MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 5332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	GCCA	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004113	GCGG	2	8	609	616	0 %	0 %	75 %	25 %	22297545
3	NC_004113	GGGT	2	8	1497	1504	0 %	25 %	75 %	0 %	22297546
4	NC_004113	GATT	2	8	3432	3439	25 %	50 %	25 %	0 %	22297549
5	NC_004113	GGCG	2	8	3451	3458	0 %	0 %	75 %	25 %	22297549
6	NC_004113	CGCC	2	8	4027	4034	0 %	0 %	25 %	75 %	22297549
7	NC_004113	CTTT	2	8	4143	4150	0 %	75 %	0 %	25 %	22297549
8	NC_004113	GCGG	2	8	4459	4466	0 %	0 %	75 %	25 %	22297549
9	NC_004113	CTGG	2	8	4678	4685	0 %	25 %	50 %	25 %	22297550
10	NC_004113	AGCG	2	8	5455	5462	25 %	0 %	50 %	25 %	22297551
11	NC_004113	ACGA	2	8	5637	5644	50 %	0 %	25 %	25 %	22297551
12	NC_004113	GTCG	2	8	7516	7523	0 %	25 %	50 %	25 %	22297551
13	NC_004113	CGGC	2	8	7707	7714	0 %	0 %	50 %	50 %	22297552
14	NC_004113	ACCC	2	8	7811	7818	25 %	0 %	0 %	75 %	22297552
15	NC_004113	CCTT	2	8	7836	7843	0 %	50 %	0 %	50 %	22297552
16	NC_004113	TTAA	2	8	8322	8329	50 %	50 %	0 %	0 %	22297552
17	NC_004113	CACC	2	8	8970	8977	25 %	0 %	0 %	75 %	22297553
18	NC_004113	CCGC	2	8	9349	9356	0 %	0 %	25 %	75 %	22297553
19	NC_004113	GCAC	2	8	9795	9802	25 %	0 %	25 %	50 %	22297554
20	NC_004113	AGGA	2	8	9808	9815	50 %	0 %	50 %	0 %	22297554
21	NC_004113	CCAA	2	8	10654	10661	50 %	0 %	0 %	50 %	22297554
22	NC_004113	TTTG	2	8	10973	10980	0 %	75 %	25 %	0 %	22297555
23	NC_004113	CCGC	2	8	11763	11770	0 %	0 %	25 %	75 %	22297556
24	NC_004113	CTCC	2	8	12189	12196	0 %	25 %	0 %	75 %	22297556
25	NC_004113	TAGG	2	8	12721	12728	25 %	25 %	50 %	0 %	22297557
26	NC_004113	AGCA	2	8	13630	13637	50 %	0 %	25 %	25 %	22297557
27	NC_004113	ACGC	2	8	14033	14040	25 %	0 %	25 %	50 %	22297558
28	NC_004113	CAGC	2	8	14309	14316	25 %	0 %	25 %	50 %	22297559
29	NC_004113	GCTT	2	8	15191	15198	0 %	50 %	25 %	25 %	22297559
30	NC_004113	CCAG	2	8	15783	15790	25 %	0 %	25 %	50 %	22297560
31	NC_004113	GGTG	2	8	16002	16009	0 %	25 %	75 %	0 %	22297560
32	NC_004113	ATTC	2	8	16179	16186	25 %	50 %	0 %	25 %	22297560
33	NC_004113	TGCC	2	8	16609	16616	0 %	25 %	25 %	50 %	22297560
34	NC_004113	CCAC	2	8	16626	16633	25 %	0 %	0 %	75 %	22297560
35	NC_004113	AGGG	2	8	17215	17222	25 %	0 %	75 %	0 %	22297561
36	NC_004113	CTGC	2	8	17375	17382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004113	TTCA	2	8	17783	17790	25 %	50 %	0 %	25 %	22297562
38	NC_004113	CTGG	2	8	17848	17855	0 %	25 %	50 %	25 %	22297562
39	NC_004113	GAAG	2	8	18148	18155	50 %	0 %	50 %	0 %	22297562
40	NC_004113	AGCC	2	8	18598	18605	25 %	0 %	25 %	50 %	22297562
41	NC_004113	TTGA	2	8	19002	19009	25 %	50 %	25 %	0 %	22297563
42	NC_004113	GCGG	2	8	20312	20319	0 %	0 %	75 %	25 %	22297565
43	NC_004113	TTGA	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	22297565
44	NC_004113	ATTC	2	8	21737	21744	25 %	50 %	0 %	25 %	22297567
45	NC_004113	GAGG	2	8	22740	22747	25 %	0 %	75 %	0 %	22297569
46	NC_004113	AATC	2	8	23218	23225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004113	GTAA	2	8	23282	23289	50 %	25 %	25 %	0 %	22297570
48	NC_004113	CTTC	2	8	23749	23756	0 %	50 %	0 %	50 %	22297571
49	NC_004113	TTTC	2	8	24702	24709	0 %	75 %	0 %	25 %	22297572
50	NC_004113	GTTA	2	8	25051	25058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004113	TGTT	2	8	25198	25205	0 %	75 %	25 %	0 %	22297573
52	NC_004113	GTCC	2	8	25365	25372	0 %	25 %	25 %	50 %	22297573
53	NC_004113	AGGC	2	8	27779	27786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004113	CCCG	2	8	27892	27899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_004113	TGCT	2	8	28294	28301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004113	AGGC	2	8	28408	28415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_004113	TGCA	2	8	28690	28697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004113	ACCA	2	8	28842	28849	50 %	0 %	0 %	50 %	22297575
59	NC_004113	GAAG	2	8	28934	28941	50 %	0 %	50 %	0 %	22297575
60	NC_004113	CCCA	2	8	29490	29497	25 %	0 %	0 %	75 %	22297575
61	NC_004113	AGGG	2	8	29512	29519	25 %	0 %	75 %	0 %	22297575
62	NC_004113	CAAA	2	8	30019	30026	75 %	0 %	0 %	25 %	22297575
63	NC_004113	ATCA	2	8	31189	31196	50 %	25 %	0 %	25 %	22297576
64	NC_004113	TGTT	2	8	31743	31750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004113	AGTG	2	8	31876	31883	25 %	25 %	50 %	0 %	22297577
66	NC_004113	GGAC	2	8	31999	32006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004113	GTTG	2	8	32566	32573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004113	TGAT	2	8	32691	32698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004113	AACG	2	8	32862	32869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004113	GGAA	2	8	32876	32883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004113	GTAG	2	8	32920	32927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004113	TGAT	2	8	33487	33494	25 %	50 %	25 %	0 %	22297580
73	NC_004113	AGCA	2	8	33793	33800	50 %	0 %	25 %	25 %	22297580
74	NC_004113	TCCC	2	8	34810	34817	0 %	25 %	0 %	75 %	22297581
75	NC_004113	TAAA	2	8	35320	35327	75 %	25 %	0 %	0 %	22297583
76	NC_004113	AGGT	2	8	35842	35849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004113	GGTC	2	8	36051	36058	0 %	25 %	50 %	25 %	22297585
78	NC_004113	GTGG	2	8	38316	38323	0 %	25 %	75 %	0 %	22297587
79	NC_004113	CCAC	2	8	38540	38547	25 %	0 %	0 %	75 %	22297588
80	NC_004113	TGCC	2	8	38887	38894	0 %	25 %	25 %	50 %	22297589
81	NC_004113	GTTG	2	8	38928	38935	0 %	50 %	50 %	0 %	22297589
82	NC_004113	GCCT	2	8	39452	39459	0 %	25 %	25 %	50 %	22297589
83	NC_004113	GAAA	2	8	39684	39691	75 %	0 %	25 %	0 %	22297589
84	NC_004113	CCAC	2	8	40059	40066	25 %	0 %	0 %	75 %	22297589
85	NC_004113	CAAT	2	8	41965	41972	50 %	25 %	0 %	25 %	22297592
86	NC_004113	GGCC	2	8	42838	42845	0 %	0 %	50 %	50 %	22297593
87	NC_004113	CCCA	2	8	43221	43228	25 %	0 %	0 %	75 %	22297593
88	NC_004113	TGAC	2	8	43301	43308	25 %	25 %	25 %	25 %	22297593
89	NC_004113	ATTG	2	8	44611	44618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004113	CAAT	2	8	44657	44664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004113	ACCT	2	8	45014	45021	25 %	25 %	0 %	50 %	22297594
92	NC_004113	GTCG	2	8	45305	45312	0 %	25 %	50 %	25 %	22297594
93	NC_004113	GATT	2	8	45929	45936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004113	GAGT	2	8	46100	46107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004113	GTGC	2	8	46667	46674	0 %	25 %	50 %	25 %	22297595
96	NC_004113	CGGC	2	8	47657	47664	0 %	0 %	50 %	50 %	22297595
97	NC_004113	ACCC	2	8	48058	48065	25 %	0 %	0 %	75 %	22297595
98	NC_004113	TCAG	2	8	48126	48133	25 %	25 %	25 %	25 %	22297595
99	NC_004113	GATC	2	8	48517	48524	25 %	25 %	25 %	25 %	22297595
100	NC_004113	TCAA	2	8	48942	48949	50 %	25 %	0 %	25 %	22297595
101	NC_004113	TGAT	2	8	48963	48970	25 %	50 %	25 %	0 %	22297595
102	NC_004113	AGCA	2	8	49215	49222	50 %	0 %	25 %	25 %	22297596
103	NC_004113	GTGG	2	8	49541	49548	0 %	25 %	75 %	0 %	22297596
104	NC_004113	TGGG	2	8	49566	49573	0 %	25 %	75 %	0 %	22297596
105	NC_004113	TTTC	2	8	49771	49778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004113	TTAC	2	8	50349	50356	25 %	50 %	0 %	25 %	22297597
107	NC_004113	CCAA	2	8	50364	50371	50 %	0 %	0 %	50 %	22297597
108	NC_004113	CCCT	2	8	50420	50427	0 %	25 %	0 %	75 %	22297597
109	NC_004113	CGGG	2	8	50540	50547	0 %	0 %	75 %	25 %	22297597
110	NC_004113	TGGC	2	8	51169	51176	0 %	25 %	50 %	25 %	22297598
111	NC_004113	TGGG	2	8	51449	51456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004113	GTCG	2	8	52094	52101	0 %	25 %	50 %	25 %	22297600
113	NC_004113	CACT	2	8	52515	52522	25 %	25 %	0 %	50 %	22297600
114	NC_004113	CAAA	2	8	52807	52814	75 %	0 %	0 %	25 %	22297600
115	NC_004113	ATCT	2	8	52862	52869	25 %	50 %	0 %	25 %	22297600
116	NC_004113	CCTC	2	8	53191	53198	0 %	25 %	0 %	75 %	22297601
117	NC_004113	TGAT	2	8	53323	53330	25 %	50 %	25 %	0 %	22297601
118	NC_004113	AAAG	2	8	54017	54024	75 %	0 %	25 %	0 %	22297602
119	NC_004113	AAGG	2	8	54063	54070	50 %	0 %	50 %	0 %	22297602
120	NC_004113	TTGA	2	8	54159	54166	25 %	50 %	25 %	0 %	22297602
121	NC_004113	GATT	2	8	54343	54350	25 %	50 %	25 %	0 %	22297602
122	NC_004113	CTGA	2	8	54869	54876	25 %	25 %	25 %	25 %	22297603
123	NC_004113	TCAA	2	8	55269	55276	50 %	25 %	0 %	25 %	22297603
124	NC_004113	GATG	2	8	55857	55864	25 %	25 %	50 %	0 %	22297604
125	NC_004113	ACCC	2	8	56268	56275	25 %	0 %	0 %	75 %	22297604
126	NC_004113	GGAC	2	8	56904	56911	25 %	0 %	50 %	25 %	22297605
127	NC_004113	TGGA	2	8	57105	57112	25 %	25 %	50 %	0 %	22297605
128	NC_004113	CTGG	2	8	57530	57537	0 %	25 %	50 %	25 %	22297605
129	NC_004113	CGGC	2	8	57805	57812	0 %	0 %	50 %	50 %	22297605
130	NC_004113	GGCG	2	8	57998	58005	0 %	0 %	75 %	25 %	22297605
131	NC_004113	CTGT	2	8	58300	58307	0 %	50 %	25 %	25 %	22297606
132	NC_004113	CGCC	2	8	58339	58346	0 %	0 %	25 %	75 %	22297606
133	NC_004113	AGAC	2	8	58458	58465	50 %	0 %	25 %	25 %	22297606
134	NC_004113	AGCC	2	8	58770	58777	25 %	0 %	25 %	50 %	22297607
135	NC_004113	CAAC	2	8	58797	58804	50 %	0 %	0 %	50 %	22297607
136	NC_004113	AAAC	2	8	58914	58921	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004113	CAGC	2	8	60698	60705	25 %	0 %	25 %	50 %	22297609
138	NC_004113	TCAA	2	8	60923	60930	50 %	25 %	0 %	25 %	22297609
139	NC_004113	GCGG	2	8	61983	61990	0 %	0 %	75 %	25 %	22297611
140	NC_004113	TCAT	2	8	62538	62545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004113	CCTG	2	8	62882	62889	0 %	25 %	25 %	50 %	22297613
142	NC_004113	GTGA	2	8	62898	62905	25 %	25 %	50 %	0 %	22297613
143	NC_004113	CAGT	2	8	63766	63773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004113	GAAA	2	8	64402	64409	75 %	0 %	25 %	0 %	22297614
145	NC_004113	AGCG	2	8	64439	64446	25 %	0 %	50 %	25 %	22297614
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