MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	CT	3	6	335	340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003981	TC	3	6	994	999	0 %	50 %	0 %	50 %	21392894
3	NC_003981	TC	3	6	1045	1050	0 %	50 %	0 %	50 %	21392894
4	NC_003981	TA	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	21392895
5	NC_003981	CT	3	6	2058	2063	0 %	50 %	0 %	50 %	21392897
6	NC_003981	AT	3	6	2149	2154	50 %	50 %	0 %	0 %	21392897
7	NC_003981	CA	3	6	3908	3913	50 %	0 %	0 %	50 %	21392900
8	NC_003981	CT	3	6	4418	4423	0 %	50 %	0 %	50 %	21392900
9	NC_003981	AT	3	6	7505	7510	50 %	50 %	0 %	0 %	21392903
10	NC_003981	CA	3	6	7815	7820	50 %	0 %	0 %	50 %	21392904
11	NC_003981	GA	3	6	7998	8003	50 %	0 %	50 %	0 %	21392905
12	NC_003981	TC	3	6	8793	8798	0 %	50 %	0 %	50 %	21392906
13	NC_003981	AT	3	6	9864	9869	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
14	NC_003981	AC	3	6	10192	10197	50 %	0 %	0 %	50 %	21392906
15	NC_003981	TA	3	6	10802	10807	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
16	NC_003981	AG	3	6	12894	12899	50 %	0 %	50 %	0 %	21392908
17	NC_003981	TC	3	6	14053	14058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_003981	TC	3	6	14210	14215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_003981	AT	3	6	15525	15530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003981	CT	3	6	15652	15657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003981	GT	3	6	15729	15734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003981	TG	3	6	16039	16044	0 %	50 %	50 %	0 %	21392911
23	NC_003981	GA	3	6	16324	16329	50 %	0 %	50 %	0 %	21392996
24	NC_003981	TC	3	6	16464	16469	0 %	50 %	0 %	50 %	21392912
25	NC_003981	TC	3	6	16688	16693	0 %	50 %	0 %	50 %	21392912
26	NC_003981	GA	3	6	16875	16880	50 %	0 %	50 %	0 %	21392913
27	NC_003981	TA	3	6	17743	17748	50 %	50 %	0 %	0 %	21392914
28	NC_003981	AT	3	6	18276	18281	50 %	50 %	0 %	0 %	21392914
29	NC_003981	AT	3	6	19209	19214	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
30	NC_003981	AC	3	6	19343	19348	50 %	0 %	0 %	50 %	21392915
31	NC_003981	AT	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
32	NC_003981	AT	3	6	19508	19513	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
33	NC_003981	TC	3	6	19639	19644	0 %	50 %	0 %	50 %	21392915
34	NC_003981	TC	3	6	20133	20138	0 %	50 %	0 %	50 %	21392916
35	NC_003981	GA	3	6	20243	20248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003981	TC	4	8	20253	20260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003981	GC	3	6	20529	20534	0 %	0 %	50 %	50 %	21392918
38	NC_003981	TA	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003981	CT	4	8	23377	23384	0 %	50 %	0 %	50 %	21392920
40	NC_003981	AG	3	6	23592	23597	50 %	0 %	50 %	0 %	21392920
41	NC_003981	CA	3	6	23955	23960	50 %	0 %	0 %	50 %	21392920
42	NC_003981	TA	3	6	24011	24016	50 %	50 %	0 %	0 %	21392920
43	NC_003981	TC	3	6	25726	25731	0 %	50 %	0 %	50 %	21392922
44	NC_003981	CT	3	6	26253	26258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003981	AT	3	6	26279	26284	50 %	50 %	0 %	0 %	21392923
46	NC_003981	AT	3	6	26789	26794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003981	CA	3	6	27449	27454	50 %	0 %	0 %	50 %	21392924
48	NC_003981	TC	3	6	27748	27753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003981	TC	3	6	28086	28091	0 %	50 %	0 %	50 %	21392925
50	NC_003981	TG	3	6	28331	28336	0 %	50 %	50 %	0 %	21392925
51	NC_003981	TC	3	6	28357	28362	0 %	50 %	0 %	50 %	21392925
52	NC_003981	TC	3	6	28371	28376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003981	GT	3	6	28743	28748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003981	CA	3	6	29408	29413	50 %	0 %	0 %	50 %	21392926
55	NC_003981	AT	3	6	29658	29663	50 %	50 %	0 %	0 %	21392927
56	NC_003981	CT	3	6	29744	29749	0 %	50 %	0 %	50 %	21392927
57	NC_003981	TA	3	6	30364	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	21392928
58	NC_003981	AG	3	6	31527	31532	50 %	0 %	50 %	0 %	21392930
59	NC_003981	GA	3	6	31988	31993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003981	CT	4	8	32214	32221	0 %	50 %	0 %	50 %	21392931
61	NC_003981	CT	3	6	32871	32876	0 %	50 %	0 %	50 %	21392931
62	NC_003981	TA	3	6	33346	33351	50 %	50 %	0 %	0 %	21392931
63	NC_003981	TA	4	8	33714	33721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003981	TC	5	10	34233	34242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003981	TA	3	6	34436	34441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003981	AT	3	6	34499	34504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003981	TA	3	6	35778	35783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003981	TA	3	6	36347	36352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003981	AT	3	6	37719	37724	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
70	NC_003981	AT	3	6	37750	37755	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
71	NC_003981	CT	3	6	38598	38603	0 %	50 %	0 %	50 %	21392936
72	NC_003981	AT	3	6	38642	38647	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
73	NC_003981	TA	3	6	39149	39154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003981	AT	3	6	39746	39751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003981	AC	3	6	39766	39771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_003981	AC	3	6	39824	39829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003981	AT	3	6	40017	40022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003981	AT	3	6	40209	40214	50 %	50 %	0 %	0 %	21392937
79	NC_003981	AC	3	6	40228	40233	50 %	0 %	0 %	50 %	21392937
80	NC_003981	TA	3	6	41403	41408	50 %	50 %	0 %	0 %	21392941
81	NC_003981	TC	3	6	41757	41762	0 %	50 %	0 %	50 %	21392943
82	NC_003981	TA	3	6	42505	42510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003981	AT	3	6	42617	42622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003981	TA	4	8	42800	42807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003981	TA	3	6	42838	42843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003981	TA	3	6	43035	43040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003981	GA	3	6	43281	43286	50 %	0 %	50 %	0 %	21392944
88	NC_003981	TA	4	8	43376	43383	50 %	50 %	0 %	0 %	21392944
89	NC_003981	CT	3	6	44383	44388	0 %	50 %	0 %	50 %	21392945
90	NC_003981	TA	3	6	44946	44951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003981	TC	3	6	45658	45663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003981	TA	3	6	45939	45944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003981	GA	3	6	46727	46732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003981	CA	3	6	46737	46742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003981	AT	3	6	47031	47036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003981	AT	3	6	47040	47045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003981	AT	3	6	47185	47190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003981	GT	3	6	47458	47463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003981	TC	3	6	47777	47782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003981	AG	3	6	47977	47982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003981	AT	4	8	48268	48275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003981	AT	4	8	48843	48850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003981	TA	3	6	49222	49227	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
104	NC_003981	AT	3	6	49399	49404	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
105	NC_003981	TA	4	8	50047	50054	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
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107	NC_003981	CT	3	6	50088	50093	0 %	50 %	0 %	50 %	21392948
108	NC_003981	AT	3	6	50375	50380	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
109	NC_003981	TA	3	6	50731	50736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003981	AT	4	8	51283	51290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003981	AT	3	6	51814	51819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003981	TC	4	8	52366	52373	0 %	50 %	0 %	50 %	21392951
113	NC_003981	AT	4	8	52892	52899	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
114	NC_003981	TA	3	6	53033	53038	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
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116	NC_003981	AT	3	6	55562	55567	50 %	50 %	0 %	0 %	21392953
117	NC_003981	AT	3	6	55852	55857	50 %	50 %	0 %	0 %	21392954
118	NC_003981	TC	3	6	56235	56240	0 %	50 %	0 %	50 %	21392954
119	NC_003981	AT	3	6	56574	56579	50 %	50 %	0 %	0 %	21392954
120	NC_003981	TC	3	6	57034	57039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003981	GA	3	6	57158	57163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003981	CA	4	8	57352	57359	50 %	0 %	0 %	50 %	21392955
123	NC_003981	TA	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	21392955
124	NC_003981	TC	3	6	57941	57946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_003981	AT	3	6	58379	58384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003981	TA	4	8	58858	58865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003981	TA	4	8	58930	58937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003981	TA	3	6	58991	58996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003981	AC	3	6	59524	59529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003981	AT	3	6	59617	59622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003981	TG	3	6	59765	59770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003981	AC	3	6	59863	59868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003981	AT	3	6	60477	60482	50 %	50 %	0 %	0 %	21392959
134	NC_003981	AT	3	6	60855	60860	50 %	50 %	0 %	0 %	21392959
135	NC_003981	TA	3	6	61157	61162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003981	AT	4	8	61210	61217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003981	CT	3	6	62560	62565	0 %	50 %	0 %	50 %	21392961
138	NC_003981	TC	5	10	62681	62690	0 %	50 %	0 %	50 %	21392961
139	NC_003981	TA	3	6	62859	62864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003981	TA	3	6	63530	63535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003981	AT	3	6	64035	64040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003981	TA	3	6	64097	64102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003981	TA	3	6	64202	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_003981	TA	3	6	65700	65705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003981	TA	3	6	65766	65771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003981	CA	3	6	65893	65898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.