MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	ACC	2	6	52	57	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_004041	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
3	NC_004041	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492964
4	NC_004041	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
5	NC_004041	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
6	NC_004041	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492964
7	NC_004041	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492964
8	NC_004041	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
9	NC_004041	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
10	NC_004041	CGA	2	6	561	566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004041	CGC	2	6	591	596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_004041	CGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
13	NC_004041	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
14	NC_004041	GGC	2	6	851	856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
15	NC_004041	GGA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
16	NC_004041	GCC	2	6	880	885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
17	NC_004041	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
18	NC_004041	GCG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
19	NC_004041	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
20	NC_004041	GGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
21	NC_004041	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
22	NC_004041	CGA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
23	NC_004041	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
24	NC_004041	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
25	NC_004041	ATC	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
26	NC_004041	GCT	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
27	NC_004041	CGA	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
28	NC_004041	GGT	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492963
29	NC_004041	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
30	NC_004041	CGA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
31	NC_004041	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492963
32	NC_004041	TCG	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
33	NC_004041	GCC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
34	NC_004041	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
35	NC_004041	AAG	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004041	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004041	CGG	2	6	1631	1636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004041	GAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004041	GGC	2	6	1719	1724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004041	TCG	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004041	GGC	2	6	1865	1870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004041	CGT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004041	GAT	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004041	CGA	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004041	CGC	2	6	2385	2390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_004041	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
47	NC_004041	TCG	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
48	NC_004041	GGT	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492961
49	NC_004041	TCC	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492961
50	NC_004041	CAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492961
51	NC_004041	CGC	2	6	2639	2644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492961
52	NC_004041	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
53	NC_004041	GAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492961
54	NC_004041	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492961
55	NC_004041	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
56	NC_004041	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492961
57	NC_004041	GGC	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492961
58	NC_004041	TAT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492961
59	NC_004041	ACC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492961
60	NC_004041	CGC	2	6	3363	3368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_004041	CTG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004041	GCT	2	6	3475	3480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004041	GGT	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004041	ACA	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004041	CTA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004041	CTC	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_004041	CGC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_004041	GTA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004041	CGG	2	6	3839	3844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004041	GGC	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004041	TCG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004041	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_004041	GGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004041	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
75	NC_004041	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
76	NC_004041	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492960
77	NC_004041	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
78	NC_004041	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
79	NC_004041	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
80	NC_004041	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
81	NC_004041	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
82	NC_004041	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492960
83	NC_004041	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492960
84	NC_004041	CTG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004041	CGG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004041	CCG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_004041	GAC	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004041	GCG	2	6	5723	5728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004041	CAT	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004041	TGC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004041	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255299
92	NC_004041	GAG	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
93	NC_004041	TCG	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
94	NC_004041	CAG	2	6	6368	6373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
95	NC_004041	CCG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
96	NC_004041	TCC	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255299
97	NC_004041	AGG	2	6	6623	6628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
98	NC_004041	TCG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
99	NC_004041	ATC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255299
100	NC_004041	CGT	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
101	NC_004041	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
102	NC_004041	GCC	3	9	6878	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
103	NC_004041	CGG	2	6	6900	6905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255299
104	NC_004041	TGA	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255299
105	NC_004041	CGC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
106	NC_004041	CCG	3	9	7008	7016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
107	NC_004041	CGG	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
108	NC_004041	AGC	2	6	7217	7222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
109	NC_004041	CGC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
110	NC_004041	CTT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492958
111	NC_004041	ACA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
112	NC_004041	GGT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
113	NC_004041	ACG	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
114	NC_004041	GAC	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
115	NC_004041	GTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
116	NC_004041	GCC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
117	NC_004041	ACG	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
118	NC_004041	TAT	2	6	7934	7939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492958
119	NC_004041	GAT	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
120	NC_004041	CGA	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
121	NC_004041	GCC	2	6	8112	8117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
122	NC_004041	CGG	2	6	8118	8123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
123	NC_004041	CAA	2	6	8442	8447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
124	NC_004041	ATG	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
125	NC_004041	TGA	2	6	8622	8627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
126	NC_004041	AGC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
127	NC_004041	TGG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
128	NC_004041	GCC	2	6	8812	8817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
129	NC_004041	CAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
130	NC_004041	CCG	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
131	NC_004041	CAA	2	6	8916	8921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
132	NC_004041	TGA	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
133	NC_004041	GAC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
134	NC_004041	AGG	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492958
135	NC_004041	GAA	2	6	9226	9231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492958
136	NC_004041	CGG	2	6	9317	9322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
137	NC_004041	CGG	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
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143	NC_004041	GCA	2	6	9549	9554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492957
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153	NC_004041	GCG	2	6	10126	10131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_004041	TTG	2	6	10176	10181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_004041	GCG	2	6	11414	11419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_004041	GGA	2	6	11545	11550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_004041	CTC	2	6	11724	11729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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249	NC_004041	ATC	2	6	17368	17373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_004041	GTT	2	6	17608	17613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492953
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258	NC_004041	GGC	2	6	18131	18136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_004041	GCT	2	6	18350	18355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492952
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263	NC_004041	ATG	2	6	18537	18542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492952
264	NC_004041	GCA	2	6	18593	18598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492952
265	NC_004041	TTG	2	6	18784	18789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_004041	GGC	2	6	18814	18819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_004041	ACG	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_004041	CGC	2	6	18954	18959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492951
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283	NC_004041	CGA	2	6	20239	20244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_004041	GTC	2	6	20545	20550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255300
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381	NC_004041	GCG	2	6	26196	26201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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