MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC64

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003922	GATC	2	8	200	207	25 %	25 %	25 %	25 %	21264229
2	NC_003922	TACG	2	8	1353	1360	25 %	25 %	25 %	25 %	21264231
3	NC_003922	CTCG	2	8	1960	1967	0 %	25 %	25 %	50 %	21264233
4	NC_003922	CGGC	2	8	2063	2070	0 %	0 %	50 %	50 %	21264233
5	NC_003922	GCCG	2	8	2137	2144	0 %	0 %	50 %	50 %	21264233
6	NC_003922	CCGC	2	8	2226	2233	0 %	0 %	25 %	75 %	21264233
7	NC_003922	CGCC	2	8	2670	2677	0 %	0 %	25 %	75 %	21264232
8	NC_003922	GAAC	2	8	2855	2862	50 %	0 %	25 %	25 %	21264232
9	NC_003922	GAAT	2	8	4497	4504	50 %	25 %	25 %	0 %	21264235
10	NC_003922	GCGA	2	8	4545	4552	25 %	0 %	50 %	25 %	21264235
11	NC_003922	GCTG	2	8	4767	4774	0 %	25 %	50 %	25 %	21264235
12	NC_003922	TCCT	2	8	4789	4796	0 %	50 %	0 %	50 %	21264235
13	NC_003922	GCCA	2	8	4967	4974	25 %	0 %	25 %	50 %	21264235
14	NC_003922	GGCC	2	8	5388	5395	0 %	0 %	50 %	50 %	21264236
15	NC_003922	CCGG	2	8	5880	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	21264236
16	NC_003922	CCAG	2	8	6474	6481	25 %	0 %	25 %	50 %	21264236
17	NC_003922	CGGT	2	8	6527	6534	0 %	25 %	50 %	25 %	21264236
18	NC_003922	CTGG	2	8	7057	7064	0 %	25 %	50 %	25 %	21264236
19	NC_003922	CGGC	2	8	7151	7158	0 %	0 %	50 %	50 %	21264236
20	NC_003922	ATCG	2	8	7537	7544	25 %	25 %	25 %	25 %	21264236
21	NC_003922	GCCC	2	8	8284	8291	0 %	0 %	25 %	75 %	21264237
22	NC_003922	GCAG	2	8	8461	8468	25 %	0 %	50 %	25 %	21264237
23	NC_003922	TGGC	2	8	8605	8612	0 %	25 %	50 %	25 %	21264237
24	NC_003922	GGCG	2	8	8635	8642	0 %	0 %	75 %	25 %	21264237
25	NC_003922	TCCG	2	8	9807	9814	0 %	25 %	25 %	50 %	21264238
26	NC_003922	CGCC	2	8	9951	9958	0 %	0 %	25 %	75 %	21264238
27	NC_003922	GCTC	2	8	10073	10080	0 %	25 %	25 %	50 %	21264238
28	NC_003922	GGCG	2	8	10128	10135	0 %	0 %	75 %	25 %	21264238
29	NC_003922	GGCA	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	21264238
30	NC_003922	ACGG	2	8	11300	11307	25 %	0 %	50 %	25 %	21264239
31	NC_003922	GGCA	2	8	11388	11395	25 %	0 %	50 %	25 %	21264239
32	NC_003922	CCAG	2	8	13608	13615	25 %	0 %	25 %	50 %	21264241
33	NC_003922	CTTC	2	8	13781	13788	0 %	50 %	0 %	50 %	21264242
34	NC_003922	TGCG	2	8	13862	13869	0 %	25 %	50 %	25 %	21264242
35	NC_003922	TTCG	2	8	14568	14575	0 %	50 %	25 %	25 %	21264243
36	NC_003922	GCCG	2	8	15001	15008	0 %	0 %	50 %	50 %	21264243
37	NC_003922	ACGC	2	8	15022	15029	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
38	NC_003922	CAGC	2	8	15037	15044	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
39	NC_003922	GTTC	2	8	15071	15078	0 %	50 %	25 %	25 %	21264243
40	NC_003922	TGCA	2	8	15381	15388	25 %	25 %	25 %	25 %	21264243
41	NC_003922	GCCA	2	8	15551	15558	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
42	NC_003922	GCCA	2	8	15755	15762	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
43	NC_003922	GCCA	2	8	16061	16068	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
44	NC_003922	GCCA	2	8	16877	16884	25 %	0 %	25 %	50 %	21264243
45	NC_003922	GCCT	2	8	17084	17091	0 %	25 %	25 %	50 %	21264243
46	NC_003922	CCCA	2	8	17247	17254	25 %	0 %	0 %	75 %	21264243
47	NC_003922	TGCA	2	8	17466	17473	25 %	25 %	25 %	25 %	21264243
48	NC_003922	GCGG	2	8	18550	18557	0 %	0 %	75 %	25 %	21264244
49	NC_003922	TGAG	2	8	18681	18688	25 %	25 %	50 %	0 %	21264244
50	NC_003922	CAGC	2	8	19228	19235	25 %	0 %	25 %	50 %	21264244
51	NC_003922	GCTT	2	8	19710	19717	0 %	50 %	25 %	25 %	21264245
52	NC_003922	TCAT	2	8	19860	19867	25 %	50 %	0 %	25 %	21264245
53	NC_003922	GTCA	2	8	20728	20735	25 %	25 %	25 %	25 %	21264247
54	NC_003922	ACCG	2	8	20761	20768	25 %	0 %	25 %	50 %	21264247
55	NC_003922	TTGC	2	8	20866	20873	0 %	50 %	25 %	25 %	21264247
56	NC_003922	CTAT	2	8	21096	21103	25 %	50 %	0 %	25 %	21264248
57	NC_003922	AGCA	3	12	21237	21248	50 %	0 %	25 %	25 %	21264248
58	NC_003922	GGTA	2	8	21411	21418	25 %	25 %	50 %	0 %	21264248
59	NC_003922	GCCA	2	8	21505	21512	25 %	0 %	25 %	50 %	21264248
60	NC_003922	GCCG	2	8	22330	22337	0 %	0 %	50 %	50 %	21264249
61	NC_003922	GGAC	2	8	22350	22357	25 %	0 %	50 %	25 %	21264249
62	NC_003922	GCCC	2	8	22437	22444	0 %	0 %	25 %	75 %	21264249
63	NC_003922	CAGC	2	8	22514	22521	25 %	0 %	25 %	50 %	21264249
64	NC_003922	CCGA	2	8	24523	24530	25 %	0 %	25 %	50 %	21264253
65	NC_003922	GCCG	2	8	24677	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	21264253
66	NC_003922	GCTG	2	8	24710	24717	0 %	25 %	50 %	25 %	21264253
67	NC_003922	GGCT	2	8	26836	26843	0 %	25 %	50 %	25 %	21264258
68	NC_003922	GTCG	2	8	27234	27241	0 %	25 %	50 %	25 %	21264258
69	NC_003922	TCGT	2	8	27925	27932	0 %	50 %	25 %	25 %	21264258
70	NC_003922	GCCG	2	8	27933	27940	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
71	NC_003922	GCGA	2	8	28099	28106	25 %	0 %	50 %	25 %	21264258
72	NC_003922	CGGC	2	8	28537	28544	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
73	NC_003922	CGAC	2	8	28581	28588	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
74	NC_003922	AGGC	2	8	29271	29278	25 %	0 %	50 %	25 %	21264259
75	NC_003922	TCGC	2	8	30347	30354	0 %	25 %	25 %	50 %	21264259
76	NC_003922	CCGA	2	8	30386	30393	25 %	0 %	25 %	50 %	21264259
77	NC_003922	CGGC	3	12	30919	30930	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
78	NC_003922	ACCT	2	8	31474	31481	25 %	25 %	0 %	50 %	21264260
79	NC_003922	CCAT	2	8	31729	31736	25 %	25 %	0 %	50 %	21264261
80	NC_003922	GCGA	2	8	32778	32785	25 %	0 %	50 %	25 %	21264263
81	NC_003922	CTCG	2	8	33174	33181	0 %	25 %	25 %	50 %	21264264
82	NC_003922	CGAC	2	8	33273	33280	25 %	0 %	25 %	50 %	21264264
83	NC_003922	TCCG	2	8	33298	33305	0 %	25 %	25 %	50 %	21264264
84	NC_003922	GGCA	2	8	33400	33407	25 %	0 %	50 %	25 %	21264264
85	NC_003922	CAGC	2	8	33873	33880	25 %	0 %	25 %	50 %	21264264
86	NC_003922	CGGC	2	8	34129	34136	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
87	NC_003922	CGCA	2	8	34326	34333	25 %	0 %	25 %	50 %	21264265
88	NC_003922	TCTT	2	8	34872	34879	0 %	75 %	0 %	25 %	21264265
89	NC_003922	GCCG	2	8	35106	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
90	NC_003922	CCGG	2	8	35384	35391	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
91	NC_003922	CGCC	2	8	35756	35763	0 %	0 %	25 %	75 %	21264266
92	NC_003922	TTGT	2	8	36202	36209	0 %	75 %	25 %	0 %	21264266
93	NC_003922	CTTG	2	8	36879	36886	0 %	50 %	25 %	25 %	21264267
94	NC_003922	CTGC	2	8	37172	37179	0 %	25 %	25 %	50 %	21264268
95	NC_003922	GCCG	2	8	37257	37264	0 %	0 %	50 %	50 %	21264268
96	NC_003922	GCGA	2	8	37731	37738	25 %	0 %	50 %	25 %	21264269
97	NC_003922	ACAA	2	8	38137	38144	75 %	0 %	0 %	25 %	21264269
98	NC_003922	AGCC	2	8	38319	38326	25 %	0 %	25 %	50 %	21264269
99	NC_003922	CGGC	2	8	38796	38803	0 %	0 %	50 %	50 %	21264270
100	NC_003922	CGGT	2	8	41497	41504	0 %	25 %	50 %	25 %	21264273
101	NC_003922	GACG	2	8	44016	44023	25 %	0 %	50 %	25 %	21264277
102	NC_003922	CCAG	2	8	44867	44874	25 %	0 %	25 %	50 %	21264278
103	NC_003922	CTTC	2	8	45040	45047	0 %	50 %	0 %	50 %	21264279
104	NC_003922	ATAA	2	8	45969	45976	75 %	25 %	0 %	0 %	21264280
105	NC_003922	CTGT	2	8	46072	46079	0 %	50 %	25 %	25 %	21264281
106	NC_003922	TGCT	2	8	46181	46188	0 %	50 %	25 %	25 %	21264281
107	NC_003922	GGCT	2	8	46349	46356	0 %	25 %	50 %	25 %	21264281
108	NC_003922	CCGT	2	8	46530	46537	0 %	25 %	25 %	50 %	21264281
109	NC_003922	CGGC	2	8	46840	46847	0 %	0 %	50 %	50 %	21264281
110	NC_003922	GTTG	2	8	47132	47139	0 %	50 %	50 %	0 %	21264282
111	NC_003922	TGCG	2	8	47144	47151	0 %	25 %	50 %	25 %	21264282
112	NC_003922	ACGC	2	8	47191	47198	25 %	0 %	25 %	50 %	21264282
113	NC_003922	TGGG	2	8	47462	47469	0 %	25 %	75 %	0 %	21264282
114	NC_003922	TGGC	2	8	47647	47654	0 %	25 %	50 %	25 %	21264282
115	NC_003922	ACGG	2	8	48337	48344	25 %	0 %	50 %	25 %	21264283
116	NC_003922	CCGG	2	8	48839	48846	0 %	0 %	50 %	50 %	21264284
117	NC_003922	ATCT	2	8	50143	50150	25 %	50 %	0 %	25 %	21264285
118	NC_003922	TCGT	2	8	50307	50314	0 %	50 %	25 %	25 %	21264285
119	NC_003922	CGGC	2	8	50332	50339	0 %	0 %	50 %	50 %	21264285
120	NC_003922	CTGA	2	8	50344	50351	25 %	25 %	25 %	25 %	21264285
121	NC_003922	CGGC	2	8	50462	50469	0 %	0 %	50 %	50 %	21264285
122	NC_003922	GGCG	2	8	50614	50621	0 %	0 %	75 %	25 %	21264285
123	NC_003922	CGTT	2	8	50881	50888	0 %	50 %	25 %	25 %	21264285
124	NC_003922	GGTC	2	8	51050	51057	0 %	25 %	50 %	25 %	21264285
125	NC_003922	CGGC	2	8	51239	51246	0 %	0 %	50 %	50 %	21264285
126	NC_003922	ACAT	2	8	51923	51930	50 %	25 %	0 %	25 %	21264287
127	NC_003922	TTCG	2	8	52738	52745	0 %	50 %	25 %	25 %	21264289
128	NC_003922	CGGG	2	8	52774	52781	0 %	0 %	75 %	25 %	21264289
129	NC_003922	AGAC	2	8	53358	53365	50 %	0 %	25 %	25 %	21264290
130	NC_003922	CCTG	2	8	53481	53488	0 %	25 %	25 %	50 %	21264290
131	NC_003922	GATC	2	8	53496	53503	25 %	25 %	25 %	25 %	21264290
132	NC_003922	TCGC	2	8	53552	53559	0 %	25 %	25 %	50 %	21264290
133	NC_003922	GCCA	2	8	54063	54070	25 %	0 %	25 %	50 %	21264291
134	NC_003922	CTTT	2	8	54852	54859	0 %	75 %	0 %	25 %	21264292
135	NC_003922	ATGG	2	8	54938	54945	25 %	25 %	50 %	0 %	21264292
136	NC_003922	TTCG	2	8	55231	55238	0 %	50 %	25 %	25 %	21264293
137	NC_003922	GCCG	2	8	55664	55671	0 %	0 %	50 %	50 %	21264293
138	NC_003922	ACGC	2	8	55685	55692	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
139	NC_003922	CAGC	2	8	55700	55707	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
140	NC_003922	GTTC	2	8	55734	55741	0 %	50 %	25 %	25 %	21264293
141	NC_003922	TGCA	2	8	56044	56051	25 %	25 %	25 %	25 %	21264293
142	NC_003922	GCCA	2	8	56619	56626	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
143	NC_003922	GCCA	2	8	56721	56728	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
144	NC_003922	GCCA	2	8	56925	56932	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
145	NC_003922	GCCA	2	8	57537	57544	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
146	NC_003922	GCCA	2	8	57639	57646	25 %	0 %	25 %	50 %	21264293
147	NC_003922	GCCT	2	8	57948	57955	0 %	25 %	25 %	50 %	21264293
148	NC_003922	CCCA	2	8	58111	58118	25 %	0 %	0 %	75 %	21264293
149	NC_003922	TGCA	2	8	58330	58337	25 %	25 %	25 %	25 %	21264293
150	NC_003922	GAGC	2	8	59963	59970	25 %	0 %	50 %	25 %	21264295
151	NC_003922	TCAG	2	8	60642	60649	25 %	25 %	25 %	25 %	21264295
152	NC_003922	AGCG	2	8	60933	60940	25 %	0 %	50 %	25 %	21264295
153	NC_003922	GGGC	2	8	61310	61317	0 %	0 %	75 %	25 %	21264295
154	NC_003922	CACG	2	8	61726	61733	25 %	0 %	25 %	50 %	21264295
155	NC_003922	CCAG	2	8	61981	61988	25 %	0 %	25 %	50 %	21264296
156	NC_003922	CGGA	2	8	63048	63055	25 %	0 %	50 %	25 %	21264298
157	NC_003922	CTCA	2	8	63520	63527	25 %	25 %	0 %	50 %	21264299
158	NC_003922	GTCG	2	8	63805	63812	0 %	25 %	50 %	25 %	21264299
159	NC_003922	ACAA	2	8	63894	63901	75 %	0 %	0 %	25 %	21264299
160	NC_003922	TCGA	2	8	64028	64035	25 %	25 %	25 %	25 %	21264299

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.