MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004070	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004070	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_004070	AGTGTA	2	12	27883	27894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004070	ACTAAT	2	12	27911	27922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004070	TATTTT	2	12	64891	64902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004070	AGTGTA	2	12	84860	84871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004070	ACTAAT	2	12	84888	84899	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_004070	TTCGGG	2	12	85830	85841	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_004070	ATAAAA	2	12	112975	112986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004070	AGATAA	2	12	124417	124428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004070	AGATAA	2	12	136062	136073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004070	CTTTAT	2	12	161020	161031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004070	CTCTTT	2	12	162884	162895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004070	GGTGTT	2	12	165950	165961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004070	TGACAC	2	12	181625	181636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004070	CAGTTC	2	12	186270	186281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004070	TTTAAA	2	12	188118	188129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004070	TCTTGC	2	12	255562	255573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_004070	AGTGTA	2	12	261003	261014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004070	ACTAAT	2	12	261031	261042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004070	GGGTTA	2	12	276842	276853	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004070	TTAAAA	2	12	282735	282746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004070	TTTAAT	2	12	299816	299827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004070	TTTTAG	2	12	311169	311180	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004070	AAGACC	2	12	326311	326322	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004070	ATTTAA	2	12	357993	358004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004070	TTTACC	2	12	368701	368712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004070	AGTGTA	2	12	379431	379442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004070	AGAAAT	2	12	390899	390910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004070	ATTTTA	2	12	422187	422198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004070	GAGTAA	2	12	427976	427987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004070	TAAAAA	2	12	438865	438876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004070	AGGACT	2	12	443988	443999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004070	AAAAGA	2	12	456444	456455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004070	TAAAAA	2	12	463414	463425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004070	AAAAGA	2	12	463597	463608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004070	GAAAAA	2	12	491918	491929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004070	CATCTT	2	12	524883	524894	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004070	CCTTGT	2	12	529476	529487	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004070	AGGAGA	2	12	562379	562390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004070	TAAATA	2	12	643797	643808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004070	AGGTAA	2	12	654617	654628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004070	TTCGGG	2	12	689690	689701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004070	GAAAAA	2	12	742927	742938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004070	TAATTT	2	12	753772	753783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004070	TAGCAA	2	12	784958	784969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_004070	TTAAAA	2	12	845257	845268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004070	TAACAA	2	12	893617	893628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_004070	GATAAT	2	12	927505	927516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004070	TTTAAA	2	12	955589	955600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004070	CATCCT	2	12	1004567	1004578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_004070	TTGTTT	2	12	1025984	1025995	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004070	ATATGA	2	12	1050967	1050978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004070	ATTCTT	2	12	1063451	1063462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_004070	AGTCTT	2	12	1070813	1070824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_004070	TCTTTT	2	12	1098405	1098416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_004070	CCTTGG	2	12	1130415	1130426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004070	CTAAAA	2	12	1164021	1164032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_004070	TGACTT	2	12	1187961	1187972	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004070	ATGATA	2	12	1194468	1194479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004070	TAGAAT	2	12	1204311	1204322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004070	AGCCTT	2	12	1249427	1249438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004070	TAAAAA	2	12	1256329	1256340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004070	TCCTTC	2	12	1311075	1311086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004070	CGATTC	2	12	1318017	1318028	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004070	CTCAAT	2	12	1353502	1353513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004070	TATTAG	2	12	1354795	1354806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004070	TACACT	2	12	1354824	1354835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004070	GAAAAA	2	12	1360293	1360304	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004070	CAATTC	2	12	1379380	1379391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004070	TATTTT	2	12	1380452	1380463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004070	CTGAAA	2	12	1380504	1380515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004070	AATACC	2	12	1389466	1389477	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004070	ATATTT	2	12	1438599	1438610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004070	GTCTTT	2	12	1466862	1466873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_004070	CTAGTC	2	12	1582189	1582200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004070	AATATT	2	12	1600806	1600817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004070	TATCAC	2	12	1611300	1611311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004070	TTTGCT	2	12	1616554	1616565	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004070	TATAAT	2	12	1619400	1619411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004070	TAACAA	2	12	1630501	1630512	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_004070	TTTTTC	2	12	1632888	1632899	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_004070	AGAAAA	2	12	1635584	1635595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004070	TATTAG	2	12	1641916	1641927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004070	TACACT	2	12	1641945	1641956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004070	GTTAAA	2	12	1657062	1657073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004070	TTTTCA	2	12	1691760	1691771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_004070	TTAATA	2	12	1818620	1818631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004070	ATTTTA	2	12	1829044	1829055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004070	TTTTCA	2	12	1836238	1836249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004070	TAAAAA	2	12	1848218	1848229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004070	AATTTA	3	18	1859677	1859694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004070	GAAAAA	2	12	1896065	1896076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.