MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 plasmid pXAC33

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003921	ACTG	2	8	212	219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003921	GGGC	2	8	545	552	0 %	0 %	75 %	25 %	21264186
3	NC_003921	GCGT	2	8	598	605	0 %	25 %	50 %	25 %	21264186
4	NC_003921	TCGA	2	8	824	831	25 %	25 %	25 %	25 %	21264186
5	NC_003921	CGGC	3	12	1152	1163	0 %	0 %	50 %	50 %	21264186
6	NC_003921	CGGC	2	8	1213	1220	0 %	0 %	50 %	50 %	21264186
7	NC_003921	CGGT	2	8	1230	1237	0 %	25 %	50 %	25 %	21264186
8	NC_003921	AAGA	2	8	2053	2060	75 %	0 %	25 %	0 %	21264187
9	NC_003921	CGCA	2	8	2289	2296	25 %	0 %	25 %	50 %	21264189
10	NC_003921	CTGG	2	8	2543	2550	0 %	25 %	50 %	25 %	21264190
11	NC_003921	CGAA	2	8	3544	3551	50 %	0 %	25 %	25 %	21264191
12	NC_003921	TCCG	2	8	3837	3844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003921	CGAC	2	8	3902	3909	25 %	0 %	25 %	50 %	21264192
14	NC_003921	GCAA	2	8	4234	4241	50 %	0 %	25 %	25 %	21264192
15	NC_003921	TTTG	2	8	4373	4380	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003921	ATCA	2	8	4735	4742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003921	AGCC	2	8	5133	5140	25 %	0 %	25 %	50 %	21264193
18	NC_003921	ACGG	2	8	5246	5253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003921	CAGC	2	8	6210	6217	25 %	0 %	25 %	50 %	21264197
20	NC_003921	CGGC	2	8	6243	6250	0 %	0 %	50 %	50 %	21264197
21	NC_003921	GTCG	2	8	6396	6403	0 %	25 %	50 %	25 %	21264197
22	NC_003921	GCAG	2	8	8169	8176	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003921	GGGC	2	8	8483	8490	0 %	0 %	75 %	25 %	21264201
24	NC_003921	CGTC	2	8	8569	8576	0 %	25 %	25 %	50 %	21264201
25	NC_003921	CGGC	2	8	8590	8597	0 %	0 %	50 %	50 %	21264201
26	NC_003921	CCGC	2	8	8748	8755	0 %	0 %	25 %	75 %	21264201
27	NC_003921	CGAC	2	8	9198	9205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003921	TGGC	2	8	9415	9422	0 %	25 %	50 %	25 %	21264202
29	NC_003921	CCTA	2	8	9511	9518	25 %	25 %	0 %	50 %	21264202
30	NC_003921	GCCA	2	8	9561	9568	25 %	0 %	25 %	50 %	21264202
31	NC_003921	GCTT	3	12	9676	9687	0 %	50 %	25 %	25 %	21264202
32	NC_003921	GGTA	2	8	9730	9737	25 %	25 %	50 %	0 %	21264202
33	NC_003921	GTAT	2	8	9812	9819	25 %	50 %	25 %	0 %	21264202
34	NC_003921	ATAG	2	8	9824	9831	50 %	25 %	25 %	0 %	21264202
35	NC_003921	GCAA	2	8	10054	10061	50 %	0 %	25 %	25 %	21264203
36	NC_003921	CGGT	2	8	10159	10166	0 %	25 %	50 %	25 %	21264203
37	NC_003921	TGAC	2	8	10192	10199	25 %	25 %	25 %	25 %	21264203
38	NC_003921	GAAT	2	8	11058	11065	50 %	25 %	25 %	0 %	21264205
39	NC_003921	CAAG	2	8	11209	11216	50 %	0 %	25 %	25 %	21264205
40	NC_003921	GCTG	2	8	11692	11699	0 %	25 %	50 %	25 %	21264206
41	NC_003921	CTCA	2	8	12239	12246	25 %	25 %	0 %	50 %	21264206
42	NC_003921	TTAC	2	8	13031	13038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003921	ATGC	2	8	13453	13460	25 %	25 %	25 %	25 %	21264207
44	NC_003921	TGGG	2	8	13673	13680	0 %	25 %	75 %	0 %	21264207
45	NC_003921	AGGC	2	8	13836	13843	25 %	0 %	50 %	25 %	21264207
46	NC_003921	TGGC	2	8	14043	14050	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
47	NC_003921	TGGC	2	8	14145	14152	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
48	NC_003921	TGGC	2	8	14448	14455	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
49	NC_003921	TGGC	2	8	14652	14659	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
50	NC_003921	TGGC	2	8	14955	14962	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
51	NC_003921	TGGC	2	8	15057	15064	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
52	NC_003921	CGAA	2	8	15938	15945	50 %	0 %	25 %	25 %	21264207
53	NC_003921	GCGT	2	8	15988	15995	0 %	25 %	50 %	25 %	21264207
54	NC_003921	CGGC	2	8	16009	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	21264207
55	NC_003921	CGAA	2	8	16442	16449	50 %	0 %	25 %	25 %	21264207
56	NC_003921	TGGC	2	8	17050	17057	0 %	25 %	50 %	25 %	21264209
57	NC_003921	CTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	0 %	50 %	21264209
58	NC_003921	GGCA	2	8	17395	17402	25 %	0 %	50 %	25 %	21264210
59	NC_003921	GGCG	2	8	18755	18762	0 %	0 %	75 %	25 %	21264213
60	NC_003921	CTCA	2	8	19265	19272	25 %	25 %	0 %	50 %	21264214
61	NC_003921	CGCT	2	8	19293	19300	0 %	25 %	25 %	50 %	21264214
62	NC_003921	ATCA	2	8	20128	20135	50 %	25 %	0 %	25 %	21264216
63	NC_003921	GGCG	2	8	20542	20549	0 %	0 %	75 %	25 %	21264217
64	NC_003921	GCCA	2	8	21112	21119	25 %	0 %	25 %	50 %	21264218
65	NC_003921	ATGC	2	8	21506	21513	25 %	25 %	25 %	25 %	21264218
66	NC_003921	TGCG	2	8	21571	21578	0 %	25 %	50 %	25 %	21264218
67	NC_003921	GCAT	2	8	22072	22079	25 %	25 %	25 %	25 %	21264218
68	NC_003921	GAGT	2	8	22086	22093	25 %	25 %	50 %	0 %	21264218
69	NC_003921	GAGC	2	8	22903	22910	25 %	0 %	50 %	25 %	21264219
70	NC_003921	TCAG	2	8	23582	23589	25 %	25 %	25 %	25 %	21264219
71	NC_003921	AGCG	2	8	23873	23880	25 %	0 %	50 %	25 %	21264219
72	NC_003921	GGGC	2	8	24250	24257	0 %	0 %	75 %	25 %	21264219
73	NC_003921	CACG	2	8	24666	24673	25 %	0 %	25 %	50 %	21264219
74	NC_003921	CCAG	2	8	24921	24928	25 %	0 %	25 %	50 %	21264220
75	NC_003921	CGGA	2	8	25988	25995	25 %	0 %	50 %	25 %	21264222
76	NC_003921	CTCA	2	8	26460	26467	25 %	25 %	0 %	50 %	21264223
77	NC_003921	GTCG	2	8	26745	26752	0 %	25 %	50 %	25 %	21264223
78	NC_003921	ACAA	2	8	26834	26841	75 %	0 %	0 %	25 %	21264223
79	NC_003921	TCGA	2	8	26968	26975	25 %	25 %	25 %	25 %	21264223
80	NC_003921	TTAC	2	8	27251	27258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_003921	ATGC	2	8	27673	27680	25 %	25 %	25 %	25 %	21264224
82	NC_003921	TGGG	2	8	27893	27900	0 %	25 %	75 %	0 %	21264224
83	NC_003921	AGGC	2	8	28056	28063	25 %	0 %	50 %	25 %	21264224
84	NC_003921	TGGC	2	8	28875	28882	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
85	NC_003921	TGGC	2	8	29079	29086	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
86	NC_003921	TGGC	2	8	29181	29188	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
87	NC_003921	TGGC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
88	NC_003921	TGGC	2	8	29589	29596	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
89	NC_003921	CATG	2	8	29757	29764	25 %	25 %	25 %	25 %	21264224
90	NC_003921	CGAA	2	8	30068	30075	50 %	0 %	25 %	25 %	21264224
91	NC_003921	GCGT	2	8	30118	30125	0 %	25 %	50 %	25 %	21264224
92	NC_003921	CGGC	2	8	30139	30146	0 %	0 %	50 %	50 %	21264224
93	NC_003921	CGAA	2	8	30572	30579	50 %	0 %	25 %	25 %	21264224
94	NC_003921	GGGC	2	8	32448	32455	0 %	0 %	75 %	25 %	21264226
95	NC_003921	CTTT	2	8	32711	32718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003921	CGGC	2	8	33451	33458	0 %	0 %	50 %	50 %	21264227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.