MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	TGCTTC	2	12	279	290	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003981	ACTCTG	2	12	4855	4866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21392901
3	NC_003981	TCATCT	2	12	7349	7360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392902
4	NC_003981	GTTACC	2	12	7803	7814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21392904
5	NC_003981	AATTCA	2	12	15447	15458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003981	GAACAT	2	12	15858	15869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21392910
7	NC_003981	TTTCTT	2	12	18409	18420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21392914
8	NC_003981	CCTGTT	2	12	19144	19155	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21392915
9	NC_003981	TCTTTG	2	12	21190	21201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003981	CATTTT	2	12	27054	27065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21392924
11	NC_003981	TAAATT	2	12	28385	28396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003981	CATTCT	2	12	29570	29581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392927
13	NC_003981	TTTGCA	2	12	30300	30311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21392928
14	NC_003981	TGTGTA	2	12	30986	30997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21392929
15	NC_003981	TTTTTC	2	12	34219	34230	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_003981	CTTGAC	2	12	35477	35488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21392933
17	NC_003981	CAATAT	2	12	41653	41664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21392942
18	NC_003981	GAATTA	2	12	43567	43578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21392944
19	NC_003981	TATAAT	2	12	46540	46551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003981	TACCAA	2	12	47346	47357	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21392946
21	NC_003981	TAAAAT	2	12	48416	48427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003981	ATGAAT	2	12	48509	48520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003981	ACTTTC	2	12	49153	49164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392948
24	NC_003981	TTGTTT	2	12	50076	50087	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	21392948
25	NC_003981	TCCCTT	2	12	50191	50202	0 %	50 %	0 %	50 %	21392948
26	NC_003981	TTTTAT	2	12	50203	50214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21392948
27	NC_003981	GATTTG	2	12	50344	50355	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21392948
28	NC_003981	TATACA	2	12	50416	50427	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003981	CATTCT	2	12	52871	52882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392951
30	NC_003981	TCTTTA	2	12	53572	53583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21392951
31	NC_003981	TTTTCT	2	12	53916	53927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21392952
32	NC_003981	TCGTCA	2	12	54934	54945	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21392952
33	NC_003981	TGCTTC	2	12	56469	56480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21392954
34	NC_003981	ATTCAT	2	12	59664	59675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_003981	ACTTTG	2	12	62150	62161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21392960
36	NC_003981	TTATAA	2	12	64008	64019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003981	CAAATA	2	12	65402	65413	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21392963
38	NC_003981	AATATG	2	12	66204	66215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003981	TATAAA	2	12	70164	70175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003981	TTTTAA	2	12	70305	70316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003981	ATTTTT	2	12	73726	73737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21392972
42	NC_003981	ATTGTA	2	12	75133	75144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21392974
43	NC_003981	TGTTTC	2	12	75238	75249	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21392975
44	NC_003981	TTAAAT	2	12	79169	79180	50 %	50 %	0 %	0 %	21392980
45	NC_003981	TCCAAA	2	12	84803	84814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_003981	TTCCTA	2	12	85806	85817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392986
47	NC_003981	TACTTT	2	12	86677	86688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_003981	TCATAA	2	12	89287	89298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21392989
49	NC_003981	TATTTA	2	12	89679	89690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21392990
50	NC_003981	CATATC	2	12	90684	90695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21392992
51	NC_003981	CATCTT	2	12	91398	91409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392993
52	NC_003981	TCTCTT	2	12	92105	92116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21392993
53	NC_003981	TTTAAT	2	12	92515	92526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21392993
54	NC_003981	TTTCTT	2	12	94049	94060	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_003981	GTTTTC	2	12	94498	94509	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.