MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 9576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004061	TGG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672295
2	NC_004061	GCA	2	6	70	75	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672295
3	NC_004061	ATT	3	9	102	110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
4	NC_004061	TAT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
5	NC_004061	GGA	2	6	160	165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21672295
6	NC_004061	GGT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672295
7	NC_004061	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
8	NC_004061	CTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672295
9	NC_004061	TTA	2	6	337	342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
10	NC_004061	TAT	2	6	461	466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
11	NC_004061	CTG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672295
12	NC_004061	GAA	2	6	524	529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
13	NC_004061	ACC	2	6	609	614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672295
14	NC_004061	ATC	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
15	NC_004061	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
16	NC_004061	TAT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
17	NC_004061	ATT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
18	NC_004061	TAC	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
19	NC_004061	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
20	NC_004061	TGA	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672295
21	NC_004061	ACT	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
22	NC_004061	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
23	NC_004061	TAG	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672295
24	NC_004061	TTA	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
25	NC_004061	AGC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672295
26	NC_004061	GAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672295
27	NC_004061	TTA	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
28	NC_004061	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
29	NC_004061	CTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672295
30	NC_004061	TTA	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672295
31	NC_004061	ATA	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672295
32	NC_004061	TAA	2	6	1927	1932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004061	TTA	2	6	1945	1950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004061	TCA	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672296
35	NC_004061	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672296
36	NC_004061	ATC	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672296
37	NC_004061	TAT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672296
38	NC_004061	TGG	2	6	2719	2724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672296
39	NC_004061	TAA	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672296
40	NC_004061	TGT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672297
41	NC_004061	TAT	2	6	2928	2933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672297
42	NC_004061	GTA	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672297
43	NC_004061	TTA	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672297
44	NC_004061	TAG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672297
45	NC_004061	TTA	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004061	CAA	2	6	3250	3255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672298
47	NC_004061	CCT	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672298
48	NC_004061	ATT	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
49	NC_004061	GAA	3	9	3387	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672298
50	NC_004061	TTA	3	9	3397	3405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
51	NC_004061	AAT	2	6	3425	3430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672298
52	NC_004061	TAT	2	6	3458	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
53	NC_004061	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
54	NC_004061	TTA	2	6	3640	3645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672298
55	NC_004061	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
56	NC_004061	TTG	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672299
57	NC_004061	TAA	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672299
58	NC_004061	ATT	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
59	NC_004061	TAA	2	6	4006	4011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672299
60	NC_004061	TAT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
61	NC_004061	ATT	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672299
62	NC_004061	ATC	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672299
63	NC_004061	TAT	2	6	4376	4381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
64	NC_004061	ATG	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672300
65	NC_004061	TTA	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
66	NC_004061	TAT	2	6	4832	4837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
67	NC_004061	TAT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
68	NC_004061	ATG	2	6	4930	4935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672300
69	NC_004061	TTA	2	6	4938	4943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
70	NC_004061	TTG	4	12	4951	4962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672300
71	NC_004061	AGC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672300
72	NC_004061	ATG	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672300
73	NC_004061	TAT	2	6	5110	5115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
74	NC_004061	ACC	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672300
75	NC_004061	TTA	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
76	NC_004061	TAT	2	6	5270	5275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
77	NC_004061	TGC	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672300
78	NC_004061	ATT	2	6	5439	5444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
79	NC_004061	TCT	2	6	5454	5459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672300
80	NC_004061	GCA	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672300
81	NC_004061	AAC	2	6	5531	5536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672300
82	NC_004061	AAT	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672300
83	NC_004061	ATT	2	6	5676	5681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672300
84	NC_004061	GAA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672300
85	NC_004061	ATA	2	6	5769	5774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672300
86	NC_004061	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672300
87	NC_004061	ATA	2	6	5916	5921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
88	NC_004061	AGA	2	6	5990	5995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672301
89	NC_004061	TCA	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672301
90	NC_004061	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672301
91	NC_004061	TAT	2	6	6281	6286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672301
92	NC_004061	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672301
93	NC_004061	AAT	2	6	6369	6374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
94	NC_004061	TAA	2	6	6401	6406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
95	NC_004061	ATA	2	6	6412	6417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
96	NC_004061	TAA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
97	NC_004061	ATT	2	6	6502	6507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672301
98	NC_004061	ATT	2	6	6542	6547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672301
99	NC_004061	ATA	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
100	NC_004061	TAA	2	6	6683	6688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672301
101	NC_004061	TTG	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672301
102	NC_004061	CAG	2	6	6742	6747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672301
103	NC_004061	ATT	2	6	6801	6806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672302
104	NC_004061	ATT	2	6	6810	6815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672302
105	NC_004061	GTA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672302
106	NC_004061	CAA	2	6	6918	6923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672302
107	NC_004061	CTA	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672302
108	NC_004061	TCT	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672302
109	NC_004061	TGG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672302
110	NC_004061	ATG	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672302
111	NC_004061	CCT	2	6	7437	7442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672302
112	NC_004061	TGA	2	6	7496	7501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672302
113	NC_004061	ATA	2	6	7528	7533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672302
114	NC_004061	CTT	2	6	7572	7577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672302
115	NC_004061	CTG	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672302
116	NC_004061	GAA	2	6	7620	7625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672302
117	NC_004061	AAG	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672302
118	NC_004061	TGA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672302
119	NC_004061	CTA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672302
120	NC_004061	GTC	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672302
121	NC_004061	GCT	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672302
122	NC_004061	GTC	2	6	7825	7830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672302
123	NC_004061	CGA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672302
124	NC_004061	ATT	2	6	7920	7925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672302
125	NC_004061	AAG	2	6	7954	7959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672302
126	NC_004061	ATA	2	6	8068	8073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672302
127	NC_004061	ATT	2	6	8091	8096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672302
128	NC_004061	GAA	2	6	8151	8156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672302
129	NC_004061	TAA	2	6	8158	8163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672302
130	NC_004061	ATT	2	6	8174	8179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672302
131	NC_004061	TTG	2	6	8322	8327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672303
132	NC_004061	AGA	2	6	8375	8380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672303
133	NC_004061	GTT	2	6	8424	8429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672303
134	NC_004061	GAA	2	6	8505	8510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672303
135	NC_004061	ATT	2	6	8657	8662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004061	TCT	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672304
137	NC_004061	CTA	2	6	8785	8790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672304
138	NC_004061	TTA	2	6	8817	8822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
139	NC_004061	TTG	2	6	8878	8883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672304
140	NC_004061	TTA	2	6	8959	8964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
141	NC_004061	TAT	2	6	9208	9213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
142	NC_004061	CTA	2	6	9238	9243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672304
143	NC_004061	GAT	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672304
144	NC_004061	TCA	2	6	9489	9494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672304
145	NC_004061	TAA	2	6	9605	9610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672304
146	NC_004061	ATA	2	6	9657	9662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672304
147	NC_004061	ATT	2	6	9753	9758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
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149	NC_004061	TGC	2	6	9983	9988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672304
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152	NC_004061	TAA	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672304
153	NC_004061	CCA	2	6	10302	10307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672304
154	NC_004061	TTA	2	6	10323	10328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
155	NC_004061	ATT	2	6	10358	10363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
156	NC_004061	TCT	2	6	10497	10502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672304
157	NC_004061	TTA	2	6	10602	10607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672304
158	NC_004061	ATG	2	6	10668	10673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672304
159	NC_004061	TTG	2	6	10706	10711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672304
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162	NC_004061	ACC	2	6	10832	10837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672304
163	NC_004061	ATA	2	6	10854	10859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672304
164	NC_004061	ACT	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672304
165	NC_004061	CAA	2	6	11005	11010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672304
166	NC_004061	ATG	2	6	11024	11029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672304
167	NC_004061	CAT	2	6	11041	11046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672304
168	NC_004061	AGA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672304
169	NC_004061	ATA	2	6	11177	11182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_004061	ATT	2	6	11185	11190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_004061	ATT	2	6	11217	11222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_004061	ACA	2	6	11311	11316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672305
173	NC_004061	GAA	2	6	11326	11331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672305
174	NC_004061	AGA	2	6	11355	11360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672305
175	NC_004061	TTG	2	6	11404	11409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672305
176	NC_004061	ATA	2	6	11424	11429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672305
177	NC_004061	AAT	2	6	11462	11467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672305
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192	NC_004061	TCT	2	6	12431	12436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672306
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206	NC_004061	ATG	2	6	14053	14058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
207	NC_004061	ATT	2	6	14060	14065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_004061	TTC	2	6	14111	14116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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210	NC_004061	TTA	2	6	14137	14142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_004061	TAA	2	6	14151	14156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_004061	ATA	2	6	14320	14325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672307
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243	NC_004061	CAA	2	6	16375	16380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672310
244	NC_004061	TAT	2	6	16476	16481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672310
245	NC_004061	ACA	2	6	16482	16487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672310
246	NC_004061	ATT	2	6	16533	16538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_004061	TAT	2	6	16590	16595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
248	NC_004061	TAT	2	6	16836	16841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
249	NC_004061	TAA	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
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252	NC_004061	AGA	2	6	17109	17114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
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257	NC_004061	AGA	2	6	17409	17414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
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261	NC_004061	AAG	2	6	17564	17569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
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263	NC_004061	AAG	2	6	17723	17728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
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392	NC_004061	CAA	2	6	25593	25598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672319
393	NC_004061	ATT	2	6	25615	25620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672319
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480	NC_004061	TAT	2	6	31509	31514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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