MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	GA	3	6	533	538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004041	GC	3	6	2294	2299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004041	CG	3	6	4166	4171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004041	CT	3	6	4374	4379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004041	TG	3	6	5599	5604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004041	TG	3	6	11350	11355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004041	GC	3	6	17073	17078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_004041	AC	3	6	18162	18167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_004041	GA	3	6	21963	21968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004041	GA	3	6	28351	28356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004041	CG	4	8	28502	28509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004041	CG	3	6	30364	30369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004041	CT	3	6	30813	30818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_004041	CT	4	8	30985	30992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004041	TC	3	6	32239	32244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004041	CT	3	6	33258	33263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004041	CG	3	6	34807	34812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004041	CG	3	6	35519	35524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_004041	CG	3	6	36053	36058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004041	AC	3	6	36163	36168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004041	GC	3	6	36426	36431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004041	CG	3	6	39733	39738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004041	GC	3	6	39891	39896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_004041	GA	3	6	40088	40093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004041	CT	3	6	40125	40130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004041	TC	3	6	41825	41830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004041	CT	3	6	46370	46375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004041	TC	3	6	46488	46493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004041	GA	3	6	49823	49828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004041	AC	3	6	54406	54411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004041	GC	3	6	79428	79433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004041	CT	3	6	82136	82141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004041	AG	3	6	82382	82387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004041	CG	3	6	84347	84352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004041	TG	3	6	89420	89425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004041	AG	3	6	93152	93157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004041	AG	3	6	93164	93169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004041	CT	3	6	94470	94475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004041	CG	3	6	98682	98687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004041	TC	3	6	111193	111198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_004041	GA	3	6	114035	114040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004041	AG	3	6	114175	114180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004041	CG	3	6	114422	114427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_004041	GA	3	6	114464	114469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004041	TG	3	6	119629	119634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004041	CG	3	6	119916	119921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004041	GC	3	6	122652	122657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004041	CT	3	6	125931	125936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_004041	CT	3	6	126644	126649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004041	CG	3	6	128024	128029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_004041	GA	3	6	135897	135902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004041	CG	3	6	142514	142519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_004041	GC	4	8	149875	149882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_004041	GC	3	6	149888	149893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_004041	AT	3	6	151298	151303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004041	CA	3	6	152648	152653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_004041	GC	3	6	157983	157988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004041	CT	3	6	158494	158499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004041	GC	3	6	158844	158849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004041	AG	3	6	172946	172951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004041	CG	3	6	173001	173006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_004041	GC	3	6	175559	175564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004041	GC	3	6	175690	175695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004041	GC	3	6	175877	175882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004041	GC	3	6	177814	177819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004041	TC	3	6	189093	189098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_004041	GA	3	6	190231	190236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004041	CG	3	6	193021	193026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004041	GC	3	6	199996	200001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004041	GA	3	6	201018	201023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004041	CG	4	8	201123	201130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004041	TC	3	6	202785	202790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004041	GA	3	6	203614	203619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004041	GT	3	6	203628	203633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004041	CG	3	6	203820	203825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_004041	CG	3	6	204502	204507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_004041	CT	3	6	224374	224379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_004041	AT	4	8	225984	225991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004041	CG	3	6	228122	228127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004041	GC	3	6	228252	228257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_004041	CG	3	6	228352	228357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004041	GC	3	6	232475	232480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_004041	GA	3	6	236252	236257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004041	TC	3	6	238577	238582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004041	GA	3	6	242597	242602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004041	TA	3	6	243007	243012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004041	GC	4	8	250514	250521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_004041	GC	3	6	250560	250565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_004041	CG	3	6	250995	251000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004041	GC	3	6	253264	253269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_004041	CT	3	6	254554	254559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_004041	CA	3	6	254633	254638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_004041	GA	3	6	255506	255511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004041	GC	3	6	256107	256112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004041	CG	3	6	259192	259197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_004041	GA	3	6	259340	259345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004041	GC	3	6	259367	259372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004041	GA	3	6	259561	259566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004041	AC	3	6	261898	261903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_004041	CG	3	6	262118	262123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004041	GC	3	6	262254	262259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004041	CG	3	6	264787	264792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_004041	GC	3	6	267752	267757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_004041	CG	3	6	267771	267776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004041	GC	3	6	267800	267805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004041	CG	7	14	267942	267955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004041	GC	3	6	273246	273251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_004041	CA	4	8	273559	273566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004041	TC	3	6	275086	275091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004041	CG	3	6	275248	275253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004041	TC	3	6	275470	275475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_004041	TC	3	6	277892	277897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_004041	CG	3	6	286737	286742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004041	GA	3	6	291200	291205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004041	TC	3	6	293010	293015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004041	GA	3	6	296921	296926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004041	TA	3	6	297052	297057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004041	CG	3	6	297118	297123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004041	GA	3	6	297198	297203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004041	CG	3	6	300188	300193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004041	GC	3	6	301403	301408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004041	CG	3	6	302832	302837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_004041	GC	3	6	309338	309343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_004041	AG	3	6	309347	309352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004041	CT	3	6	313094	313099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_004041	AC	3	6	313744	313749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_004041	CG	3	6	315401	315406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004041	CG	3	6	317507	317512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_004041	GA	3	6	318267	318272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004041	GC	3	6	320149	320154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_004041	TG	3	6	324937	324942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004041	GC	3	6	325246	325251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_004041	CG	3	6	325735	325740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_004041	AG	3	6	325813	325818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004041	GC	3	6	326480	326485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_004041	TA	3	6	330716	330721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004041	TC	3	6	338624	338629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_004041	CG	4	8	341393	341400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_004041	TC	3	6	341888	341893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_004041	GA	3	6	341907	341912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004041	GC	3	6	346693	346698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004041	CT	3	6	352880	352885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004041	TC	3	6	356760	356765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_004041	AG	3	6	357630	357635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004041	AC	3	6	366206	366211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004041	CG	3	6	366552	366557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_004041	AC	3	6	367444	367449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_004041	GA	3	6	370038	370043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.