MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. Ames chromosome

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003997	CTATTA	2	12	1854	1865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003997	TTTCGT	2	12	10905	10916	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003997	TTTCGT	2	12	30699	30710	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003997	TTTAAA	2	12	41436	41447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003997	CTTTTT	2	12	74465	74476	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003997	TTATAT	2	12	82129	82140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003997	TATATT	2	12	82224	82235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003997	AGTCAA	2	12	87387	87398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003997	AAATAC	2	12	163599	163610	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003997	GTATGT	2	12	177274	177285	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003997	GTATGT	2	12	183113	183124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003997	TAAATT	2	12	191753	191764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003997	TTCTTT	2	12	202325	202336	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003997	AAAATA	2	12	210683	210694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003997	AAGGGG	2	12	210767	210778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003997	GTTTTG	2	12	212250	212261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003997	AGAGGT	2	12	214151	214162	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003997	TTTCAT	2	12	227985	227996	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003997	ATAAAA	2	12	241034	241045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003997	AAAAGA	2	12	254370	254381	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003997	AAGATG	2	12	289939	289950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003997	AGTAAT	2	12	294937	294948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003997	TATATT	2	12	319361	319372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003997	TTGCTG	2	12	325376	325387	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_003997	TATAAA	2	12	326147	326158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003997	CTTTTA	2	12	336921	336932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_003997	AAAAAT	2	12	342165	342176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003997	AATAGA	2	12	342412	342423	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003997	ATTTGA	2	12	343938	343949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003997	AATGAT	2	12	363265	363276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003997	TTATTT	2	12	376366	376377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003997	GTTAAT	2	12	378619	378630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003997	TTTATA	2	12	404298	404309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003997	AAAAAT	2	12	412207	412218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003997	CAATTG	2	12	433079	433090	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003997	ATTTTT	2	12	436565	436576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003997	CCAATT	2	12	442394	442405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_003997	TAAAAT	2	12	453266	453277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003997	TAAAAA	2	12	461796	461807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003997	CTTTTT	2	12	462852	462863	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003997	TTTTTG	2	12	463397	463408	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003997	TTAAGT	2	12	466832	466843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003997	AGAAAA	2	12	471806	471817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003997	AATGAT	2	12	480217	480228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003997	TTTTCT	2	12	495814	495825	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003997	ATTTTA	2	12	500661	500672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003997	GAAGTT	2	12	513257	513268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003997	TAAAAA	2	12	545991	546002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003997	ATCATT	2	12	552135	552146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003997	TGTATA	2	12	604159	604170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003997	AGCATT	2	12	613311	613322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003997	CTTTTT	2	12	617097	617108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_003997	AAATGA	2	12	668813	668824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003997	AGAAAA	2	12	669085	669096	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003997	TTTTTC	2	12	677301	677312	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_003997	GCAATT	2	12	677593	677604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003997	TTTCAT	2	12	677995	678006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003997	TACATT	2	12	681276	681287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_003997	ACTTAA	2	12	714282	714293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003997	TTTTTA	2	12	724378	724389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003997	CCATTG	2	12	732235	732246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003997	TAAATT	2	12	733194	733205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003997	TTAAAA	2	12	734148	734159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003997	TTAATT	2	12	740946	740957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003997	TTTTAT	2	12	778128	778139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003997	ATCAAT	2	12	786085	786096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003997	GTATAT	2	12	793974	793985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003997	ATAAAA	2	12	796716	796727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003997	ACATTT	2	12	799937	799948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003997	ATAAGT	2	12	800011	800022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003997	ATGTAA	2	12	816335	816346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003997	TTAAAG	2	12	831388	831399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003997	AATGTA	2	12	859708	859719	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003997	ACGAGA	2	12	859756	859767	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003997	TTTAAA	2	12	862522	862533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003997	GTTTTT	2	12	865313	865324	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003997	TCATAT	2	12	872728	872739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003997	GTATAT	3	18	876375	876392	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003997	AAGTAG	2	12	893083	893094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003997	TTGAAA	2	12	899294	899305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003997	TGTACA	2	12	902574	902585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_003997	ATATTT	2	12	920329	920340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003997	GCGATG	2	12	926037	926048	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_003997	CGTTAT	2	12	926213	926224	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_003997	AACAAA	3	18	944571	944588	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003997	CAAAAA	2	12	954368	954379	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_003997	TGATGG	2	12	961591	961602	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003997	AATGGA	2	12	973988	973999	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003997	AAACAA	2	12	982172	982183	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_003997	TACTTT	2	12	992936	992947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_003997	AATTAA	2	12	1010725	1010736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003997	CTTTTT	2	12	1012005	1012016	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003997	TCTTTT	2	12	1014589	1014600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_003997	AAAAAG	2	12	1039811	1039822	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003997	AAAATA	2	12	1042654	1042665	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003997	CCTTTT	2	12	1062520	1062531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_003997	TAATAT	2	12	1067946	1067957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003997	CAACAG	2	12	1084871	1084882	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_003997	TGTGTT	3	18	1086304	1086321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003997	AATAAA	2	12	1088007	1088018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003997	TTTATT	2	12	1108607	1108618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003997	ATTTTT	2	12	1109693	1109704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003997	TTTTCT	2	12	1141806	1141817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_003997	TGTTTC	2	12	1147011	1147022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_003997	AATATA	2	12	1160917	1160928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003997	CTTTTC	2	12	1172356	1172367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003997	TTGCAA	2	12	1179360	1179371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_003997	AAGTAT	2	12	1190264	1190275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003997	CAGTAA	2	12	1214592	1214603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_003997	GGAGAG	2	12	1236209	1236220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003997	AAATAA	2	12	1238582	1238593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003997	AAAATT	2	12	1244450	1244461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003997	AATGAT	2	12	1286977	1286988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003997	TGTAAC	2	12	1287289	1287300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003997	TGCGAA	2	12	1287797	1287808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_003997	TCAAAA	2	12	1288520	1288531	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_003997	ATTTGG	2	12	1288919	1288930	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003997	GGATAA	2	12	1292452	1292463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003997	AATGAA	2	12	1303397	1303408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003997	AAAAGT	2	12	1304380	1304391	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003997	TGCTCA	2	12	1308082	1308093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003997	TTTACT	2	12	1313051	1313062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_003997	GAAAGG	2	12	1348448	1348459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003997	ATACAA	2	12	1362645	1362656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_003997	GTTTTT	2	12	1384137	1384148	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003997	ATTTCT	2	12	1389153	1389164	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_003997	TTATCA	2	12	1398977	1398988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_003997	GAAGGA	2	12	1410376	1410387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003997	TTTTTA	2	12	1510240	1510251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.