MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO1

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003980	TTTC	2	8	1448	1455	0 %	75 %	0 %	25 %	21392691
2	NC_003980	AATT	2	8	1739	1746	50 %	50 %	0 %	0 %	21392691
3	NC_003980	ATAG	3	12	2076	2087	50 %	25 %	25 %	0 %	21392692
4	NC_003980	TTTG	2	8	3229	3236	0 %	75 %	25 %	0 %	21392694
5	NC_003980	GAAA	2	8	3447	3454	75 %	0 %	25 %	0 %	21392694
6	NC_003980	TAAT	2	8	3850	3857	50 %	50 %	0 %	0 %	21392695
7	NC_003980	TGAT	2	8	3955	3962	25 %	50 %	25 %	0 %	21392695
8	NC_003980	TTCG	2	8	3993	4000	0 %	50 %	25 %	25 %	21392695
9	NC_003980	TTAC	2	8	4694	4701	25 %	50 %	0 %	25 %	21392696
10	NC_003980	AAAT	2	8	5860	5867	75 %	25 %	0 %	0 %	21392698
11	NC_003980	CTTT	2	8	5910	5917	0 %	75 %	0 %	25 %	21392698
12	NC_003980	AATT	2	8	6418	6425	50 %	50 %	0 %	0 %	21392698
13	NC_003980	TGGA	2	8	7179	7186	25 %	25 %	50 %	0 %	21392699
14	NC_003980	TTAT	2	8	7195	7202	25 %	75 %	0 %	0 %	21392699
15	NC_003980	TTGG	2	8	7425	7432	0 %	50 %	50 %	0 %	21392699
16	NC_003980	CATA	2	8	7583	7590	50 %	25 %	0 %	25 %	21392699
17	NC_003980	TTGA	2	8	8265	8272	25 %	50 %	25 %	0 %	21392699
18	NC_003980	TTCC	2	8	8415	8422	0 %	50 %	0 %	50 %	21392699
19	NC_003980	TATT	2	8	9084	9091	25 %	75 %	0 %	0 %	21392701
20	NC_003980	GCTT	2	8	9595	9602	0 %	50 %	25 %	25 %	21392701
21	NC_003980	TTGC	2	8	10199	10206	0 %	50 %	25 %	25 %	21392701
22	NC_003980	ATTT	2	8	10211	10218	25 %	75 %	0 %	0 %	21392701
23	NC_003980	CTTC	2	8	10472	10479	0 %	50 %	0 %	50 %	21392701
24	NC_003980	GGTT	2	8	10569	10576	0 %	50 %	50 %	0 %	21392701
25	NC_003980	TGTA	2	8	10901	10908	25 %	50 %	25 %	0 %	21392701
26	NC_003980	ATAG	2	8	11134	11141	50 %	25 %	25 %	0 %	21392701
27	NC_003980	ATTC	2	8	11150	11157	25 %	50 %	0 %	25 %	21392701
28	NC_003980	CTTT	2	8	11351	11358	0 %	75 %	0 %	25 %	21392701
29	NC_003980	CAAT	2	8	11938	11945	50 %	25 %	0 %	25 %	21392702
30	NC_003980	AAGT	2	8	12248	12255	50 %	25 %	25 %	0 %	21392703
31	NC_003980	GTTT	2	8	12358	12365	0 %	75 %	25 %	0 %	21392703
32	NC_003980	TAAA	2	8	12683	12690	75 %	25 %	0 %	0 %	21392703
33	NC_003980	AGCA	2	8	12973	12980	50 %	0 %	25 %	25 %	21392703
34	NC_003980	GCTC	2	8	12984	12991	0 %	25 %	25 %	50 %	21392703
35	NC_003980	GTTT	2	8	13265	13272	0 %	75 %	25 %	0 %	21392704
36	NC_003980	CTTA	2	8	14793	14800	25 %	50 %	0 %	25 %	21392706
37	NC_003980	AAAT	2	8	15192	15199	75 %	25 %	0 %	0 %	21392707
38	NC_003980	TCAC	2	8	15343	15350	25 %	25 %	0 %	50 %	21392707
39	NC_003980	TTAA	2	8	15472	15479	50 %	50 %	0 %	0 %	21392707
40	NC_003980	TATT	2	8	15586	15593	25 %	75 %	0 %	0 %	21392707
41	NC_003980	TTCC	2	8	15600	15607	0 %	50 %	0 %	50 %	21392707
42	NC_003980	ATTT	2	8	16070	16077	25 %	75 %	0 %	0 %	21392707
43	NC_003980	TTTA	2	8	16092	16099	25 %	75 %	0 %	0 %	21392707
44	NC_003980	CGAA	2	8	16684	16691	50 %	0 %	25 %	25 %	21392707
45	NC_003980	ATTA	2	8	17076	17083	50 %	50 %	0 %	0 %	21392707
46	NC_003980	TAAA	3	12	17129	17140	75 %	25 %	0 %	0 %	21392707
47	NC_003980	AGAA	2	8	17852	17859	75 %	0 %	25 %	0 %	21392707
48	NC_003980	CACT	2	8	18197	18204	25 %	25 %	0 %	50 %	21392707
49	NC_003980	ATAA	2	8	18445	18452	75 %	25 %	0 %	0 %	21392707
50	NC_003980	TAAC	2	8	18554	18561	50 %	25 %	0 %	25 %	21392707
51	NC_003980	ATTT	2	8	18680	18687	25 %	75 %	0 %	0 %	21392707
52	NC_003980	CATT	2	8	18788	18795	25 %	50 %	0 %	25 %	21392707
53	NC_003980	TTTC	2	8	19322	19329	0 %	75 %	0 %	25 %	21392708
54	NC_003980	ATGA	2	8	19763	19770	50 %	25 %	25 %	0 %	21392708
55	NC_003980	ATAA	2	8	20100	20107	75 %	25 %	0 %	0 %	21392708
56	NC_003980	ATTT	2	8	20801	20808	25 %	75 %	0 %	0 %	21392708
57	NC_003980	TAGC	2	8	21523	21530	25 %	25 %	25 %	25 %	21392710
58	NC_003980	ATAC	2	8	22452	22459	50 %	25 %	0 %	25 %	21392711
59	NC_003980	ACTC	2	8	22828	22835	25 %	25 %	0 %	50 %	21392711
60	NC_003980	CTTT	2	8	22905	22912	0 %	75 %	0 %	25 %	21392711
61	NC_003980	TTCA	2	8	23348	23355	25 %	50 %	0 %	25 %	21392711
62	NC_003980	TGCA	2	8	23649	23656	25 %	25 %	25 %	25 %	21392711
63	NC_003980	TGAA	2	8	25310	25317	50 %	25 %	25 %	0 %	21392713
64	NC_003980	GAAT	2	8	25419	25426	50 %	25 %	25 %	0 %	21392713
65	NC_003980	ATCA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	0 %	25 %	21392713
66	NC_003980	TCTA	2	8	25650	25657	25 %	50 %	0 %	25 %	21392713
67	NC_003980	TAAT	2	8	25721	25728	50 %	50 %	0 %	0 %	21392713
68	NC_003980	AAAT	2	8	25824	25831	75 %	25 %	0 %	0 %	21392713
69	NC_003980	ATCT	2	8	26303	26310	25 %	50 %	0 %	25 %	21392714
70	NC_003980	CTGA	2	8	26330	26337	25 %	25 %	25 %	25 %	21392714
71	NC_003980	CAAT	2	8	26597	26604	50 %	25 %	0 %	25 %	21392715
72	NC_003980	AAAG	2	8	26811	26818	75 %	0 %	25 %	0 %	21392716
73	NC_003980	AATT	2	8	26840	26847	50 %	50 %	0 %	0 %	21392716
74	NC_003980	GAAA	2	8	27024	27031	75 %	0 %	25 %	0 %	21392716
75	NC_003980	ATAG	2	8	27130	27137	50 %	25 %	25 %	0 %	21392716
76	NC_003980	ATTT	2	8	27335	27342	25 %	75 %	0 %	0 %	21392716
77	NC_003980	TGGG	2	8	27437	27444	0 %	25 %	75 %	0 %	21392716
78	NC_003980	ATCA	2	8	27976	27983	50 %	25 %	0 %	25 %	21392716
79	NC_003980	AAAC	2	8	28174	28181	75 %	0 %	0 %	25 %	21392716
80	NC_003980	ATAA	2	8	28293	28300	75 %	25 %	0 %	0 %	21392716
81	NC_003980	TTTC	2	8	29005	29012	0 %	75 %	0 %	25 %	21392718
82	NC_003980	GGAA	2	8	29143	29150	50 %	0 %	50 %	0 %	21392718
83	NC_003980	TTTC	2	8	30044	30051	0 %	75 %	0 %	25 %	21392719
84	NC_003980	GCAC	2	8	30691	30698	25 %	0 %	25 %	50 %	21392721
85	NC_003980	TATT	2	8	30940	30947	25 %	75 %	0 %	0 %	21392721
86	NC_003980	AATG	2	8	31331	31338	50 %	25 %	25 %	0 %	21392722
87	NC_003980	GCTT	2	8	31540	31547	0 %	50 %	25 %	25 %	21392722
88	NC_003980	CTTT	2	8	31982	31989	0 %	75 %	0 %	25 %	21392722
89	NC_003980	TTTA	2	8	32550	32557	25 %	75 %	0 %	0 %	21392722
90	NC_003980	TTCA	2	8	32790	32797	25 %	50 %	0 %	25 %	21392722
91	NC_003980	TTTC	2	8	33993	34000	0 %	75 %	0 %	25 %	21392724
92	NC_003980	AATG	2	8	34682	34689	50 %	25 %	25 %	0 %	21392726
93	NC_003980	TCCT	2	8	34709	34716	0 %	50 %	0 %	50 %	21392726
94	NC_003980	GTAT	2	8	34767	34774	25 %	50 %	25 %	0 %	21392726
95	NC_003980	TAAT	2	8	36847	36854	50 %	50 %	0 %	0 %	21392730
96	NC_003980	ATCT	2	8	37213	37220	25 %	50 %	0 %	25 %	21392730
97	NC_003980	AATT	2	8	37240	37247	50 %	50 %	0 %	0 %	21392730
98	NC_003980	ATTA	2	8	37382	37389	50 %	50 %	0 %	0 %	21392730
99	NC_003980	ATCT	2	8	37789	37796	25 %	50 %	0 %	25 %	21392731
100	NC_003980	AATT	2	8	37908	37915	50 %	50 %	0 %	0 %	21392731
101	NC_003980	ATTT	2	8	38091	38098	25 %	75 %	0 %	0 %	21392731
102	NC_003980	ATGC	2	8	38349	38356	25 %	25 %	25 %	25 %	21392732
103	NC_003980	AATA	2	8	38975	38982	75 %	25 %	0 %	0 %	21392732
104	NC_003980	AGTA	2	8	39025	39032	50 %	25 %	25 %	0 %	21392732
105	NC_003980	GTTT	2	8	39480	39487	0 %	75 %	25 %	0 %	21392733
106	NC_003980	CGAA	2	8	39620	39627	50 %	0 %	25 %	25 %	21392733
107	NC_003980	GATA	2	8	39799	39806	50 %	25 %	25 %	0 %	21392733
108	NC_003980	TCCT	2	8	39820	39827	0 %	50 %	0 %	50 %	21392733
109	NC_003980	GTTT	2	8	40108	40115	0 %	75 %	25 %	0 %	21392733
110	NC_003980	CTTT	2	8	41000	41007	0 %	75 %	0 %	25 %	21392734
111	NC_003980	ATAA	2	8	41452	41459	75 %	25 %	0 %	0 %	21392735
112	NC_003980	TGCC	2	8	41816	41823	0 %	25 %	25 %	50 %	21392735
113	NC_003980	TTTC	3	12	44569	44580	0 %	75 %	0 %	25 %	21392737
114	NC_003980	CCTC	2	8	45684	45691	0 %	25 %	0 %	75 %	21392739
115	NC_003980	AGAA	2	8	45724	45731	75 %	0 %	25 %	0 %	21392739
116	NC_003980	TAGA	2	8	45764	45771	50 %	25 %	25 %	0 %	21392739
117	NC_003980	TAAA	2	8	46360	46367	75 %	25 %	0 %	0 %	21392740
118	NC_003980	TCTT	2	8	47377	47384	0 %	75 %	0 %	25 %	21392741
119	NC_003980	TGTA	2	8	47844	47851	25 %	50 %	25 %	0 %	21392741
120	NC_003980	AATT	2	8	48978	48985	50 %	50 %	0 %	0 %	21392742
121	NC_003980	AAAC	2	8	51518	51525	75 %	0 %	0 %	25 %	21392747
122	NC_003980	TTAC	2	8	51573	51580	25 %	50 %	0 %	25 %	21392747
123	NC_003980	GAAT	2	8	52523	52530	50 %	25 %	25 %	0 %	21392750
124	NC_003980	ATGA	2	8	52779	52786	50 %	25 %	25 %	0 %	21392750
125	NC_003980	TTGG	2	8	54464	54471	0 %	50 %	50 %	0 %	21392750
126	NC_003980	TTAT	2	8	54635	54642	25 %	75 %	0 %	0 %	21392750
127	NC_003980	TAAA	2	8	54930	54937	75 %	25 %	0 %	0 %	21392750
128	NC_003980	AGTG	2	8	54973	54980	25 %	25 %	50 %	0 %	21392750
129	NC_003980	GTTT	2	8	55513	55520	0 %	75 %	25 %	0 %	21392751
130	NC_003980	GTAC	2	8	56036	56043	25 %	25 %	25 %	25 %	21392752
131	NC_003980	CGTA	2	8	56561	56568	25 %	25 %	25 %	25 %	21392752
132	NC_003980	CATA	2	8	56607	56614	50 %	25 %	0 %	25 %	21392752
133	NC_003980	TCAC	2	8	57915	57922	25 %	25 %	0 %	50 %	21392753
134	NC_003980	CTCG	2	8	58095	58102	0 %	25 %	25 %	50 %	21392753
135	NC_003980	ATTA	2	8	58286	58293	50 %	50 %	0 %	0 %	21392753
136	NC_003980	TGCC	2	8	59008	59015	0 %	25 %	25 %	50 %	21392753
137	NC_003980	TTAA	2	8	59079	59086	50 %	50 %	0 %	0 %	21392754
138	NC_003980	GAAG	2	8	59196	59203	50 %	0 %	50 %	0 %	21392754
139	NC_003980	TTCA	2	8	59333	59340	25 %	50 %	0 %	25 %	21392754
140	NC_003980	TGAT	2	8	59982	59989	25 %	50 %	25 %	0 %	21392755
141	NC_003980	AGAA	2	8	60961	60968	75 %	0 %	25 %	0 %	21392756
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.