MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 1254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	GCGCG	2	10	642	651	0 %	0 %	60 %	40 %	22297545
2	NC_004113	CAATC	2	10	1527	1536	40 %	20 %	0 %	40 %	22297546
3	NC_004113	GGTTC	2	10	1603	1612	0 %	40 %	40 %	20 %	22297546
4	NC_004113	CCCCA	2	10	4918	4927	20 %	0 %	0 %	80 %	22297550
5	NC_004113	CGCTG	2	10	10000	10009	0 %	20 %	40 %	40 %	22297554
6	NC_004113	TCTTG	2	10	10331	10340	0 %	60 %	20 %	20 %	22297554
7	NC_004113	AGGCA	2	10	13387	13396	40 %	0 %	40 %	20 %	22297557
8	NC_004113	CAATT	2	10	13802	13811	40 %	40 %	0 %	20 %	22297558
9	NC_004113	ATTGA	2	10	14840	14849	40 %	40 %	20 %	0 %	22297559
10	NC_004113	CCCAG	2	10	15218	15227	20 %	0 %	20 %	60 %	22297559
11	NC_004113	ATCAC	2	10	16559	16568	40 %	20 %	0 %	40 %	22297560
12	NC_004113	CGGCG	2	10	17906	17915	0 %	0 %	60 %	40 %	22297562
13	NC_004113	GCCAA	2	10	19609	19618	40 %	0 %	20 %	40 %	22297564
14	NC_004113	GCATC	2	10	20150	20159	20 %	20 %	20 %	40 %	22297564
15	NC_004113	CGTTG	2	10	20662	20671	0 %	40 %	40 %	20 %	22297565
16	NC_004113	TTGGC	2	10	22295	22304	0 %	40 %	40 %	20 %	22297568
17	NC_004113	GATGG	2	10	29553	29562	20 %	20 %	60 %	0 %	22297575
18	NC_004113	AGAAA	2	10	31475	31484	80 %	0 %	20 %	0 %	22297576
19	NC_004113	AAGCC	2	10	34496	34505	40 %	0 %	20 %	40 %	22297581
20	NC_004113	TGGAT	2	10	35693	35702	20 %	40 %	40 %	0 %	22297584
21	NC_004113	CCCAG	2	10	36108	36117	20 %	0 %	20 %	60 %	22297585
22	NC_004113	TCCTG	2	10	36571	36580	0 %	40 %	20 %	40 %	22297585
23	NC_004113	AACCC	2	10	41779	41788	40 %	0 %	0 %	60 %	22297591
24	NC_004113	TGCAC	2	10	42050	42059	20 %	20 %	20 %	40 %	22297592
25	NC_004113	CTGTG	2	10	44905	44914	0 %	40 %	40 %	20 %	22297594
26	NC_004113	GAGCA	2	10	47345	47354	40 %	0 %	40 %	20 %	22297595
27	NC_004113	GGCGG	2	10	47851	47860	0 %	0 %	80 %	20 %	22297595
28	NC_004113	CCCCT	2	10	51971	51980	0 %	20 %	0 %	80 %	22297599
29	NC_004113	CGCAG	2	10	52555	52564	20 %	0 %	40 %	40 %	22297600
30	NC_004113	GATTT	2	10	53244	53253	20 %	60 %	20 %	0 %	22297601
31	NC_004113	CCGGT	2	10	53855	53864	0 %	20 %	40 %	40 %	22297602
32	NC_004113	AATTT	2	10	54522	54531	40 %	60 %	0 %	0 %	22297602
33	NC_004113	CTTTC	2	10	54572	54581	0 %	60 %	0 %	40 %	22297602
34	NC_004113	GTAGC	2	10	56356	56365	20 %	20 %	40 %	20 %	22297604
35	NC_004113	GGGGT	2	10	57430	57439	0 %	20 %	80 %	0 %	22297605
36	NC_004113	GGCGC	2	10	58386	58395	0 %	0 %	60 %	40 %	22297606
37	NC_004113	AAATT	2	10	65972	65981	60 %	40 %	0 %	0 %	22297616
38	NC_004113	GCCAA	2	10	66397	66406	40 %	0 %	20 %	40 %	22297616
39	NC_004113	TCCAC	2	10	66850	66859	20 %	20 %	0 %	60 %	22297617
40	NC_004113	AGTTG	2	10	67669	67678	20 %	40 %	40 %	0 %	22297617
41	NC_004113	AGGCG	2	10	68296	68305	20 %	0 %	60 %	20 %	22297618
42	NC_004113	AGATC	2	10	69795	69804	40 %	20 %	20 %	20 %	22297620
43	NC_004113	AGGGC	2	10	70535	70544	20 %	0 %	60 %	20 %	22297621
44	NC_004113	CTCTA	2	10	78789	78798	20 %	40 %	0 %	40 %	22297636
45	NC_004113	CGCAA	2	10	79568	79577	40 %	0 %	20 %	40 %	22297638
46	NC_004113	CCCCA	2	10	81148	81157	20 %	0 %	0 %	80 %	22297641
47	NC_004113	TAGTG	2	10	81688	81697	20 %	40 %	40 %	0 %	22297642
48	NC_004113	TGGGC	2	10	82284	82293	0 %	20 %	60 %	20 %	22297643
49	NC_004113	GGTGA	2	10	84761	84770	20 %	20 %	60 %	0 %	22297648
50	NC_004113	CCTTG	2	10	94889	94898	0 %	40 %	20 %	40 %	22297659
51	NC_004113	TGGTG	2	10	102045	102054	0 %	40 %	60 %	0 %	22297669
52	NC_004113	GCGCC	2	10	102538	102547	0 %	0 %	40 %	60 %	22297669
53	NC_004113	ATTGG	2	10	102921	102930	20 %	40 %	40 %	0 %	22297669
54	NC_004113	TCTCT	2	10	104906	104915	0 %	60 %	0 %	40 %	22297671
55	NC_004113	CGCTG	2	10	107747	107756	0 %	20 %	40 %	40 %	22297672
56	NC_004113	CCCCA	2	10	112027	112036	20 %	0 %	0 %	80 %	22297675
57	NC_004113	GCGCG	2	10	113700	113709	0 %	0 %	60 %	40 %	22297677
58	NC_004113	TGGTG	2	10	114055	114064	0 %	40 %	60 %	0 %	22297677
59	NC_004113	TTTGG	2	10	114221	114230	0 %	60 %	40 %	0 %	22297677
60	NC_004113	TACGG	2	10	117738	117747	20 %	20 %	40 %	20 %	22297681
61	NC_004113	GCGGT	2	10	117871	117880	0 %	20 %	60 %	20 %	22297681
62	NC_004113	CCACC	2	10	118756	118765	20 %	0 %	0 %	80 %	22297683
63	NC_004113	CCCAT	2	10	120408	120417	20 %	20 %	0 %	60 %	22297684
64	NC_004113	TGGGG	2	10	120446	120455	0 %	20 %	80 %	0 %	22297684
65	NC_004113	GTGGC	2	10	125393	125402	0 %	20 %	60 %	20 %	22297688
66	NC_004113	TCGCT	2	10	126213	126222	0 %	40 %	20 %	40 %	22297689
67	NC_004113	TGCGC	2	10	128903	128912	0 %	20 %	40 %	40 %	22297691
68	NC_004113	GCGAC	2	10	131191	131200	20 %	0 %	40 %	40 %	22297694
69	NC_004113	CCGCT	2	10	138200	138209	0 %	20 %	20 %	60 %	22297697
70	NC_004113	CCACA	2	10	139993	140002	40 %	0 %	0 %	60 %	22297700
71	NC_004113	CCCTG	2	10	141816	141825	0 %	20 %	20 %	60 %	22297702
72	NC_004113	CAAAT	2	10	142012	142021	60 %	20 %	0 %	20 %	22297702
73	NC_004113	AGCCC	2	10	142131	142140	20 %	0 %	20 %	60 %	22297702
74	NC_004113	CAAAC	2	10	143385	143394	60 %	0 %	0 %	40 %	22297704
75	NC_004113	CTGTG	2	10	143397	143406	0 %	40 %	40 %	20 %	22297704
76	NC_004113	GTGCT	2	10	148883	148892	0 %	40 %	40 %	20 %	22297712
77	NC_004113	GGGTC	2	10	150033	150042	0 %	20 %	60 %	20 %	22297714
78	NC_004113	TTGAT	2	10	152024	152033	20 %	60 %	20 %	0 %	22297716
79	NC_004113	CCAAA	2	10	152238	152247	60 %	0 %	0 %	40 %	22297716
80	NC_004113	TGCAC	2	10	152840	152849	20 %	20 %	20 %	40 %	22297716
81	NC_004113	GCTGT	2	10	153658	153667	0 %	40 %	40 %	20 %	22297717
82	NC_004113	CGCCC	2	10	155204	155213	0 %	0 %	20 %	80 %	22297718
83	NC_004113	CAGCT	2	10	156170	156179	20 %	20 %	20 %	40 %	22297718
84	NC_004113	GGGAC	2	10	156790	156799	20 %	0 %	60 %	20 %	22297719
85	NC_004113	ACCTC	2	10	156800	156809	20 %	20 %	0 %	60 %	22297719
86	NC_004113	TCCCC	2	10	157198	157207	0 %	20 %	0 %	80 %	22297719
87	NC_004113	GCCCA	2	10	159092	159101	20 %	0 %	20 %	60 %	22297723
88	NC_004113	TAAAT	2	10	161948	161957	60 %	40 %	0 %	0 %	22297726
89	NC_004113	CATGG	2	10	167831	167840	20 %	20 %	40 %	20 %	22297729
90	NC_004113	GGAAA	2	10	169215	169224	60 %	0 %	40 %	0 %	22297731
91	NC_004113	CCATG	2	10	169574	169583	20 %	20 %	20 %	40 %	22297732
92	NC_004113	ACCAA	2	10	170157	170166	60 %	0 %	0 %	40 %	22297732
93	NC_004113	TCCGC	2	10	170447	170456	0 %	20 %	20 %	60 %	22297732
94	NC_004113	CTAGG	2	10	173041	173050	20 %	20 %	40 %	20 %	22297734
95	NC_004113	AGCCA	2	10	174114	174123	40 %	0 %	20 %	40 %	22297736
96	NC_004113	TGCGG	2	10	174856	174865	0 %	20 %	60 %	20 %	22297737
97	NC_004113	CCCCA	2	10	175211	175220	20 %	0 %	0 %	80 %	22297737
98	NC_004113	TTTGG	2	10	176669	176678	0 %	60 %	40 %	0 %	22297737
99	NC_004113	TTCCT	2	10	177108	177117	0 %	60 %	0 %	40 %	22297738
100	NC_004113	AGCAG	2	10	177793	177802	40 %	0 %	40 %	20 %	22297739
101	NC_004113	CTGAA	2	10	180922	180931	40 %	20 %	20 %	20 %	22297744
102	NC_004113	TCAAT	2	10	181614	181623	40 %	40 %	0 %	20 %	22297745
103	NC_004113	AACGG	2	10	183351	183360	40 %	0 %	40 %	20 %	22297747
104	NC_004113	TTCTG	2	10	186799	186808	0 %	60 %	20 %	20 %	22297749
105	NC_004113	GTGAA	2	10	188459	188468	40 %	20 %	40 %	0 %	22297752
106	NC_004113	CCTCC	2	10	189096	189105	0 %	20 %	0 %	80 %	22297753
107	NC_004113	CCAAC	2	10	190429	190438	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
108	NC_004113	AGACC	2	10	190641	190650	40 %	0 %	20 %	40 %	22297754
109	NC_004113	ACCCA	2	10	190679	190688	40 %	0 %	0 %	60 %	22297754
110	NC_004113	ATCAC	2	10	191431	191440	40 %	20 %	0 %	40 %	22297756
111	NC_004113	GCGCC	2	10	192696	192705	0 %	0 %	40 %	60 %	22297756
112	NC_004113	TGCTG	2	10	193561	193570	0 %	40 %	40 %	20 %	22297757
113	NC_004113	TTGAT	2	10	194838	194847	20 %	60 %	20 %	0 %	22297757
114	NC_004113	TGGAT	2	10	206462	206471	20 %	40 %	40 %	0 %	22297769
115	NC_004113	CGCTG	2	10	207220	207229	0 %	20 %	40 %	40 %	22297770
116	NC_004113	TGAAT	2	10	211430	211439	40 %	40 %	20 %	0 %	22297773
117	NC_004113	TGCAG	2	10	212466	212475	20 %	20 %	40 %	20 %	22297774
118	NC_004113	GCCAA	2	10	213842	213851	40 %	0 %	20 %	40 %	22297776
119	NC_004113	GGTGG	2	10	214194	214203	0 %	20 %	80 %	0 %	22297776
120	NC_004113	TTTGC	2	10	217499	217508	0 %	60 %	20 %	20 %	22297780
121	NC_004113	GTCCT	2	10	225655	225664	0 %	40 %	20 %	40 %	22297786
122	NC_004113	TTTTA	2	10	230103	230112	20 %	80 %	0 %	0 %	22297790
123	NC_004113	CTATT	2	10	230430	230439	20 %	60 %	0 %	20 %	22297790
124	NC_004113	ATCCA	2	10	232770	232779	40 %	20 %	0 %	40 %	22297792
125	NC_004113	CCCTG	2	10	235617	235626	0 %	20 %	20 %	60 %	22297794
126	NC_004113	TGGGG	2	10	237807	237816	0 %	20 %	80 %	0 %	22297795
127	NC_004113	CGGGT	2	10	238020	238029	0 %	20 %	60 %	20 %	22297795
128	NC_004113	ACCTA	2	10	243039	243048	40 %	20 %	0 %	40 %	22297802
129	NC_004113	GCTTG	2	10	249180	249189	0 %	40 %	40 %	20 %	22297810
130	NC_004113	CAATC	2	10	249513	249522	40 %	20 %	0 %	40 %	22297810
131	NC_004113	AGAAA	2	10	254356	254365	80 %	0 %	20 %	0 %	22297815
132	NC_004113	AAGGC	2	10	262227	262236	40 %	0 %	40 %	20 %	22297821
133	NC_004113	ATCAG	2	10	262973	262982	40 %	20 %	20 %	20 %	22297822
134	NC_004113	GATGG	2	10	269060	269069	20 %	20 %	60 %	0 %	22297828
135	NC_004113	CATGG	2	10	271455	271464	20 %	20 %	40 %	20 %	22297830
136	NC_004113	CAGTG	2	10	271815	271824	20 %	20 %	40 %	20 %	22297831
137	NC_004113	TTTTC	2	10	273208	273217	0 %	80 %	0 %	20 %	22297832
138	NC_004113	CCTTG	2	10	273238	273247	0 %	40 %	20 %	40 %	22297832
139	NC_004113	CCCAC	2	10	275326	275335	20 %	0 %	0 %	80 %	22297834
140	NC_004113	GCTGC	2	10	275877	275886	0 %	20 %	40 %	40 %	22297834
141	NC_004113	AGCCA	2	10	276439	276448	40 %	0 %	20 %	40 %	22297834
142	NC_004113	CGCTA	2	10	276900	276909	20 %	20 %	20 %	40 %	22297834
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144	NC_004113	TTTAC	2	10	282581	282590	20 %	60 %	0 %	20 %	22297843
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150	NC_004113	TTGTC	2	10	297298	297307	0 %	60 %	20 %	20 %	22297853
151	NC_004113	TGCGC	2	10	299215	299224	0 %	20 %	40 %	40 %	22297855
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154	NC_004113	GGCCA	2	10	303415	303424	20 %	0 %	40 %	40 %	22297859
155	NC_004113	TGGGG	2	10	304718	304727	0 %	20 %	80 %	0 %	22297862
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166	NC_004113	CATGG	2	10	338482	338491	20 %	20 %	40 %	20 %	22297891
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171	NC_004113	CGGGG	2	10	348606	348615	0 %	0 %	80 %	20 %	22297896
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252	NC_004113	GCCCT	2	10	499095	499104	0 %	20 %	20 %	60 %	22298047
253	NC_004113	GTTGA	2	10	500545	500554	20 %	40 %	40 %	0 %	22298049
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255	NC_004113	AGTAA	2	10	502887	502896	60 %	20 %	20 %	0 %	22298050
256	NC_004113	CGGGG	2	10	505348	505357	0 %	0 %	80 %	20 %	22298052
257	NC_004113	TACGA	2	10	505566	505575	40 %	20 %	20 %	20 %	22298052
258	NC_004113	GATGT	2	10	507158	507167	20 %	40 %	40 %	0 %	22298053
259	NC_004113	CTCAA	2	10	507335	507344	40 %	20 %	0 %	40 %	22298054
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