MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 2370

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	CT	3	6	573	578	0 %	50 %	0 %	50 %	22297545
2	NC_004113	CT	3	6	1245	1250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004113	TC	3	6	2346	2351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004113	AC	3	6	5805	5810	50 %	0 %	0 %	50 %	22297551
5	NC_004113	CA	3	6	6582	6587	50 %	0 %	0 %	50 %	22297551
6	NC_004113	CA	3	6	7429	7434	50 %	0 %	0 %	50 %	22297551
7	NC_004113	CA	3	6	9846	9851	50 %	0 %	0 %	50 %	22297554
8	NC_004113	GC	3	6	10224	10229	0 %	0 %	50 %	50 %	22297554
9	NC_004113	GC	3	6	13036	13041	0 %	0 %	50 %	50 %	22297557
10	NC_004113	CG	3	6	14401	14406	0 %	0 %	50 %	50 %	22297559
11	NC_004113	AC	3	6	14994	14999	50 %	0 %	0 %	50 %	22297559
12	NC_004113	AG	3	6	16024	16029	50 %	0 %	50 %	0 %	22297560
13	NC_004113	GA	3	6	16043	16048	50 %	0 %	50 %	0 %	22297560
14	NC_004113	CA	3	6	17885	17890	50 %	0 %	0 %	50 %	22297562
15	NC_004113	AG	3	6	20979	20984	50 %	0 %	50 %	0 %	22297565
16	NC_004113	GC	3	6	22281	22286	0 %	0 %	50 %	50 %	22297568
17	NC_004113	GA	3	6	22960	22965	50 %	0 %	50 %	0 %	22297569
18	NC_004113	GA	3	6	23276	23281	50 %	0 %	50 %	0 %	22297570
19	NC_004113	AC	3	6	23391	23396	50 %	0 %	0 %	50 %	22297570
20	NC_004113	TC	3	6	23542	23547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004113	CT	3	6	24524	24529	0 %	50 %	0 %	50 %	22297571
22	NC_004113	AG	3	6	25682	25687	50 %	0 %	50 %	0 %	22297573
23	NC_004113	AG	3	6	26786	26791	50 %	0 %	50 %	0 %	22297574
24	NC_004113	AG	3	6	28660	28665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004113	CA	3	6	29072	29077	50 %	0 %	0 %	50 %	22297575
26	NC_004113	TA	3	6	29146	29151	50 %	50 %	0 %	0 %	22297575
27	NC_004113	AC	3	6	29893	29898	50 %	0 %	0 %	50 %	22297575
28	NC_004113	TC	3	6	30930	30935	0 %	50 %	0 %	50 %	22297576
29	NC_004113	TG	3	6	31993	31998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004113	GT	3	6	32715	32720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004113	TC	3	6	33051	33056	0 %	50 %	0 %	50 %	22297579
32	NC_004113	GC	3	6	36017	36022	0 %	0 %	50 %	50 %	22297585
33	NC_004113	CT	3	6	36213	36218	0 %	50 %	0 %	50 %	22297585
34	NC_004113	TG	3	6	37003	37008	0 %	50 %	50 %	0 %	22297586
35	NC_004113	CA	3	6	39386	39391	50 %	0 %	0 %	50 %	22297589
36	NC_004113	AC	4	8	42058	42065	50 %	0 %	0 %	50 %	22297592
37	NC_004113	GT	3	6	42890	42895	0 %	50 %	50 %	0 %	22297593
38	NC_004113	GT	3	6	42944	42949	0 %	50 %	50 %	0 %	22297593
39	NC_004113	GC	3	6	43489	43494	0 %	0 %	50 %	50 %	22297593
40	NC_004113	CG	3	6	44599	44604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004113	TC	4	8	49929	49936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004113	GA	3	6	50031	50036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004113	CG	3	6	52665	52670	0 %	0 %	50 %	50 %	22297600
44	NC_004113	CT	3	6	55412	55417	0 %	50 %	0 %	50 %	22297604
45	NC_004113	GA	3	6	55421	55426	50 %	0 %	50 %	0 %	22297604
46	NC_004113	GA	3	6	56831	56836	50 %	0 %	50 %	0 %	22297605
47	NC_004113	AG	3	6	57616	57621	50 %	0 %	50 %	0 %	22297605
48	NC_004113	CA	3	6	59923	59928	50 %	0 %	0 %	50 %	22297608
49	NC_004113	CA	3	6	61095	61100	50 %	0 %	0 %	50 %	22297610
50	NC_004113	GA	4	8	62494	62501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004113	GT	3	6	62953	62958	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
52	NC_004113	TG	3	6	63423	63428	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
53	NC_004113	TG	3	6	63658	63663	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
54	NC_004113	AC	3	6	67490	67495	50 %	0 %	0 %	50 %	22297617
55	NC_004113	GC	3	6	69212	69217	0 %	0 %	50 %	50 %	22297620
56	NC_004113	GA	3	6	70107	70112	50 %	0 %	50 %	0 %	22297620
57	NC_004113	AG	3	6	70713	70718	50 %	0 %	50 %	0 %	22297621
58	NC_004113	TC	3	6	71419	71424	0 %	50 %	0 %	50 %	22297623
59	NC_004113	CA	3	6	72194	72199	50 %	0 %	0 %	50 %	22297624
60	NC_004113	GA	3	6	73216	73221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004113	GA	3	6	73530	73535	50 %	0 %	50 %	0 %	22297625
62	NC_004113	GC	3	6	74751	74756	0 %	0 %	50 %	50 %	22297627
63	NC_004113	CT	3	6	78910	78915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004113	GT	4	8	81848	81855	0 %	50 %	50 %	0 %	22297642
65	NC_004113	TC	3	6	82120	82125	0 %	50 %	0 %	50 %	22297643
66	NC_004113	CA	3	6	84201	84206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_004113	AC	3	6	85773	85778	50 %	0 %	0 %	50 %	22297649
68	NC_004113	AG	3	6	86030	86035	50 %	0 %	50 %	0 %	22297649
69	NC_004113	TC	3	6	86285	86290	0 %	50 %	0 %	50 %	22297650
70	NC_004113	GA	3	6	89303	89308	50 %	0 %	50 %	0 %	22297655
71	NC_004113	GT	3	6	92033	92038	0 %	50 %	50 %	0 %	22297658
72	NC_004113	AT	3	6	92572	92577	50 %	50 %	0 %	0 %	22297658
73	NC_004113	TG	3	6	92854	92859	0 %	50 %	50 %	0 %	22297658
74	NC_004113	AG	3	6	93163	93168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004113	TG	3	6	95115	95120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004113	CA	3	6	95884	95889	50 %	0 %	0 %	50 %	22297661
77	NC_004113	AG	3	6	96883	96888	50 %	0 %	50 %	0 %	22297663
78	NC_004113	AC	3	6	99891	99896	50 %	0 %	0 %	50 %	22297666
79	NC_004113	GA	3	6	101364	101369	50 %	0 %	50 %	0 %	22297667
80	NC_004113	TG	3	6	105475	105480	0 %	50 %	50 %	0 %	22297672
81	NC_004113	CA	3	6	105669	105674	50 %	0 %	0 %	50 %	22297672
82	NC_004113	GC	3	6	106577	106582	0 %	0 %	50 %	50 %	22297672
83	NC_004113	GT	3	6	106679	106684	0 %	50 %	50 %	0 %	22297672
84	NC_004113	AT	3	6	108255	108260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004113	GA	3	6	109988	109993	50 %	0 %	50 %	0 %	22297674
86	NC_004113	GA	3	6	110526	110531	50 %	0 %	50 %	0 %	22297674
87	NC_004113	AG	3	6	110701	110706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004113	GA	3	6	111629	111634	50 %	0 %	50 %	0 %	22297675
89	NC_004113	GA	3	6	114307	114312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004113	AG	3	6	114541	114546	50 %	0 %	50 %	0 %	22297678
91	NC_004113	AG	3	6	114914	114919	50 %	0 %	50 %	0 %	22297678
92	NC_004113	AC	3	6	115489	115494	50 %	0 %	0 %	50 %	22297678
93	NC_004113	CA	3	6	118934	118939	50 %	0 %	0 %	50 %	22297683
94	NC_004113	CT	3	6	122463	122468	0 %	50 %	0 %	50 %	22297685
95	NC_004113	CT	3	6	123102	123107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004113	GC	3	6	123962	123967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_004113	CG	3	6	124370	124375	0 %	0 %	50 %	50 %	22297687
98	NC_004113	CT	3	6	124502	124507	0 %	50 %	0 %	50 %	22297687
99	NC_004113	TC	4	8	124538	124545	0 %	50 %	0 %	50 %	22297687
100	NC_004113	GC	3	6	125679	125684	0 %	0 %	50 %	50 %	22297688
101	NC_004113	TC	3	6	125892	125897	0 %	50 %	0 %	50 %	22297689
102	NC_004113	CA	3	6	128021	128026	50 %	0 %	0 %	50 %	22297690
103	NC_004113	TC	3	6	129567	129572	0 %	50 %	0 %	50 %	22297692
104	NC_004113	CA	3	6	131108	131113	50 %	0 %	0 %	50 %	22297694
105	NC_004113	CA	3	6	132420	132425	50 %	0 %	0 %	50 %	22297695
106	NC_004113	TG	3	6	133539	133544	0 %	50 %	50 %	0 %	22297695
107	NC_004113	GC	3	6	135573	135578	0 %	0 %	50 %	50 %	22297696
108	NC_004113	GC	3	6	136383	136388	0 %	0 %	50 %	50 %	22297697
109	NC_004113	CT	3	6	137688	137693	0 %	50 %	0 %	50 %	22297697
110	NC_004113	CA	3	6	137732	137737	50 %	0 %	0 %	50 %	22297697
111	NC_004113	AC	3	6	140006	140011	50 %	0 %	0 %	50 %	22297700
112	NC_004113	AC	3	6	140800	140805	50 %	0 %	0 %	50 %	22297702
113	NC_004113	GA	3	6	141221	141226	50 %	0 %	50 %	0 %	22297702
114	NC_004113	GA	3	6	141887	141892	50 %	0 %	50 %	0 %	22297702
115	NC_004113	CA	3	6	142062	142067	50 %	0 %	0 %	50 %	22297702
116	NC_004113	TG	3	6	143374	143379	0 %	50 %	50 %	0 %	22297704
117	NC_004113	GC	3	6	143739	143744	0 %	0 %	50 %	50 %	22297705
118	NC_004113	GA	3	6	146999	147004	50 %	0 %	50 %	0 %	22297708
119	NC_004113	GA	3	6	147563	147568	50 %	0 %	50 %	0 %	22297709
120	NC_004113	TG	3	6	148277	148282	0 %	50 %	50 %	0 %	22297710
121	NC_004113	GC	3	6	148662	148667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004113	TC	3	6	151867	151872	0 %	50 %	0 %	50 %	22297715
123	NC_004113	GA	3	6	153814	153819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004113	TG	3	6	153855	153860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004113	CT	4	8	153887	153894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_004113	GC	3	6	155258	155263	0 %	0 %	50 %	50 %	22297718
127	NC_004113	TC	3	6	156130	156135	0 %	50 %	0 %	50 %	22297718
128	NC_004113	AG	3	6	156205	156210	50 %	0 %	50 %	0 %	22297718
129	NC_004113	AC	4	8	156334	156341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_004113	AC	3	6	156357	156362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004113	GA	3	6	156381	156386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004113	CA	3	6	156930	156935	50 %	0 %	0 %	50 %	22297719
133	NC_004113	AG	3	6	157578	157583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004113	TG	3	6	157909	157914	0 %	50 %	50 %	0 %	22297721
135	NC_004113	CT	3	6	158705	158710	0 %	50 %	0 %	50 %	22297723
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139	NC_004113	GA	3	6	163255	163260	50 %	0 %	50 %	0 %	22297727
140	NC_004113	AG	3	6	163783	163788	50 %	0 %	50 %	0 %	22297728
141	NC_004113	AC	3	6	164362	164367	50 %	0 %	0 %	50 %	22297728
142	NC_004113	AG	3	6	164806	164811	50 %	0 %	50 %	0 %	22297728
143	NC_004113	AG	3	6	165472	165477	50 %	0 %	50 %	0 %	22297728
144	NC_004113	GA	3	6	168637	168642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004113	CT	3	6	171191	171196	0 %	50 %	0 %	50 %	22297733
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