MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	TTAA	2	8	895	902	50 %	50 %	0 %	0 %	21392894
2	NC_003981	TCTA	2	8	1229	1236	25 %	50 %	0 %	25 %	21392895
3	NC_003981	TTTC	2	8	1393	1400	0 %	75 %	0 %	25 %	21392895
4	NC_003981	TTTC	2	8	1787	1794	0 %	75 %	0 %	25 %	21392897
5	NC_003981	ATTG	2	8	1860	1867	25 %	50 %	25 %	0 %	21392897
6	NC_003981	TAAA	2	8	2522	2529	75 %	25 %	0 %	0 %	21392897
7	NC_003981	TTTC	2	8	2668	2675	0 %	75 %	0 %	25 %	21392898
8	NC_003981	TCTT	2	8	3463	3470	0 %	75 %	0 %	25 %	21392899
9	NC_003981	ATTT	2	8	3562	3569	25 %	75 %	0 %	0 %	21392899
10	NC_003981	TGAC	2	8	3713	3720	25 %	25 %	25 %	25 %	21392900
11	NC_003981	CATC	2	8	3942	3949	25 %	25 %	0 %	50 %	21392900
12	NC_003981	AAAT	2	8	5962	5969	75 %	25 %	0 %	0 %	21392901
13	NC_003981	TTTC	2	8	6187	6194	0 %	75 %	0 %	25 %	21392901
14	NC_003981	CCAC	2	8	6866	6873	25 %	0 %	0 %	75 %	21392902
15	NC_003981	AAGT	2	8	7119	7126	50 %	25 %	25 %	0 %	21392902
16	NC_003981	TAAT	2	8	7730	7737	50 %	50 %	0 %	0 %	21392903
17	NC_003981	ATTG	2	8	8831	8838	25 %	50 %	25 %	0 %	21392906
18	NC_003981	ATTT	2	8	8953	8960	25 %	75 %	0 %	0 %	21392906
19	NC_003981	GTTT	2	8	9043	9050	0 %	75 %	25 %	0 %	21392906
20	NC_003981	GTTT	2	8	9133	9140	0 %	75 %	25 %	0 %	21392906
21	NC_003981	AGAT	2	8	9811	9818	50 %	25 %	25 %	0 %	21392906
22	NC_003981	ATTA	2	8	9827	9834	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
23	NC_003981	AAAC	2	8	9846	9853	75 %	0 %	0 %	25 %	21392906
24	NC_003981	TAAA	2	8	10087	10094	75 %	25 %	0 %	0 %	21392906
25	NC_003981	ATTT	2	8	10202	10209	25 %	75 %	0 %	0 %	21392906
26	NC_003981	TCGT	2	8	10233	10240	0 %	50 %	25 %	25 %	21392906
27	NC_003981	CTGT	2	8	10377	10384	0 %	50 %	25 %	25 %	21392906
28	NC_003981	TAAA	2	8	10445	10452	75 %	25 %	0 %	0 %	21392906
29	NC_003981	CCCT	2	8	10826	10833	0 %	25 %	0 %	75 %	21392906
30	NC_003981	ATTG	2	8	10836	10843	25 %	50 %	25 %	0 %	21392906
31	NC_003981	CATT	2	8	10878	10885	25 %	50 %	0 %	25 %	21392906
32	NC_003981	CTTT	3	12	11562	11573	0 %	75 %	0 %	25 %	21392907
33	NC_003981	CTTT	2	8	12208	12215	0 %	75 %	0 %	25 %	21392908
34	NC_003981	TTTA	2	8	12449	12456	25 %	75 %	0 %	0 %	21392908
35	NC_003981	TTGA	2	8	13099	13106	25 %	50 %	25 %	0 %	21392908
36	NC_003981	ATCA	2	8	13127	13134	50 %	25 %	0 %	25 %	21392908
37	NC_003981	GTCT	2	8	13265	13272	0 %	50 %	25 %	25 %	21392908
38	NC_003981	ATTC	2	8	13537	13544	25 %	50 %	0 %	25 %	21392908
39	NC_003981	ATTA	2	8	17048	17055	50 %	50 %	0 %	0 %	21392913
40	NC_003981	GCGA	2	8	18081	18088	25 %	0 %	50 %	25 %	21392914
41	NC_003981	TTTC	2	8	18167	18174	0 %	75 %	0 %	25 %	21392914
42	NC_003981	AATC	2	8	19407	19414	50 %	25 %	0 %	25 %	21392915
43	NC_003981	TAAT	2	8	19535	19542	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
44	NC_003981	CTTT	2	8	19824	19831	0 %	75 %	0 %	25 %	21392916
45	NC_003981	TACT	2	8	19845	19852	25 %	50 %	0 %	25 %	21392916
46	NC_003981	CTCG	2	8	20081	20088	0 %	25 %	25 %	50 %	21392916
47	NC_003981	TCAC	2	8	22437	22444	25 %	25 %	0 %	50 %	21392920
48	NC_003981	ACCA	2	8	22445	22452	50 %	0 %	0 %	50 %	21392920
49	NC_003981	ATTT	2	8	22598	22605	25 %	75 %	0 %	0 %	21392920
50	NC_003981	GTAA	2	8	22778	22785	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
51	NC_003981	CAAG	2	8	23335	23342	50 %	0 %	25 %	25 %	21392920
52	NC_003981	GAAT	2	8	23405	23412	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
53	NC_003981	GCAT	2	8	23475	23482	25 %	25 %	25 %	25 %	21392920
54	NC_003981	TTTC	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	21392920
55	NC_003981	GTTT	2	8	24685	24692	0 %	75 %	25 %	0 %	21392920
56	NC_003981	AAGT	2	8	24911	24918	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
57	NC_003981	TTTG	2	8	25264	25271	0 %	75 %	25 %	0 %	21392921
58	NC_003981	TTCC	2	8	25440	25447	0 %	50 %	0 %	50 %	21392921
59	NC_003981	ACCT	2	8	25664	25671	25 %	25 %	0 %	50 %	21392922
60	NC_003981	ATTT	2	8	26481	26488	25 %	75 %	0 %	0 %	21392923
61	NC_003981	CATT	2	8	26590	26597	25 %	50 %	0 %	25 %	21392923
62	NC_003981	ACTA	2	8	27187	27194	50 %	25 %	0 %	25 %	21392924
63	NC_003981	AGAA	2	8	27280	27287	75 %	0 %	25 %	0 %	21392924
64	NC_003981	TGAT	2	8	29312	29319	25 %	50 %	25 %	0 %	21392926
65	NC_003981	TTAT	2	8	29782	29789	25 %	75 %	0 %	0 %	21392927
66	NC_003981	CTTG	2	8	30338	30345	0 %	50 %	25 %	25 %	21392928
67	NC_003981	TAGT	2	8	30559	30566	25 %	50 %	25 %	0 %	21392928
68	NC_003981	TCTT	2	8	31633	31640	0 %	75 %	0 %	25 %	21392930
69	NC_003981	AAAG	2	8	32733	32740	75 %	0 %	25 %	0 %	21392931
70	NC_003981	TGTT	2	8	32771	32778	0 %	75 %	25 %	0 %	21392931
71	NC_003981	ACTT	2	8	34931	34938	25 %	50 %	0 %	25 %	21392932
72	NC_003981	ATTT	2	8	35228	35235	25 %	75 %	0 %	0 %	21392932
73	NC_003981	AAAG	2	8	35452	35459	75 %	0 %	25 %	0 %	21392933
74	NC_003981	TACA	2	8	36039	36046	50 %	25 %	0 %	25 %	21392997
75	NC_003981	AGAA	2	8	36707	36714	75 %	0 %	25 %	0 %	21392935
76	NC_003981	AACA	2	8	37666	37673	75 %	0 %	0 %	25 %	21392936
77	NC_003981	ATGA	2	8	38473	38480	50 %	25 %	25 %	0 %	21392936
78	NC_003981	ATAA	2	8	40413	40420	75 %	25 %	0 %	0 %	21392938
79	NC_003981	AGTA	2	8	41858	41865	50 %	25 %	25 %	0 %	21392943
80	NC_003981	ATAG	2	8	41882	41889	50 %	25 %	25 %	0 %	21392943
81	NC_003981	TAAA	2	8	42151	42158	75 %	25 %	0 %	0 %	21392943
82	NC_003981	TACT	2	8	42172	42179	25 %	50 %	0 %	25 %	21392943
83	NC_003981	GTTA	2	8	42314	42321	25 %	50 %	25 %	0 %	21392943
84	NC_003981	TAGT	2	8	43145	43152	25 %	50 %	25 %	0 %	21392944
85	NC_003981	AAAG	2	8	43230	43237	75 %	0 %	25 %	0 %	21392944
86	NC_003981	AATT	2	8	43583	43590	50 %	50 %	0 %	0 %	21392944
87	NC_003981	TATT	2	8	44027	44034	25 %	75 %	0 %	0 %	21392945
88	NC_003981	AGGA	2	8	44394	44401	50 %	0 %	50 %	0 %	21392945
89	NC_003981	TCGC	2	8	44441	44448	0 %	25 %	25 %	50 %	21392945
90	NC_003981	GGAG	2	8	44470	44477	25 %	0 %	75 %	0 %	21392945
91	NC_003981	TATT	2	8	47402	47409	25 %	75 %	0 %	0 %	21392946
92	NC_003981	GTTT	2	8	49355	49362	0 %	75 %	25 %	0 %	21392948
93	NC_003981	ACAT	2	8	49377	49384	50 %	25 %	0 %	25 %	21392948
94	NC_003981	TAAC	2	8	49500	49507	50 %	25 %	0 %	25 %	21392948
95	NC_003981	TCCT	2	8	49525	49532	0 %	50 %	0 %	50 %	21392948
96	NC_003981	TTTA	2	8	49561	49568	25 %	75 %	0 %	0 %	21392948
97	NC_003981	AAAT	2	8	50095	50102	75 %	25 %	0 %	0 %	21392948
98	NC_003981	GTTG	2	8	51463	51470	0 %	50 %	50 %	0 %	21392949
99	NC_003981	ATCC	2	8	52265	52272	25 %	25 %	0 %	50 %	21392950
100	NC_003981	ATTT	2	8	52307	52314	25 %	75 %	0 %	0 %	21392951
101	NC_003981	TTAA	2	8	52378	52385	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
102	NC_003981	TCTT	2	8	52636	52643	0 %	75 %	0 %	25 %	21392951
103	NC_003981	TCAC	2	8	52903	52910	25 %	25 %	0 %	50 %	21392951
104	NC_003981	TTTC	2	8	52956	52963	0 %	75 %	0 %	25 %	21392951
105	NC_003981	TCTG	2	8	53278	53285	0 %	50 %	25 %	25 %	21392951
106	NC_003981	AATA	2	8	53348	53355	75 %	25 %	0 %	0 %	21392951
107	NC_003981	TAAT	2	8	53419	53426	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
108	NC_003981	CACT	2	8	53735	53742	25 %	25 %	0 %	50 %	21392951
109	NC_003981	ACCA	2	8	54926	54933	50 %	0 %	0 %	50 %	21392952
110	NC_003981	ATAA	2	8	55427	55434	75 %	25 %	0 %	0 %	21392953
111	NC_003981	TTCT	2	8	55515	55522	0 %	75 %	0 %	25 %	21392953
112	NC_003981	TGCT	2	8	55611	55618	0 %	50 %	25 %	25 %	21392954
113	NC_003981	AAGC	2	8	56138	56145	50 %	0 %	25 %	25 %	21392954
114	NC_003981	ATAA	2	8	56748	56755	75 %	25 %	0 %	0 %	21392954
115	NC_003981	TGTT	2	8	57382	57389	0 %	75 %	25 %	0 %	21392955
116	NC_003981	TATT	2	8	58183	58190	25 %	75 %	0 %	0 %	21392956
117	NC_003981	TAAT	2	8	58536	58543	50 %	50 %	0 %	0 %	21392957
118	NC_003981	TTTA	2	8	60381	60388	25 %	75 %	0 %	0 %	21392958
119	NC_003981	TTTG	2	8	60638	60645	0 %	75 %	25 %	0 %	21392959
120	NC_003981	TCAA	2	8	60662	60669	50 %	25 %	0 %	25 %	21392959
121	NC_003981	GGTT	2	8	60808	60815	0 %	50 %	50 %	0 %	21392959
122	NC_003981	ATAA	2	8	64614	64621	75 %	25 %	0 %	0 %	21392962
123	NC_003981	TCAT	2	8	65135	65142	25 %	50 %	0 %	25 %	21392963
124	NC_003981	ATCT	2	8	65184	65191	25 %	50 %	0 %	25 %	21392963
125	NC_003981	GTTT	2	8	66775	66782	0 %	75 %	25 %	0 %	21392964
126	NC_003981	AATA	2	8	66955	66962	75 %	25 %	0 %	0 %	21392965
127	NC_003981	TTTA	2	8	67489	67496	25 %	75 %	0 %	0 %	21392966
128	NC_003981	TAAA	2	8	69162	69169	75 %	25 %	0 %	0 %	21392968
129	NC_003981	GTAA	2	8	69233	69240	50 %	25 %	25 %	0 %	21392968
130	NC_003981	GCAA	2	8	69878	69885	50 %	0 %	25 %	25 %	21392968
131	NC_003981	GTAA	2	8	73487	73494	50 %	25 %	25 %	0 %	21392972
132	NC_003981	TCCG	2	8	73606	73613	0 %	25 %	25 %	50 %	21392972
133	NC_003981	TTCT	2	8	73808	73815	0 %	75 %	0 %	25 %	21392972
134	NC_003981	ATTT	2	8	73876	73883	25 %	75 %	0 %	0 %	21392972
135	NC_003981	TCAC	2	8	74372	74379	25 %	25 %	0 %	50 %	21392972
136	NC_003981	TTCC	2	8	74415	74422	0 %	50 %	0 %	50 %	21392972
137	NC_003981	AGCT	2	8	74532	74539	25 %	25 %	25 %	25 %	21392972
138	NC_003981	TGCT	2	8	75853	75860	0 %	50 %	25 %	25 %	21392976
139	NC_003981	CAAT	2	8	75984	75991	50 %	25 %	0 %	25 %	21392976
140	NC_003981	AAAC	2	8	77324	77331	75 %	0 %	0 %	25 %	21392977
141	NC_003981	AAGA	2	8	78087	78094	75 %	0 %	25 %	0 %	21392979
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.