MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	TTTCT	2	10	1985	1994	0 %	80 %	0 %	20 %	21392897
2	NC_003981	CTTTT	2	10	2534	2543	0 %	80 %	0 %	20 %	21392897
3	NC_003981	TCATT	2	10	2591	2600	20 %	60 %	0 %	20 %	21392897
4	NC_003981	ACTTT	2	10	3401	3410	20 %	60 %	0 %	20 %	21392899
5	NC_003981	GAATC	2	10	5618	5627	40 %	20 %	20 %	20 %	21392901
6	NC_003981	ATCTT	2	10	8207	8216	20 %	60 %	0 %	20 %	21392906
7	NC_003981	GCTTC	2	10	8514	8523	0 %	40 %	20 %	40 %	21392906
8	NC_003981	CGCTT	2	10	8756	8765	0 %	40 %	20 %	40 %	21392906
9	NC_003981	TTCAC	2	10	8877	8886	20 %	40 %	0 %	40 %	21392906
10	NC_003981	TTTTC	2	10	9423	9432	0 %	80 %	0 %	20 %	21392906
11	NC_003981	TTCAT	2	10	11141	11150	20 %	60 %	0 %	20 %	21392907
12	NC_003981	TTTCT	2	10	11270	11279	0 %	80 %	0 %	20 %	21392907
13	NC_003981	TTCTT	2	10	13641	13650	0 %	80 %	0 %	20 %	21392908
14	NC_003981	ATTCA	2	10	15143	15152	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003981	TTTCA	2	10	17866	17875	20 %	60 %	0 %	20 %	21392914
16	NC_003981	AGAAA	2	10	18290	18299	80 %	0 %	20 %	0 %	21392914
17	NC_003981	TCTTG	2	10	19663	19672	0 %	60 %	20 %	20 %	21392915
18	NC_003981	CAAAT	2	10	22644	22653	60 %	20 %	0 %	20 %	21392920
19	NC_003981	CAAAA	2	10	25221	25230	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003981	AAAAT	2	10	25940	25949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003981	AATTT	2	10	26259	26268	40 %	60 %	0 %	0 %	21392923
22	NC_003981	GATGT	2	10	26384	26393	20 %	40 %	40 %	0 %	21392923
23	NC_003981	CATTT	2	10	26764	26773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003981	CATTA	2	10	26779	26788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003981	TGCTT	2	10	28075	28084	0 %	60 %	20 %	20 %	21392925
26	NC_003981	CTTCT	2	10	28199	28208	0 %	60 %	0 %	40 %	21392925
27	NC_003981	TTTTC	2	10	29725	29734	0 %	80 %	0 %	20 %	21392927
28	NC_003981	TAACT	2	10	30413	30422	40 %	40 %	0 %	20 %	21392928
29	NC_003981	CAACA	2	10	31285	31294	60 %	0 %	0 %	40 %	21392930
30	NC_003981	AACCA	2	10	32032	32041	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_003981	ACTTT	2	10	33504	33513	20 %	60 %	0 %	20 %	21392931
32	NC_003981	CTTAT	2	10	34608	34617	20 %	60 %	0 %	20 %	21392932
33	NC_003981	GGGAT	2	10	35411	35420	20 %	20 %	60 %	0 %	21392933
34	NC_003981	AAACA	2	10	35592	35601	80 %	0 %	0 %	20 %	21392933
35	NC_003981	GAAAA	2	10	36508	36517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003981	GGAAA	2	10	37399	37408	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003981	AAATC	2	10	38725	38734	60 %	20 %	0 %	20 %	21392936
38	NC_003981	TTTCC	2	10	39401	39410	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_003981	TTTTG	2	10	41499	41508	0 %	80 %	20 %	0 %	21392942
40	NC_003981	ATAAG	2	10	41844	41853	60 %	20 %	20 %	0 %	21392943
41	NC_003981	CGGTT	2	10	42525	42534	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_003981	AATAA	2	10	42591	42600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003981	GCAAA	2	10	43331	43340	60 %	0 %	20 %	20 %	21392944
44	NC_003981	TTCTT	2	10	44449	44458	0 %	80 %	0 %	20 %	21392945
45	NC_003981	CTTCT	2	10	45301	45310	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_003981	GAAAA	2	10	46166	46175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003981	TTAAA	2	10	47951	47960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003981	TGAAT	2	10	48035	48044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003981	ATCTT	2	10	49616	49625	20 %	60 %	0 %	20 %	21392948
50	NC_003981	ATTTC	2	10	50150	50159	20 %	60 %	0 %	20 %	21392948
51	NC_003981	TTTTA	2	10	50632	50641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003981	TAAAA	2	10	51776	51785	80 %	20 %	0 %	0 %	21392949
53	NC_003981	TTTTA	2	10	53793	53802	20 %	80 %	0 %	0 %	21392951
54	NC_003981	ATTTT	2	10	56410	56419	20 %	80 %	0 %	0 %	21392954
55	NC_003981	CCTTT	2	10	57458	57467	0 %	60 %	0 %	40 %	21392955
56	NC_003981	CTAAT	2	10	57803	57812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003981	TAAAT	2	10	58239	58248	60 %	40 %	0 %	0 %	21392956
58	NC_003981	ATTAA	4	20	58394	58413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003981	GTTTT	2	10	58955	58964	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003981	TTTCA	2	10	59563	59572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_003981	AAATT	2	10	61136	61145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003981	TAAAA	2	10	64422	64431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003981	TATTT	2	10	65366	65375	20 %	80 %	0 %	0 %	21392963
64	NC_003981	AATAA	2	10	65831	65840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003981	GAATT	2	10	68310	68319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003981	AAATA	2	10	68353	68362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003981	TAAAG	2	10	69073	69082	60 %	20 %	20 %	0 %	21392968
68	NC_003981	GAAAT	2	10	69533	69542	60 %	20 %	20 %	0 %	21392968
69	NC_003981	TAATA	2	10	70689	70698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003981	AAATC	2	10	72386	72395	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003981	CTTCA	2	10	73027	73036	20 %	40 %	0 %	40 %	21392972
72	NC_003981	TTTCT	2	10	74582	74591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003981	AACAA	2	10	77805	77814	80 %	0 %	0 %	20 %	21392978
74	NC_003981	TAATA	2	10	78025	78034	60 %	40 %	0 %	0 %	21392978
75	NC_003981	TTAAT	2	10	78453	78462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003981	ACAAT	2	10	79466	79475	60 %	20 %	0 %	20 %	21392980
77	NC_003981	CAAAA	2	10	82730	82739	80 %	0 %	0 %	20 %	21392983
78	NC_003981	CATTT	2	10	85068	85077	20 %	60 %	0 %	20 %	21392985
79	NC_003981	GTTAA	2	10	85437	85446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003981	TTAAA	2	10	85526	85535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003981	TAATG	2	10	86723	86732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003981	TTTTA	2	10	88429	88438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003981	ATGCA	2	10	89190	89199	40 %	20 %	20 %	20 %	21392989
84	NC_003981	CATTC	2	10	89965	89974	20 %	40 %	0 %	40 %	21392991
85	NC_003981	AAATA	2	10	90004	90013	80 %	20 %	0 %	0 %	21392991
86	NC_003981	TTCCG	2	10	91057	91066	0 %	40 %	20 %	40 %	21392992
87	NC_003981	TAAAA	2	10	91292	91301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003981	ACTCA	2	10	94430	94439	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.