MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	CTTC	2	8	86	93	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003981	TAAC	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003981	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003981	ATGT	2	8	404	411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003981	TTTG	2	8	471	478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003981	AACT	2	8	1468	1475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003981	TTAA	2	8	1532	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003981	TCCT	2	8	2875	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003981	ATTT	2	8	2888	2895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003981	CTTT	2	8	13977	13984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003981	TCTT	2	8	13986	13993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003981	TCTT	2	8	14325	14332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_003981	TGAT	2	8	14384	14391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003981	AATT	2	8	14462	14469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003981	CTCA	2	8	14750	14757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003981	TTTC	2	8	16849	16856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003981	CCCT	2	8	16857	16864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_003981	CAAA	2	8	20231	20238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003981	TAAA	2	8	21215	21222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003981	AATC	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003981	TTTA	2	8	21672	21679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003981	CTTG	2	8	21840	21847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003981	ACCA	2	8	22169	22176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003981	GTTT	2	8	25926	25933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003981	AAAC	2	8	26017	26024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003981	GAAA	2	8	26098	26105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003981	ATGA	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003981	CATT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003981	ATCT	2	8	26940	26947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003981	AAAT	2	8	26979	26986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003981	TCGG	2	8	27637	27644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003981	CATT	2	8	30645	30652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003981	CTGT	2	8	33964	33971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003981	AAAT	2	8	34153	34160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003981	AAGA	2	8	36417	36424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003981	AGTA	2	8	36457	36464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003981	CTTC	2	8	37269	37276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003981	TTTG	2	8	39435	39442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003981	CTTT	2	8	39897	39904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003981	ACAA	2	8	42644	42651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003981	AAAT	2	8	43659	43666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003981	TTCA	2	8	44588	44595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003981	AATA	2	8	44616	44623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003981	CAAA	2	8	45311	45318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003981	ATCA	2	8	45331	45338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003981	AGGC	2	8	45454	45461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003981	ATGA	2	8	47061	47068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003981	ATTA	2	8	47216	47223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003981	TACT	2	8	47491	47498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003981	TCCT	2	8	47917	47924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003981	AATA	2	8	48052	48059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003981	TTCA	2	8	48483	48490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003981	CTAA	2	8	48560	48567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003981	CCCA	2	8	48624	48631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_003981	TAAA	2	8	48864	48871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003981	AATT	2	8	50454	50461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003981	TTTG	2	8	50474	50481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003981	ATTA	2	8	50578	50585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003981	ATAA	2	8	50699	50706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003981	TCTT	2	8	50878	50885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003981	TTTC	2	8	51033	51040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_003981	AAAT	2	8	51964	51971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003981	TTCT	2	8	57261	57268	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003981	TCAA	2	8	58068	58075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003981	AATT	2	8	58303	58310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003981	AAAG	2	8	58424	58431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003981	ATAA	2	8	59021	59028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003981	ACTC	2	8	59096	59103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_003981	CTAT	2	8	59780	59787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003981	TAAA	2	8	59911	59918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003981	CTTT	2	8	59992	59999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003981	ACCA	2	8	60132	60139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_003981	CATT	2	8	61265	61272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_003981	AATT	2	8	62308	62315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003981	ATCT	2	8	63029	63036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003981	TTTA	2	8	63224	63231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003981	TGAA	2	8	63242	63249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003981	CATT	2	8	63337	63344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003981	CTTG	2	8	63547	63554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003981	TTTG	2	8	63625	63632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003981	ACAA	2	8	63864	63871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003981	AAAC	2	8	64511	64518	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_003981	TGGT	2	8	64698	64705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003981	CTAC	2	8	65630	65637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_003981	AAAC	2	8	66049	66056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003981	AAAT	2	8	66132	66139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003981	AGTA	2	8	66196	66203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003981	TAGA	2	8	66288	66295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003981	ATGT	2	8	66619	66626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003981	GGAA	2	8	67412	67419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003981	GTTT	2	8	67744	67751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003981	AAAT	2	8	68413	68420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003981	ATAA	2	8	70071	70078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003981	CCTT	2	8	70131	70138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003981	TTAA	2	8	70323	70330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003981	TTTG	2	8	70969	70976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003981	TAAT	2	8	71065	71072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003981	TTAT	2	8	71465	71472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003981	ATTA	2	8	71509	71516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003981	TGTA	2	8	72076	72083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003981	GATG	2	8	72608	72615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003981	TAAA	2	8	72641	72648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003981	GTTT	2	8	72744	72751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003981	AATA	2	8	76317	76324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003981	AACA	2	8	80740	80747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003981	TCTT	2	8	80780	80787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_003981	ATAA	2	8	81422	81429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003981	AGCA	2	8	81774	81781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003981	TTGT	2	8	83509	83516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003981	TTAT	2	8	83665	83672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003981	TAAA	2	8	83673	83680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003981	ATTT	2	8	85541	85548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003981	AATC	2	8	86166	86173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_003981	GTTT	2	8	86205	86212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003981	CCTT	2	8	86259	86266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_003981	CTAT	2	8	86367	86374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003981	AGGA	2	8	86822	86829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003981	TTGG	2	8	87148	87155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003981	AAAG	2	8	87539	87546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003981	TCCT	2	8	87749	87756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003981	CTTT	2	8	87947	87954	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_003981	ATCC	2	8	88129	88136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003981	AATG	2	8	94588	94595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.