MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	TC	3	6	994	999	0 %	50 %	0 %	50 %	21392894
2	NC_003981	TC	3	6	1045	1050	0 %	50 %	0 %	50 %	21392894
3	NC_003981	TA	3	6	1202	1207	50 %	50 %	0 %	0 %	21392895
4	NC_003981	CT	3	6	2058	2063	0 %	50 %	0 %	50 %	21392897
5	NC_003981	AT	3	6	2149	2154	50 %	50 %	0 %	0 %	21392897
6	NC_003981	CA	3	6	3908	3913	50 %	0 %	0 %	50 %	21392900
7	NC_003981	CT	3	6	4418	4423	0 %	50 %	0 %	50 %	21392900
8	NC_003981	AT	3	6	7505	7510	50 %	50 %	0 %	0 %	21392903
9	NC_003981	CA	3	6	7815	7820	50 %	0 %	0 %	50 %	21392904
10	NC_003981	GA	3	6	7998	8003	50 %	0 %	50 %	0 %	21392905
11	NC_003981	TC	3	6	8793	8798	0 %	50 %	0 %	50 %	21392906
12	NC_003981	AT	3	6	9864	9869	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
13	NC_003981	AC	3	6	10192	10197	50 %	0 %	0 %	50 %	21392906
14	NC_003981	TA	3	6	10802	10807	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
15	NC_003981	AG	3	6	12894	12899	50 %	0 %	50 %	0 %	21392908
16	NC_003981	TG	3	6	16039	16044	0 %	50 %	50 %	0 %	21392911
17	NC_003981	GA	3	6	16324	16329	50 %	0 %	50 %	0 %	21392996
18	NC_003981	TC	3	6	16464	16469	0 %	50 %	0 %	50 %	21392912
19	NC_003981	TC	3	6	16688	16693	0 %	50 %	0 %	50 %	21392912
20	NC_003981	GA	3	6	16875	16880	50 %	0 %	50 %	0 %	21392913
21	NC_003981	TA	3	6	17743	17748	50 %	50 %	0 %	0 %	21392914
22	NC_003981	AT	3	6	18276	18281	50 %	50 %	0 %	0 %	21392914
23	NC_003981	AT	3	6	19209	19214	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
24	NC_003981	AC	3	6	19343	19348	50 %	0 %	0 %	50 %	21392915
25	NC_003981	AT	3	6	19420	19425	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
26	NC_003981	AT	3	6	19508	19513	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
27	NC_003981	TC	3	6	19639	19644	0 %	50 %	0 %	50 %	21392915
28	NC_003981	TC	3	6	20133	20138	0 %	50 %	0 %	50 %	21392916
29	NC_003981	GC	3	6	20529	20534	0 %	0 %	50 %	50 %	21392918
30	NC_003981	CT	4	8	23377	23384	0 %	50 %	0 %	50 %	21392920
31	NC_003981	AG	3	6	23592	23597	50 %	0 %	50 %	0 %	21392920
32	NC_003981	CA	3	6	23955	23960	50 %	0 %	0 %	50 %	21392920
33	NC_003981	TA	3	6	24011	24016	50 %	50 %	0 %	0 %	21392920
34	NC_003981	TC	3	6	25726	25731	0 %	50 %	0 %	50 %	21392922
35	NC_003981	AT	3	6	26279	26284	50 %	50 %	0 %	0 %	21392923
36	NC_003981	CA	3	6	27449	27454	50 %	0 %	0 %	50 %	21392924
37	NC_003981	TC	3	6	28086	28091	0 %	50 %	0 %	50 %	21392925
38	NC_003981	TG	3	6	28331	28336	0 %	50 %	50 %	0 %	21392925
39	NC_003981	TC	3	6	28357	28362	0 %	50 %	0 %	50 %	21392925
40	NC_003981	CA	3	6	29408	29413	50 %	0 %	0 %	50 %	21392926
41	NC_003981	AT	3	6	29658	29663	50 %	50 %	0 %	0 %	21392927
42	NC_003981	CT	3	6	29744	29749	0 %	50 %	0 %	50 %	21392927
43	NC_003981	TA	3	6	30364	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	21392928
44	NC_003981	AG	3	6	31527	31532	50 %	0 %	50 %	0 %	21392930
45	NC_003981	CT	4	8	32214	32221	0 %	50 %	0 %	50 %	21392931
46	NC_003981	CT	3	6	32871	32876	0 %	50 %	0 %	50 %	21392931
47	NC_003981	TA	3	6	33346	33351	50 %	50 %	0 %	0 %	21392931
48	NC_003981	AT	3	6	37719	37724	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
49	NC_003981	AT	3	6	37750	37755	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
50	NC_003981	CT	3	6	38598	38603	0 %	50 %	0 %	50 %	21392936
51	NC_003981	AT	3	6	38642	38647	50 %	50 %	0 %	0 %	21392936
52	NC_003981	AT	3	6	40209	40214	50 %	50 %	0 %	0 %	21392937
53	NC_003981	AC	3	6	40228	40233	50 %	0 %	0 %	50 %	21392937
54	NC_003981	TA	3	6	41403	41408	50 %	50 %	0 %	0 %	21392941
55	NC_003981	TC	3	6	41757	41762	0 %	50 %	0 %	50 %	21392943
56	NC_003981	GA	3	6	43281	43286	50 %	0 %	50 %	0 %	21392944
57	NC_003981	TA	4	8	43376	43383	50 %	50 %	0 %	0 %	21392944
58	NC_003981	CT	3	6	44383	44388	0 %	50 %	0 %	50 %	21392945
59	NC_003981	TA	3	6	49222	49227	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
60	NC_003981	AT	3	6	49399	49404	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
61	NC_003981	TA	4	8	50047	50054	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
62	NC_003981	TC	3	6	50056	50061	0 %	50 %	0 %	50 %	21392948
63	NC_003981	CT	3	6	50088	50093	0 %	50 %	0 %	50 %	21392948
64	NC_003981	AT	3	6	50375	50380	50 %	50 %	0 %	0 %	21392948
65	NC_003981	TC	4	8	52366	52373	0 %	50 %	0 %	50 %	21392951
66	NC_003981	AT	4	8	52892	52899	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
67	NC_003981	TA	3	6	53033	53038	50 %	50 %	0 %	0 %	21392951
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69	NC_003981	AT	3	6	55562	55567	50 %	50 %	0 %	0 %	21392953
70	NC_003981	AT	3	6	55852	55857	50 %	50 %	0 %	0 %	21392954
71	NC_003981	TC	3	6	56235	56240	0 %	50 %	0 %	50 %	21392954
72	NC_003981	AT	3	6	56574	56579	50 %	50 %	0 %	0 %	21392954
73	NC_003981	CA	4	8	57352	57359	50 %	0 %	0 %	50 %	21392955
74	NC_003981	TA	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	21392955
75	NC_003981	AT	3	6	60477	60482	50 %	50 %	0 %	0 %	21392959
76	NC_003981	AT	3	6	60855	60860	50 %	50 %	0 %	0 %	21392959
77	NC_003981	CT	3	6	62560	62565	0 %	50 %	0 %	50 %	21392961
78	NC_003981	TC	5	10	62681	62690	0 %	50 %	0 %	50 %	21392961
79	NC_003981	AT	3	6	64589	64594	50 %	50 %	0 %	0 %	21392962
80	NC_003981	AG	3	6	64688	64693	50 %	0 %	50 %	0 %	21392962
81	NC_003981	AT	3	6	64997	65002	50 %	50 %	0 %	0 %	21392963
82	NC_003981	TA	3	6	65234	65239	50 %	50 %	0 %	0 %	21392963
83	NC_003981	TG	3	6	65442	65447	0 %	50 %	50 %	0 %	21392963
84	NC_003981	AT	3	6	68559	68564	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
85	NC_003981	AT	3	6	68809	68814	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
86	NC_003981	TA	3	6	68966	68971	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
87	NC_003981	TA	3	6	69118	69123	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
88	NC_003981	AT	3	6	69414	69419	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
89	NC_003981	AT	3	6	69667	69672	50 %	50 %	0 %	0 %	21392968
90	NC_003981	TA	3	6	74430	74435	50 %	50 %	0 %	0 %	21392972
91	NC_003981	AT	3	6	74752	74757	50 %	50 %	0 %	0 %	21392973
92	NC_003981	TA	9	18	75019	75036	50 %	50 %	0 %	0 %	21392974
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97	NC_003981	TA	3	6	79271	79276	50 %	50 %	0 %	0 %	21392980
98	NC_003981	AT	3	6	79829	79834	50 %	50 %	0 %	0 %	21392980
99	NC_003981	TA	3	6	80235	80240	50 %	50 %	0 %	0 %	21392980
100	NC_003981	CT	3	6	80428	80433	0 %	50 %	0 %	50 %	21392981
101	NC_003981	CT	3	6	80965	80970	0 %	50 %	0 %	50 %	21392982
102	NC_003981	TC	3	6	80976	80981	0 %	50 %	0 %	50 %	21392982
103	NC_003981	TA	3	6	82308	82313	50 %	50 %	0 %	0 %	21392983
104	NC_003981	AT	3	6	82361	82366	50 %	50 %	0 %	0 %	21392983
105	NC_003981	TA	3	6	82713	82718	50 %	50 %	0 %	0 %	21392983
106	NC_003981	TA	3	6	83401	83406	50 %	50 %	0 %	0 %	21392983
107	NC_003981	TA	3	6	83793	83798	50 %	50 %	0 %	0 %	21392984
108	NC_003981	TA	3	6	84240	84245	50 %	50 %	0 %	0 %	21392984
109	NC_003981	AT	3	6	85019	85024	50 %	50 %	0 %	0 %	21392985
110	NC_003981	TA	3	6	85032	85037	50 %	50 %	0 %	0 %	21392985
111	NC_003981	AT	3	6	85209	85214	50 %	50 %	0 %	0 %	21392985
112	NC_003981	TC	3	6	85227	85232	0 %	50 %	0 %	50 %	21392985
113	NC_003981	TA	3	6	85266	85271	50 %	50 %	0 %	0 %	21392985
114	NC_003981	TA	3	6	85954	85959	50 %	50 %	0 %	0 %	21392986
115	NC_003981	TA	3	6	88545	88550	50 %	50 %	0 %	0 %	21392988
116	NC_003981	TA	3	6	88556	88561	50 %	50 %	0 %	0 %	21392988
117	NC_003981	CT	3	6	88638	88643	0 %	50 %	0 %	50 %	21392988
118	NC_003981	TC	3	6	88779	88784	0 %	50 %	0 %	50 %	21392989
119	NC_003981	AC	3	6	88816	88821	50 %	0 %	0 %	50 %	21392989
120	NC_003981	AT	3	6	90575	90580	50 %	50 %	0 %	0 %	21392992
121	NC_003981	TC	3	6	91330	91335	0 %	50 %	0 %	50 %	21392993
122	NC_003981	TA	3	6	91610	91615	50 %	50 %	0 %	0 %	21392993

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.