MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 30856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004116	TTC	2	6	21	26	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004116	AAT	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004116	GAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004116	AAC	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536186
6	NC_004116	CAG	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536186
7	NC_004116	CTC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536186
8	NC_004116	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
9	NC_004116	CTA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536186
10	NC_004116	CTG	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536186
11	NC_004116	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
12	NC_004116	GAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
13	NC_004116	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536186
14	NC_004116	AGA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
15	NC_004116	CAC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536186
16	NC_004116	ATG	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536186
17	NC_004116	AGA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
18	NC_004116	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536186
19	NC_004116	CTA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004116	TAC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004116	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
22	NC_004116	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
23	NC_004116	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
24	NC_004116	ACA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
25	NC_004116	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
26	NC_004116	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536187
27	NC_004116	CAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
28	NC_004116	TAA	2	6	2205	2210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
29	NC_004116	GTT	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536187
30	NC_004116	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536187
31	NC_004116	TCT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
32	NC_004116	CCT	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536187
33	NC_004116	TAA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
34	NC_004116	ATG	2	6	2812	2817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004116	TAA	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536188
36	NC_004116	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536188
37	NC_004116	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536188
38	NC_004116	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
39	NC_004116	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536188
40	NC_004116	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
41	NC_004116	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
42	NC_004116	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536188
43	NC_004116	CAG	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536188
44	NC_004116	TAT	2	6	3536	3541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
45	NC_004116	TAC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
46	NC_004116	TTG	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536189
47	NC_004116	ATG	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536189
48	NC_004116	AAT	2	6	3928	3933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004116	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004116	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004116	GGT	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004116	ATT	2	6	4270	4275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
53	NC_004116	CTA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536190
54	NC_004116	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
55	NC_004116	TCT	2	6	4401	4406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004116	TCT	2	6	4422	4427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004116	ATA	2	6	4438	4443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004116	CAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536191
59	NC_004116	GCT	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
60	NC_004116	TAA	2	6	4737	4742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536191
61	NC_004116	TGA	3	9	4797	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
62	NC_004116	AGA	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
63	NC_004116	GTT	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536191
64	NC_004116	AAC	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536191
65	NC_004116	TGA	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
66	NC_004116	TGA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
67	NC_004116	AGT	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
68	NC_004116	GAA	3	9	5221	5229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
69	NC_004116	TGA	3	9	5241	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
70	NC_004116	GCT	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
71	NC_004116	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536191
72	NC_004116	CTG	2	6	5351	5356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
73	NC_004116	GCT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
74	NC_004116	TAT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536191
75	NC_004116	ATG	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
76	NC_004116	AAG	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
77	NC_004116	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
78	NC_004116	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004116	TTG	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536192
80	NC_004116	ATA	2	6	5734	5739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536192
81	NC_004116	AGA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536192
82	NC_004116	ACT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536192
83	NC_004116	ACA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536192
84	NC_004116	GAT	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
85	NC_004116	CTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536192
86	NC_004116	TAT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
87	NC_004116	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
88	NC_004116	ATG	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
89	NC_004116	ATT	3	9	6190	6198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
90	NC_004116	ATT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
91	NC_004116	GTG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536193
92	NC_004116	TGA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
93	NC_004116	GCA	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
94	NC_004116	TTC	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536193
95	NC_004116	CAG	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
96	NC_004116	ATT	2	6	6929	6934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
97	NC_004116	TCG	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536193
98	NC_004116	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
99	NC_004116	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536193
100	NC_004116	CTT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536193
101	NC_004116	TCA	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536193
102	NC_004116	TTG	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
103	NC_004116	TTG	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
104	NC_004116	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
105	NC_004116	ATG	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
106	NC_004116	AGA	2	6	7963	7968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
107	NC_004116	TGA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
108	NC_004116	TTG	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
109	NC_004116	ATA	2	6	8040	8045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536193
110	NC_004116	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
111	NC_004116	GTT	3	9	8234	8242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
112	NC_004116	CAA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536193
113	NC_004116	CAG	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
114	NC_004116	ATT	3	9	8396	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
115	NC_004116	TGT	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
116	NC_004116	TGA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
117	NC_004116	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
118	NC_004116	AGG	2	6	8704	8709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536193
119	NC_004116	AAT	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536193
120	NC_004116	TTG	2	6	8931	8936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
121	NC_004116	GTG	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536193
122	NC_004116	CCA	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536193
123	NC_004116	CAG	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
124	NC_004116	TAG	2	6	9498	9503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
125	NC_004116	ATT	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
126	NC_004116	GTT	2	6	9638	9643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
127	NC_004116	ATT	2	6	9674	9679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
128	NC_004116	GAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
129	NC_004116	AGA	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
130	NC_004116	AAG	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004116	TTA	2	6	9876	9881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004116	TAG	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536194
133	NC_004116	ATC	2	6	10029	10034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004116	CGT	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536195
135	NC_004116	AAG	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536195
136	NC_004116	TCA	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536195
137	NC_004116	TAA	2	6	10191	10196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536195
138	NC_004116	TTG	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536195
139	NC_004116	ATT	2	6	10267	10272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536195
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142	NC_004116	CGT	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536196
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165	NC_004116	ATA	2	6	11902	11907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536198
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246	NC_004116	TCA	2	6	15913	15918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_004116	AAG	2	6	16017	16022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
248	NC_004116	CAA	2	6	16063	16068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_004116	ATA	2	6	16092	16097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_004116	AAC	2	6	16211	16216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_004116	GGC	2	6	16441	16446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_004116	GGA	2	6	17583	17588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_004116	GAG	2	6	19788	19793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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