MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC33

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003921	GTAGC	2	10	1844	1853	20 %	20 %	40 %	20 %	21264188
2	NC_003921	GCGCA	2	10	3742	3751	20 %	0 %	40 %	40 %	21264191
3	NC_003921	CTGAC	2	10	6931	6940	20 %	20 %	20 %	40 %	21264198
4	NC_003921	ACCCG	2	10	7289	7298	20 %	0 %	20 %	60 %	21264198
5	NC_003921	ACTCG	2	10	7552	7561	20 %	20 %	20 %	40 %	21264199
6	NC_003921	GCCGG	2	10	8859	8868	0 %	0 %	60 %	40 %	21264201
7	NC_003921	CAGGG	2	10	11341	11350	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003921	CGATC	2	10	13356	13365	20 %	20 %	20 %	40 %	21264207
9	NC_003921	TGGGC	2	10	13412	13421	0 %	20 %	60 %	20 %	21264207
10	NC_003921	GCCAA	2	10	18708	18717	40 %	0 %	20 %	40 %	21264213
11	NC_003921	CCAAG	2	10	20798	20807	40 %	0 %	20 %	40 %	21264217
12	NC_003921	GTTGC	2	10	21393	21402	0 %	40 %	40 %	20 %	21264218
13	NC_003921	TGCGG	2	10	27109	27118	0 %	20 %	60 %	20 %	21264223
14	NC_003921	CGATC	2	10	27576	27585	20 %	20 %	20 %	40 %	21264224
15	NC_003921	GGCCG	2	10	30932	30941	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_003921	CGGCC	2	10	32156	32165	0 %	0 %	40 %	60 %	21264226
17	NC_003921	GGGCT	2	10	32377	32386	0 %	20 %	60 %	20 %	21264226
18	NC_003921	GCGCC	2	10	32828	32837	0 %	0 %	40 %	60 %	21264227
19	NC_003921	GCCTG	3	15	32844	32858	0 %	20 %	40 %	40 %	21264227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.