MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004070	ACATT	2	10	16522	16531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_004070	TCGTG	2	10	18141	18150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004070	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004070	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004070	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004070	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004070	TCGTG	2	10	24143	24152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004070	GTTAA	2	10	25040	25049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004070	GGGAG	2	10	25559	25568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004070	AGGGA	2	10	27770	27779	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004070	GCTTA	2	10	28136	28145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004070	TTCTT	2	10	29970	29979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004070	CTTTT	2	10	30076	30085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004070	TATAA	2	10	32512	32521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004070	AGCGA	2	10	40638	40647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_004070	AAATT	2	10	51685	51694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004070	CAAAT	2	10	51899	51908	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004070	ATTTT	2	10	61380	61389	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004070	AAATA	2	10	62648	62657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004070	TATAT	2	10	62733	62742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004070	AAGGA	2	10	70591	70600	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004070	GTTTC	2	10	77861	77870	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004070	TCGTG	2	10	81121	81130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004070	GTTAA	2	10	82018	82027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004070	GGGAG	2	10	82537	82546	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004070	AGGGA	2	10	84747	84756	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004070	GCTTA	2	10	85113	85122	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004070	ATTAT	2	10	85403	85412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004070	TATAT	2	10	85486	85495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004070	AGCTC	2	10	90404	90413	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_004070	TTTAG	2	10	110985	110994	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004070	TTTAG	2	10	117701	117710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004070	TTGGC	2	10	135689	135698	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004070	CTTAA	2	10	135888	135897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_004070	ATTAT	2	10	155362	155371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004070	ATATT	2	10	155376	155385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004070	CGTCA	2	10	160783	160792	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_004070	AACAA	2	10	162522	162531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004070	TCTAA	2	10	183129	183138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_004070	TCCCC	2	10	184242	184251	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_004070	TTAAA	2	10	187916	187925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004070	TGTCT	2	10	197033	197042	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_004070	TAAGA	2	10	198551	198560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004070	GTAAA	2	10	201694	201703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004070	CCTTT	2	10	210809	210818	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_004070	AATAA	2	10	217876	217885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004070	TCATT	2	10	248628	248637	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004070	TTGTA	2	10	255251	255260	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004070	TCGTG	2	10	257263	257272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004070	GTTAA	2	10	258160	258169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004070	GGGAG	2	10	258679	258688	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004070	AGGGA	2	10	260890	260899	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004070	AAAAG	2	10	261566	261575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004070	TTATC	2	10	262365	262374	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_004070	GTTAT	2	10	272058	272067	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004070	ATTAT	2	10	276637	276646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004070	ATTAT	2	10	276774	276783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004070	TGTGT	2	10	290027	290036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004070	AAAAG	2	10	298424	298433	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004070	TTATG	2	10	301193	301202	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004070	TGCTA	2	10	309656	309665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004070	CAGGG	2	10	309676	309685	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_004070	TAAAA	2	10	315323	315332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004070	TTTGC	2	10	328884	328893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004070	ACAAG	2	10	333044	333053	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_004070	TTGAT	2	10	339786	339795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004070	AGTAG	2	10	343591	343600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004070	TGAAA	2	10	348727	348736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004070	TAAGA	2	10	350378	350387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004070	TGAGA	2	10	352803	352812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004070	TTGAT	2	10	352826	352835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004070	TTTAT	2	10	362387	362396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004070	AAATC	2	10	366143	366152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004070	AGAAA	2	10	367930	367939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004070	AAGGA	2	10	376605	376614	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004070	ATAAA	2	10	378516	378525	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004070	AATGT	2	10	378790	378799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004070	TAGAG	2	10	381015	381024	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004070	AGTGA	2	10	381430	381439	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004070	AAAGC	2	10	384819	384828	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_004070	TTTTA	2	10	409399	409408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004070	AGCTT	2	10	409480	409489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004070	TTTTC	2	10	409524	409533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004070	TTATT	2	10	437630	437639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004070	GAATG	2	10	438937	438946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004070	TCCTT	2	10	456772	456781	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_004070	GTTAT	2	10	460022	460031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004070	TTTCC	2	10	461589	461598	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004070	AAAAT	2	10	461672	461681	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004070	AGAAA	2	10	461727	461736	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004070	TTAGT	2	10	466141	466150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004070	TATAA	2	10	467168	467177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004070	CTGCT	2	10	473953	473962	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_004070	CTTTT	2	10	476460	476469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004070	ATGGG	2	10	479865	479874	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004070	TTTAG	2	10	479908	479917	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004070	TAGAA	2	10	481607	481616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004070	TAAAA	2	10	482213	482222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004070	TTTCC	2	10	487980	487989	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_004070	AAAAG	2	10	487990	487999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004070	TTAAT	2	10	492136	492145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004070	AGCTG	2	10	496713	496722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_004070	ATAAA	2	10	498092	498101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004070	TTTTG	2	10	500960	500969	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004070	AAGCC	2	10	501947	501956	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_004070	TGATA	2	10	511590	511599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004070	TTATT	2	10	518396	518405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004070	ACGTA	2	10	521263	521272	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_004070	TAAAT	2	10	521932	521941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004070	AAAAG	2	10	538288	538297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004070	ATAAA	2	10	542125	542134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004070	GAATA	2	10	545480	545489	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004070	ATAGA	2	10	554928	554937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004070	AGCAC	2	10	561562	561571	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_004070	TATAA	2	10	562646	562655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004070	AGCAT	2	10	571325	571334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004070	GAAAG	2	10	574578	574587	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004070	ATTTA	2	10	608261	608270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004070	AAAGA	2	10	611352	611361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004070	TCTTT	2	10	611406	611415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_004070	AAATA	2	10	611433	611442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004070	CTTGT	2	10	619091	619100	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_004070	TTCGG	2	10	622536	622545	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_004070	AAAAG	2	10	624433	624442	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004070	TGAAA	2	10	625057	625066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004070	AGATT	2	10	625067	625076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004070	TTTTA	2	10	643498	643507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004070	ATGTT	2	10	648392	648401	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004070	AAAGG	2	10	672197	672206	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004070	ATTGA	2	10	672224	672233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004070	ATGTT	2	10	677370	677379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004070	TCTTA	2	10	679058	679067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004070	CTAAT	2	10	689733	689742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_004070	CTAAT	2	10	689755	689764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004070	CATCT	2	10	692124	692133	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_004070	GGAAA	2	10	709855	709864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004070	TAAGG	2	10	723144	723153	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004070	CACCT	2	10	725367	725376	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_004070	ATGAT	2	10	735371	735380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004070	TAGAA	2	10	742836	742845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004070	ATTTA	2	10	743006	743015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004070	TTTTA	2	10	743020	743029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004070	AAGGA	2	10	753218	753227	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004070	TTATT	2	10	753712	753721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004070	AAAAG	2	10	755343	755352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004070	GAAAT	2	10	764003	764012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004070	AGAAA	2	10	767273	767282	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004070	CTTTT	2	10	787604	787613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_004070	CCTTA	2	10	787830	787839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_004070	ATAAA	2	10	794896	794905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004070	TAAAA	2	10	804751	804760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004070	AATGT	2	10	805420	805429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004070	AATAA	2	10	811124	811133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_004070	AGTTG	2	10	876172	876181	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_004070	ATAAA	2	10	883121	883130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_004070	CATAA	2	10	891290	891299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_004070	ATTTA	2	10	955562	955571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_004070	TATAA	2	10	959969	959978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_004070	ATGTT	2	10	1037607	1037616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_004070	CTCAT	2	10	1762769	1762778	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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288	NC_004070	TTTTG	2	10	1765562	1765571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_004070	TTACT	2	10	1765650	1765659	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_004070	AAAAG	2	10	1774878	1774887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_004070	TATAC	2	10	1784441	1784450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_004070	GGTAA	2	10	1791048	1791057	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
293	NC_004070	AATTA	2	10	1791647	1791656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_004070	TAGAC	2	10	1795510	1795519	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_004070	TAAAA	2	10	1817313	1817322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_004070	TTATC	2	10	1888798	1888807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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315	NC_004070	CTTTT	2	10	1898355	1898364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.