_004116	AATC	2	8	47036	47043	50 %	25 %	0 %	25 %	22536216
123	NC_004116	ACTA	2	8	47415	47422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004116	ATAA	2	8	47752	47759	75 %	25 %	0 %	0 %	22536217
125	NC_004116	TTAT	2	8	47777	47784	25 %	75 %	0 %	0 %	22536217
126	NC_004116	GTCA	4	16	48159	48174	25 %	25 %	25 %	25 %	22536217
127	NC_004116	ACAG	2	8	48361	48368	50 %	0 %	25 %	25 %	22536217
128	NC_004116	ATTT	2	8	50187	50194	25 %	75 %	0 %	0 %	22536219
129	NC_004116	TTGC	2	8	51698	51705	0 %	50 %	25 %	25 %	22536220
130	NC_004116	AATT	2	8	51895	51902	50 %	50 %	0 %	0 %	22536220
131	NC_004116	TTAG	2	8	52496	52503	25 %	50 %	25 %	0 %	22536221
132	NC_004116	TAGG	2	8	52946	52953	25 %	25 %	50 %	0 %	22536221
133	NC_004116	GATT	2	8	53026	53033	25 %	50 %	25 %	0 %	22536222
134	NC_004116	TCTT	2	8	53757	53764	0 %	75 %	0 %	25 %	22536223
135	NC_004116	TTAT	2	8	53964	53971	25 %	75 %	0 %	0 %	22536223
136	NC_004116	TATT	2	8	53989	53996	25 %	75 %	0 %	0 %	22536223
137	NC_004116	TGCT	2	8	54127	54134	0 %	50 %	25 %	25 %	22536224
138	NC_004116	ATGC	2	8	54365	54372	25 %	25 %	25 %	25 %	22536224
139	NC_004116	ATTT	2	8	54413	54420	25 %	75 %	0 %	0 %	22536224
140	NC_004116	AACT	2	8	54888	54895	50 %	25 %	0 %	25 %	22536224
141	NC_004116	ATTG	2	8	56379	56386	25 %	50 %	25 %	0 %	22536226
142	NC_004116	CCAA	2	8	58267	58274	50 %	0 %	0 %	50 %	22536228
143	NC_004116	AGAA	2	8	59310	59317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004116	CCTG	2	8	59776	59783	0 %	25 %	25 %	50 %	22536229
145	NC_004116	GGAT	2	8	61090	61097	25 %	25 %	50 %	0 %	22536230
146	NC_004116	CTAT	2	8	61232	61239	25 %	50 %	0 %	25 %	22536231
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