MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC64

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003922	GCCAT	2	10	2453	2462	20 %	20 %	20 %	40 %	21264232
2	NC_003922	GCATT	2	10	2816	2825	20 %	40 %	20 %	20 %	21264232
3	NC_003922	GGCCG	2	10	4189	4198	0 %	0 %	60 %	40 %	21264235
4	NC_003922	GGCCG	2	10	8134	8143	0 %	0 %	60 %	40 %	21264236
5	NC_003922	GCCGC	2	10	8753	8762	0 %	0 %	40 %	60 %	21264237
6	NC_003922	GACCT	2	10	9209	9218	20 %	20 %	20 %	40 %	21264237
7	NC_003922	GTGGC	2	10	9235	9244	0 %	20 %	60 %	20 %	21264237
8	NC_003922	GCGAA	2	10	10863	10872	40 %	0 %	40 %	20 %	21264239
9	NC_003922	GCCCA	2	10	17506	17515	20 %	0 %	20 %	60 %	21264243
10	NC_003922	GATCG	2	10	17562	17571	20 %	20 %	40 %	20 %	21264243
11	NC_003922	CCGGC	2	10	22059	22068	0 %	0 %	40 %	60 %	21264249
12	NC_003922	GCGCC	2	10	22577	22586	0 %	0 %	40 %	60 %	21264249
13	NC_003922	CGAGT	2	10	23366	23375	20 %	20 %	40 %	20 %	21264251
14	NC_003922	CGGGT	2	10	23629	23638	0 %	20 %	60 %	20 %	21264252
15	NC_003922	GTCAG	2	10	23987	23996	20 %	20 %	40 %	20 %	21264252
16	NC_003922	GCTTG	2	10	28486	28495	0 %	40 %	40 %	20 %	21264259
17	NC_003922	TACCG	2	10	29969	29978	20 %	20 %	20 %	40 %	21264259
18	NC_003922	GCGCC	2	10	31207	31216	0 %	0 %	40 %	60 %	21264259
19	NC_003922	TCTCG	2	10	32674	32683	0 %	40 %	20 %	40 %	21264263
20	NC_003922	CCGCT	2	10	32861	32870	0 %	20 %	20 %	60 %	21264263
21	NC_003922	GATTT	2	10	35619	35628	20 %	60 %	20 %	0 %	21264266
22	NC_003922	TGCGT	2	10	35905	35914	0 %	40 %	40 %	20 %	21264266
23	NC_003922	TCGCG	2	10	36362	36371	0 %	20 %	40 %	40 %	21264267
24	NC_003922	AATCG	2	10	36766	36775	40 %	20 %	20 %	20 %	21264267
25	NC_003922	ACCGT	2	10	38669	38678	20 %	20 %	20 %	40 %	21264270
26	NC_003922	CCGCA	2	10	39469	39478	20 %	0 %	20 %	60 %	21264272
27	NC_003922	CGATG	2	10	40394	40403	20 %	20 %	40 %	20 %	21264273
28	NC_003922	GCCGT	2	10	40441	40450	0 %	20 %	40 %	40 %	21264273
29	NC_003922	CTAGG	2	10	43721	43730	20 %	20 %	40 %	20 %	21264277
30	NC_003922	ATGCC	2	10	44419	44428	20 %	20 %	20 %	40 %	21264278
31	NC_003922	ACGCC	2	10	45843	45852	20 %	0 %	20 %	60 %	21264280
32	NC_003922	CGGGC	2	10	48117	48126	0 %	0 %	60 %	40 %	21264283
33	NC_003922	CGATG	2	10	48851	48860	20 %	20 %	40 %	20 %	21264284
34	NC_003922	GGTAG	2	10	49707	49716	20 %	20 %	60 %	0 %	21264284
35	NC_003922	GGCGC	2	10	51417	51426	0 %	0 %	60 %	40 %	21264286
36	NC_003922	TCGGC	2	10	51479	51488	0 %	20 %	40 %	40 %	21264286
37	NC_003922	TGCGC	2	10	52538	52547	0 %	20 %	40 %	40 %	21264289
38	NC_003922	GCCCA	2	10	58370	58379	20 %	0 %	20 %	60 %	21264293
39	NC_003922	GATCG	2	10	58426	58435	20 %	20 %	40 %	20 %	21264293
40	NC_003922	CCAAG	2	10	59472	59481	40 %	0 %	20 %	40 %	21264295
41	NC_003922	TGCGG	2	10	64169	64178	0 %	20 %	60 %	20 %	21264299

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.