MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004113	CT	3	6	1245	1250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004113	TC	3	6	2346	2351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004113	TC	3	6	23542	23547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004113	AG	3	6	28660	28665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004113	TG	3	6	31993	31998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004113	GT	3	6	32715	32720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004113	CG	3	6	44599	44604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004113	TC	4	8	49929	49936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_004113	GA	3	6	50031	50036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004113	GA	4	8	62494	62501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004113	GA	3	6	73216	73221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004113	CT	3	6	78910	78915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004113	CA	3	6	84201	84206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_004113	AG	3	6	93163	93168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004113	TG	3	6	95115	95120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004113	AT	3	6	108255	108260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004113	AG	3	6	110701	110706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004113	GA	3	6	114307	114312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004113	CT	3	6	123102	123107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004113	GC	3	6	123962	123967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004113	GC	3	6	148662	148667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004113	GA	3	6	153814	153819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004113	TG	3	6	153855	153860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004113	CT	4	8	153887	153894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_004113	AC	4	8	156334	156341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004113	AC	3	6	156357	156362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004113	GA	3	6	156381	156386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004113	AG	3	6	157578	157583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004113	GA	3	6	168637	168642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004113	AG	3	6	173206	173211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004113	GT	3	6	185652	185657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004113	TC	3	6	187009	187014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004113	AG	3	6	199990	199995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004113	GC	3	6	200714	200719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004113	TC	3	6	202330	202335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004113	TC	3	6	203748	203753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004113	GT	3	6	213653	213658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004113	AC	3	6	220477	220482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004113	GC	3	6	221162	221167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004113	CA	3	6	221543	221548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004113	TC	3	6	222488	222493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004113	AC	3	6	223402	223407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_004113	CG	3	6	223681	223686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004113	TG	3	6	227144	227149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004113	TC	3	6	227316	227321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_004113	GC	3	6	228193	228198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004113	AT	3	6	228416	228421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004113	GC	3	6	231046	231051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004113	GA	3	6	231568	231573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004113	CA	3	6	232486	232491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_004113	CA	4	8	232571	232578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_004113	TC	3	6	236107	236112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004113	TC	3	6	236271	236276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004113	GT	3	6	238314	238319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004113	GT	3	6	238487	238492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004113	GA	3	6	239371	239376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004113	AG	3	6	245739	245744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004113	CT	3	6	245923	245928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004113	AT	3	6	247343	247348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004113	GA	3	6	257376	257381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004113	CT	3	6	272136	272141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004113	TA	3	6	273501	273506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004113	GT	3	6	280462	280467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004113	GA	3	6	284292	284297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004113	AG	3	6	294722	294727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004113	CT	3	6	308547	308552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_004113	AT	3	6	311011	311016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004113	TG	3	6	311997	312002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004113	TG	3	6	312116	312121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004113	AC	3	6	321558	321563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_004113	TG	3	6	321874	321879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004113	AG	3	6	322991	322996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004113	CG	3	6	327337	327342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_004113	CT	3	6	333874	333879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004113	AC	3	6	336883	336888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004113	TC	3	6	374951	374956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_004113	TG	3	6	380960	380965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004113	TC	3	6	401679	401684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004113	CT	3	6	401889	401894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004113	AC	3	6	403148	403153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004113	GA	3	6	403294	403299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004113	CT	4	8	406800	406807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_004113	TC	3	6	431450	431455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_004113	AC	3	6	441186	441191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004113	AG	3	6	445460	445465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004113	AC	3	6	445697	445702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_004113	CT	3	6	447456	447461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004113	AT	3	6	447481	447486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004113	CT	3	6	447735	447740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004113	AG	3	6	447832	447837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004113	CA	3	6	447838	447843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_004113	TC	3	6	465917	465922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004113	AG	3	6	490012	490017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004113	GA	3	6	491278	491283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004113	CG	3	6	491288	491293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004113	TC	3	6	509490	509495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_004113	TC	3	6	510611	510616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004113	AG	3	6	510648	510653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004113	CT	3	6	511446	511451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_004113	TA	3	6	519469	519474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004113	AG	3	6	520799	520804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004113	GA	3	6	524153	524158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004113	AT	3	6	529664	529669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004113	CA	3	6	532962	532967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004113	GC	3	6	532969	532974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004113	TC	3	6	545157	545162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004113	AC	3	6	546800	546805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_004113	AC	3	6	557971	557976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004113	GT	3	6	558198	558203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004113	CT	3	6	562477	562482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004113	GT	3	6	599898	599903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004113	TC	3	6	612683	612688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_004113	TC	3	6	615217	615222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004113	CT	3	6	623469	623474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_004113	TG	3	6	623502	623507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004113	TC	3	6	625533	625538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004113	TC	3	6	632068	632073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_004113	GT	3	6	668033	668038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004113	AG	3	6	670551	670556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004113	AT	3	6	706246	706251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004113	TC	3	6	707840	707845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004113	CA	3	6	714397	714402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_004113	GA	3	6	714577	714582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004113	CT	3	6	719874	719879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004113	AG	3	6	744652	744657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004113	TG	3	6	747064	747069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004113	GA	3	6	752985	752990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004113	AT	3	6	762311	762316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004113	TC	3	6	772182	772187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_004113	CT	3	6	772200	772205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004113	CG	3	6	777720	777725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_004113	AC	3	6	777758	777763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004113	GT	3	6	778479	778484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004113	TC	3	6	782211	782216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004113	CT	3	6	782331	782336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004113	CT	4	8	786560	786567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_004113	GA	3	6	786712	786717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004113	CT	3	6	792689	792694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_004113	GA	3	6	792743	792748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004113	CT	3	6	797664	797669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004113	GT	3	6	803977	803982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004113	CT	3	6	804843	804848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004113	GC	3	6	816806	816811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_004113	AG	3	6	828362	828367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004113	GT	3	6	832826	832831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004113	GT	3	6	843712	843717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004113	GA	3	6	847977	847982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004113	AT	3	6	859607	859612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004113	CT	3	6	859694	859699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_004113	GA	3	6	859900	859905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004113	TC	3	6	861464	861469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_004113	AC	3	6	874879	874884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_004113	CT	3	6	882132	882137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.