MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	TTATT	2	10	1973	1982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004061	TTTTA	2	10	2691	2700	20 %	80 %	0 %	0 %	21672296
3	NC_004061	ATTTT	2	10	3128	3137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004061	TTTTA	2	10	3208	3217	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004061	GACAA	2	10	3338	3347	60 %	0 %	20 %	20 %	21672298
6	NC_004061	ATGTT	2	10	4423	4432	20 %	60 %	20 %	0 %	21672300
7	NC_004061	AAAAT	2	10	6489	6498	80 %	20 %	0 %	0 %	21672301
8	NC_004061	ATGAA	2	10	7375	7384	60 %	20 %	20 %	0 %	21672302
9	NC_004061	TTGTT	2	10	10213	10222	0 %	80 %	20 %	0 %	21672304
10	NC_004061	AAAAT	2	10	10409	10418	80 %	20 %	0 %	0 %	21672304
11	NC_004061	GAAAT	2	10	12311	12320	60 %	20 %	20 %	0 %	21672305
12	NC_004061	TTTTA	2	10	12631	12640	20 %	80 %	0 %	0 %	21672306
13	NC_004061	TTGAT	2	10	13357	13366	20 %	60 %	20 %	0 %	21672306
14	NC_004061	AAAAT	2	10	14001	14010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004061	TTTTG	2	10	16256	16265	0 %	80 %	20 %	0 %	21672310
16	NC_004061	TTTTG	2	10	17574	17583	0 %	80 %	20 %	0 %	21672311
17	NC_004061	ATAAA	2	10	18131	18140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004061	TAAAC	2	10	18566	18575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004061	TTATT	2	10	19228	19237	20 %	80 %	0 %	0 %	21672313
20	NC_004061	ATCTA	2	10	19900	19909	40 %	40 %	0 %	20 %	21672313
21	NC_004061	TGATA	2	10	20477	20486	40 %	40 %	20 %	0 %	21672314
22	NC_004061	TTTTA	2	10	20843	20852	20 %	80 %	0 %	0 %	21672314
23	NC_004061	CTATT	2	10	23329	23338	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004061	TTTTC	2	10	23613	23622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_004061	ATACA	2	10	24118	24127	60 %	20 %	0 %	20 %	21672318
26	NC_004061	TTTCT	2	10	27346	27355	0 %	80 %	0 %	20 %	21672320
27	NC_004061	TAAAA	2	10	28715	28724	80 %	20 %	0 %	0 %	21672321
28	NC_004061	ACTTT	2	10	29675	29684	20 %	60 %	0 %	20 %	21672322
29	NC_004061	AAAAT	2	10	29691	29700	80 %	20 %	0 %	0 %	21672322
30	NC_004061	AAAGT	2	10	30719	30728	60 %	20 %	20 %	0 %	21672323
31	NC_004061	AATTG	2	10	31315	31324	40 %	40 %	20 %	0 %	21672323
32	NC_004061	AACAT	2	10	32268	32277	60 %	20 %	0 %	20 %	21672324
33	NC_004061	ATTCA	2	10	32634	32643	40 %	40 %	0 %	20 %	21672324
34	NC_004061	ATTTA	2	10	32788	32797	40 %	60 %	0 %	0 %	21672324
35	NC_004061	TATTT	2	10	33199	33208	20 %	80 %	0 %	0 %	21672324
36	NC_004061	TAAAA	2	10	33784	33793	80 %	20 %	0 %	0 %	21672324
37	NC_004061	AAATC	2	10	35062	35071	60 %	20 %	0 %	20 %	21672325
38	NC_004061	ATTTT	2	10	35434	35443	20 %	80 %	0 %	0 %	21672325
39	NC_004061	AGATA	2	10	36097	36106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004061	ATTTA	2	10	36325	36334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004061	GATAA	2	10	36386	36395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004061	CTTGT	2	10	37557	37566	0 %	60 %	20 %	20 %	21672327
43	NC_004061	GGTAT	2	10	37628	37637	20 %	40 %	40 %	0 %	21672327
44	NC_004061	AAATA	2	10	38382	38391	80 %	20 %	0 %	0 %	21672327
45	NC_004061	TGATC	2	10	38832	38841	20 %	40 %	20 %	20 %	21672327
46	NC_004061	ACTTT	2	10	40415	40424	20 %	60 %	0 %	20 %	21672327
47	NC_004061	TTCCA	2	10	42687	42696	20 %	40 %	0 %	40 %	21672328
48	NC_004061	TTGAA	2	10	44709	44718	40 %	40 %	20 %	0 %	21672328
49	NC_004061	GTAAA	2	10	46171	46180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004061	TGATT	2	10	47053	47062	20 %	60 %	20 %	0 %	21672332
51	NC_004061	TAAAA	2	10	47331	47340	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004061	CTACT	2	10	47823	47832	20 %	40 %	0 %	40 %	21672333
53	NC_004061	TATAT	2	10	48986	48995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004061	AAAAT	2	10	52077	52086	80 %	20 %	0 %	0 %	21672337
55	NC_004061	ATAAA	2	10	52367	52376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004061	ATAAA	2	10	53772	53781	80 %	20 %	0 %	0 %	21672339
57	NC_004061	TAAAA	2	10	55492	55501	80 %	20 %	0 %	0 %	21672340
58	NC_004061	CTTAT	2	10	56481	56490	20 %	60 %	0 %	20 %	21672341
59	NC_004061	TAGTT	2	10	56565	56574	20 %	60 %	20 %	0 %	21672341
60	NC_004061	TTTAA	2	10	57692	57701	40 %	60 %	0 %	0 %	21672343
61	NC_004061	ATTTA	2	10	58920	58929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004061	ATCTT	2	10	59409	59418	20 %	60 %	0 %	20 %	21672345
63	NC_004061	CTTTT	2	10	61439	61448	0 %	80 %	0 %	20 %	21672346
64	NC_004061	ATTGC	2	10	62543	62552	20 %	40 %	20 %	20 %	21672346
65	NC_004061	TTTTA	2	10	63165	63174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004061	TAATA	2	10	64883	64892	60 %	40 %	0 %	0 %	21672349
67	NC_004061	ATTAA	2	10	65034	65043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004061	TAATT	2	10	65541	65550	40 %	60 %	0 %	0 %	21672350
69	NC_004061	ATCTA	2	10	65838	65847	40 %	40 %	0 %	20 %	21672350
70	NC_004061	ATTTT	2	10	66352	66361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004061	AGAAT	2	10	66408	66417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004061	AAGAA	2	10	66627	66636	80 %	0 %	20 %	0 %	21672351
73	NC_004061	ATTTT	2	10	67055	67064	20 %	80 %	0 %	0 %	21672351
74	NC_004061	TTTCT	2	10	67133	67142	0 %	80 %	0 %	20 %	21672351
75	NC_004061	AAAAT	2	10	67487	67496	80 %	20 %	0 %	0 %	21672351
76	NC_004061	TGAAT	2	10	67608	67617	40 %	40 %	20 %	0 %	21672351
77	NC_004061	ATAAA	2	10	67694	67703	80 %	20 %	0 %	0 %	21672352
78	NC_004061	AGAAA	2	10	69036	69045	80 %	0 %	20 %	0 %	21672353
79	NC_004061	TAAAT	2	10	69073	69082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004061	AAATA	2	10	69649	69658	80 %	20 %	0 %	0 %	21672354
81	NC_004061	TTTAA	2	10	71280	71289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004061	CATAT	2	10	72175	72184	40 %	40 %	0 %	20 %	21672356
83	NC_004061	TTAAT	2	10	72528	72537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004061	AAATT	2	10	73836	73845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004061	AGGAA	2	10	74395	74404	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004061	ATTTT	2	10	76284	76293	20 %	80 %	0 %	0 %	30410812
87	NC_004061	GCATG	2	10	76821	76830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_004061	AAATT	2	10	77069	77078	60 %	40 %	0 %	0 %	21672358
89	NC_004061	TGATT	2	10	77199	77208	20 %	60 %	20 %	0 %	21672358
90	NC_004061	ATTAG	2	10	77535	77544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004061	TCTTT	2	10	78969	78978	0 %	80 %	0 %	20 %	21672359
92	NC_004061	TAATT	2	10	79418	79427	40 %	60 %	0 %	0 %	21672360
93	NC_004061	TTATG	2	10	80752	80761	20 %	60 %	20 %	0 %	21672361
94	NC_004061	ATGTT	2	10	81026	81035	20 %	60 %	20 %	0 %	30410813
95	NC_004061	ACGAA	2	10	83373	83382	60 %	0 %	20 %	20 %	21672364
96	NC_004061	AATGA	2	10	84064	84073	60 %	20 %	20 %	0 %	21672365
97	NC_004061	ATCTT	2	10	86917	86926	20 %	60 %	0 %	20 %	21672369
98	NC_004061	TTTAA	2	10	87663	87672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004061	TTAAA	2	10	88468	88477	60 %	40 %	0 %	0 %	21672372
100	NC_004061	TCAAA	2	10	89263	89272	60 %	20 %	0 %	20 %	21672372
101	NC_004061	AAATA	2	10	90923	90932	80 %	20 %	0 %	0 %	21672372
102	NC_004061	AAATT	2	10	90987	90996	60 %	40 %	0 %	0 %	21672372
103	NC_004061	TTTTA	2	10	91192	91201	20 %	80 %	0 %	0 %	21672372
104	NC_004061	TATTT	2	10	93321	93330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004061	ATTAA	2	10	94485	94494	60 %	40 %	0 %	0 %	21672375
106	NC_004061	CAAAA	2	10	95576	95585	80 %	0 %	0 %	20 %	21672376
107	NC_004061	ATCAA	2	10	99968	99977	60 %	20 %	0 %	20 %	30410814
108	NC_004061	GTACA	2	10	102022	102031	40 %	20 %	20 %	20 %	21672381
109	NC_004061	AAACA	2	10	102168	102177	80 %	0 %	0 %	20 %	21672381
110	NC_004061	AGAAA	2	10	107566	107575	80 %	0 %	20 %	0 %	21672386
111	NC_004061	AAACT	2	10	108209	108218	60 %	20 %	0 %	20 %	21672387
112	NC_004061	TACAA	2	10	108326	108335	60 %	20 %	0 %	20 %	21672387
113	NC_004061	GTTTT	2	10	108659	108668	0 %	80 %	20 %	0 %	21672387
114	NC_004061	TTCAA	2	10	108999	109008	40 %	40 %	0 %	20 %	21672388
115	NC_004061	ATTTT	2	10	109374	109383	20 %	80 %	0 %	0 %	21672388
116	NC_004061	TTATA	2	10	109392	109401	40 %	60 %	0 %	0 %	21672388
117	NC_004061	CAAAA	2	10	109881	109890	80 %	0 %	0 %	20 %	21672389
118	NC_004061	TATAT	2	10	110106	110115	40 %	60 %	0 %	0 %	21672389
119	NC_004061	ATTTA	2	10	111570	111579	40 %	60 %	0 %	0 %	21672391
120	NC_004061	TAATT	2	10	111619	111628	40 %	60 %	0 %	0 %	21672391
121	NC_004061	TTACC	2	10	113964	113973	20 %	40 %	0 %	40 %	21672393
122	NC_004061	ACATC	2	10	114041	114050	40 %	20 %	0 %	40 %	21672393
123	NC_004061	ATAAA	2	10	115908	115917	80 %	20 %	0 %	0 %	21672394
124	NC_004061	ATAAA	2	10	116166	116175	80 %	20 %	0 %	0 %	21672395
125	NC_004061	GTAAA	2	10	117972	117981	60 %	20 %	20 %	0 %	21672396
126	NC_004061	ATTTT	2	10	118312	118321	20 %	80 %	0 %	0 %	21672397
127	NC_004061	TCAAA	2	10	118359	118368	60 %	20 %	0 %	20 %	21672397
128	NC_004061	TATCT	2	10	118879	118888	20 %	60 %	0 %	20 %	21672398
129	NC_004061	GATTA	2	10	119777	119786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004061	AATTT	2	10	121514	121523	40 %	60 %	0 %	0 %	21672399
131	NC_004061	AATTT	2	10	122976	122985	40 %	60 %	0 %	0 %	21672401
132	NC_004061	ATTGT	2	10	123027	123036	20 %	60 %	20 %	0 %	21672401
133	NC_004061	TTTAT	2	10	123419	123428	20 %	80 %	0 %	0 %	21672402
134	NC_004061	GTTTT	2	10	125292	125301	0 %	80 %	20 %	0 %	21672403
135	NC_004061	CAAAA	2	10	125557	125566	80 %	0 %	0 %	20 %	21672403
136	NC_004061	TTTAA	2	10	125744	125753	40 %	60 %	0 %	0 %	21672403
137	NC_004061	TAAAA	2	10	127420	127429	80 %	20 %	0 %	0 %	21672404
138	NC_004061	ATTAT	2	10	127542	127551	40 %	60 %	0 %	0 %	21672404
139	NC_004061	AAAAT	2	10	127956	127965	80 %	20 %	0 %	0 %	21672405
140	NC_004061	ATTAT	2	10	128117	128126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004061	TATAA	2	10	128244	128253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004061	TCGCG	2	10	128848	128857	0 %	20 %	40 %	40 %	21672406
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144	NC_004061	ATTAT	2	10	129559	129568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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