MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	CGAG	2	8	552	559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004041	GCGA	2	8	914	921	25 %	0 %	50 %	25 %	21492963
3	NC_004041	GACT	2	8	1005	1012	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
4	NC_004041	TGCC	2	8	1405	1412	0 %	25 %	25 %	50 %	21492963
5	NC_004041	CATG	2	8	1518	1525	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
6	NC_004041	TCGC	2	8	1903	1910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004041	GCCG	2	8	2749	2756	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
8	NC_004041	GCTC	2	8	3319	3326	0 %	25 %	25 %	50 %	21492961
9	NC_004041	CGAA	2	8	3780	3787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004041	TCAA	2	8	3984	3991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004041	CGGA	2	8	4025	4032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004041	CTGA	2	8	4055	4062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004041	TGAC	2	8	5069	5076	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
14	NC_004041	TCGA	2	8	5089	5096	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
15	NC_004041	GCGG	2	8	5539	5546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_004041	GCCC	2	8	6320	6327	0 %	0 %	25 %	75 %	89255299
17	NC_004041	CAGG	2	8	6634	6641	25 %	0 %	50 %	25 %	89255299
18	NC_004041	TTCC	2	8	6670	6677	0 %	50 %	0 %	50 %	89255299
19	NC_004041	CGCA	2	8	7909	7916	25 %	0 %	25 %	50 %	21492958
20	NC_004041	GATC	2	8	8046	8053	25 %	25 %	25 %	25 %	21492958
21	NC_004041	CATC	2	8	8273	8280	25 %	25 %	0 %	50 %	21492958
22	NC_004041	GCCG	2	8	8355	8362	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
23	NC_004041	TGTT	2	8	8366	8373	0 %	75 %	25 %	0 %	21492958
24	NC_004041	CCGT	2	8	8765	8772	0 %	25 %	25 %	50 %	21492958
25	NC_004041	GCGA	2	8	9104	9111	25 %	0 %	50 %	25 %	21492958
26	NC_004041	ATCA	2	8	9202	9209	50 %	25 %	0 %	25 %	21492958
27	NC_004041	GGCT	2	8	9256	9263	0 %	25 %	50 %	25 %	21492958
28	NC_004041	CCAT	2	8	9744	9751	25 %	25 %	0 %	50 %	21492957
29	NC_004041	GTCA	2	8	9851	9858	25 %	25 %	25 %	25 %	21492957
30	NC_004041	TGAT	2	8	10748	10755	25 %	50 %	25 %	0 %	21492956
31	NC_004041	CGCA	2	8	10891	10898	25 %	0 %	25 %	50 %	21492956
32	NC_004041	GAGT	2	8	11121	11128	25 %	25 %	50 %	0 %	21492956
33	NC_004041	CGTT	2	8	11552	11559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004041	AAAG	2	8	11628	11635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004041	CGGT	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
36	NC_004041	GCCC	2	8	12929	12936	0 %	0 %	25 %	75 %	21492955
37	NC_004041	TGCC	2	8	13329	13336	0 %	25 %	25 %	50 %	21492955
38	NC_004041	GCCC	2	8	13388	13395	0 %	0 %	25 %	75 %	21492955
39	NC_004041	ATCT	2	8	13887	13894	25 %	50 %	0 %	25 %	21492955
40	NC_004041	CTGG	2	8	13940	13947	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
41	NC_004041	AGCG	2	8	14150	14157	25 %	0 %	50 %	25 %	21492955
42	NC_004041	CGGG	2	8	14164	14171	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
43	NC_004041	GGGC	2	8	14222	14229	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
44	NC_004041	GACA	2	8	14751	14758	50 %	0 %	25 %	25 %	21492955
45	NC_004041	CGTG	2	8	15002	15009	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
46	NC_004041	TTGC	2	8	15082	15089	0 %	50 %	25 %	25 %	21492955
47	NC_004041	CGTG	2	8	15848	15855	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
48	NC_004041	GGCG	2	8	16229	16236	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
49	NC_004041	CCAA	2	8	16359	16366	50 %	0 %	0 %	50 %	21492955
50	NC_004041	CAAA	2	8	16529	16536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004041	CGAC	2	8	16666	16673	25 %	0 %	25 %	50 %	21492954
52	NC_004041	AAAG	2	8	16974	16981	75 %	0 %	25 %	0 %	21492954
53	NC_004041	CGAT	2	8	17050	17057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004041	TCGC	2	8	17502	17509	0 %	25 %	25 %	50 %	21492953
55	NC_004041	GCCG	2	8	17704	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	21492953
56	NC_004041	CGAT	2	8	17952	17959	25 %	25 %	25 %	25 %	21492953
57	NC_004041	CTGC	2	8	18767	18774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004041	GCTC	2	8	18944	18951	0 %	25 %	25 %	50 %	21492951
59	NC_004041	ATCG	2	8	19451	19458	25 %	25 %	25 %	25 %	21492951
60	NC_004041	ACGG	2	8	19726	19733	25 %	0 %	50 %	25 %	21492951
61	NC_004041	ACGA	2	8	20319	20326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004041	CCGC	2	8	21192	21199	0 %	0 %	25 %	75 %	21492948
63	NC_004041	CGTT	2	8	23595	23602	0 %	50 %	25 %	25 %	89255301
64	NC_004041	CGGA	2	8	23786	23793	25 %	0 %	50 %	25 %	89255301
65	NC_004041	GGCG	2	8	24144	24151	0 %	0 %	75 %	25 %	21492943
66	NC_004041	CGGA	2	8	24264	24271	25 %	0 %	50 %	25 %	21492943
67	NC_004041	GCCG	2	8	24357	24364	0 %	0 %	50 %	50 %	21492943
68	NC_004041	TTGC	2	8	24687	24694	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004041	CGTT	2	8	24769	24776	0 %	50 %	25 %	25 %	89255302
70	NC_004041	TCGC	2	8	24847	24854	0 %	25 %	25 %	50 %	89255302
71	NC_004041	ACCA	2	8	25054	25061	50 %	0 %	0 %	50 %	89255302
72	NC_004041	ATTC	2	8	25338	25345	25 %	50 %	0 %	25 %	89255302
73	NC_004041	GACG	2	8	25347	25354	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
74	NC_004041	GGCC	2	8	25953	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
75	NC_004041	GACG	2	8	26004	26011	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
76	NC_004041	CAGA	2	8	26259	26266	50 %	0 %	25 %	25 %	89255303
77	NC_004041	ACTG	2	8	26346	26353	25 %	25 %	25 %	25 %	89255303
78	NC_004041	CAGC	2	8	27278	27285	25 %	0 %	25 %	50 %	21492940
79	NC_004041	GTTG	2	8	28167	28174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004041	TCGG	2	8	28190	28197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004041	CGAT	2	8	28330	28337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004041	GTTG	2	8	28407	28414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004041	TTTG	2	8	28425	28432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004041	TGCA	2	8	28552	28559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004041	GTTC	2	8	28814	28821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004041	GCAC	2	8	29312	29319	25 %	0 %	25 %	50 %	21492939
87	NC_004041	TTCG	2	8	29703	29710	0 %	50 %	25 %	25 %	21492939
88	NC_004041	TGCT	2	8	30162	30169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004041	TGGG	2	8	31313	31320	0 %	25 %	75 %	0 %	21492936
90	NC_004041	ATCT	2	8	31514	31521	25 %	50 %	0 %	25 %	21492936
91	NC_004041	TCGC	2	8	32253	32260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_004041	GCGA	2	8	32582	32589	25 %	0 %	50 %	25 %	21492934
93	NC_004041	ACCC	2	8	33055	33062	25 %	0 %	0 %	75 %	21492934
94	NC_004041	CTGC	2	8	33510	33517	0 %	25 %	25 %	50 %	21492933
95	NC_004041	CTTG	2	8	33719	33726	0 %	50 %	25 %	25 %	89255304
96	NC_004041	CCAG	2	8	33845	33852	25 %	0 %	25 %	50 %	89255304
97	NC_004041	AAGC	2	8	34007	34014	50 %	0 %	25 %	25 %	89255304
98	NC_004041	GGAT	2	8	34473	34480	25 %	25 %	50 %	0 %	89255305
99	NC_004041	GATT	3	12	34854	34865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004041	GCAA	2	8	34998	35005	50 %	0 %	25 %	25 %	89255306
101	NC_004041	TCGG	2	8	35196	35203	0 %	25 %	50 %	25 %	89255306
102	NC_004041	GCCT	2	8	35660	35667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004041	GATC	2	8	36728	36735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004041	TCAG	2	8	37046	37053	25 %	25 %	25 %	25 %	89255307
105	NC_004041	GAAC	2	8	37778	37785	50 %	0 %	25 %	25 %	89255309
106	NC_004041	GCCG	2	8	37947	37954	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
107	NC_004041	GATC	2	8	38567	38574	25 %	25 %	25 %	25 %	89255309
108	NC_004041	AGCC	2	8	38693	38700	25 %	0 %	25 %	50 %	89255309
109	NC_004041	CTGG	2	8	38813	38820	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
110	NC_004041	TCGG	2	8	38944	38951	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
111	NC_004041	GGTC	2	8	39291	39298	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
112	NC_004041	GGCG	2	8	39335	39342	0 %	0 %	75 %	25 %	89255309
113	NC_004041	GTCG	2	8	39401	39408	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
114	NC_004041	TTGT	3	12	39979	39990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004041	TTGC	2	8	40158	40165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_004041	ATCC	2	8	41018	41025	25 %	25 %	0 %	50 %	89255311
117	NC_004041	GCCG	2	8	41049	41056	0 %	0 %	50 %	50 %	89255311
118	NC_004041	ATCG	2	8	41099	41106	25 %	25 %	25 %	25 %	89255311
119	NC_004041	CCTT	2	8	41394	41401	0 %	50 %	0 %	50 %	89255311
120	NC_004041	GCCG	2	8	41922	41929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004041	CGCA	2	8	42066	42073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004041	GCCG	2	8	43203	43210	0 %	0 %	50 %	50 %	89255312
123	NC_004041	TCAG	2	8	43225	43232	25 %	25 %	25 %	25 %	89255312
124	NC_004041	AGGA	2	8	43605	43612	50 %	0 %	50 %	0 %	89255312
125	NC_004041	TCCA	2	8	43815	43822	25 %	25 %	0 %	50 %	89255312
126	NC_004041	AACC	2	8	43898	43905	50 %	0 %	0 %	50 %	89255312
127	NC_004041	GCCG	2	8	44103	44110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004041	CGTC	2	8	44323	44330	0 %	25 %	25 %	50 %	21492922
129	NC_004041	AACG	2	8	44708	44715	50 %	0 %	25 %	25 %	21492922
130	NC_004041	CTAT	2	8	44867	44874	25 %	50 %	0 %	25 %	21492922
131	NC_004041	CAGG	2	8	45110	45117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_004041	ATGG	2	8	45128	45135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004041	AAAC	2	8	46025	46032	75 %	0 %	0 %	25 %	21492921
134	NC_004041	TCGC	2	8	46277	46284	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_004041	CCAT	2	8	46385	46392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004041	GACG	2	8	46639	46646	25 %	0 %	50 %	25 %	21492920
137	NC_004041	CTCG	2	8	46687	46694	0 %	25 %	25 %	50 %	21492920
138	NC_004041	TGTC	2	8	46935	46942	0 %	50 %	25 %	25 %	21492920
139	NC_004041	ATGG	2	8	47190	47197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004041	TGAT	2	8	47295	47302	25 %	50 %	25 %	0 %	21492919
141	NC_004041	ACGC	2	8	47788	47795	25 %	0 %	25 %	50 %	21492919
142	NC_004041	CACC	2	8	47988	47995	25 %	0 %	0 %	75 %	21492919
143	NC_004041	AAGG	2	8	48480	48487	50 %	0 %	50 %	0 %	21492919
144	NC_004041	AGCT	2	8	48489	48496	25 %	25 %	25 %	25 %	21492919
145	NC_004041	GCCG	2	8	48776	48783	0 %	0 %	50 %	50 %	21492919
146	NC_004041	AGCG	2	8	49451	49458	25 %	0 %	50 %	25 %	21492919
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