MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003923	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003923	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003923	TAAATC	2	12	17166	17177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003923	AAAAAT	2	12	38261	38272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003923	AATTAA	2	12	52893	52904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003923	ATTTAT	2	12	64036	64047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003923	AACAAA	2	12	82373	82384	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003923	AATATA	2	12	92388	92399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003923	TTAAAT	2	12	101089	101100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003923	TAACAA	2	12	102446	102457	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003923	AATGTA	2	12	126442	126453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003923	CTGTAA	2	12	128264	128275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003923	TCCCAC	2	12	166939	166950	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_003923	TTTATA	2	12	188795	188806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003923	ATTAAT	2	12	188818	188829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003923	TTTTTA	2	12	209285	209296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003923	CTTCAA	2	12	245146	245157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003923	GGAATA	2	12	254970	254981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003923	ATATAG	2	12	276794	276805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003923	ATTTTC	2	12	282111	282122	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_003923	ATAATT	2	12	283059	283070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003923	AACGAT	2	12	290490	290501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_003923	TTTAAT	2	12	298870	298881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003923	ATATGA	2	12	349967	349978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003923	TTCATT	2	12	354422	354433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003923	TTGTAA	2	12	359724	359735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003923	TAATAT	2	12	367973	367984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003923	AATTTG	2	12	397614	397625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003923	ATTAAT	2	12	416217	416228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003923	ATTAAT	2	12	420769	420780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003923	ATTGTT	2	12	420924	420935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003923	TAGTAT	2	12	424612	424623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003923	TGAAAT	2	12	430917	430928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003923	TTTAAT	2	12	437111	437122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003923	TGTATA	2	12	446416	446427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003923	AAAATG	2	12	461594	461605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003923	ACGTTG	2	12	482045	482056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003923	TATGGT	2	12	490910	490921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003923	TTATAA	2	12	502046	502057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003923	AAATTT	2	12	508805	508816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003923	TTATAA	2	12	569314	569325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003923	GTTATA	2	12	569985	569996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003923	CTTAAA	2	12	578417	578428	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003923	TTTTAA	2	12	585457	585468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003923	ACATGT	2	12	588388	588399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003923	AATGAT	2	12	621507	621518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003923	TAGATG	2	12	621580	621591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003923	TAAAAT	2	12	636900	636911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003923	TTTTAA	2	12	649007	649018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003923	CATTAT	2	12	665254	665265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003923	CATCAA	2	12	676052	676063	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_003923	TAATTT	2	12	680292	680303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003923	TGAATA	2	12	696769	696780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003923	GGATTC	2	12	708121	708132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_003923	AAATAT	2	12	710913	710924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003923	TTAAAA	2	12	723055	723066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003923	TAGTTA	2	12	727490	727501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003923	TTTTTA	2	12	745764	745775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003923	TGAAAA	2	12	754007	754018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003923	AATGAT	2	12	782721	782732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003923	AAATAA	2	12	819513	819524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003923	ACAAAA	2	12	822789	822800	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_003923	TTTTTG	2	12	839404	839415	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003923	TAGATT	2	12	850356	850367	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003923	TAAAAA	2	12	855231	855242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003923	TATCAA	2	12	861770	861781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003923	TTTTGA	2	12	865593	865604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003923	TCATTT	2	12	871584	871595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_003923	TAAAAA	2	12	874671	874682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003923	AAATTA	2	12	881695	881706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003923	AAGCAC	2	12	890431	890442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003923	TAAAAT	2	12	898065	898076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003923	TTTAAT	2	12	970674	970685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003923	ACAATA	2	12	988073	988084	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_003923	AACGGA	2	12	1002596	1002607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_003923	CTAAAT	2	12	1023367	1023378	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003923	CATTTA	2	12	1032499	1032510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003923	ATCATA	2	12	1034394	1034405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003923	TCAAAA	2	12	1040902	1040913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_003923	TTTTCT	2	12	1054687	1054698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_003923	TTTATA	2	12	1090638	1090649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003923	GAATTA	2	12	1097211	1097222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003923	ATTTTT	2	12	1114588	1114599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003923	ATAATT	2	12	1115385	1115396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003923	TAATGA	2	12	1128488	1128499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003923	TGTACA	2	12	1140239	1140250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_003923	ATTTAT	2	12	1147651	1147662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003923	ATTATA	2	12	1151569	1151580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003923	AAATTT	2	12	1152378	1152389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003923	AAGTAA	2	12	1174082	1174093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003923	TCGTTT	2	12	1177238	1177249	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003923	TTAATT	2	12	1187954	1187965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003923	AATTAA	2	12	1190690	1190701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003923	TGATTT	2	12	1195653	1195664	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003923	AGCTAA	2	12	1215354	1215365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_003923	GAAATT	2	12	1236125	1236136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003923	AATGAT	2	12	1248900	1248911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003923	TAAAGA	2	12	1263377	1263388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003923	AATTTG	2	12	1268740	1268751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003923	TTTCAT	2	12	1279183	1279194	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_003923	TATATT	2	12	1283842	1283853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003923	ATGTAT	2	12	1309552	1309563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003923	AAAGAA	2	12	1309784	1309795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003923	TTAAAG	2	12	1313361	1313372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003923	TTAAAG	2	12	1315292	1315303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003923	AGATAA	2	12	1316052	1316063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003923	ATTAAA	2	12	1343320	1343331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003923	ATATAA	2	12	1351244	1351255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003923	GTTTTA	2	12	1381057	1381068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003923	TAAAAT	2	12	1397165	1397176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003923	TATCTT	2	12	1420012	1420023	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_003923	TTGATT	2	12	1420075	1420086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003923	GTATCT	2	12	1420187	1420198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_003923	ATTCTA	2	12	1427416	1427427	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003923	AATAAA	2	12	1430267	1430278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003923	TATTCT	2	12	1476934	1476945	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_003923	TACTTG	2	12	1487604	1487615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_003923	TTAATC	2	12	1501126	1501137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_003923	TATGAT	2	12	1586539	1586550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003923	AATAAA	2	12	1591652	1591663	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003923	ATAAAA	2	12	1595439	1595450	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003923	ATTATC	2	12	1599084	1599095	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_003923	ACAAGA	2	12	1601016	1601027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_003923	TAAAAA	2	12	1613918	1613929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003923	TTATAG	2	12	1623054	1623065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003923	AATTTA	2	12	1631134	1631145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003923	AGCCAA	2	12	1659039	1659050	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003923	TTGACT	2	12	1659058	1659069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_003923	TTTAAC	2	12	1663942	1663953	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003923	ATAAAA	2	12	1664093	1664104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003923	TTATAA	2	12	1666485	1666496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003923	ACCTTT	2	12	1676442	1676453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003923	TTTTAT	2	12	1679203	1679214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_003923	AATTAA	2	12	1706220	1706231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_003923	TAAAAA	2	12	2073266	2073277	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.