MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 30937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	GCA	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297545
2	NC_004113	GGC	2	6	399	404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297545
3	NC_004113	GCC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297545
4	NC_004113	CCA	3	9	667	675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297545
5	NC_004113	ACA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297545
6	NC_004113	CGG	2	6	776	781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297545
7	NC_004113	CCA	2	6	986	991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297545
8	NC_004113	GTT	2	6	1044	1049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297545
9	NC_004113	GCC	3	9	1074	1082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297545
10	NC_004113	GGT	2	6	1124	1129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297545
11	NC_004113	CGG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297546
12	NC_004113	CAA	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297546
13	NC_004113	TGC	2	6	1558	1563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297546
14	NC_004113	TGT	2	6	1628	1633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297546
15	NC_004113	TAA	2	6	1713	1718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297546
16	NC_004113	CCG	2	6	1788	1793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297546
17	NC_004113	CAC	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297546
18	NC_004113	GCA	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297546
19	NC_004113	GCA	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297546
20	NC_004113	ACT	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297546
21	NC_004113	CAC	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297546
22	NC_004113	CCA	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297546
23	NC_004113	CAC	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297546
24	NC_004113	ACC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297546
25	NC_004113	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297547
26	NC_004113	CTG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297547
27	NC_004113	TGA	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297548
28	NC_004113	TTG	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297548
29	NC_004113	GAA	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297548
30	NC_004113	GGC	3	9	2954	2962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297549
31	NC_004113	TGG	2	6	3053	3058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297549
32	NC_004113	CAG	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297549
33	NC_004113	GCC	2	6	3263	3268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297549
34	NC_004113	GGC	2	6	3287	3292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297549
35	NC_004113	CCA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297549
36	NC_004113	GCT	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297549
37	NC_004113	AGC	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297549
38	NC_004113	TTG	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297549
39	NC_004113	TGC	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297549
40	NC_004113	GGA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297549
41	NC_004113	ATT	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297549
42	NC_004113	CCA	2	6	3778	3783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297549
43	NC_004113	TAT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297549
44	NC_004113	CTC	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297549
45	NC_004113	TAT	2	6	3931	3936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297549
46	NC_004113	ACC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297549
47	NC_004113	CAA	2	6	4324	4329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297549
48	NC_004113	TGC	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297549
49	NC_004113	ACT	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297549
50	NC_004113	ACA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297550
51	NC_004113	CAA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297550
52	NC_004113	ACC	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297550
53	NC_004113	GCT	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297550
54	NC_004113	GCC	2	6	4718	4723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297550
55	NC_004113	ATC	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297550
56	NC_004113	CGC	2	6	4820	4825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297550
57	NC_004113	ACC	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297550
58	NC_004113	CCA	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
59	NC_004113	CCA	2	6	5542	5547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
60	NC_004113	TCA	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
61	NC_004113	CTC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297551
62	NC_004113	GCA	2	6	5647	5652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
63	NC_004113	CGG	2	6	5723	5728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297551
64	NC_004113	TAG	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297551
65	NC_004113	AGC	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
66	NC_004113	GAC	2	6	5860	5865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
67	NC_004113	TGG	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297551
68	NC_004113	CCA	2	6	6017	6022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
69	NC_004113	TTG	2	6	6073	6078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297551
70	NC_004113	TGC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297551
71	NC_004113	GGA	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297551
72	NC_004113	ATC	2	6	6220	6225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
73	NC_004113	AGC	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
74	NC_004113	TCA	2	6	6293	6298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
75	NC_004113	TGT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297551
76	NC_004113	AGC	2	6	6358	6363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
77	NC_004113	ATC	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
78	NC_004113	CGG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297551
79	NC_004113	AGG	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297551
80	NC_004113	CAG	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297551
81	NC_004113	CAT	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
82	NC_004113	AAG	2	6	6766	6771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297551
83	NC_004113	ATC	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
84	NC_004113	GAA	2	6	6810	6815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297551
85	NC_004113	GTG	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297551
86	NC_004113	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297551
87	NC_004113	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297551
88	NC_004113	CTG	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297551
89	NC_004113	CTG	2	6	7161	7166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297551
90	NC_004113	CAT	2	6	7283	7288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297551
91	NC_004113	AAT	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297551
92	NC_004113	TTG	2	6	7369	7374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297551
93	NC_004113	CCA	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
94	NC_004113	CCA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
95	NC_004113	CCA	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297551
96	NC_004113	GTG	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297551
97	NC_004113	GGC	2	6	7624	7629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297551
98	NC_004113	ACC	2	6	7740	7745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297552
99	NC_004113	CAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297552
100	NC_004113	CCA	2	6	7786	7791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297552
101	NC_004113	CGT	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297552
102	NC_004113	CGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297552
103	NC_004113	AAT	2	6	8237	8242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297552
104	NC_004113	GCT	2	6	8300	8305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297552
105	NC_004113	TAA	2	6	8416	8421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297552
106	NC_004113	AGC	2	6	8481	8486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297552
107	NC_004113	CAC	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297552
108	NC_004113	AGG	2	6	8514	8519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297552
109	NC_004113	CAA	2	6	8573	8578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297552
110	NC_004113	ACG	2	6	8712	8717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297552
111	NC_004113	GAG	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297552
112	NC_004113	TCT	2	6	8804	8809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297553
113	NC_004113	TGC	2	6	8814	8819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297553
114	NC_004113	GAC	2	6	8846	8851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297553
115	NC_004113	CAC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297553
116	NC_004113	GCC	2	6	9135	9140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297553
117	NC_004113	ATC	2	6	9244	9249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297553
118	NC_004113	CAA	2	6	9293	9298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297553
119	NC_004113	GCC	2	6	9372	9377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297553
120	NC_004113	TTG	2	6	9430	9435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297553
121	NC_004113	CTT	2	6	9440	9445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297553
122	NC_004113	GGC	2	6	9531	9536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297553
123	NC_004113	GGC	2	6	9588	9593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297553
124	NC_004113	CAG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297553
125	NC_004113	TGT	2	6	9788	9793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297554
126	NC_004113	GGC	2	6	10166	10171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297554
127	NC_004113	GGC	2	6	10301	10306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297554
128	NC_004113	CTG	2	6	10311	10316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297554
129	NC_004113	TGC	2	6	10393	10398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297554
130	NC_004113	GGA	2	6	10448	10453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297554
131	NC_004113	GTC	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297554
132	NC_004113	GAT	2	6	10779	10784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297554
133	NC_004113	AGC	2	6	10793	10798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297554
134	NC_004113	GCA	3	9	10830	10838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297554
135	NC_004113	GCA	2	6	10958	10963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297555
136	NC_004113	CTG	2	6	11045	11050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297555
137	NC_004113	GTG	2	6	11129	11134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297555
138	NC_004113	GCC	2	6	11337	11342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297556
139	NC_004113	GAT	2	6	11379	11384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297556
140	NC_004113	TGG	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297556
141	NC_004113	CAC	2	6	11473	11478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297556
142	NC_004113	CCT	2	6	11484	11489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297556
143	NC_004113	CGC	2	6	11593	11598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297556
144	NC_004113	TCT	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297556
145	NC_004113	CGT	2	6	11803	11808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297556
146	NC_004113	ACC	3	9	11975	11983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297556
147	NC_004113	ATG	2	6	12002	12007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297556
148	NC_004113	TCT	2	6	12017	12022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297556
149	NC_004113	ATT	2	6	12292	12297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297556
150	NC_004113	CTA	2	6	12303	12308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297556
151	NC_004113	ACG	2	6	12419	12424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297556
152	NC_004113	TAG	2	6	12458	12463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297557
153	NC_004113	ACC	2	6	12686	12691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297557
154	NC_004113	CAC	2	6	12937	12942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297557
155	NC_004113	TGA	2	6	12990	12995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297557
156	NC_004113	AGC	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297557
157	NC_004113	ATC	2	6	13193	13198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297557
158	NC_004113	TTC	2	6	13219	13224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297557
159	NC_004113	CTC	2	6	13261	13266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297557
160	NC_004113	GTT	2	6	13425	13430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297557
161	NC_004113	CTG	2	6	13480	13485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297557
162	NC_004113	GGA	2	6	13501	13506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297557
163	NC_004113	CGA	2	6	13577	13582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297557
164	NC_004113	GTC	2	6	13742	13747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297558
165	NC_004113	TCA	2	6	13848	13853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297558
166	NC_004113	CCT	2	6	14017	14022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297558
167	NC_004113	CCG	2	6	14167	14172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297559
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169	NC_004113	ACC	2	6	14298	14303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297559
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171	NC_004113	CGC	2	6	14495	14500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297559
172	NC_004113	CAC	2	6	14543	14548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297559
173	NC_004113	CAC	2	6	14573	14578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297559
174	NC_004113	GCA	2	6	14809	14814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297559
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181	NC_004113	GCT	2	6	15681	15686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297560
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200	NC_004113	TGC	2	6	17995	18000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297562
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211	NC_004113	TAC	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297562
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223	NC_004113	ACC	2	6	19791	19796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297564
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226	NC_004113	TGG	2	6	19958	19963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297564
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230	NC_004113	CGG	2	6	20258	20263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297564
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232	NC_004113	CAA	2	6	20389	20394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297565
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239	NC_004113	CCA	2	6	21546	21551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297566
240	NC_004113	TCC	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297566
241	NC_004113	TTC	2	6	21589	21594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297566
242	NC_004113	CGC	2	6	21638	21643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297566
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244	NC_004113	AAT	2	6	21852	21857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297567
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249	NC_004113	CCA	2	6	22257	22262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297568
250	NC_004113	CGC	2	6	22271	22276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297568
251	NC_004113	AAG	2	6	22609	22614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297568
252	NC_004113	CAG	2	6	22638	22643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297568
253	NC_004113	CAA	2	6	22700	22705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297569
254	NC_004113	AAT	2	6	22770	22775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297569
255	NC_004113	ATG	2	6	22861	22866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297569
256	NC_004113	CGC	2	6	23002	23007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297569
257	NC_004113	GTT	2	6	23269	23274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297570
258	NC_004113	CAT	2	6	23307	23312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297570
259	NC_004113	AGT	2	6	23427	23432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297570
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262	NC_004113	GTG	2	6	23838	23843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297571
263	NC_004113	CTC	2	6	23845	23850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297571
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289	NC_004113	ATT	2	6	26190	26195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297573
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292	NC_004113	ACC	2	6	26520	26525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297574
293	NC_004113	GGT	2	6	26684	26689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297574
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