MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 27098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	AAC	2	6	115	120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536186
2	NC_004116	CAG	2	6	166	171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536186
3	NC_004116	CTC	2	6	201	206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536186
4	NC_004116	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
5	NC_004116	CTA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536186
6	NC_004116	CTG	2	6	652	657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536186
7	NC_004116	TTA	2	6	664	669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536186
8	NC_004116	GAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
9	NC_004116	TTC	2	6	801	806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536186
10	NC_004116	AGA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
11	NC_004116	CAC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536186
12	NC_004116	ATG	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536186
13	NC_004116	AGA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536186
14	NC_004116	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536186
15	NC_004116	TCT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
16	NC_004116	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
17	NC_004116	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
18	NC_004116	ACA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
19	NC_004116	ATT	2	6	2050	2055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536187
20	NC_004116	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536187
21	NC_004116	CAA	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536187
22	NC_004116	TAA	2	6	2205	2210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
23	NC_004116	GTT	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536187
24	NC_004116	GAT	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536187
25	NC_004116	TCT	2	6	2291	2296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536187
26	NC_004116	CCT	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536187
27	NC_004116	TAA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536187
28	NC_004116	TAA	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536188
29	NC_004116	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536188
30	NC_004116	GAT	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536188
31	NC_004116	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
32	NC_004116	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536188
33	NC_004116	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
34	NC_004116	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
35	NC_004116	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536188
36	NC_004116	CAG	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536188
37	NC_004116	TAT	2	6	3536	3541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536188
38	NC_004116	TAC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536188
39	NC_004116	TTG	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536189
40	NC_004116	ATG	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536189
41	NC_004116	ATT	2	6	4270	4275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
42	NC_004116	CTA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536190
43	NC_004116	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536190
44	NC_004116	CAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536191
45	NC_004116	GCT	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
46	NC_004116	TAA	2	6	4737	4742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536191
47	NC_004116	TGA	3	9	4797	4805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
48	NC_004116	AGA	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
49	NC_004116	GTT	2	6	5059	5064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536191
50	NC_004116	AAC	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536191
51	NC_004116	TGA	2	6	5115	5120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
52	NC_004116	TGA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
53	NC_004116	AGT	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
54	NC_004116	GAA	3	9	5221	5229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
55	NC_004116	TGA	3	9	5241	5249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
56	NC_004116	GCT	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
57	NC_004116	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536191
58	NC_004116	CTG	2	6	5351	5356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
59	NC_004116	GCT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536191
60	NC_004116	TAT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536191
61	NC_004116	ATG	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536191
62	NC_004116	AAG	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
63	NC_004116	GAA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536191
64	NC_004116	TTG	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536192
65	NC_004116	ATA	2	6	5734	5739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536192
66	NC_004116	AGA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536192
67	NC_004116	ACT	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536192
68	NC_004116	ACA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536192
69	NC_004116	GAT	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
70	NC_004116	CTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536192
71	NC_004116	TAT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
72	NC_004116	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
73	NC_004116	ATG	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536192
74	NC_004116	ATT	3	9	6190	6198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536192
75	NC_004116	ATT	2	6	6262	6267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
76	NC_004116	GTG	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536193
77	NC_004116	TGA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
78	NC_004116	GCA	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
79	NC_004116	TTC	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536193
80	NC_004116	CAG	2	6	6918	6923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
81	NC_004116	ATT	2	6	6929	6934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
82	NC_004116	TCG	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536193
83	NC_004116	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
84	NC_004116	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536193
85	NC_004116	CTT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536193
86	NC_004116	TCA	2	6	7348	7353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536193
87	NC_004116	TTG	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
88	NC_004116	TTG	2	6	7563	7568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
89	NC_004116	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
90	NC_004116	ATG	2	6	7917	7922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
91	NC_004116	AGA	2	6	7963	7968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
92	NC_004116	TGA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
93	NC_004116	TTG	2	6	7982	7987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
94	NC_004116	ATA	2	6	8040	8045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536193
95	NC_004116	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
96	NC_004116	GTT	3	9	8234	8242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
97	NC_004116	CAA	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536193
98	NC_004116	CAG	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
99	NC_004116	ATT	3	9	8396	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
100	NC_004116	TGT	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
101	NC_004116	TGA	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
102	NC_004116	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
103	NC_004116	AGG	2	6	8704	8709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536193
104	NC_004116	AAT	2	6	8887	8892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536193
105	NC_004116	TTG	2	6	8931	8936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
106	NC_004116	GTG	2	6	9138	9143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536193
107	NC_004116	CCA	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536193
108	NC_004116	CAG	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536193
109	NC_004116	TAG	2	6	9498	9503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536193
110	NC_004116	ATT	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
111	NC_004116	GTT	2	6	9638	9643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536193
112	NC_004116	ATT	2	6	9674	9679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536193
113	NC_004116	GAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
114	NC_004116	AGA	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536193
115	NC_004116	TAG	2	6	9999	10004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536194
116	NC_004116	CGT	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536195
117	NC_004116	AAG	2	6	10094	10099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536195
118	NC_004116	TCA	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536195
119	NC_004116	TAA	2	6	10191	10196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536195
120	NC_004116	TTG	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536195
121	NC_004116	ATT	2	6	10267	10272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536195
122	NC_004116	TGT	2	6	10309	10314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536196
123	NC_004116	GAG	2	6	10370	10375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536196
124	NC_004116	CGT	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536196
125	NC_004116	AAG	2	6	10488	10493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536196
126	NC_004116	TAT	2	6	10607	10612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536196
127	NC_004116	AAT	2	6	10662	10667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536196
128	NC_004116	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536197
129	NC_004116	AGA	2	6	10725	10730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536197
130	NC_004116	GAA	2	6	10805	10810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536198
131	NC_004116	CTT	2	6	10820	10825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536198
132	NC_004116	GAG	2	6	10869	10874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22536198
133	NC_004116	AGC	2	6	11155	11160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536198
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135	NC_004116	CTT	2	6	11191	11196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536198
136	NC_004116	AAT	2	6	11244	11249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536198
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140	NC_004116	TAT	2	6	11389	11394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536198
141	NC_004116	ATA	2	6	11404	11409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536198
142	NC_004116	CAA	2	6	11710	11715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536198
143	NC_004116	TTA	2	6	11726	11731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536198
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148	NC_004116	ATG	2	6	11974	11979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536198
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154	NC_004116	ATA	2	6	12086	12091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536198
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254	NC_004116	ATG	2	6	30079	30084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536202
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256	NC_004116	AGT	2	6	30107	30112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536202
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258	NC_004116	CAT	2	6	30525	30530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536203
259	NC_004116	CAA	2	6	30547	30552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536203
260	NC_004116	TGA	2	6	30860	30865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536203
261	NC_004116	TGT	3	9	30866	30874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536203
262	NC_004116	TGG	2	6	30890	30895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536203
263	NC_004116	ATT	2	6	30999	31004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536203
264	NC_004116	TGA	2	6	31037	31042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536203
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270	NC_004116	ATG	2	6	31442	31447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536204
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287	NC_004116	TAT	2	6	32491	32496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536204
288	NC_004116	TGC	2	6	32548	32553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536204
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293	NC_004116	ATT	2	6	32939	32944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536205
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