MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	G	6	6	6627	6632	0 %	0 %	100 %	0 %	89255299
2	NC_004041	A	6	6	7413	7418	100 %	0 %	0 %	0 %	21492958
3	NC_004041	T	6	6	7789	7794	0 %	100 %	0 %	0 %	21492958
4	NC_004041	A	6	6	17402	17407	100 %	0 %	0 %	0 %	21492953
5	NC_004041	A	6	6	18262	18267	100 %	0 %	0 %	0 %	21492952
6	NC_004041	A	6	6	31323	31328	100 %	0 %	0 %	0 %	21492936
7	NC_004041	A	7	7	34141	34147	100 %	0 %	0 %	0 %	89255304
8	NC_004041	G	6	6	39191	39196	0 %	0 %	100 %	0 %	89255309
9	NC_004041	A	6	6	39578	39583	100 %	0 %	0 %	0 %	89255309
10	NC_004041	A	7	7	42917	42923	100 %	0 %	0 %	0 %	21492924
11	NC_004041	G	7	7	44236	44242	0 %	0 %	100 %	0 %	21492922
12	NC_004041	C	6	6	48548	48553	0 %	0 %	0 %	100 %	21492919
13	NC_004041	C	6	6	52145	52150	0 %	0 %	0 %	100 %	89255314
14	NC_004041	C	7	7	54225	54231	0 %	0 %	0 %	100 %	21492914
15	NC_004041	A	6	6	54866	54871	100 %	0 %	0 %	0 %	89255315
16	NC_004041	G	7	7	67606	67612	0 %	0 %	100 %	0 %	21492904
17	NC_004041	A	6	6	69824	69829	100 %	0 %	0 %	0 %	21492901
18	NC_004041	T	6	6	70211	70216	0 %	100 %	0 %	0 %	21492901
19	NC_004041	G	6	6	81730	81735	0 %	0 %	100 %	0 %	21492889
20	NC_004041	G	7	7	90289	90295	0 %	0 %	100 %	0 %	89255325
21	NC_004041	A	6	6	94695	94700	100 %	0 %	0 %	0 %	21492878
22	NC_004041	A	6	6	96702	96707	100 %	0 %	0 %	0 %	21492875
23	NC_004041	C	6	6	96754	96759	0 %	0 %	0 %	100 %	21492875
24	NC_004041	A	6	6	98004	98009	100 %	0 %	0 %	0 %	89255327
25	NC_004041	G	7	7	98294	98300	0 %	0 %	100 %	0 %	89255327
26	NC_004041	G	6	6	100740	100745	0 %	0 %	100 %	0 %	89255329
27	NC_004041	T	6	6	105441	105446	0 %	100 %	0 %	0 %	89255330
28	NC_004041	A	8	8	106296	106303	100 %	0 %	0 %	0 %	89255331
29	NC_004041	C	7	7	110514	110520	0 %	0 %	0 %	100 %	21492863
30	NC_004041	T	6	6	114989	114994	0 %	100 %	0 %	0 %	21492859
31	NC_004041	T	6	6	120079	120084	0 %	100 %	0 %	0 %	21492856
32	NC_004041	A	6	6	121268	121273	100 %	0 %	0 %	0 %	21492856
33	NC_004041	T	6	6	124576	124581	0 %	100 %	0 %	0 %	21492854
34	NC_004041	G	9	9	131222	131230	0 %	0 %	100 %	0 %	89255337
35	NC_004041	G	6	6	132996	133001	0 %	0 %	100 %	0 %	21492845
36	NC_004041	A	6	6	136737	136742	100 %	0 %	0 %	0 %	89255341
37	NC_004041	G	7	7	143041	143047	0 %	0 %	100 %	0 %	21492835
38	NC_004041	A	6	6	143982	143987	100 %	0 %	0 %	0 %	21492834
39	NC_004041	G	6	6	147732	147737	0 %	0 %	100 %	0 %	89255343
40	NC_004041	A	6	6	153337	153342	100 %	0 %	0 %	0 %	21492826
41	NC_004041	C	7	7	153490	153496	0 %	0 %	0 %	100 %	21492826
42	NC_004041	T	6	6	156387	156392	0 %	100 %	0 %	0 %	89255347
43	NC_004041	G	6	6	156512	156517	0 %	0 %	100 %	0 %	89255347
44	NC_004041	A	6	6	156792	156797	100 %	0 %	0 %	0 %	89255347
45	NC_004041	A	6	6	160523	160528	100 %	0 %	0 %	0 %	21492822
46	NC_004041	G	6	6	161166	161171	0 %	0 %	100 %	0 %	21492821
47	NC_004041	A	6	6	188628	188633	100 %	0 %	0 %	0 %	21492791
48	NC_004041	A	7	7	189005	189011	100 %	0 %	0 %	0 %	21492791
49	NC_004041	T	8	8	189672	189679	0 %	100 %	0 %	0 %	21492790
50	NC_004041	T	6	6	192405	192410	0 %	100 %	0 %	0 %	21492788
51	NC_004041	G	6	6	195919	195924	0 %	0 %	100 %	0 %	21492785
52	NC_004041	T	6	6	203185	203190	0 %	100 %	0 %	0 %	21492777
53	NC_004041	A	7	7	205884	205890	100 %	0 %	0 %	0 %	21492775
54	NC_004041	C	6	6	212873	212878	0 %	0 %	0 %	100 %	21492768
55	NC_004041	T	6	6	218490	218495	0 %	100 %	0 %	0 %	21492762
56	NC_004041	C	6	6	220916	220921	0 %	0 %	0 %	100 %	21492761
57	NC_004041	C	6	6	221913	221918	0 %	0 %	0 %	100 %	89255364
58	NC_004041	A	6	6	226574	226579	100 %	0 %	0 %	0 %	21492755
59	NC_004041	T	9	9	228975	228983	0 %	100 %	0 %	0 %	21492750
60	NC_004041	G	6	6	230379	230384	0 %	0 %	100 %	0 %	21492748
61	NC_004041	T	6	6	233459	233464	0 %	100 %	0 %	0 %	21492746
62	NC_004041	T	6	6	235131	235136	0 %	100 %	0 %	0 %	89255369
63	NC_004041	T	6	6	236597	236602	0 %	100 %	0 %	0 %	21492742
64	NC_004041	G	7	7	237417	237423	0 %	0 %	100 %	0 %	21492741
65	NC_004041	A	6	6	240058	240063	100 %	0 %	0 %	0 %	21492739
66	NC_004041	C	6	6	243315	243320	0 %	0 %	0 %	100 %	89255370
67	NC_004041	T	6	6	243853	243858	0 %	100 %	0 %	0 %	89255370
68	NC_004041	G	6	6	245798	245803	0 %	0 %	100 %	0 %	21492734
69	NC_004041	A	7	7	246924	246930	100 %	0 %	0 %	0 %	21492732
70	NC_004041	A	6	6	247433	247438	100 %	0 %	0 %	0 %	21492731
71	NC_004041	A	6	6	252911	252916	100 %	0 %	0 %	0 %	21492728
72	NC_004041	C	6	6	264816	264821	0 %	0 %	0 %	100 %	21492718
73	NC_004041	G	6	6	271868	271873	0 %	0 %	100 %	0 %	21492713
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76	NC_004041	G	6	6	281394	281399	0 %	0 %	100 %	0 %	21492705
77	NC_004041	A	6	6	283391	283396	100 %	0 %	0 %	0 %	89255377
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80	NC_004041	T	6	6	288599	288604	0 %	100 %	0 %	0 %	89255380
81	NC_004041	T	6	6	288865	288870	0 %	100 %	0 %	0 %	89255380
82	NC_004041	T	6	6	290046	290051	0 %	100 %	0 %	0 %	21492697
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84	NC_004041	T	8	8	293412	293419	0 %	100 %	0 %	0 %	89255383
85	NC_004041	A	6	6	295246	295251	100 %	0 %	0 %	0 %	21492690
86	NC_004041	A	6	6	295918	295923	100 %	0 %	0 %	0 %	89255384
87	NC_004041	G	6	6	297876	297881	0 %	0 %	100 %	0 %	21492688
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89	NC_004041	C	6	6	305433	305438	0 %	0 %	0 %	100 %	21492678
90	NC_004041	C	6	6	307679	307684	0 %	0 %	0 %	100 %	21492676
91	NC_004041	C	6	6	310802	310807	0 %	0 %	0 %	100 %	21492673
92	NC_004041	T	7	7	314802	314808	0 %	100 %	0 %	0 %	89255386
93	NC_004041	A	6	6	317867	317872	100 %	0 %	0 %	0 %	21492668
94	NC_004041	T	6	6	321992	321997	0 %	100 %	0 %	0 %	21492663
95	NC_004041	C	6	6	324406	324411	0 %	0 %	0 %	100 %	21492662
96	NC_004041	T	6	6	327766	327771	0 %	100 %	0 %	0 %	21492660
97	NC_004041	A	7	7	329697	329703	100 %	0 %	0 %	0 %	21493005
98	NC_004041	T	7	7	330821	330827	0 %	100 %	0 %	0 %	21493003
99	NC_004041	T	6	6	333515	333520	0 %	100 %	0 %	0 %	21493002
100	NC_004041	T	6	6	338113	338118	0 %	100 %	0 %	0 %	21492996
101	NC_004041	A	6	6	339272	339277	100 %	0 %	0 %	0 %	89255392
102	NC_004041	C	6	6	344644	344649	0 %	0 %	0 %	100 %	89255397
103	NC_004041	T	6	6	345079	345084	0 %	100 %	0 %	0 %	89255398
104	NC_004041	C	7	7	347328	347334	0 %	0 %	0 %	100 %	21492986
105	NC_004041	G	6	6	352039	352044	0 %	0 %	100 %	0 %	89255401
106	NC_004041	A	6	6	353731	353736	100 %	0 %	0 %	0 %	21492980
107	NC_004041	A	6	6	365783	365788	100 %	0 %	0 %	0 %	21492968
108	NC_004041	C	6	6	365824	365829	0 %	0 %	0 %	100 %	21492968
109	NC_004041	T	6	6	368354	368359	0 %	100 %	0 %	0 %	89255406
110	NC_004041	A	6	6	368842	368847	100 %	0 %	0 %	0 %	89255406
111	NC_004041	A	6	6	370770	370775	100 %	0 %	0 %	0 %	21492965

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.