MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC64

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003922	CG	3	6	1148	1153	0 %	0 %	50 %	50 %	21264231
2	NC_003922	GC	3	6	1279	1284	0 %	0 %	50 %	50 %	21264231
3	NC_003922	CG	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	21264231
4	NC_003922	TA	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003922	TG	3	6	1670	1675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003922	GC	3	6	2035	2040	0 %	0 %	50 %	50 %	21264233
7	NC_003922	CG	3	6	2352	2357	0 %	0 %	50 %	50 %	21264232
8	NC_003922	CG	3	6	2467	2472	0 %	0 %	50 %	50 %	21264232
9	NC_003922	GC	3	6	2700	2705	0 %	0 %	50 %	50 %	21264232
10	NC_003922	CG	3	6	3155	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	21264234
11	NC_003922	GC	3	6	3618	3623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003922	CG	3	6	4817	4822	0 %	0 %	50 %	50 %	21264235
13	NC_003922	CA	3	6	5086	5091	50 %	0 %	0 %	50 %	21264235
14	NC_003922	CG	3	6	6353	6358	0 %	0 %	50 %	50 %	21264236
15	NC_003922	CG	3	6	6431	6436	0 %	0 %	50 %	50 %	21264236
16	NC_003922	GT	3	6	9373	9378	0 %	50 %	50 %	0 %	21264237
17	NC_003922	GC	3	6	9413	9418	0 %	0 %	50 %	50 %	21264237
18	NC_003922	GC	3	6	9789	9794	0 %	0 %	50 %	50 %	21264238
19	NC_003922	GA	3	6	9876	9881	50 %	0 %	50 %	0 %	21264238
20	NC_003922	GC	3	6	10009	10014	0 %	0 %	50 %	50 %	21264238
21	NC_003922	GC	3	6	11372	11377	0 %	0 %	50 %	50 %	21264239
22	NC_003922	GC	3	6	11731	11736	0 %	0 %	50 %	50 %	21264239
23	NC_003922	GC	3	6	12049	12054	0 %	0 %	50 %	50 %	21264240
24	NC_003922	GC	3	6	12059	12064	0 %	0 %	50 %	50 %	21264240
25	NC_003922	GC	3	6	12641	12646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003922	CG	3	6	14938	14943	0 %	0 %	50 %	50 %	21264243
27	NC_003922	GC	3	6	14950	14955	0 %	0 %	50 %	50 %	21264243
28	NC_003922	AC	3	6	15122	15127	50 %	0 %	0 %	50 %	21264243
29	NC_003922	AC	3	6	15218	15223	50 %	0 %	0 %	50 %	21264243
30	NC_003922	GC	3	6	18142	18147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003922	CG	3	6	19287	19292	0 %	0 %	50 %	50 %	21264244
32	NC_003922	GC	3	6	19475	19480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003922	CT	3	6	19661	19666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003922	TA	5	10	20107	20116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003922	TA	5	10	20127	20136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003922	AC	3	6	21071	21076	50 %	0 %	0 %	50 %	21264247
37	NC_003922	TA	3	6	21105	21110	50 %	50 %	0 %	0 %	21264248
38	NC_003922	TA	5	10	21182	21191	50 %	50 %	0 %	0 %	21264248
39	NC_003922	TA	3	6	21405	21410	50 %	50 %	0 %	0 %	21264248
40	NC_003922	TA	5	10	21417	21426	50 %	50 %	0 %	0 %	21264248
41	NC_003922	GC	3	6	21907	21912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003922	GC	3	6	22418	22423	0 %	0 %	50 %	50 %	21264249
43	NC_003922	TG	3	6	24050	24055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003922	GC	3	6	24577	24582	0 %	0 %	50 %	50 %	21264253
45	NC_003922	GC	3	6	25092	25097	0 %	0 %	50 %	50 %	21264255
46	NC_003922	CG	3	6	25098	25103	0 %	0 %	50 %	50 %	21264255
47	NC_003922	GC	3	6	25747	25752	0 %	0 %	50 %	50 %	21264256
48	NC_003922	CG	4	8	26361	26368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003922	GC	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	21264257
50	NC_003922	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
51	NC_003922	CG	3	6	27589	27594	0 %	0 %	50 %	50 %	21264258
52	NC_003922	CG	3	6	28701	28706	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
53	NC_003922	GC	3	6	28870	28875	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
54	NC_003922	GC	3	6	28888	28893	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
55	NC_003922	GC	3	6	29348	29353	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
56	NC_003922	GC	3	6	30781	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
57	NC_003922	CG	3	6	30932	30937	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
58	NC_003922	GC	3	6	30999	31004	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
59	NC_003922	CG	3	6	31150	31155	0 %	0 %	50 %	50 %	21264259
60	NC_003922	GT	3	6	31622	31627	0 %	50 %	50 %	0 %	21264260
61	NC_003922	GT	3	6	31844	31849	0 %	50 %	50 %	0 %	21264261
62	NC_003922	GA	3	6	32491	32496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003922	CG	3	6	33064	33069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003922	CG	3	6	33495	33500	0 %	0 %	50 %	50 %	21264264
65	NC_003922	GC	3	6	33572	33577	0 %	0 %	50 %	50 %	21264264
66	NC_003922	CG	4	8	34057	34064	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
67	NC_003922	CG	3	6	34075	34080	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
68	NC_003922	TG	3	6	34088	34093	0 %	50 %	50 %	0 %	21264265
69	NC_003922	GC	3	6	34310	34315	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
70	NC_003922	CG	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	21264265
71	NC_003922	GA	3	6	34752	34757	50 %	0 %	50 %	0 %	21264265
72	NC_003922	CG	3	6	35099	35104	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
73	NC_003922	CG	3	6	35462	35467	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
74	NC_003922	GC	3	6	35498	35503	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
75	NC_003922	CA	3	6	35528	35533	50 %	0 %	0 %	50 %	21264266
76	NC_003922	GC	3	6	35690	35695	0 %	0 %	50 %	50 %	21264266
77	NC_003922	GC	3	6	36260	36265	0 %	0 %	50 %	50 %	21264267
78	NC_003922	CG	3	6	37609	37614	0 %	0 %	50 %	50 %	21264268
79	NC_003922	CG	3	6	38607	38612	0 %	0 %	50 %	50 %	21264270
80	NC_003922	CA	3	6	38684	38689	50 %	0 %	0 %	50 %	21264270
81	NC_003922	GC	3	6	39403	39408	0 %	0 %	50 %	50 %	21264272
82	NC_003922	GT	3	6	39421	39426	0 %	50 %	50 %	0 %	21264272
83	NC_003922	GA	3	6	39823	39828	50 %	0 %	50 %	0 %	21264272
84	NC_003922	GA	3	6	40036	40041	50 %	0 %	50 %	0 %	21264273
85	NC_003922	AC	3	6	40880	40885	50 %	0 %	0 %	50 %	21264273
86	NC_003922	CG	3	6	41378	41383	0 %	0 %	50 %	50 %	21264273
87	NC_003922	CG	3	6	42066	42071	0 %	0 %	50 %	50 %	21264273
88	NC_003922	TG	3	6	43256	43261	0 %	50 %	50 %	0 %	21264276
89	NC_003922	GC	3	6	45122	45127	0 %	0 %	50 %	50 %	21264279
90	NC_003922	CA	3	6	45718	45723	50 %	0 %	0 %	50 %	21264280
91	NC_003922	AT	3	6	45765	45770	50 %	50 %	0 %	0 %	21264280
92	NC_003922	GC	3	6	46111	46116	0 %	0 %	50 %	50 %	21264281
93	NC_003922	CG	3	6	47163	47168	0 %	0 %	50 %	50 %	21264282
94	NC_003922	CG	3	6	47757	47762	0 %	0 %	50 %	50 %	21264282
95	NC_003922	CG	3	6	48141	48146	0 %	0 %	50 %	50 %	21264283
96	NC_003922	AT	4	8	48398	48405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003922	GC	3	6	48925	48930	0 %	0 %	50 %	50 %	21264284
98	NC_003922	GC	3	6	49006	49011	0 %	0 %	50 %	50 %	21264284
99	NC_003922	GC	3	6	49512	49517	0 %	0 %	50 %	50 %	21264284
100	NC_003922	GC	3	6	50416	50421	0 %	0 %	50 %	50 %	21264285
101	NC_003922	GC	3	6	50502	50507	0 %	0 %	50 %	50 %	21264285
102	NC_003922	GA	3	6	51962	51967	50 %	0 %	50 %	0 %	21264287
103	NC_003922	CT	3	6	52292	52297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_003922	TA	3	6	52340	52345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003922	GC	3	6	52711	52716	0 %	0 %	50 %	50 %	21264289
106	NC_003922	GC	3	6	52804	52809	0 %	0 %	50 %	50 %	21264289
107	NC_003922	GC	3	6	53947	53952	0 %	0 %	50 %	50 %	21264291
108	NC_003922	CG	3	6	54404	54409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_003922	CG	3	6	54925	54930	0 %	0 %	50 %	50 %	21264292
110	NC_003922	CG	3	6	55601	55606	0 %	0 %	50 %	50 %	21264293
111	NC_003922	GC	3	6	55613	55618	0 %	0 %	50 %	50 %	21264293
112	NC_003922	AC	3	6	55785	55790	50 %	0 %	0 %	50 %	21264293
113	NC_003922	AC	3	6	55881	55886	50 %	0 %	0 %	50 %	21264293
114	NC_003922	GC	3	6	59504	59509	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
115	NC_003922	GC	3	6	59689	59694	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
116	NC_003922	CG	3	6	59761	59766	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
117	NC_003922	CG	5	10	60626	60635	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
118	NC_003922	CG	3	6	60715	60720	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
119	NC_003922	GC	3	6	60725	60730	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
120	NC_003922	GC	3	6	60851	60856	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
121	NC_003922	CG	3	6	60886	60891	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
122	NC_003922	GC	3	6	61066	61071	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
123	NC_003922	GC	3	6	61564	61569	0 %	0 %	50 %	50 %	21264295
124	NC_003922	GC	3	6	62357	62362	0 %	0 %	50 %	50 %	21264296
125	NC_003922	TG	3	6	62412	62417	0 %	50 %	50 %	0 %	21264296
126	NC_003922	GC	3	6	62647	62652	0 %	0 %	50 %	50 %	21264297
127	NC_003922	GC	3	6	62976	62981	0 %	0 %	50 %	50 %	21264298
128	NC_003922	CT	3	6	63108	63113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_003922	GC	3	6	63332	63337	0 %	0 %	50 %	50 %	21264299
130	NC_003922	CG	3	6	63345	63350	0 %	0 %	50 %	50 %	21264299
131	NC_003922	CG	3	6	63436	63441	0 %	0 %	50 %	50 %	21264299
132	NC_003922	CG	3	6	63703	63708	0 %	0 %	50 %	50 %	21264299
133	NC_003922	AG	3	6	64198	64203	50 %	0 %	50 %	0 %	21264299
134	NC_003922	GC	3	6	64392	64397	0 %	0 %	50 %	50 %	21264300
135	NC_003922	CG	3	6	64525	64530	0 %	0 %	50 %	50 %	21264301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.