MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004070	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004070	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004070	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004070	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004070	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004070	GAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004070	ACTA	2	8	15059	15066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004070	TACT	2	8	16577	16584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004070	ACCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_004070	AAAT	2	8	17019	17026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004070	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004070	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004070	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004070	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004070	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004070	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004070	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_004070	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004070	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004070	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004070	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004070	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004070	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_004070	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004070	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004070	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_004070	AAAT	2	8	23021	23028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004070	ACCT	2	8	23195	23202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004070	GTGA	2	8	23476	23483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004070	TAAC	2	8	23559	23566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_004070	AGCG	2	8	23647	23654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004070	TGGT	2	8	24312	24319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004070	AGCC	2	8	24529	24536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004070	AGCG	2	8	24875	24882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_004070	GTAA	2	8	25126	25133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004070	ACTA	2	8	25168	25175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004070	GAAG	2	8	25208	25215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004070	GCGA	2	8	25282	25289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_004070	ATTC	2	8	26148	26155	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_004070	CTAA	2	8	26504	26511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004070	TAGG	2	8	27159	27166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004070	TTGG	2	8	27342	27349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004070	AATC	2	8	27351	27358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004070	GCGT	2	8	29198	29205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_004070	TAAA	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004070	GTTA	2	8	30090	30097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004070	ATTC	2	8	30890	30897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004070	ATTA	2	8	33675	33682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004070	AGAA	2	8	36022	36029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004070	GGAA	2	8	36757	36764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004070	TAGT	2	8	43366	43373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004070	AAAG	2	8	44120	44127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004070	TAAT	2	8	47153	47160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004070	AGAA	2	8	48548	48555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004070	TTTA	2	8	54414	54421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004070	GATT	2	8	55684	55691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004070	AAAG	2	8	58474	58481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004070	ATTT	2	8	61528	61535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004070	TATT	2	8	67497	67504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004070	TAAA	2	8	71159	71166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004070	TTAA	2	8	71399	71406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004070	TATT	2	8	75912	75919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004070	AAAT	2	8	79999	80006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004070	ACCT	2	8	80173	80180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004070	GTGA	2	8	80454	80461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004070	TAAC	2	8	80537	80544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004070	AGCG	2	8	80625	80632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_004070	TGGT	2	8	81290	81297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004070	AGCC	2	8	81507	81514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004070	AGCG	2	8	81853	81860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004070	GTAA	2	8	82104	82111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004070	ACTA	2	8	82146	82153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_004070	GAAG	2	8	82186	82193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004070	GCGA	2	8	82260	82267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004070	ATTC	2	8	83125	83132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004070	CTAA	2	8	83481	83488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004070	TAGG	2	8	84136	84143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004070	TTGG	2	8	84319	84326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004070	AATC	2	8	84328	84335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004070	GCGT	2	8	85557	85564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004070	AGTC	2	8	86872	86879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004070	TGAT	2	8	86898	86905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004070	GTTC	2	8	86910	86917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_004070	AAAT	2	8	86937	86944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004070	CAAT	2	8	87072	87079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004070	TTGC	2	8	87481	87488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004070	AAAC	2	8	87845	87852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_004070	CAAT	2	8	97920	97927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004070	GTTA	2	8	108235	108242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004070	TAAG	2	8	110696	110703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004070	ATTT	2	8	112439	112446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004070	ATTA	2	8	117518	117525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004070	CTTG	2	8	122954	122961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_004070	TGAT	2	8	123013	123020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004070	AAAG	2	8	124454	124461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004070	AAAT	2	8	124502	124509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004070	AAAT	2	8	124626	124633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004070	ATTT	2	8	124682	124689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004070	GTAA	2	8	124946	124953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004070	ATCG	2	8	127003	127010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_004070	CTTT	2	8	127884	127891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004070	GTCA	2	8	133286	133293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004070	TATC	2	8	134053	134060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004070	TTAG	2	8	141025	141032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004070	GAAA	2	8	147280	147287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004070	CCTG	2	8	147500	147507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004070	TAGT	2	8	148994	149001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004070	ACAA	2	8	151079	151086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004070	AAAG	2	8	155440	155447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004070	ATTT	2	8	155461	155468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004070	TAGC	2	8	155552	155559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004070	TAGT	2	8	156056	156063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004070	AAAT	2	8	156430	156437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004070	AAAT	2	8	156500	156507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004070	GGAT	2	8	166067	166074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004070	AGTC	2	8	167886	167893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_004070	ACAA	2	8	170802	170809	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004070	ATAG	2	8	175459	175466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004070	CGTG	2	8	175940	175947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004070	TAAA	2	8	176460	176467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004070	ATGG	2	8	176535	176542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004070	AAGA	2	8	179970	179977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004070	CTTC	2	8	183441	183448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004070	TTTA	2	8	183484	183491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004070	AGTA	2	8	184299	184306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004070	TAGA	2	8	184638	184645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004070	GATT	2	8	188038	188045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004070	AGGG	2	8	188166	188173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004070	AGTG	2	8	189264	189271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004070	CTTT	2	8	195595	195602	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004070	AGCA	2	8	195619	195626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004070	GGGA	2	8	197045	197052	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004070	ACCG	2	8	198505	198512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_004070	ACAA	2	8	199220	199227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004070	TAAA	2	8	205429	205436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004070	CAAT	2	8	205464	205471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004070	TCAA	2	8	205479	205486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004070	TTTG	2	8	205568	205575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004070	TAGT	2	8	207976	207983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004070	GTTT	2	8	208021	208028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004070	AAAT	2	8	208157	208164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004070	TAAA	2	8	212587	212594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004070	CATA	2	8	212640	212647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004070	TTTG	2	8	212703	212710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004070	AAAG	2	8	217951	217958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004070	CAAA	2	8	228498	228505	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004070	AATT	2	8	228708	228715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004070	ATTT	2	8	231237	231244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004070	TAGG	2	8	231322	231329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004070	TTCA	2	8	239125	239132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004070	AAAG	2	8	242552	242559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004070	TAAA	2	8	247104	247111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004070	GTCA	2	8	247138	247145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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