MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	TATT	2	8	1994	2001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004061	ATTT	2	8	14085	14092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004061	TTTA	2	8	16546	16553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004061	AAAG	2	8	18201	18208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004061	TAAA	2	8	18212	18219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004061	AATT	2	8	20294	20301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004061	TTAT	2	8	21998	22005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004061	GTAT	2	8	23549	23556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004061	TAAT	2	8	23793	23800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004061	ATTT	2	8	23902	23909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004061	TAAA	2	8	23927	23934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004061	TAAA	2	8	23961	23968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004061	TTAA	2	8	25140	25147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004061	TGTT	2	8	26195	26202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004061	TAAA	2	8	31469	31476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004061	TTTA	2	8	33931	33938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004061	ATTT	2	8	35581	35588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004061	CTTA	2	8	36006	36013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004061	AGTA	2	8	36014	36021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004061	TTAA	2	8	36022	36029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004061	TAAA	2	8	36032	36039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004061	TTAA	2	8	36143	36150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004061	TAAA	2	8	36243	36250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004061	TCTG	2	8	44849	44856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004061	CTAA	2	8	44979	44986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004061	AAAT	2	8	46152	46159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004061	ATTT	2	8	48504	48511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004061	CTAC	2	8	48651	48658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004061	TTTA	2	8	48948	48955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004061	ATTT	2	8	52407	52414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004061	ATTT	2	8	56998	57005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004061	GATA	2	8	58047	58054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004061	ATGT	2	8	58978	58985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004061	AGAT	2	8	63118	63125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004061	TTAA	2	8	63132	63139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004061	TAAA	2	8	63202	63209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004061	AATT	2	8	63253	63260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004061	TTAA	2	8	65219	65226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004061	TTTA	2	8	70882	70889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004061	AAAT	2	8	70895	70902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004061	AAAT	2	8	71272	71279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004061	ATTT	2	8	71323	71330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004061	TTTA	2	8	72451	72458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004061	ATAA	2	8	72467	72474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004061	ATTT	2	8	72569	72576	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004061	ATTT	2	8	72707	72714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004061	TAAA	2	8	73291	73298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004061	AAAG	2	8	73390	73397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004061	TAGA	2	8	74343	74350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004061	ATTT	2	8	74554	74561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004061	ATTA	2	8	74734	74741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004061	TTTG	2	8	74994	75001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004061	ATTA	2	8	76613	76620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004061	TTGT	2	8	76714	76721	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004061	AAAT	2	8	76748	76755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004061	TAAA	2	8	77036	77043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004061	ATAC	2	8	83872	83879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004061	ATTT	2	8	88128	88135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004061	TAAA	2	8	91768	91775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004061	TAAA	2	8	93276	93283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004061	TCAT	2	8	93371	93378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004061	TTAC	2	8	93391	93398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_004061	TAAT	2	8	100538	100545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004061	TAAA	2	8	101610	101617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004061	AATA	2	8	102372	102379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004061	TAAA	2	8	104346	104353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004061	AATA	2	8	104417	104424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004061	GTTT	2	8	104546	104553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004061	AATT	2	8	113526	113533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004061	AATT	2	8	113655	113662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004061	AATT	2	8	117470	117477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004061	TAAA	2	8	119433	119440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004061	TAAA	2	8	119448	119455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004061	TTTC	2	8	119698	119705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004061	ATCA	2	8	119842	119849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004061	TACA	2	8	119917	119924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_004061	AATT	2	8	120079	120086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004061	ATTA	2	8	120296	120303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004061	GAAA	2	8	120952	120959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004061	TATT	2	8	124023	124030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004061	TAAA	2	8	126360	126367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004061	AATT	2	8	129424	129431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004061	TAGT	2	8	129712	129719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004061	AATA	2	8	134105	134112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004061	TTAA	2	8	140629	140636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004061	AATA	2	8	144482	144489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004061	ATTA	2	8	144530	144537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004061	CTAA	2	8	145464	145471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004061	AGAA	2	8	146846	146853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004061	TAAT	2	8	149922	149929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004061	TAAA	2	8	154920	154927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004061	ACAA	2	8	156848	156855	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_004061	ATTT	2	8	156857	156864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004061	TTTA	2	8	161248	161255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004061	GTTT	2	8	164880	164887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004061	ATAG	2	8	165098	165105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004061	GAAA	2	8	165588	165595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004061	ATAA	2	8	170026	170033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004061	AATT	2	8	182595	182602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004061	TATT	2	8	182626	182633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004061	TTTA	2	8	182894	182901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004061	ATTA	2	8	182922	182929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004061	GTTA	2	8	184998	185005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004061	TAAT	2	8	185208	185215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004061	TTAA	2	8	193942	193949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004061	ATTT	2	8	200574	200581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004061	ATAA	2	8	200584	200591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004061	AATT	2	8	200602	200609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004061	TTTA	2	8	200610	200617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004061	ATTG	2	8	201277	201284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004061	TAAA	2	8	203403	203410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004061	AATT	2	8	203488	203495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004061	ATTT	2	8	205000	205007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004061	GATA	2	8	205045	205052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004061	TAAA	2	8	205110	205117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004061	ATTG	2	8	205151	205158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004061	TAAT	2	8	205939	205946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004061	ATTA	2	8	212572	212579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004061	AATA	2	8	212993	213000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004061	AAAT	2	8	213017	213024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004061	AAAT	2	8	213124	213131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004061	AATA	2	8	213189	213196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004061	AAAG	2	8	215503	215510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004061	ATTT	2	8	216186	216193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004061	ATAA	2	8	216222	216229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004061	ATTA	2	8	217171	217178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004061	ATTT	2	8	217215	217222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004061	TTAA	2	8	217239	217246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004061	TAAA	2	8	217265	217272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004061	ATTA	2	8	217322	217329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004061	GAAT	2	8	217540	217547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004061	CTTA	2	8	217842	217849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004061	TTTA	2	8	217983	217990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004061	TTAT	2	8	218113	218120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004061	AATT	2	8	218863	218870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004061	ATTT	2	8	219022	219029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004061	TAAA	2	8	219417	219424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004061	ATTT	2	8	223296	223303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004061	TAAA	2	8	224509	224516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004061	ATTA	2	8	224526	224533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004061	ATAA	2	8	231879	231886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004061	ATTT	2	8	231929	231936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004061	GATT	2	8	231991	231998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004061	TTTA	2	8	233259	233266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004061	GATA	2	8	233357	233364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004061	ATTA	2	8	233369	233376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004061	TATC	2	8	234652	234659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_004061	ATTT	2	8	236011	236018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004061	ATAA	2	8	236038	236045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004061	TATT	2	8	236153	236160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004061	TATT	2	8	237243	237250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004061	AAAT	2	8	237408	237415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004061	ATAA	2	8	237653	237660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_004061	TTAT	2	8	238642	238649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_004061	GTTG	2	8	618935	618942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_004061	AATT	2	8	619678	619685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_004061	TTAT	2	8	624170	624177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_004061	TAAA	2	8	624856	624863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_004061	GTTT	2	8	624889	624896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
456	NC_004061	AAAT	2	8	625390	625397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_004061	TGGT	2	8	625541	625548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
458	NC_004061	TATT	2	8	625841	625848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_004061	TTAA	2	8	626079	626086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_004061	AAAT	2	8	626179	626186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_004061	TTGG	2	8	626320	626327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_004061	AATT	2	8	626400	626407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_004061	TTAA	2	8	628577	628584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_004061	GATT	2	8	630689	630696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
467	NC_004061	AATT	2	8	630701	630708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_004061	AATT	2	8	634282	634289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_004061	TAAA	2	8	634310	634317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_004061	TTAA	2	8	634462	634469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_004061	ATTT	2	8	634515	634522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_004061	AATG	2	8	641115	641122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_004061	TTTA	2	8	641150	641157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_004061	AGTT	3	12	641220	641231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.