MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO1

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003980	TTTCC	2	10	1674	1683	0 %	60 %	0 %	40 %	21392691
2	NC_003980	TAAAA	2	10	1833	1842	80 %	20 %	0 %	0 %	21392692
3	NC_003980	CGGAA	2	10	2482	2491	40 %	0 %	40 %	20 %	21392693
4	NC_003980	AAGAA	2	10	2886	2895	80 %	0 %	20 %	0 %	21392694
5	NC_003980	CATAC	2	10	2904	2913	40 %	20 %	0 %	40 %	21392694
6	NC_003980	TTTAA	2	10	4193	4202	40 %	60 %	0 %	0 %	21392696
7	NC_003980	GCATT	2	10	6351	6360	20 %	40 %	20 %	20 %	21392698
8	NC_003980	TCTTT	2	10	7400	7409	0 %	80 %	0 %	20 %	21392699
9	NC_003980	TCCAT	2	10	7720	7729	20 %	40 %	0 %	40 %	21392699
10	NC_003980	TCTTT	2	10	8112	8121	0 %	80 %	0 %	20 %	21392699
11	NC_003980	CATTC	2	10	9842	9851	20 %	40 %	0 %	40 %	21392701
12	NC_003980	CTTTT	2	10	11109	11118	0 %	80 %	0 %	20 %	21392701
13	NC_003980	AGCAA	2	10	11571	11580	60 %	0 %	20 %	20 %	21392701
14	NC_003980	TTCGG	2	10	13419	13428	0 %	40 %	40 %	20 %	21392705
15	NC_003980	TTTAA	2	10	15925	15934	40 %	60 %	0 %	0 %	21392707
16	NC_003980	TTCTG	2	10	16374	16383	0 %	60 %	20 %	20 %	21392707
17	NC_003980	AATTA	2	10	18240	18249	60 %	40 %	0 %	0 %	21392707
18	NC_003980	CTCTG	2	10	18667	18676	0 %	40 %	20 %	40 %	21392707
19	NC_003980	CTCTT	2	10	20361	20370	0 %	60 %	0 %	40 %	21392708
20	NC_003980	AAATA	2	10	24021	24030	80 %	20 %	0 %	0 %	21392711
21	NC_003980	ACACT	2	10	26909	26918	40 %	20 %	0 %	40 %	21392716
22	NC_003980	ATTGC	2	10	26976	26985	20 %	40 %	20 %	20 %	21392716
23	NC_003980	TCCAA	2	10	27911	27920	40 %	20 %	0 %	40 %	21392716
24	NC_003980	GAAAA	2	10	28072	28081	80 %	0 %	20 %	0 %	21392716
25	NC_003980	TTGTT	2	10	31905	31914	0 %	80 %	20 %	0 %	21392722
26	NC_003980	TATCC	2	10	32679	32688	20 %	40 %	0 %	40 %	21392722
27	NC_003980	CCTTC	2	10	33847	33856	0 %	40 %	0 %	60 %	21392724
28	NC_003980	ATTTA	2	10	34455	34464	40 %	60 %	0 %	0 %	21392725
29	NC_003980	TTTCC	2	10	36301	36310	0 %	60 %	0 %	40 %	21392729
30	NC_003980	AATTA	2	10	37066	37075	60 %	40 %	0 %	0 %	21392730
31	NC_003980	AAATT	2	10	38606	38615	60 %	40 %	0 %	0 %	21392732
32	NC_003980	AGTAA	2	10	38919	38928	60 %	20 %	20 %	0 %	21392732
33	NC_003980	CTTGG	2	10	40655	40664	0 %	40 %	40 %	20 %	21392734
34	NC_003980	ATTTC	2	10	44563	44572	20 %	60 %	0 %	20 %	21392737
35	NC_003980	GAAAT	2	10	46699	46708	60 %	20 %	20 %	0 %	21392740
36	NC_003980	AAAAC	2	10	47744	47753	80 %	0 %	0 %	20 %	21392741
37	NC_003980	GAAAA	2	10	47942	47951	80 %	0 %	20 %	0 %	21392741
38	NC_003980	ATTTT	2	10	49852	49861	20 %	80 %	0 %	0 %	21392742
39	NC_003980	TTAAC	2	10	50882	50891	40 %	40 %	0 %	20 %	21392745
40	NC_003980	TCATC	2	10	53154	53163	20 %	40 %	0 %	40 %	21392750
41	NC_003980	TACGA	2	10	53383	53392	40 %	20 %	20 %	20 %	21392750
42	NC_003980	AGTAA	2	10	53624	53633	60 %	20 %	20 %	0 %	21392750
43	NC_003980	CTTCT	2	10	56187	56196	0 %	60 %	0 %	40 %	21392752
44	NC_003980	CTCTT	2	10	58151	58160	0 %	60 %	0 %	40 %	21392753
45	NC_003980	TTGAT	2	10	58238	58247	20 %	60 %	20 %	0 %	21392753
46	NC_003980	AACAA	2	10	60379	60388	80 %	0 %	0 %	20 %	21392755
47	NC_003980	AGTAA	2	10	64741	64750	60 %	20 %	20 %	0 %	21392761
48	NC_003980	GTGAT	2	10	65157	65166	20 %	40 %	40 %	0 %	21392762
49	NC_003980	AAAAG	2	10	66489	66498	80 %	0 %	20 %	0 %	21392762
50	NC_003980	TAAAT	2	10	68773	68782	60 %	40 %	0 %	0 %	21392765
51	NC_003980	TAGAT	2	10	70364	70373	40 %	40 %	20 %	0 %	21392766
52	NC_003980	GAAAA	2	10	70542	70551	80 %	0 %	20 %	0 %	21392766
53	NC_003980	AAAAG	2	10	70685	70694	80 %	0 %	20 %	0 %	21392766
54	NC_003980	AAGAA	2	10	73481	73490	80 %	0 %	20 %	0 %	21392770
55	NC_003980	AAAGA	2	10	74320	74329	80 %	0 %	20 %	0 %	21392771
56	NC_003980	GAAAG	2	10	74898	74907	60 %	0 %	40 %	0 %	21392771
57	NC_003980	TAGTA	2	10	75589	75598	40 %	40 %	20 %	0 %	21392772
58	NC_003980	AAAGA	2	10	76871	76880	80 %	0 %	20 %	0 %	21392773
59	NC_003980	ATTGC	2	10	77121	77130	20 %	40 %	20 %	20 %	21392773
60	NC_003980	AAATG	2	10	77658	77667	60 %	20 %	20 %	0 %	21392776
61	NC_003980	TCAAA	2	10	79588	79597	60 %	20 %	0 %	20 %	21392778
62	NC_003980	TAATT	2	10	86600	86609	40 %	60 %	0 %	0 %	21392891
63	NC_003980	AATGG	2	10	86890	86899	40 %	20 %	40 %	0 %	21392787
64	NC_003980	GATTT	2	10	87294	87303	20 %	60 %	20 %	0 %	21392788
65	NC_003980	ATTTA	2	10	89004	89013	40 %	60 %	0 %	0 %	21392791
66	NC_003980	AAAGA	2	10	92476	92485	80 %	0 %	20 %	0 %	21392792
67	NC_003980	GTTTT	2	10	98672	98681	0 %	80 %	20 %	0 %	21392797
68	NC_003980	TAAAG	2	10	102424	102433	60 %	20 %	20 %	0 %	21392802
69	NC_003980	TATTT	2	10	106873	106882	20 %	80 %	0 %	0 %	21392808
70	NC_003980	TGAAT	2	10	107512	107521	40 %	40 %	20 %	0 %	21392808
71	NC_003980	AAAAG	2	10	109195	109204	80 %	0 %	20 %	0 %	21392809
72	NC_003980	GTGAT	2	10	109484	109493	20 %	40 %	40 %	0 %	21392809
73	NC_003980	ATTAT	2	10	111006	111015	40 %	60 %	0 %	0 %	21392811
74	NC_003980	ATGAA	2	10	120176	120185	60 %	20 %	20 %	0 %	21392817
75	NC_003980	GAAAA	2	10	123037	123046	80 %	0 %	20 %	0 %	21392820
76	NC_003980	TACAA	2	10	123965	123974	60 %	20 %	0 %	20 %	21392820
77	NC_003980	AAAGG	2	10	124863	124872	60 %	0 %	40 %	0 %	21392820
78	NC_003980	ATGTA	2	10	128434	128443	40 %	40 %	20 %	0 %	21392822
79	NC_003980	ATTTA	2	10	129914	129923	40 %	60 %	0 %	0 %	21392824
80	NC_003980	AATTC	2	10	133171	133180	40 %	40 %	0 %	20 %	21392830
81	NC_003980	TTAAT	2	10	134359	134368	40 %	60 %	0 %	0 %	21392830
82	NC_003980	TATTT	2	10	135773	135782	20 %	80 %	0 %	0 %	21392830
83	NC_003980	CAATT	2	10	136451	136460	40 %	40 %	0 %	20 %	21392831
84	NC_003980	CAAAA	2	10	136631	136640	80 %	0 %	0 %	20 %	21392831
85	NC_003980	AAATT	2	10	137775	137784	60 %	40 %	0 %	0 %	21392832
86	NC_003980	ATTAT	2	10	139871	139880	40 %	60 %	0 %	0 %	21392834
87	NC_003980	TAAAA	2	10	142834	142843	80 %	20 %	0 %	0 %	21392839
88	NC_003980	GGATT	2	10	144250	144259	20 %	40 %	40 %	0 %	21392840
89	NC_003980	GATAT	2	10	145841	145850	40 %	40 %	20 %	0 %	21392840
90	NC_003980	ATAAA	2	10	147801	147810	80 %	20 %	0 %	0 %	21392843
91	NC_003980	ATTCC	2	10	149975	149984	20 %	40 %	0 %	40 %	21392848
92	NC_003980	GAAGC	2	10	160449	160458	40 %	0 %	40 %	20 %	21392866
93	NC_003980	AGGGA	2	10	160931	160940	40 %	0 %	60 %	0 %	21392866
94	NC_003980	TTAAA	2	10	161236	161245	60 %	40 %	0 %	0 %	21392866
95	NC_003980	TTGGA	2	10	161537	161546	20 %	40 %	40 %	0 %	21392867
96	NC_003980	GTAAT	2	10	168382	168391	40 %	40 %	20 %	0 %	21392873
97	NC_003980	ATTAT	2	10	169870	169879	40 %	60 %	0 %	0 %	21392874
98	NC_003980	AATTA	2	10	170610	170619	60 %	40 %	0 %	0 %	21392874
99	NC_003980	TAATA	2	10	170899	170908	60 %	40 %	0 %	0 %	21392875
100	NC_003980	AAATT	2	10	171175	171184	60 %	40 %	0 %	0 %	21392875
101	NC_003980	CAAAG	2	10	172772	172781	60 %	0 %	20 %	20 %	21392878
102	NC_003980	TAATT	2	10	172832	172841	40 %	60 %	0 %	0 %	21392878
103	NC_003980	AAAGA	2	10	172926	172935	80 %	0 %	20 %	0 %	21392878
104	NC_003980	TTACA	2	10	174384	174393	40 %	40 %	0 %	20 %	21392880
105	NC_003980	TTTTC	2	10	175276	175285	0 %	80 %	0 %	20 %	21392882
106	NC_003980	TTACT	2	10	175426	175435	20 %	60 %	0 %	20 %	21392883
107	NC_003980	ACTCT	2	10	177000	177009	20 %	40 %	0 %	40 %	270000248
108	NC_003980	AATCG	2	10	177084	177093	40 %	20 %	20 %	20 %	270000248
109	NC_003980	TCATT	2	10	177688	177697	20 %	60 %	0 %	20 %	270000248
110	NC_003980	AATTT	2	10	180039	180048	40 %	60 %	0 %	0 %	21392889
111	NC_003980	TCTTT	2	10	180911	180920	0 %	80 %	0 %	20 %	21392890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.