MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	G	9	9	1635	1643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004041	G	6	6	6627	6632	0 %	0 %	100 %	0 %	89255299
3	NC_004041	A	6	6	7413	7418	100 %	0 %	0 %	0 %	21492958
4	NC_004041	T	6	6	7789	7794	0 %	100 %	0 %	0 %	21492958
5	NC_004041	A	6	6	17402	17407	100 %	0 %	0 %	0 %	21492953
6	NC_004041	A	6	6	18262	18267	100 %	0 %	0 %	0 %	21492952
7	NC_004041	A	6	6	31323	31328	100 %	0 %	0 %	0 %	21492936
8	NC_004041	A	7	7	34141	34147	100 %	0 %	0 %	0 %	89255304
9	NC_004041	A	6	6	35675	35680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004041	G	6	6	39191	39196	0 %	0 %	100 %	0 %	89255309
11	NC_004041	A	6	6	39578	39583	100 %	0 %	0 %	0 %	89255309
12	NC_004041	T	6	6	41836	41841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004041	A	7	7	42917	42923	100 %	0 %	0 %	0 %	21492924
14	NC_004041	G	7	7	44236	44242	0 %	0 %	100 %	0 %	21492922
15	NC_004041	A	7	7	46343	46349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004041	C	6	6	48548	48553	0 %	0 %	0 %	100 %	21492919
17	NC_004041	C	6	6	52145	52150	0 %	0 %	0 %	100 %	89255314
18	NC_004041	C	7	7	54225	54231	0 %	0 %	0 %	100 %	21492914
19	NC_004041	A	6	6	54866	54871	100 %	0 %	0 %	0 %	89255315
20	NC_004041	A	6	6	56163	56168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004041	T	7	7	62813	62819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004041	G	7	7	67606	67612	0 %	0 %	100 %	0 %	21492904
23	NC_004041	A	6	6	69824	69829	100 %	0 %	0 %	0 %	21492901
24	NC_004041	T	6	6	70211	70216	0 %	100 %	0 %	0 %	21492901
25	NC_004041	G	6	6	81730	81735	0 %	0 %	100 %	0 %	21492889
26	NC_004041	A	6	6	81845	81850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004041	A	6	6	82464	82469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004041	G	7	7	90289	90295	0 %	0 %	100 %	0 %	89255325
29	NC_004041	A	6	6	94695	94700	100 %	0 %	0 %	0 %	21492878
30	NC_004041	A	6	6	96702	96707	100 %	0 %	0 %	0 %	21492875
31	NC_004041	C	6	6	96754	96759	0 %	0 %	0 %	100 %	21492875
32	NC_004041	A	6	6	98004	98009	100 %	0 %	0 %	0 %	89255327
33	NC_004041	G	7	7	98294	98300	0 %	0 %	100 %	0 %	89255327
34	NC_004041	G	6	6	100740	100745	0 %	0 %	100 %	0 %	89255329
35	NC_004041	T	6	6	105441	105446	0 %	100 %	0 %	0 %	89255330
36	NC_004041	A	8	8	106296	106303	100 %	0 %	0 %	0 %	89255331
37	NC_004041	C	7	7	110514	110520	0 %	0 %	0 %	100 %	21492863
38	NC_004041	A	6	6	114589	114594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004041	T	6	6	114989	114994	0 %	100 %	0 %	0 %	21492859
40	NC_004041	A	6	6	115604	115609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004041	A	6	6	118362	118367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004041	T	6	6	120079	120084	0 %	100 %	0 %	0 %	21492856
43	NC_004041	A	6	6	121268	121273	100 %	0 %	0 %	0 %	21492856
44	NC_004041	T	6	6	124576	124581	0 %	100 %	0 %	0 %	21492854
45	NC_004041	T	6	6	125794	125799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004041	G	9	9	131222	131230	0 %	0 %	100 %	0 %	89255337
47	NC_004041	G	6	6	132996	133001	0 %	0 %	100 %	0 %	21492845
48	NC_004041	A	6	6	136737	136742	100 %	0 %	0 %	0 %	89255341
49	NC_004041	A	6	6	141281	141286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004041	G	7	7	143041	143047	0 %	0 %	100 %	0 %	21492835
51	NC_004041	A	6	6	143574	143579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004041	A	6	6	143982	143987	100 %	0 %	0 %	0 %	21492834
53	NC_004041	G	6	6	147732	147737	0 %	0 %	100 %	0 %	89255343
54	NC_004041	A	6	6	153337	153342	100 %	0 %	0 %	0 %	21492826
55	NC_004041	C	7	7	153490	153496	0 %	0 %	0 %	100 %	21492826
56	NC_004041	T	6	6	156387	156392	0 %	100 %	0 %	0 %	89255347
57	NC_004041	G	6	6	156512	156517	0 %	0 %	100 %	0 %	89255347
58	NC_004041	A	6	6	156792	156797	100 %	0 %	0 %	0 %	89255347
59	NC_004041	A	7	7	158620	158626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004041	A	6	6	160523	160528	100 %	0 %	0 %	0 %	21492822
61	NC_004041	G	6	6	161166	161171	0 %	0 %	100 %	0 %	21492821
62	NC_004041	T	7	7	167463	167469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004041	T	6	6	172914	172919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004041	G	6	6	187341	187346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004041	A	6	6	187922	187927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004041	A	6	6	188628	188633	100 %	0 %	0 %	0 %	21492791
67	NC_004041	A	7	7	189005	189011	100 %	0 %	0 %	0 %	21492791
68	NC_004041	T	8	8	189672	189679	0 %	100 %	0 %	0 %	21492790
69	NC_004041	T	6	6	192405	192410	0 %	100 %	0 %	0 %	21492788
70	NC_004041	G	6	6	195919	195924	0 %	0 %	100 %	0 %	21492785
71	NC_004041	T	6	6	203185	203190	0 %	100 %	0 %	0 %	21492777
72	NC_004041	C	6	6	204648	204653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_004041	A	7	7	205884	205890	100 %	0 %	0 %	0 %	21492775
74	NC_004041	A	6	6	210847	210852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004041	C	6	6	212873	212878	0 %	0 %	0 %	100 %	21492768
76	NC_004041	T	6	6	218490	218495	0 %	100 %	0 %	0 %	21492762
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78	NC_004041	C	6	6	221913	221918	0 %	0 %	0 %	100 %	89255364
79	NC_004041	A	6	6	223020	223025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004041	T	7	7	226275	226281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004041	A	6	6	226574	226579	100 %	0 %	0 %	0 %	21492755
82	NC_004041	T	9	9	228975	228983	0 %	100 %	0 %	0 %	21492750
83	NC_004041	G	6	6	230379	230384	0 %	0 %	100 %	0 %	21492748
84	NC_004041	T	6	6	231199	231204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004041	T	6	6	233459	233464	0 %	100 %	0 %	0 %	21492746
86	NC_004041	T	6	6	235131	235136	0 %	100 %	0 %	0 %	89255369
87	NC_004041	T	6	6	236597	236602	0 %	100 %	0 %	0 %	21492742
88	NC_004041	G	7	7	237417	237423	0 %	0 %	100 %	0 %	21492741
89	NC_004041	A	6	6	240058	240063	100 %	0 %	0 %	0 %	21492739
90	NC_004041	C	6	6	243315	243320	0 %	0 %	0 %	100 %	89255370
91	NC_004041	T	6	6	243853	243858	0 %	100 %	0 %	0 %	89255370
92	NC_004041	G	6	6	245798	245803	0 %	0 %	100 %	0 %	21492734
93	NC_004041	A	7	7	246924	246930	100 %	0 %	0 %	0 %	21492732
94	NC_004041	A	6	6	247433	247438	100 %	0 %	0 %	0 %	21492731
95	NC_004041	A	6	6	252911	252916	100 %	0 %	0 %	0 %	21492728
96	NC_004041	T	6	6	254203	254208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004041	T	6	6	254801	254806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004041	T	6	6	254842	254847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004041	C	6	6	264816	264821	0 %	0 %	0 %	100 %	21492718
100	NC_004041	G	6	6	271868	271873	0 %	0 %	100 %	0 %	21492713
101	NC_004041	G	6	6	273220	273225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004041	A	7	7	274808	274814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004041	A	8	8	277632	277639	100 %	0 %	0 %	0 %	21492708
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105	NC_004041	A	6	6	280714	280719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004041	G	6	6	281394	281399	0 %	0 %	100 %	0 %	21492705
107	NC_004041	A	7	7	282589	282595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004041	A	6	6	283391	283396	100 %	0 %	0 %	0 %	89255377
109	NC_004041	T	6	6	285519	285524	0 %	100 %	0 %	0 %	89255378
110	NC_004041	T	6	6	285876	285881	0 %	100 %	0 %	0 %	89255378
111	NC_004041	T	6	6	285992	285997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004041	T	6	6	286010	286015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004041	T	6	6	288599	288604	0 %	100 %	0 %	0 %	89255380
114	NC_004041	T	6	6	288865	288870	0 %	100 %	0 %	0 %	89255380
115	NC_004041	T	6	6	290046	290051	0 %	100 %	0 %	0 %	21492697
116	NC_004041	C	6	6	292811	292816	0 %	0 %	0 %	100 %	21492693
117	NC_004041	T	8	8	293412	293419	0 %	100 %	0 %	0 %	89255383
118	NC_004041	A	6	6	295246	295251	100 %	0 %	0 %	0 %	21492690
119	NC_004041	A	6	6	295918	295923	100 %	0 %	0 %	0 %	89255384
120	NC_004041	G	6	6	297876	297881	0 %	0 %	100 %	0 %	21492688
121	NC_004041	T	6	6	303770	303775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004041	C	6	6	304664	304669	0 %	0 %	0 %	100 %	21492679
123	NC_004041	C	6	6	305433	305438	0 %	0 %	0 %	100 %	21492678
124	NC_004041	C	6	6	307679	307684	0 %	0 %	0 %	100 %	21492676
125	NC_004041	C	6	6	310802	310807	0 %	0 %	0 %	100 %	21492673
126	NC_004041	T	6	6	313952	313957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004041	T	7	7	314802	314808	0 %	100 %	0 %	0 %	89255386
128	NC_004041	A	6	6	317867	317872	100 %	0 %	0 %	0 %	21492668
129	NC_004041	A	6	6	318703	318708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004041	T	6	6	321992	321997	0 %	100 %	0 %	0 %	21492663
131	NC_004041	C	6	6	324406	324411	0 %	0 %	0 %	100 %	21492662
132	NC_004041	T	7	7	325300	325306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_004041	A	7	7	329697	329703	100 %	0 %	0 %	0 %	21493005
135	NC_004041	T	7	7	330821	330827	0 %	100 %	0 %	0 %	21493003
136	NC_004041	T	6	6	332570	332575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004041	T	6	6	333515	333520	0 %	100 %	0 %	0 %	21493002
138	NC_004041	A	6	6	336605	336610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_004041	A	6	6	339272	339277	100 %	0 %	0 %	0 %	89255392
141	NC_004041	T	7	7	340623	340629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004041	C	6	6	344644	344649	0 %	0 %	0 %	100 %	89255397
143	NC_004041	T	6	6	345079	345084	0 %	100 %	0 %	0 %	89255398
144	NC_004041	C	7	7	347328	347334	0 %	0 %	0 %	100 %	21492986
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.